Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F184 I0 R1
|
45 |
69.8 |
1527574 |
94.8% |
1448140 |
140.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
607,884 |
G→A |
100% |
R209* (CGA→TGA) |
dck ← |
deoxynucleoside kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 607,884 | 0 | G | A | 100.0%
| 268.8
/ ‑6.5
| 87 | R209* (CGA→TGA) | dck | deoxynucleoside kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (52/33); minor base C (1/0); total (53/34) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
TGTGAATTAATGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCGAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCTTTTTCCAG > CP000730/607751‑608020
|
tgtgAATTAATGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGAATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCaaa > 2:550411/1‑139 (MQ=255)
gtgAATTATTGTATTCGATTGAATTGATAATATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAAtt < 1:277815/140‑1 (MQ=255)
gtgAATTAATGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAAtt < 1:455680/140‑1 (MQ=255)
aaTGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTa < 2:660238/140‑1 (MQ=255)
aaTGTATTCGATAGAACTGATAAAACAATCGATAATAGCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTTGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTa < 2:593992/140‑1 (MQ=255)
tGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATc > 1:370369/1‑140 (MQ=255)
taatCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCAt < 2:523482/137‑1 (MQ=255)
tATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTATACTTTTATAATGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTtattat > 1:20544/1‑140 (MQ=255)
tATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCAt < 2:523710/140‑1 (MQ=255)
aTTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACTTATATGCTAAGTCGTAAGACTTTTAACGAGTATCGACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATa > 1:720809/1‑140 (MQ=255)
aTTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTCGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATGCATGCAATTTTGATTATCATa > 2:434498/1‑140 (MQ=255)
aTTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTTAAGCAATTTTGTTTATCATa > 2:669583/1‑140 (MQ=255)
aTTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTATTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATa > 1:29896/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAGAATTGAAAAAATAATCGAAAATATCTATGGAATATACATTTAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCTTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAg < 2:179015/140‑1 (MQ=255)
aTAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACTTTTTAGCCAAGACCTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGAtt < 1:175317/140‑1 (MQ=255)
gAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTaa < 1:603002/140‑1 (MQ=255)
gAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTaa < 1:702807/140‑1 (MQ=255)
acaTTGATAAAATAATCGATAATTGCAATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTaa < 2:743458/138‑1 (MQ=255)
aTTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTTTATCTACTTGTCGATATATTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTAATCAAAGGACTTAAAg > 1:285008/1‑140 (MQ=255)
aTTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAg > 2:699305/1‑140 (MQ=255)
aTTGATAAAATAATCGATAAGATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAg > 1:460834/1‑140 (MQ=255)
taatCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGACTAATTCAAGCAGAGTAGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTc > 2:156965/1‑140 (MQ=255)
taatCGAT‑ATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTcc < 1:577647/140‑1 (MQ=255)
aatCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTCTCTCTTTATTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTcc < 1:550354/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATATCAATGTAATATACATTGAATATAAACATATTCGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCtt < 1:96627/140‑1 (MQ=255)
tCGACAATATCTATGGATTATACATTGAATATAACCATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCtt < 2:117809/140‑1 (MQ=255)
cGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTa > 1:338548/1‑140 (MQ=255)
gATAATATCTATGGAAAATACATTGAATATTAACATATAAGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATATATTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATTATAGGATTTAAAGGTTCGGGGTCCTTAt > 2:247309/1‑140 (MQ=255)
ataataTCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCCAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGTTTCAGGGTCCttgtt > 2:48723/1‑137 (MQ=255)
ataataTCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATg > 2:268639/1‑140 (MQ=255)
aataTCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACATGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCAGGGTCCTTATGGa > 1:215837/1‑140 (MQ=255)
atatCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGat < 2:562974/140‑1 (MQ=255)
atCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGatat < 2:327319/140‑1 (MQ=255)
tagggAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTATTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCat < 1:23685/137‑1 (MQ=255)
ataCATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTa < 2:311333/140‑1 (MQ=255)
ataCATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTa > 1:631432/1‑140 (MQ=255)
ataCATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTa > 2:703072/1‑140 (MQ=255)
ataCATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGAGGTCCTTATGGATATCATATTCAtaa > 1:245287/1‑138 (MQ=255)
aCATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTTTGGTTATCATATTCATTAat > 1:119281/1‑140 (MQ=255)
cATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAata < 2:71571/140‑1 (MQ=255)
aatGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAatat > 2:466779/3‑140 (MQ=255)
aTTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTTTTTTATCGTGTATCTACTTGTAGATCTGTTTGAATAATTCAAGCACTTTTGTCTATCATAGGTTTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAatat > 2:82566/1‑140 (MQ=255)
aaTATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGAt < 2:682506/140‑1 (MQ=255)
aaTATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGAt < 2:64135/140‑1 (MQ=255)
aaTATAAACATATACGCTATGTCTTCAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATCTCATATTCATTAATATTGAt < 1:464445/140‑1 (MQ=255)
atatAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGTGTCCTTATGAATATCATATTCATTAATATTGATa > 1:188459/1‑140 (MQ=255)
aaCATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTAc > 1:71920/1‑140 (MQ=255)
aaCATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTGGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTAc > 1:506242/1‑140 (MQ=255)
aaCATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGAAATGGTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTAc > 1:145757/1‑140 (MQ=255)
aaCATATACGCGATGTCTTTAGTCGTTTATCGGGTATCTACTAGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGAGTTAAAGATGCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATGAATATTGATACGTAc > 2:728934/1‑140 (MQ=255)
aCATATAAGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTAACTATTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACa < 1:483741/140‑1 (MQ=255)
cATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACaa > 1:602167/1‑140 (MQ=255)
taCGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTgg > 2:72182/1‑140 (MQ=255)
aCGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCTATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGa < 1:45712/140‑1 (MQ=255)
aCGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTgaa > 1:99146/1‑138 (MQ=255)
aCGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGa > 1:164625/1‑140 (MQ=255)
cGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGAc > 1:599663/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTTAGTCTTTTAGCGTGTAGCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGc < 2:76646/139‑1 (MQ=255)
aTGTATTTGGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCTATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGAGTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAAATGGACATGc < 2:241464/140‑1 (MQ=255)
gTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATATACTTGTCGATCAGTTTGAATAATTCAAGCAAGTTTGTTTTTCATAGGCTTTAAAGATTCAGGGTCCTTATGGATAATATATGCATTAATATTGATACGTCCAACTGGCCATggct > 2:657391/1‑137 (MQ=255)
gTCTTTAGTCTTTTATCGTGAATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCAt > 1:534185/1‑140 (MQ=255)
tCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCAAATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCAtt > 2:78347/1‑140 (MQ=255)
gcTTTGGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCAtt > 2:181827/2‑140 (MQ=255)
cTTTAGACCTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTa > 2:658318/1‑140 (MQ=255)
tttAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCCTTaa < 2:460834/140‑1 (MQ=255)
ttAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACCAGCATTaaa > 1:184081/1‑140 (MQ=255)
aGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTATAGc > 1:313948/1‑140 (MQ=255)
ttttATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTAtt > 2:531918/1‑140 (MQ=255)
tATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAAt > 2:337785/1‑140 (MQ=255)
tATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGATATTAAt > 1:490477/1‑140 (MQ=255)
tACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGAAATGTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCAt > 1:366711/1‑140 (MQ=255)
aCTTGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATa > 1:266936/1‑140 (MQ=255)
aCTTGTCGATATGTTTCAATATTTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATa > 1:390606/1‑140 (MQ=255)
gggTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGc > 2:239015/3‑140 (MQ=255)
tGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATacag > 2:396580/1‑137 (MQ=255)
tGTCGATATGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCg < 1:571255/140‑1 (MQ=255)
tgggtatGTTTGAATAATTCGAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGtt < 2:250484/136‑1 (MQ=255)
atatGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTaa < 2:740811/140‑1 (MQ=255)
atttttGAACAATTCAAGCAATTTTGTTTATCAGAGCATTTAAAGATTCGGTGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTAATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAAt < 1:48723/137‑1 (MQ=255)
atGTTTGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAAt < 1:268639/140‑1 (MQ=255)
ttGAATAATTCAAGTAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCt < 1:244527/140‑1 (MQ=255)
tGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCtt > 2:80854/1‑140 (MQ=255)
tGAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCtt > 1:58769/1‑140 (MQ=255)
gAATAATTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTACGACAATCGTCATAGCGTTTCAATAGCttt > 2:342983/1‑140 (MQ=255)
aataatTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCtttt > 2:652195/1‑140 (MQ=255)
atTCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCTTTTTCCa > 1:386511/1‑140 (MQ=255)
ttCAAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCAATTAATCCAATCGTCATACCGTTTAAATAGCTTTTTCCAg > 1:496694/1‑140 (MQ=255)
|
TGTGAATTAATGTATTCGATAGAATTGATAAAATAATCGATAATATCTATGGAATATACATTGAATATAAACATATACGCTATGTCTTTAGTCTTTTATCGTGTATCTACTTGTCGATATGTTTGAATAATTCGAGCAATTTTGTTTATCATAGGATTTAAAGATTCGGGGTCCTTATGGATATCATATTCATTAATATTGATACGTACAACTGGACATGCATTAAAGCTATTAATCCAATCGTCATAGCGTTTAAATAGCTTTTTCCAG > CP000730/607751‑608020
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
