Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R1
|
782 |
634.5 |
21863942 |
98.1% |
21448527 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,598,952 |
(C)9→8 |
pseudogene (3955/5423 nt) |
CXP41_RS08400 ← |
ECSE_1600 family autotransporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,598,944 | 0 | C | . | 94.0%
| 2339.3
/ 137.1
| 565 | pseudogene (3963/5423 nt) | CXP41_RS08400 | ECSE_1600 family autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/22); new base . (218/302); total (229/336) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 631 total aligned reads displayed.
AACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACG > NZ_CP025268/1598805‑1599079
|
aaCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTGATTTGTTCCGTGCCGCCGTTCTCCAGGTTGGCGCCGATAGTGGGGTTAGCGTCACGCAGTGc > 1:2992919/1‑140 (MQ=255)
ccGTCCTCCGGCCATGGTTTCCGGTCTAGTTGCCGTTACCGGTAAGCCCCTGCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTAGTCCTTTGACCCGGGCCGCCATTCTCCCGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTGAGCGACACGCAGTGcc < 2:1872454/139‑1 (MQ=255)
aagTCATCTGGCCTTTTTTTCCGTTTTAGTTGCCTTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCACCCCTTCGCTATTCTTTTGAAACTTTCCGCCATTCTACATGTTGCCGACTATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 2:7749308/138‑1 (MQ=255)
aCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 1:5158587/140‑1 (MQ=255)
aCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 2:522798/140‑1 (MQ=255)
aCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 2:830562/140‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCCGGCCATTGTTTCCGGTAGAGTTGCCGATACCGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCACCCTTCGCTAGTCATTTGCACCGTGCCGCCATACTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 2:9510200/140‑1 (MQ=255)
catcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcccccc < 1:10008353/140‑1 (MQ=255)
atcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccc < 1:114148/140‑1 (MQ=255)
atcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccc < 1:9080162/140‑1 (MQ=255)
atcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccc < 1:3787890/140‑1 (MQ=255)
atcaGGACATTGTTTCCGGTATATTTGACGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccc < 2:7184704/140‑1 (MQ=255)
cATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCAt < 1:8880634/140‑1 (MQ=255)
aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATa < 1:6643188/140‑1 (MQ=255)
aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATa < 1:5365596/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGtt < 1:2727694/140‑1 (MQ=255)
cGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCat < 1:10647946/140‑1 (MQ=255)
cGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCat < 1:4347226/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGc < 1:10806037/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGc < 1:4120833/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGGTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGGTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGc < 2:9677083/140‑1 (MQ=255)
gCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTAGTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTGTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCAGCa > 2:4712872/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCCGTTTCCCCCCTACGATATTCATTAGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTTGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCa < 2:9301409/140‑1 (MQ=255)
gTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGTACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑GCGCCCCCAGGCATATCGTTCATATCACCTGCAgtg > 2:6915318/1‑140 (MQ=255)
tAACGGTCAGTACATTCGCCGGTTTCCCCCCTTCGATATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGTTAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑GCCCACCCAGGCTTAACGTTCATTTCACCTGCAgtggt > 2:10904669/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAAGCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGGTAGTGGTGTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCTGGCATTACGTTCATATCACCTGCCgtggtg > 2:7522707/1‑140 (MQ=255)
cGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGAc < 2:3225515/140‑1 (MQ=255)
cGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTGTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCTTATCACCTGCAGTGGTGAc > 2:10282857/1‑140 (MQ=255)
cGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCAGTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGGTCATATCGCCTGCAGTGGTGAc > 2:3533549/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACAt < 1:9831323/140‑1 (MQ=255)
tCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATaa > 2:2850498/1‑112 (MQ=255)
tCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATaa < 1:2850498/112‑1 (MQ=255)
gTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:7950786/140‑1 (MQ=255)
gTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc > 2:14280/1‑140 (MQ=255)
gTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGAAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:6779882/140‑1 (MQ=255)
gTACATGCCCCGGTGTCCCCCCTTCGCTATTCTTTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGGGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCGCCC‑GGCTTAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 2:1253522/140‑1 (MQ=255)
tACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTccc < 1:3425589/140‑1 (MQ=255)
tACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCAGTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCCTAACGGTCATATCACCTGCAGTGGTGACaggtccg > 2:8733907/1‑134 (MQ=255)
cATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGa < 1:14280/140‑1 (MQ=255)
cATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGa < 1:9950086/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCCTAACGTTGATAGGACCGGCAGTGGTGTCATTTGCCggcg > 1:2411510/1‑137 (MQ=255)
ttCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa < 1:6851589/140‑1 (MQ=255)
tCCCGGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCCGGTTGCCGCCTATAGTGGTTTTCGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa < 1:7719907/140‑1 (MQ=255)
tCCCCGGTGTCCCCCCTTCTCGATTCCTTTGAACCGGGCCGCCATTCTCCAGTGGGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGT‑TCCCCCCACAGGCATAACGTTCATAGCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACAt < 2:364651/140‑1 (MQ=255)
ccccGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGTCATTTCCCGagctc > 1:8170542/1‑136 (MQ=255)
cccGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATca < 1:6251974/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCacac > 2:6147523/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCacac < 1:10233826/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACAGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGACCCCCCCC‑GTCATAACGTTCATATCACCTTCATTGGTGACATTTCCCTACATCacac < 2:1794466/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCCCCCCTGCGCTATTCATTAGACCCGCGCCGCCATTCTCCCGGTCGCCGCCGATAGTGGTTTGAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCC‑GCCATAACGTTCATATCCCCGGCAGTGGCGACATGTCCCGACATCacac < 2:4293658/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCTGTG‑CCCGCCCCGGGCTTAACGGTGATCTCACCTGCGGTGGTGGCGGTTCCCGACCTCACACCg > 1:7298121/1‑140 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:9461150/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAG‑GGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACAGCACACCg < 2:4132412/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTCCGCTTTAATTTTTAACCGTGCGGCATTTCTCCTGGTTGCCGCGGTTTGTGTTTTTTCCGA‑ACCGATGGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:10348958/140‑1 (MQ=255)
ccccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTg < 1:3125938/140‑1 (MQ=255)
ccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt < 1:4926533/140‑1 (MQ=255)
ccTTCGCTAGTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCAAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTAt < 2:8830829/140‑1 (MQ=255)
cgtctcTATTCATTTGACCCGTGCCGCCATTCTCCCGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAAAGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATg < 2:6739199/135‑1 (MQ=255)
ttCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGCTAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACAGTGCCCGACCTCACACCGCTGTTCTgg > 2:4004798/1‑140 (MQ=255)
ttCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATgg > 1:8547795/1‑140 (MQ=255)
ttCGCTATTCATGTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGGTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCCGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGATGTTATgg < 2:2366598/140‑1 (MQ=255)
tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCCTTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACCCGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCGGATCGTTCATCTCACCGGCCGTGGTGTACGGTCCCGACAACACACCGCGGTTATGGa > 2:659331/1‑140 (MQ=255)
tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGa < 2:4871922/140‑1 (MQ=255)
tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGa > 2:3785484/1‑140 (MQ=255)
tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGGGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGa > 1:5455330/1‑140 (MQ=255)
cGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGGTGCCGCCGTTAGTGGTTTTAGCGTCACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGa < 1:971074/140‑1 (MQ=255)
tATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATAtt < 1:3940788/140‑1 (MQ=255)
tATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATAtt < 2:2167349/140‑1 (MQ=255)
tATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATAtt < 1:2533000/140‑1 (MQ=255)
cATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACCTCACACCGCTGTTATGGATATTAAtg > 2:1510434/1‑140 (MQ=255)
cATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTTTGGATGTTAAtg > 1:7112090/1‑140 (MQ=255)
tttGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCTAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATCTTAAtgtt > 2:918356/1‑139 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATgtgt < 1:5640607/140‑1 (MQ=255)
caCCCTGCCCCCATTCTCCAGGTTTCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGGGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGa < 1:6182235/139‑1 (MQ=255)
aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGa < 1:6347715/140‑1 (MQ=255)
aCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTGTAGCGACACGCAG‑GGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 1:8034555/140‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACt > 2:5610385/1‑140 (MQ=255)
gTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATCTTAATGTGTTGACTTg > 1:9262690/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGTTATTAATGTGTTGACTTGc > 1:8684149/1‑140 (MQ=255)
cccgccCTTCTCCCCCTTGCCGCCGATCGTGGTTCACGCGACACCCAGCG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCAAACCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCCCCAGCACACCGCTCTTATGGAGAATACTGTGTTGACTGGcc < 2:3135796/139‑1 (MQ=255)
cgccTTTCTCCAGTTTGCGGCCGATATTGGTATGAGCCACTCGCACTG‑CCCCCCCCACTCATAACTTTCATATCACCTCCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGATGTGACGGATATTATTGTGTTGACTTGCCat < 2:10704225/140‑1 (MQ=255)
cgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCat < 1:9580369/140‑1 (MQ=255)
cgccATTCTCCAGGTTGCCGACGATTGTTGTTTTAGCGACACGCATTG‑CCCCCCCCAGGCTTATCGTTCATATCTCCTGCATTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCat < 2:8547967/140‑1 (MQ=255)
ccactcctcCCGGTTGCCGCCTATAGTGGTTTTCGCGAAACGCA‑TGGCCCCCCCCAGGCTTATCGTTCATATCACCTGCTGTGGTGAAATGTACCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCata < 2:8047599/134‑1 (MQ=255)
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GAACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGC > NZ_CP025268/1598804‑1599102
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |