Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
343,725 |
C→T |
H167Y (CAC→TAC) |
CXP41_RS01800 → |
protein YahL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 343,725 | 0 | C | T | 100.0%
| 3374.5
/ NA
| 882 | H167Y (CAC→TAC) | CXP41_RS01800 | protein YahL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (349/533); total (349/533) |
Only 100 of 884 total aligned reads displayed.
CAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACA > NZ_CP025268/343588‑343861
|
tttGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCat > 1:3908720/1‑140 (MQ=255)
ttGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTCCTTGAATACCata < 1:8874003/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGATATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGc > 1:3414189/1‑140 (MQ=255)
ggTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGc > 2:2612911/1‑140 (MQ=255)
ggTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGc > 2:4751363/1‑140 (MQ=255)
tataTGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCt < 1:286525/140‑1 (MQ=255)
atatGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCtt < 1:11068502/140‑1 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 1:5857411/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 1:4098157/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGc > 2:5177275/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 1:7874466/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTgag > 2:8754274/1‑140 (MQ=255)
atgatgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAAtt > 1:2049584/1‑140 (MQ=255)
atgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCTATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACAATATGCCTTTGCTGAGAATTTTc > 2:3786119/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 2:8558976/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGAGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTAACGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:1950670/1‑140 (MQ=255)
tgCGTTTCGTGATATTAAAGCAAACGTGCATGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATAGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTcc > 1:8258556/1‑140 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 1:8520881/140‑1 (MQ=255)
gCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTccc < 2:4580909/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:1617903/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:1689273/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 2:9250616/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGAAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:1603030/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGCTATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:9764126/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAAt < 1:2966921/130‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:9549834/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:9335264/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 1:4384346/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:8951486/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:4102032/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTaaa < 2:7157607/140‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa < 1:6367769/138‑1 (MQ=255)
ttCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTa > 2:6367768/1‑138 (MQ=255)
tCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAg > 2:1172264/1‑140 (MQ=255)
ttGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAggg < 1:722097/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAATCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCATAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATAGGCCTTTGCTGAGAAATTTCCCTAACGGGa < 2:6957924/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATTTGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:3198933/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 2:3590117/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 2:10907594/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:6631136/140‑1 (MQ=255)
tGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 2:491483/140‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa > 1:9938269/1‑140 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:7678822/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:1484355/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 2:6626862/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2569997/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:2349761/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:5616497/140‑1 (MQ=255)
atatTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTCGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaaa < 1:4015269/140‑1 (MQ=255)
atTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 2:10554926/140‑1 (MQ=255)
aagaaaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCATAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAaga < 2:10723433/137‑1 (MQ=255)
tAAAGCTAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACAGTGCTTAAGATATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgt < 1:10310033/140‑1 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt > 2:10436805/1‑140 (MQ=255)
aaGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAgtgt > 2:4403735/1‑140 (MQ=255)
aGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTa < 1:1093335/140‑1 (MQ=255)
aaaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGc < 2:5470254/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCa > 1:10562329/1‑95 (MQ=255)
aaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCt > 1:7425452/1‑102 (MQ=255)
aaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCa < 2:5957081/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCa > 2:7397990/1‑140 (MQ=255)
gTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCAtgt < 2:10100482/140‑1 (MQ=255)
gCAGGCTGGACGCTTTCCCGGGCTGAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTgg > 2:11104484/1‑140 (MQ=255)
cAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGa > 1:4609594/1‑140 (MQ=255)
aGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGaa > 2:182495/1‑140 (MQ=255)
gACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCGAAAGGGAAAGAGTGTATGCCTGTGGGAAGATgg > 1:10159591/1‑140 (MQ=255)
gCTTGACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTACAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCtt < 1:5025949/140‑1 (MQ=255)
tttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAACGAGTGTATGCATGTGGAAAATTGGCTTcg > 2:7571839/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTcgc > 1:6979135/1‑140 (MQ=255)
aCCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAACGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGa > 1:4849309/1‑140 (MQ=255)
aCCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGa < 2:5690135/140‑1 (MQ=255)
ggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTTCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATg < 1:9108449/140‑1 (MQ=255)
ggCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATg < 1:2213761/140‑1 (MQ=255)
tAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgt < 2:6758731/140‑1 (MQ=255)
aaGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGa < 1:6139469/97‑1 (MQ=255)
aaGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGACAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATgtcgtc > 1:7660737/1‑140 (MQ=255)
aGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCt < 1:11219149/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc < 1:1337528/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTcc > 1:11420967/1‑140 (MQ=255)
tGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGaa > 2:11309928/1‑88 (MQ=255)
tATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 2:8382673/140‑1 (MQ=255)
tATCGATACAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATACTTCTTGAATACCATATGCCATTGCTGAGAATATTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcg < 2:9397769/140‑1 (MQ=255)
aTCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGAcgc < 1:1851690/140‑1 (MQ=255)
cAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCAtt > 2:2235586/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAg > 1:5423103/1‑140 (MQ=255)
aaCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAgg < 2:2773353/140‑1 (MQ=255)
aaCAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAgg > 1:6729902/1‑140 (MQ=255)
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TTGAATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTCAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACACTTAAACAA < SRR14920198.11176138/151‑1 (MQ=60)
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ATACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACACTTAAAAAATATC > SRR14920198.1850597/1‑151 (MQ=60)
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AATCAAAAAGGGACAGTTTGGGTATATGACCAGGATGATGCGTTTCTTGATATTAAAGCAAACGTGCAGGCTGGACGCTTTACCGGGCTTAAGAAATTAGTGCAGTTTATCGATTCAGTGCGAACAGATTGCAAATGTATTCTTCTTGAACACCATATGCCTTTGCTGAGAATTTTCCCTAAAGGGAAAGAGTGTATGCATGTGGAAAAATGGCTTCGCGAAATGTCGTCTATTCCGGAGACAGACGCGCCCATTAAGCAGGCGCTTGCGCATGGATTATTATTACACTTAAAAAATATC > NZ_CP025268/343575‑343874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |