Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
343,725 |
C→T |
H167Y (CAC→TAC) |
CXP41_RS01800 → |
protein YahL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 343,725 | 0 | C | T | 99.9%
| 3502.2
/ NA
| 901 | H167Y (CAC→TAC) | CXP41_RS01800 | protein YahL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (276/624); minor base G (0/1); total (276/625) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 901 total aligned reads displayed.
GTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACA > NZ_CP025268/343590‑343861
|
gTTTGGGTATCTGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCCAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCa < 2:6415446/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCa < 1:3463652/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCa < 1:6116444/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCa < 1:7642600/140‑1 (MQ=255)
gTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGcc > 1:2839332/1‑140 (MQ=255)
tataTGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCt < 2:1713391/140‑1 (MQ=255)
tatGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCttt > 2:7755743/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 1:10033454/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 1:1219112/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 2:8199505/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGATTAATAAATTAGTGAAGTTTATCTATTAAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATACTTATTGAATACCATATGAATTTGc > 2:7096390/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 1:8411445/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 2:5423816/1‑140 (MQ=255)
ggATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGaa > 2:9679229/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:2964366/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:9530855/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:9861837/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:2905085/1‑140 (MQ=255)
tcGTTTCTTTATATTAAAGAAAACGTGAAGGCTGGACTCTTTAACTGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTAAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTacc < 2:8911348/139‑1 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 1:8180137/140‑1 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc > 1:2175476/1‑140 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:5865466/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:10642020/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:8956309/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:7479647/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:2331324/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:5234896/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:7008425/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:6407998/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa < 2:6786354/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa < 1:6595580/140‑1 (MQ=255)
atcttAAATCAAAAGTGCATGCTTGTCGCTTTACCGGTCTTAAGAAATTATTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTTC‑AAATGTATTCTTATTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:3414969/137‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGTGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:9816742/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTCAAGGGaaa < 2:6560747/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:2175767/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:1546861/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:3964133/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:10838965/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:8024630/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:532468/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:1485220/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:1965650/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:3274305/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:8769328/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:311335/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2709200/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGAAGGCTGTACGCTTTACCGGGCTTATGAATTTTGTGCAGTGTTTGGATTCAGTGCTAACTGATTGC‑TATTGTATTCTTCTTGTATACCTTTTGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaat < 1:5964251/140‑2 (MQ=255)
atTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 1:9225610/140‑1 (MQ=255)
atTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 1:9727226/140‑1 (MQ=255)
atTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 2:4933084/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAag < 2:3117058/138‑1 (MQ=255)
tAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCata > 2:7938162/1‑104 (MQ=255)
tAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:2673662/136‑1 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt < 2:10814777/140‑1 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt < 2:9181352/140‑1 (MQ=255)
aGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTa < 1:4837094/140‑1 (MQ=255)
gACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATgg < 2:10633257/140‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGc > 2:5167968/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 1:4683442/1‑140 (MQ=255)
tACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgcg > 1:3828797/1‑140 (MQ=255)
tACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgcg < 2:1872730/140‑1 (MQ=255)
ccGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGaa < 2:8508628/140‑1 (MQ=255)
ccGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGaa < 1:10092331/140‑1 (MQ=255)
ccGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGaa < 1:9167119/140‑1 (MQ=255)
gggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAAt < 1:73418/140‑1 (MQ=255)
gggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAAt < 1:5419156/140‑1 (MQ=255)
cTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtc < 2:4481961/140‑1 (MQ=255)
tAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt < 1:8584697/140‑1 (MQ=255)
aaGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt < 2:3760833/139‑1 (MQ=255)
aaaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAt < 2:5646857/140‑1 (MQ=255)
aaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAtt < 2:6115816/140‑1 (MQ=255)
aaTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTAtt < 2:9384120/140‑1 (MQ=255)
aTTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa > 2:7293134/1‑94 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt < 1:412746/133‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc < 1:4383490/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTAGCGATTCAGTGCGAACAGAGTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc < 2:8417996/140‑1 (MQ=255)
tGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTa > 2:4192571/1‑96 (MQ=255)
tGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCt < 1:10289480/131‑1 (MQ=255)
tATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 2:7011337/140‑1 (MQ=255)
tATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 2:9456344/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 1:7164678/140‑1 (MQ=255)
tCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AACTGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgcg < 2:10227395/140‑1 (MQ=255)
ttCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCa < 1:506990/140‑1 (MQ=255)
tCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 1:810964/65‑1 (MQ=255)
tGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCt < 1:1707346/49‑1 (MQ=255)
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AATCAAAAAGGGACAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGC‑AAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACACTTAAAAAA > NZ_CP025268/343575‑343870
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |