Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 576 total aligned reads displayed.
TACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTT > CP043523/838767‑839065
|
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TACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGT > SRR13214403.4304517/1‑150 (MQ=60)
AGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCC > SRR13214403.2080634/1‑150 (MQ=60)
GTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCC > SRR13214403.1200794/1‑150 (MQ=60)
CAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCT < SRR13214403.2225954/150‑1 (MQ=60)
CAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCT > SRR13214403.3009259/1‑150 (MQ=60)
CAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCT > SRR13214403.1677527/1‑150 (MQ=60)
AACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTT < SRR13214403.285687/150‑1 (MQ=60)
ACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTA < SRR13214403.1910456/150‑1 (MQ=60)
CGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAA < SRR13214403.217990/150‑1 (MQ=60)
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ACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAAT > SRR13214403.1439403/1‑150 (MQ=60)
ACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAAT > SRR13214403.1503492/1‑150 (MQ=60)
ACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAAT > SRR13214403.3078508/1‑150 (MQ=60)
CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATT < SRR13214403.2624284/150‑1 (MQ=60)
CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATT < SRR13214403.2533585/150‑1 (MQ=60)
CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATT > SRR13214403.3451542/1‑150 (MQ=60)
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CTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTT < SRR13214403.1915397/150‑1 (MQ=60)
CTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTT < SRR13214403.624348/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTC < SRR13214403.1545725/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTC < SRR13214403.3063482/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTC > SRR13214403.387801/1‑150 (MQ=60)
GTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCT > SRR13214403.3577550/1‑150 (MQ=60)
TTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTG < SRR13214403.1660352/150‑1 (MQ=60)
TTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTG < SRR13214403.3948822/150‑1 (MQ=60)
TGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGG > SRR13214403.2525218/1‑150 (MQ=60)
GTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGT < SRR13214403.101910/150‑1 (MQ=60)
AACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTG > SRR13214403.4061938/1‑150 (MQ=60)
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CATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGG > SRR13214403.4180812/1‑150 (MQ=60)
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ATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGT < SRR13214403.3143142/150‑1 (MQ=60)
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CATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTT > SRR13214403.1087181/1‑150 (MQ=60)
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ATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGT < SRR13214403.2895165/150‑1 (MQ=60)
TTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTT > SRR13214403.2035213/1‑150 (MQ=60)
AATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTT > SRR13214403.4242664/1‑150 (MQ=60)
ATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTA > SRR13214403.736749/1‑150 (MQ=60)
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TAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAG > SRR13214403.1896680/1‑150 (MQ=60)
TAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAG > SRR13214403.2729002/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGG > SRR13214403.4528412/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGG > SRR13214403.1736421/1‑150 (MQ=60)
TTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGT > SRR13214403.1828916/1‑150 (MQ=60)
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TGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTT < SRR13214403.2021529/150‑1 (MQ=60)
GTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTT > SRR13214403.312826/1‑150 (MQ=60)
TTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT < SRR13214403.2388527/150‑1 (MQ=60)
TTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT > SRR13214403.26700/1‑150 (MQ=60)
TTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT > SRR13214403.3236750/1‑150 (MQ=60)
TTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT > SRR13214403.792618/1‑150 (MQ=60)
TAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTC > SRR13214403.806630/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCT > SRR13214403.2245029/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTG > SRR13214403.178273/1‑150 (MQ=60)
GTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGC > SRR13214403.676523/1‑150 (MQ=60)
GTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGC < SRR13214403.3469791/150‑1 (MQ=60)
TTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCA < SRR13214403.1199525/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCAT < SRR13214403.97620/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCAT > SRR13214403.1652881/1‑150 (MQ=60)
GAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATT < SRR13214403.4105139/150‑1 (MQ=60)
GAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATT > SRR13214403.2161082/1‑150 (MQ=60)
AGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTG > SRR13214403.2808026/1‑150 (MQ=60)
GAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGT < SRR13214403.3637/150‑1 (MQ=60)
AAGAAGCCACGTTCTACGGACAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTT < SRR13214403.4376354/150‑1 (MQ=60)
AAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGCTTTCCTTTGTTATAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTT > SRR13214403.3880372/1‑150 (MQ=60)
CCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAAT > SRR13214403.295441/1‑150 (MQ=60)
ACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGC > SRR13214403.2647489/1‑150 (MQ=60)
ACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGC > SRR13214403.2426946/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT < SRR13214403.4346131/150‑1 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT > SRR13214403.4479064/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT > SRR13214403.840346/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT < SRR13214403.352083/150‑1 (MQ=60)
CTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTT < SRR13214403.1959240/150‑1 (MQ=60)
TTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTT > SRR13214403.2590673/1‑150 (MQ=60)
CTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCA > SRR13214403.4154098/1‑150 (MQ=60)
TACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCAT > SRR13214403.2227257/1‑150 (MQ=60)
TACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCAT < SRR13214403.2791564/150‑1 (MQ=60)
TACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCAT < SRR13214403.3970940/150‑1 (MQ=60)
ACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATG < SRR13214403.1249246/150‑1 (MQ=60)
CGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGT > SRR13214403.3736221/1‑150 (MQ=60)
CAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGT < SRR13214403.2760763/150‑1 (MQ=60)
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AGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTT > SRR13214403.1027343/1‑150 (MQ=60)
GAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTT < SRR13214403.1726901/150‑1 (MQ=60)
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AAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTC < SRR13214403.228855/150‑1 (MQ=60)
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GAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTT < SRR13214403.1176856/150‑1 (MQ=60)
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CATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA < SRR13214403.2137615/150‑1 (MQ=60)
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ATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCAT < SRR13214403.2406984/150‑1 (MQ=60)
TCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATA > SRR13214403.3530208/1‑150 (MQ=60)
CCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAA < SRR13214403.3718656/150‑1 (MQ=60)
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CCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAA < SRR13214403.2837722/150‑1 (MQ=60)
CACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAAT > SRR13214403.1674795/1‑150 (MQ=60)
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CACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAAT > SRR13214403.2349226/1‑150 (MQ=60)
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TTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTC < SRR13214403.4555104/150‑1 (MQ=60)
AATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTT < SRR13214403.3682025/150‑1 (MQ=60)
ATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTTATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTT > SRR13214403.1745938/1‑150 (MQ=60)
ATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTT > SRR13214403.4620105/1‑150 (MQ=60)
GCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTAT > SRR13214403.2097400/1‑150 (MQ=60)
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CCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTT > SRR13214403.2929280/1‑150 (MQ=60)
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TTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGAT > SRR13214403.3797136/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGAT < SRR13214403.1923122/150‑1 (MQ=60)
TTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGAT > SRR13214403.1599466/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGAT < SRR13214403.2060490/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGCGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATC > SRR13214403.3045220/1‑150 (MQ=60)
TATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATC < SRR13214403.464753/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATN < SRR13214403.548387/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCATAACTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATC < SRR13214403.2281655/150‑1 (MQ=60)
ATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCA < SRR13214403.3837592/150‑1 (MQ=60)
TCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAA > SRR13214403.949329/1‑150 (MQ=60)
TCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAA > SRR13214403.1634784/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATATTGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATG > SRR13214403.2141857/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATG > SRR13214403.4542262/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATG < SRR13214403.3333852/150‑1 (MQ=60)
CATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGAT < SRR13214403.1157549/150‑1 (MQ=60)
ATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATT < SRR13214403.928178/150‑1 (MQ=60)
ATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATT > SRR13214403.1067290/1‑150 (MQ=60)
TAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTC < SRR13214403.1719473/150‑1 (MQ=60)
TAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGCTGGGTTTCCTTAGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTC < SRR13214403.3916846/150‑1 (MQ=60)
AAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCC < SRR13214403.1569328/150‑1 (MQ=60)
AAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCC > SRR13214403.3024105/1‑150 (MQ=60)
AGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCT < SRR13214403.1855731/150‑1 (MQ=60)
GTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTG < SRR13214403.4330771/150‑1 (MQ=60)
GTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTG > SRR13214403.2452768/1‑150 (MQ=60)
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CAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTC < SRR13214403.131712/150‑1 (MQ=60)
AAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattt < SRR13214403.788598/150‑5 (MQ=60)
AAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattt < SRR13214403.3199548/150‑5 (MQ=60)
AGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTTTTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGatttt > SRR13214403.3114056/1‑145 (MQ=60)
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GTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattttt > SRR13214403.1419359/1‑144 (MQ=60)
GTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattttt > SRR13214403.1611406/1‑144 (MQ=60)
TCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGatttttt > SRR13214403.2653632/1‑143 (MQ=60)
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TACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTT > CP043523/838767‑839065
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |