Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F288 I0 R1
|
40 |
146.2 |
2522132 |
93.7% |
2363237 |
284.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,006,859 |
A→C |
100% |
S200R (AGC→CGC) |
ygeW → |
putative carbamoyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,006,859 | 0 | A | C | 96.1%
| 697.5
/ 14.8
| 207 | S200R (AGC→CGC) | ygeW | putative carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/4); new base C (109/87); total (113/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.68e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TGCGTGAAACCGCCAATATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGAAGGCTTAAAAG > NC_000913/3006575‑3007144
|
tgcgtgAAACCGCCAATATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTa > 1:1221332/1‑289 (MQ=255)
ctccAATATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTAGTCGCGACGATATGTATCTGCGCGCAGGCAACGCCTATATTCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTCACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCg < 1:818239/287‑1 (MQ=255)
cGCCAATATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCg < 2:391371/289‑1 (MQ=255)
cgaaTATTATCGCCTTCTGCGCCGACGCTATTGTGATTCGGGACGATAGGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct < 2:1196949/287‑1 (MQ=255)
ccAATATTATCTCGTTCTGCGCGGACCCTATTGGTATTCCCAACGATATCTATCTGGGCGGAGGGAACGCCGATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCAGTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCGACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct < 2:1221332/289‑1 (MQ=255)
ccAATATGCTCTCCTTCTGCGCCACCGCTATTAGTATTCGCGACTATATTTATCTGGACCCAGGCAACGCCTATATGCGTGCAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACGGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct < 1:1056316/289‑1 (MQ=255)
aaTATGATGTCCTACTGGGCGAACACTTTTGGTATTCGCGACTATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctct < 2:515024/289‑1 (MQ=255)
aaTATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctct < 1:1149722/289‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGTTGACCTCGCGTGGTTACGTAAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACca < 2:914610/283‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGTTGACCTCGCGTGGTTACGTAAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACca > 1:914610/1‑283 (MQ=255)
cgcCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGcat > 2:324511/1‑288 (MQ=255)
cgcCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGcat > 2:710132/1‑288 (MQ=255)
cgcCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCCCCCTGTACCACCAGGcatc > 2:1113430/1‑289 (MQ=255)
gcctaggCTATTGGTATTCGCGACGTTATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGcatca < 2:653654/283‑1 (MQ=255)
aCGCTATTGGTATTCGCGATGATATGTATCCGGGCGCAGGCAACGACTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCTGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGCGAACCTGCAATGCGACATTGCCTACCCGACTCAGTCCATCGCTGAGCTCGCGTGGTTACGGGAACACTTTGGTTCACTTCAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGAACCGGGCCGACTCTCCACGCCATGGCAACCAGACCCCTGTACCACCAgcaactatccg > 2:680572/1‑279 (MQ=255)
tATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACt < 1:679919/289‑1 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTAGGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGATCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCt > 2:1146371/1‑289 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGACAGGTAAAAAAATCGCAATGACCTGGGCCTACTCTCAACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACCCGCt > 2:127086/1‑289 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTg > 1:828249/1‑256 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTg < 2:828249/256‑1 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCt > 1:42392/1‑289 (MQ=255)
cgcgACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCt > 1:104430/1‑289 (MQ=255)
gacgaTATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCg < 1:860000/289‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTc > 2:326277/1‑289 (MQ=255)
ggCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCAcgc > 2:883795/1‑287 (MQ=255)
cAGGCAACGCCCACATGCGTGAAGCTGGCGCTGCACTCGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCACTGCGCTATCGACCACCCGACTCAGTCAACGGCTGACCCCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACAGGATAACCTTCCAGGTAACAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTTCCGCCAACAGCGCTCCGTACGACAACGAATGATCGGTCCGATCACTTGTCCCGGTAGGGAAGTCatcaggca > 2:1023298/1‑282 (MQ=255)
ggCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGccc < 2:730018/289‑1 (MQ=255)
gCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCa > 1:1004897/1‑289 (MQ=255)
ccTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 1:920208/289‑1 (MQ=255)
ccTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 1:387429/289‑1 (MQ=255)
tatGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGc > 2:562895/1‑289 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGAc < 2:359715/289‑1 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGGTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGAc > 1:1047472/1‑289 (MQ=255)
gAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGAcc > 1:244867/1‑289 (MQ=255)
aaGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGAc < 2:643898/287‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 2:694871/272‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATcc > 2:345242/1‑289 (MQ=255)
aCGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAg < 1:1019568/288‑1 (MQ=255)
cGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCCGATCCCGGATGTGGTTGAAGTg > 1:1031458/1‑289 (MQ=255)
ttACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGc > 1:126997/1‑288 (MQ=255)
ttACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGc > 1:962857/1‑288 (MQ=255)
cAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACa < 1:336280/289‑1 (MQ=255)
cAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACa < 1:1131895/289‑1 (MQ=255)
aGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACaa > 1:815349/1‑289 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGTCAAACTGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTTGGTATGGATGTCACCCGGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGGTGTTGCATTGGCCAAAAACACTg > 2:918166/1‑289 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAACACAATg > 2:439277/1‑289 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAACACAATg > 2:442828/1‑289 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATg > 1:644121/1‑289 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATg > 1:1196123/1‑289 (MQ=255)
gtgtACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAACCCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGCCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCCCCCTGGCCCATCCGGAAGGCCACGACCTGACCCCGGATGCGGTTGAAGGGGCTAAAACCAATg > 1:1235286/1‑288 (MQ=255)
tACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGCTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTa > 1:569647/1‑288 (MQ=255)
gCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGcc > 1:35743/1‑289 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTc > 1:1050519/1‑289 (MQ=255)
caGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAACAAACGCTACCGCCTCCg > 2:808160/1‑289 (MQ=255)
caGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCg > 1:695312/1‑289 (MQ=255)
gCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAGAAACAATGCTAAAGCCTCCggt > 2:774413/1‑289 (MQ=255)
gCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCggt > 1:1071243/1‑289 (MQ=255)
gCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCggt > 2:233590/1‑289 (MQ=255)
cGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAg > 2:150402/1‑289 (MQ=255)
gTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGt < 1:907101/288‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAg < 1:503559/288‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAg < 1:223960/288‑1 (MQ=255)
ccTGCAATGCGATATTGACCACACGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTc > 2:279513/1‑289 (MQ=255)
tGCGATGTTGGCCACCCGACTCAGTCAATGGCTTACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGGTAACTGGAAAACCTGAGAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCa < 2:246830/289‑1 (MQ=255)
tGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCa < 1:251803/289‑1 (MQ=255)
ttGACCACCAGACTAAGGCAATGGATTGCGACGCGTGGTTACGTGAACACTTGTGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTACAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACGCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCAGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGgaaga < 1:821185/289‑1 (MQ=255)
tGACCCCCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGgaaga < 2:780646/288‑1 (MQ=255)
accaccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGACGAAGc > 1:150784/1‑289 (MQ=255)
accaccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGc > 1:176750/1‑289 (MQ=255)
accaccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGc > 1:467589/1‑289 (MQ=255)
accaccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGc > 1:378785/1‑289 (MQ=255)
ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAACGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGACGAAGCCTTc > 2:89551/1‑288 (MQ=255)
ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTc > 1:1068968/1‑288 (MQ=255)
tGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGtt > 2:852348/1‑289 (MQ=255)
gACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGCAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCTCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAACACAATGCTAAAGCCCCCGGTGGTAGCTGCCGCCAGTTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGttt > 1:745633/1‑289 (MQ=255)
cgTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGaa < 1:1036988/289‑1 (MQ=255)
gTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTACCCGAAgcaa > 2:945727/1‑286 (MQ=255)
gTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGc < 1:305623/289‑1 (MQ=255)
tGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCa < 1:1146371/289‑1 (MQ=255)
tGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCa < 1:945727/289‑1 (MQ=255)
aaCACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCAcc < 1:837455/289‑1 (MQ=255)
acTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTa > 1:715735/1‑289 (MQ=255)
tGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGACGAAGCCTTCAAAGCAGCAGACATCGTTTATCCGCAGCCATGCGCACCTTACa > 2:1166206/1‑287 (MQ=255)
tGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCT‑CACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGATGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAg > 1:18412/1‑289 (MQ=255)
gTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAg < 1:324511/288‑1 (MQ=255)
cgctgtgaaaCCTGAAAGGTAAGAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGa < 2:1036516/281‑1 (MQ=255)
tGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 1:996450/136‑1 (MQ=255)
tGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTGAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATgg > 1:200665/1‑288 (MQ=255)
gaaaCCTGAAAGGGAAAGAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCGCCGCTATGGCAAACCGCTCGCTGTACCACAAGGCGTCATCGGTCTGATGCCTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGGTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAGAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAaga < 2:865863/288‑1 (MQ=255)
aaaaCCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAaga < 2:1179158/289‑1 (MQ=255)
aaaaCCGTAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGCGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAaga < 2:104430/289‑1 (MQ=255)
aaaaaaTCGCCATGACCTTGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCAt < 2:30690/249‑1 (MQ=255)
aaaaaaTCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTATACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATtgct > 1:1081468/1‑289 (MQ=255)
gCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCtgcgtgcg < 1:550742/288‑1 (MQ=255)
gggCCTACTCTCCACGGTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCGCAAGGGATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGa < 2:1228710/289‑1 (MQ=255)
ggCCTACTCTCCCGGCTATGAGAAACCGCTCGCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGa < 2:483410/288‑1 (MQ=255)
ggCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTACCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGa < 1:1113430/288‑1 (MQ=255)
ctctCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACTCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGAAGGCtt > 1:371424/1‑288 (MQ=255)
ccACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGAAGGCTTAAAAg > 2:1182811/1‑289 (MQ=255)
ccACGCTATGGCAAACCGCCCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCCTCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGGTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTACGTCAGGTCACCAGAATGGAAGAAGCCTTCAAAGAAGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCGGCGTGCGAACGATCCCGAAGGCTTaa > 2:665158/1‑286 (MQ=255)
|
TGCGTGAAACCGCCAATATGATCTCCTTCTGCGCCGACGCTATTGGTATTCGCGACGATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGATGGAAGAGCGTACTGAATTGCTGCGTGCGAACGATCACGAAGGCTTAAAAG > NC_000913/3006575‑3007144
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
