Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,033,768 |
(C)5→6 |
pseudogene (190/920 nt) |
yedA → |
drug/metabolite exporter YedA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 96.7%
| 2120.3
/ 57.5
| 631 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/10); new base C (282/325); total (296/335) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 676 total aligned reads displayed.
TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897
|
tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑c‑cc < 1:8816040/140‑1 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTAGATTCCTGGAAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑c‑cc‑c > 2:9371504/1‑140 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGATCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑c‑cc‑c > 2:6987130/1‑140 (MQ=255)
cATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑c‑cc‑c‑ccgc > 1:4173685/1‑137 (MQ=255)
tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑c‑cc‑c‑ccgcta > 1:6380862/1‑135 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:1981617/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:4886792/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:5362528/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:3130322/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:22546/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 2:2230355/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 2:3588152/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 1:7072193/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTAGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGt > 2:678446/1‑140 (MQ=255)
gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTc < 2:8849490/140‑1 (MQ=255)
gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTACGTTAATGATGGCGGGCTTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTc < 2:238998/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCg < 2:5693944/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCg < 1:3607858/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCg < 1:7269058/140‑1 (MQ=255)
cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCgctg > 2:6395852/1‑140 (MQ=255)
aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCCGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTCCTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCgctgg > 2:737764/1‑139 (MQ=255)
aTTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAAt > 1:7816550/1‑140 (MQ=255)
ttttGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 1:1788599/140‑1 (MQ=255)
ttttGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATCCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 1:3347504/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 1:8230293/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 1:2047952/1‑140 (MQ=255)
cATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc > 1:4568862/1‑140 (MQ=255)
cATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc > 1:11278427/1‑140 (MQ=255)
aTTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTAGTATATTGCTTGCATTTTTGCTACTGCTCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCAACGAACGCTGCTCAATGCCGCGCt > 2:6482575/1‑140 (MQ=255)
ttCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTg > 1:11015497/1‑140 (MQ=255)
tCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 1:3789086/140‑1 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGAGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:1488637/1‑140 (MQ=255)
cGGAGTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 2:3751793/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 2:10397213/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg > 2:9884791/1‑140 (MQ=255)
gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt > 1:7646341/1‑140 (MQ=255)
aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg < 1:8104438/140‑1 (MQ=255)
aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg > 1:5021493/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGTCAGCCGGGATTTTATTGCTTGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAAT‑‑CACC‑C‑CGCGACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:1976891/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 1:9061516/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 1:5223014/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 2:5368629/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCAGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCTGTATTTTATTTCTGGCATTTTTGCTACTGCGCTGAAACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGTCCTGTTATTgctgg < 1:569210/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:5591224/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:10510662/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 2:6622205/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTGAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:4367177/140‑1 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCC‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg < 1:10004070/140‑1 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 2:1010486/140‑1 (MQ=255)
ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGGCTTGTATTGCTGGCCTTTTTTCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑C‑CCAC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGAGCTTATTGGACTGTTATTGCTGGCTGTCGGTac > 2:11172719/1‑139 (MQ=255)
tAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAAt < 2:1349798/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGTTGTCGGTAATGGc < 1:9856808/140‑1 (MQ=255)
ggatgGCGGGCGTTCGCGTCCGGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTAGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCGGCTCACTGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:2727074/139‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTCTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATg < 1:2674529/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:1221839/1‑140 (MQ=255)
cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTg > 1:1084697/1‑140 (MQ=255)
gggcgTTCGAGTCCTGGCAGCCGGTATTTTAGTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGa < 2:7933626/140‑1 (MQ=255)
ggccgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAAGGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGa < 2:4833565/137‑1 (MQ=255)
ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:6560000/1‑140 (MQ=255)
ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 2:7062110/1‑140 (MQ=255)
cttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTATTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCg < 2:389261/139‑1 (MQ=255)
ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGa < 2:1862092/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCCGGTATTTTCTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACa < 2:10756460/140‑1 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 2:3039893/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCAGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAATGCTGGCTGTCGGTAATGTCATTGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCATTCCg > 1:11420227/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:2488730/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:7504174/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 2:7526383/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:11230183/1‑140 (MQ=255)
gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCGGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 2:3192784/140‑1 (MQ=255)
aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccg < 2:8493910/140‑1 (MQ=255)
tttttGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTTCGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccgc < 2:6036279/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:9323584/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:4142236/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:3251686/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:2642626/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:615453/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑C‑CC‑C‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTGATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:11030157/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑C‑CC‑CNCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGNCATCGCCGCCGTa < 1:6057856/140‑1 (MQ=255)
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CAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGC > SRR14920170.2065387/1‑151 (MQ=60)
CAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGC > SRR14920170.6767754/1‑151 (MQ=60)
CAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGC > SRR14920170.2065121/1‑151 (MQ=60)
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ACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGC > SRR14920170.4607917/1‑151 (MQ=60)
ACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGC < SRR14920170.5255486/151‑1 (MQ=60)
ACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGC < SRR14920170.2428591/151‑1 (MQ=60)
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GTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCC < SRR14920170.3234048/151‑1 (MQ=60)
GTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCC < SRR14920170.8302372/151‑1 (MQ=60)
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TGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTC‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGT < SRR14920170.5801630/151‑1 (MQ=60)
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|
GCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑‑CC‑CC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAG > NZ_CP025268/2033621‑2033918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |