Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F58 I1 R1
|
20 |
92.2 |
2125266 |
63.9% |
1358044 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
2,289,257 |
A→C |
V78G (GTA→GGA) |
ybbP ← |
hypothetical membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 2,289,257 | 0 | A | C | 97.3%
| 264.3
/ 0.8
| 75 | coding (233/810 nt) | ybbP | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (31/42); minor base . (2/0); total (33/42) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.33e-01 |
TATTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAG > CP000730/2289110‑2289399
|
tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:206940/1‑151 (MQ=255)
tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc < 1:826113/151‑1 (MQ=255)
tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:1052973/1‑151 (MQ=255)
tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:1052968/1‑151 (MQ=255)
ttttcacaGCCTTTGAAACCGTTTGAATCACTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 1:387753/147‑1 (MQ=255)
ccatgactacaatagAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 2:276497/137‑1 (MQ=255)
atTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 2:487910/151‑1 (MQ=255)
ttGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccccc < 2:950086/151‑1 (MQ=255)
cacaTCCTTTGAACCCGATTGAATCTATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACTTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCAt < 2:278050/151‑1 (MQ=255)
caGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTg < 1:409189/151‑1 (MQ=255)
tGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACg < 2:765349/151‑1 (MQ=255)
gAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGa > 2:820739/1‑151 (MQ=255)
aaaCCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGat < 1:612144/151‑1 (MQ=255)
aCCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGatat > 2:920896/1‑151 (MQ=255)
ttGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaat < 2:67443/151‑1 (MQ=255)
ttGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaat < 1:548164/151‑1 (MQ=255)
gAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaataa > 1:276498/1‑151 (MQ=255)
aaTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaataat > 2:460453/1‑151 (MQ=255)
aTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAAtt > 1:997641/1‑151 (MQ=255)
aTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAAtt > 1:544231/1‑151 (MQ=255)
aaTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAg > 2:693538/1‑151 (MQ=255)
tggctctTCATCTTTACGATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAGAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGGATAACGATATCGAATAATTTAGAt < 2:34641/148‑1 (MQ=255)
ctctTCATCCATACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTATTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGtt < 2:179395/151‑1 (MQ=255)
ctTCATCTGTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGc < 2:180388/151‑1 (MQ=255)
tCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAg < 2:888640/151‑1 (MQ=255)
cATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGt > 2:422424/1‑151 (MQ=255)
tCTTTTCTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTCAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCa < 1:470097/151‑1 (MQ=255)
cTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCaa > 1:440408/1‑151 (MQ=255)
tttACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAg < 1:71396/151‑1 (MQ=255)
tACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGtt < 1:854686/151‑1 (MQ=255)
ccTATACGTATTAGAAGTAAAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGCTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTATAGCTACTCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTc < 2:729275/150‑1 (MQ=255)
tataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 1:299370/1‑151 (MQ=255)
tataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 1:237467/1‑151 (MQ=255)
aataCGTATTAGAAATATAGCGTTTTAAAGAGCTATCTCTACCAAGTTGTTCGAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCAGTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa < 2:1005520/150‑1 (MQ=255)
ataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAat < 1:309710/151‑1 (MQ=255)
cGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAAT‑CCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCa > 1:37397/1‑151 (MQ=255)
cGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAAT‑CCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCa > 1:988204/1‑151 (MQ=255)
tATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCAt < 2:946910/151‑1 (MQ=255)
tataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctg < 2:275906/151‑1 (MQ=255)
ataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCCGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgt > 1:387474/1‑150 (MQ=255)
aGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgctg > 2:345825/1‑151 (MQ=255)
aGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgctg > 2:940982/1‑151 (MQ=255)
cGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAc > 1:224507/1‑151 (MQ=255)
gTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAcc > 2:572512/1‑151 (MQ=255)
gTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAcc < 2:528164/151‑1 (MQ=255)
ttttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCa < 1:79151/151‑1 (MQ=255)
tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCaa < 1:115236/151‑1 (MQ=255)
tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCaa < 2:598583/151‑1 (MQ=255)
tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATa < 2:227164/151‑1 (MQ=255)
tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATATGCTGACCAATa > 1:319690/1‑151 (MQ=255)
aaaaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATaa > 2:342297/1‑151 (MQ=255)
aaaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAAc > 2:279766/1‑151 (MQ=255)
aaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACaa < 1:290570/151‑1 (MQ=255)
aaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACaa < 2:191611/151‑1 (MQ=255)
gCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCGAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAAtt > 2:487435/1‑151 (MQ=255)
tACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAatat > 2:724483/1‑151 (MQ=255)
ccAAGTGGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATcc < 1:608211/151‑1 (MQ=255)
cAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATccc < 2:544231/151‑1 (MQ=255)
ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTa < 1:260990/151‑1 (MQ=255)
ngttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTaa > 1:868163/2‑151 (MQ=255)
gttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAg < 1:422424/151‑1 (MQ=255)
cTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTaa > 2:204238/1‑151 (MQ=255)
aCGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTg < 1:71825/151‑1 (MQ=255)
cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:940982/151‑1 (MQ=255)
cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:345825/151‑1 (MQ=255)
cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt > 1:717804/1‑151 (MQ=255)
cACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTAt > 2:129705/1‑151 (MQ=255)
gTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGACTAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 2:913348/1‑151 (MQ=255)
tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCttt < 2:237467/151‑1 (MQ=255)
ttCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGtt > 2:460081/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc > 1:246287/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc < 2:276498/151‑1 (MQ=255)
cTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTcc < 2:664171/151‑1 (MQ=255)
ggAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTaaa < 2:1045728/151‑1 (MQ=255)
tACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtg < 1:449033/151‑1 (MQ=255)
aCTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtga < 1:791068/151‑1 (MQ=255)
ttAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgag < 1:271401/151‑1 (MQ=255)
tAACGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgaga > 2:575139/1‑151 (MQ=255)
aaaGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaa > 1:576940/1‑151 (MQ=255)
aaGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaag > 2:610144/1‑151 (MQ=255)
|
TATTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAG > CP000730/2289110‑2289399
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
