Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCATTACGATATGGATTTTATTAAT‑GGAGAGTAGTTTGACATTGACTATAATTAGTGTTATTATGAAGAAGTAAATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATGAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATTATGGCAAATG > CP043523/1848012‑1848301
|
ATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAGTCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAAT > SRR13214403.4178537/1‑150 (MQ=60)
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TAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAAT‑C < SRR13214403.4610782/150‑1 (MQ=60)
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TTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAA > SRR13214403.886083/1‑150 (MQ=60)
TTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAA > SRR13214403.1245545/1‑150 (MQ=60)
TTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAA > SRR13214403.3942624/1‑150 (MQ=60)
GCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGTTTTCACTACAGTTAATAAAATCCATGTCACTACGATATGTATTTTATGAATCAGAGAGTAGTTTGAAATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGA > SRR13214403.2188596/1‑150 (MQ=60)
GCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGTTTTTATTAATCAGAGAGTAATTTGACATTGAGTATAATTAGTGATATTATaaata > SRR13214403.2875185/1‑145 (MQ=60)
GCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGA > SRR13214403.902962/1‑150 (MQ=60)
TATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAGGAAG > SRR13214403.3518426/1‑150 (MQ=60)
TATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAG > SRR13214403.336595/1‑150 (MQ=60)
TATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAG > SRR13214403.1637254/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGT > SRR13214403.1841747/1‑150 (MQ=60)
TTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTA < SRR13214403.351634/150‑1 (MQ=60)
TTGCAAAAATAAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACTATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTA < SRR13214403.352514/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGA > SRR13214403.1482093/1‑150 (MQ=60)
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GCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGA > SRR13214403.1481956/1‑150 (MQ=60)
GCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTGTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGA > SRR13214403.4529785/1‑150 (MQ=60)
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CAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGAT > SRR13214403.3679876/1‑150 (MQ=60)
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AAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTT > SRR13214403.896227/1‑150 (MQ=60)
AAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTT > SRR13214403.2706362/1‑150 (MQ=60)
TGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTC > SRR13214403.337662/1‑150 (MQ=60)
GAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCA > SRR13214403.4567765/1‑150 (MQ=60)
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GAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCA > SRR13214403.1754995/1‑150 (MQ=60)
AATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCAT > SRR13214403.3112428/1‑150 (MQ=60)
TTAAAATGTCATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGA < SRR13214403.3683517/150‑1 (MQ=60)
TAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAG < SRR13214403.67667/150‑1 (MQ=60)
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AAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTA < SRR13214403.3963513/150‑1 (MQ=60)
ATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAA > SRR13214403.2753854/1‑150 (MQ=60)
ATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAA > SRR13214403.1463145/1‑150 (MQ=60)
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TGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAA < SRR13214403.3572928/150‑1 (MQ=60)
TTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGACATGAGTAAAATG > SRR13214403.4368013/1‑150 (MQ=60)
TATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGT > SRR13214403.3022310/1‑150 (MQ=60)
ATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTT > SRR13214403.1097971/1‑150 (MQ=60)
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TACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTT > SRR13214403.927778/1‑150 (MQ=60)
TACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTT > SRR13214403.739282/1‑150 (MQ=60)
TACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTT > SRR13214403.739619/1‑150 (MQ=60)
TACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTT < SRR13214403.3586941/150‑1 (MQ=60)
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ACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTT > SRR13214403.1722292/1‑150 (MQ=60)
ACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTT > SRR13214403.1721006/1‑150 (MQ=60)
CTGAGTGAGNGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTA > SRR13214403.4153299/1‑150 (MQ=60)
TGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTAT > SRR13214403.253411/1‑150 (MQ=60)
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TTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGA < SRR13214403.1067455/150‑1 (MQ=60)
TTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGA > SRR13214403.3510345/1‑150 (MQ=60)
TTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGA > SRR13214403.2958744/1‑150 (MQ=60)
TCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGAT > SRR13214403.847075/1‑150 (MQ=60)
CTACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTA > SRR13214403.3207027/1‑150 (MQ=60)
TACAGTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTAC > SRR13214403.2851629/1‑150 (MQ=60)
GTTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATT > SRR13214403.1225472/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATaagatcgaccaccg < SRR13214403.1987838/150‑15 (MQ=60)
TCATAAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTT > SRR13214403.1029933/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCG > SRR13214403.3717410/1‑150 (MQ=60)
ATCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAA > SRR13214403.2270521/1‑150 (MQ=56)
TCCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTCGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAG > SRR13214403.2083070/1‑150 (MQ=53)
CCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGG < SRR13214403.905262/150‑1 (MQ=53)
CCATGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGG > SRR13214403.4090554/1‑150 (MQ=53)
TGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAA > SRR13214403.1790474/1‑150 (MQ=47)
TGTCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTGTCGCAAAATAAGATTTAAAATTTTGTCGAAAGGAAA > SRR13214403.3811668/1‑150 (MQ=45)
TCACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATA > SRR13214403.4282190/1‑150 (MQ=46)
CACTACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA > SRR13214403.4225365/1‑150 (MQ=46)
TACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATA > SRR13214403.4195261/1‑150 (MQ=47)
TACGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATA > SRR13214403.2544343/1‑150 (MQ=47)
CGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCCTGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGACTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATA > SRR13214403.3207336/1‑150 (MQ=41)
CGATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTTGAAAGGAAATAA‑‑ATATA > SRR13214403.1929662/1‑150 (MQ=42)
GATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATat > SRR13214403.3021476/1‑148 (MQ=42)
GATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATat > SRR13214403.2223745/1‑148 (MQ=42)
GATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATat > SRR13214403.3021988/1‑148 (MQ=42)
GATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATat > SRR13214403.1565793/1‑148 (MQ=42)
ATATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATatt > SRR13214403.3052957/1‑147 (MQ=40)
TATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATatta > SRR13214403.1428475/1‑146 (MQ=38)
ATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATattat > SRR13214403.531231/1‑145 (MQ=36)
ATGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATattat > SRR13214403.528984/1‑145 (MQ=36)
TGGATTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATG < SRR13214403.4483574/150‑1 (MQ=33)
TTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAA > SRR13214403.2883858/1‑150 (MQ=27)
TTTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAA > SRR13214403.2884400/1‑150 (MQ=27)
TTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAAA > SRR13214403.1741269/1‑150 (MQ=28)
TTTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAAA < SRR13214403.1115822/150‑1 (MQ=28)
TTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAAAT > SRR13214403.2312465/1‑150 (MQ=28)
TTATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAAAT > SRR13214403.1472804/1‑150 (MQ=28)
TATTAATCAGAGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTATTATAAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATAAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAAATATATTATGGCAAATG > SRR13214403.3406324/1‑150 (MQ=28)
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ATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCATTACGATATGGATTTTATTAAT‑GGAGAGTAGTTTGACATTGACTATAATTAGTGTTATTATGAAGAAGTAAATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATGAGATTTACAATTTTGTCGAAAGGAAATAA‑‑ATATTATGGCAAATG > CP043523/1848012‑1848301
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
