Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
343,725 |
C→T |
H167Y (CAC→TAC) |
CXP41_RS01800 → |
protein YahL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 343,725 | 0 | C | T | 99.1%
| 834.4
/ NA
| 221 | H167Y (CAC→TAC) | CXP41_RS01800 | protein YahL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (93/126); minor base G (2/0); total (95/126) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
GTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTA > NZ_CP025268/343590‑343859
|
ttGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGAATCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCata < 2:4893315/140‑1 (MQ=255)
ttGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATAGTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTCCCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCata < 1:4221284/140‑1 (MQ=255)
gTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGcc > 1:3249520/1‑140 (MQ=255)
gTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGcc > 2:857281/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 2:3302942/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 2:75539/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 1:4065303/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTTAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 2:2256537/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 2:3066655/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 2:4063030/1‑140 (MQ=255)
gatgatGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAAt > 1:731727/1‑140 (MQ=255)
gatgatGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAAt > 1:3442454/1‑140 (MQ=255)
tgatgCGTTTCTTGATGTTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAAttt < 2:645955/140‑1 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCata > 1:1516351/1‑119 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:1875859/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:972630/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:5181796/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:1059082/1‑140 (MQ=255)
ggttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:1330732/138‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCCCCCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTCCCGTTTATCTATTCCGTGCGAACCGCTTGCCAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:2601449/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:1319974/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTAACGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:5233579/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:2847672/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:264364/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:993100/140‑1 (MQ=255)
tCTTGATATTAACGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAACTTAGTTCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTACAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAg > 2:1891268/1‑140 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCTGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:3812661/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:3091941/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2222549/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:1875859/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:1630001/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:4766622/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:3651536/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:4320800/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:1351247/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:1972653/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:1754877/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGAGTGCAAATGTATTCTGCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:3033139/140‑1 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt > 1:3596299/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGc < 2:1921801/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCa > 1:5100562/1‑140 (MQ=255)
aCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAt > 1:4157176/1‑140 (MQ=255)
cGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtg < 1:63640/140‑1 (MQ=255)
cGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtg > 1:2464092/1‑140 (MQ=255)
gCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGaaaa > 2:4441260/1‑140 (MQ=255)
aCGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGc > 2:1636103/1‑140 (MQ=255)
aCGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGc < 2:3331271/140‑1 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 1:56346/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 2:3843730/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATGCAGTGCGGACAGATTGCAAATGTATGCTTCTTGAAGACCATATGCCTTTGTTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATTTGGAAAAATGGCTTcgc > 2:2695123/1‑140 (MQ=255)
ccGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGCTTCCGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAACATGGCTTCGCGaa < 2:1686259/140‑1 (MQ=255)
gggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAAt < 1:1593375/140‑1 (MQ=255)
gggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAAt < 1:1223877/140‑1 (MQ=255)
ttAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGACTTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcg > 2:3910979/1‑140 (MQ=255)
ttAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcg > 1:5176713/1‑140 (MQ=255)
aaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAtt < 2:2283135/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc > 2:1315397/1‑140 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc > 2:542534/1‑140 (MQ=255)
tGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGTCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGgag > 1:3024095/1‑140 (MQ=255)
gTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGagacag > 2:3826916/1‑140 (MQ=255)
tATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 2:621124/140‑1 (MQ=255)
gaTCGATTCAGTGCGAACAGATTGAAAATTTATTCTTCTTGAAGACCATATAGCTTGGAGGAGGATTTGCCCGAAAGAGAAAGAGTGGATGGATGTGGTAGAATGGCTTCGCGAAAGCGTGTCTATTGCGGCGTCAAAcg > 2:4074683/2‑140 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:4001487/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 2:2496486/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 2:3444954/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:4951891/140‑1 (MQ=255)
aTCGACTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTCAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:3533229/140‑1 (MQ=255)
cGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACgcgc > 1:1004269/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCa < 1:142438/140‑1 (MQ=255)
cAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCAtt > 2:3565228/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAg > 2:5162818/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAg > 2:237833/1‑140 (MQ=255)
gCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGc < 2:4590835/140‑1 (MQ=255)
cGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCa < 2:4039225/140‑1 (MQ=255)
aaCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAgg < 1:278897/140‑1 (MQ=255)
aCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt > 2:5008495/1‑106 (MQ=255)
aCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:3143434/125‑1 (MQ=255)
aCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGgc > 1:1870127/1‑140 (MQ=255)
gATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCt > 2:1358916/1‑140 (MQ=255)
aTTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCtt > 2:1454658/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTg > 2:899177/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTg > 1:4369811/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTg > 2:1049713/1‑140 (MQ=255)
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cAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTCTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTgcgc < 2:4369811/140‑1 (MQ=255)
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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |