Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
343,725 |
C→T |
H167Y (CAC→TAC) |
CXP41_RS01800 → |
protein YahL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 343,725 | 0 | C | T | 99.7%
| 2714.0
/ NA
| 712 | H167Y (CAC→TAC) | CXP41_RS01800 | protein YahL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (337/372); minor base A (2/0); total (339/373) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 714 total aligned reads displayed.
CAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACA > NZ_CP025268/343588‑343861
|
cAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAatac > 2:220264/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 2:6701464/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 1:4399520/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 2:9800593/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 2:11383204/1‑140 (MQ=255)
aGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgaga > 1:4275194/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 1:5814777/1‑140 (MQ=255)
atgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTc > 2:8106576/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:6105964/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:10535609/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:1247273/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:9306468/1‑140 (MQ=255)
gcttttCTTGATTTTAAAGCAAACGTGTAGGCTGGACGCTTTTCCGGGCTTAAGTAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGTTTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 2:7883401/137‑1 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 1:10997620/140‑1 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 1:11427982/140‑1 (MQ=255)
cGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCt > 1:11572656/1‑140 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:1268065/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:6084816/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:2608811/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa > 2:10368891/1‑140 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa > 1:7750996/1‑140 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa > 1:7620330/1‑140 (MQ=255)
tCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAg > 1:1554043/1‑140 (MQ=255)
ttGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAggg < 2:1851118/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:8521733/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:8058420/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 2:7694458/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:10902646/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa < 2:5361738/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa < 1:10557076/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa < 1:5156006/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:5574186/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:1601104/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:11209195/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2658068/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:10104428/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2912866/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:8680975/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:837449/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:7276496/140‑1 (MQ=255)
atatAAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGTAATTAGTGCAGTTTATCTATTCAGAGCTAACAGATTGAAAATGTATTCATCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:11020412/140‑1 (MQ=255)
tatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAag > 1:3905255/1‑140 (MQ=255)
atTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 1:8274747/140‑1 (MQ=255)
tAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgt > 1:11195736/1‑140 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt < 1:4630039/140‑1 (MQ=255)
cGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtg < 2:1469761/140‑1 (MQ=255)
gTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtgt < 1:5284444/140‑1 (MQ=255)
cAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGa > 2:9141160/1‑140 (MQ=255)
aGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGaa > 1:1813967/1‑140 (MQ=255)
gCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa > 2:1072918/1‑120 (MQ=255)
aCGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGc < 1:2350921/140‑1 (MQ=255)
cGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCt < 1:4952141/140‑1 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 1:1595776/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 1:8907041/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 2:4881201/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc < 2:7548456/140‑1 (MQ=255)
ggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATg < 1:9523296/140‑1 (MQ=255)
ggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGACTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATg > 2:5066618/1‑140 (MQ=255)
ttAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcg > 1:7363918/1‑140 (MQ=255)
ttAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcg > 2:6435016/1‑140 (MQ=255)
tAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTATAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt < 1:9691050/140‑1 (MQ=255)
aaGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtg < 1:10720091/104‑1 (MQ=255)
aaGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgtc > 1:3379953/1‑140 (MQ=255)
aGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCt < 2:5633655/140‑1 (MQ=255)
aaaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAt < 1:725005/140‑1 (MQ=255)
aaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGGTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAtt < 2:2162203/140‑1 (MQ=255)
aTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACNATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTc > 1:6305022/1‑140 (MQ=255)
aTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTc > 1:9206421/1‑140 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc > 1:3762307/1‑140 (MQ=255)
tttATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGagacaga < 1:3221774/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:3478804/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:10044920/140‑1 (MQ=255)
cGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTTCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACgcgc > 1:835710/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtgt < 2:697139/90‑1 (MQ=255)
ttCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCa > 1:10183125/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCa < 2:3848990/140‑1 (MQ=255)
gCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGc > 2:4577762/1‑140 (MQ=255)
aaCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa > 2:2807553/1‑67 (MQ=255)
aaCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAgg > 2:2468126/1‑140 (MQ=255)
aCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAATGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGGTTCGCGACATGTCGTCTATGCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGgc > 2:10873268/1‑140 (MQ=255)
gATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCt > 2:3682917/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTg > 1:3129678/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTg > 1:6872308/1‑140 (MQ=255)
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AGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGAC < SRR14920200.6983801/151‑1 (MQ=60)
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AATCAAAAAGGGACAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACACTTAAAAAATATCT > NZ_CP025268/343575‑343875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |