Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F88 I2 R1
|
8 |
93.0 |
2080396 |
95.7% |
1990938 |
211.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,006,859 |
A→C |
S200R (AGC→CGC) |
ygeW → |
putative carbamoyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,006,859 | 0 | A | C | 100.0%
| 342.4
/ NA
| 96 | S200R (AGC→CGC) | ygeW | putative carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (49/47); total (49/47) |
GATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGAT > NC_000913/3006631‑3007094
|
gaTATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCa > 2:906574/1‑238 (MQ=255)
gaTATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCa < 1:906574/238‑1 (MQ=255)
aTCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct < 2:215070/238‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctct < 1:493406/239‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctct < 1:781290/239‑1 (MQ=255)
ggCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCCCAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctc > 1:1016777/1‑234 (MQ=255)
ggCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTAAAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctc > 1:552240/1‑234 (MQ=255)
cgcAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGctc > 2:316508/1‑232 (MQ=255)
cAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTAcc > 2:924506/1‑238 (MQ=255)
ggCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGTGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGGGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACcaca > 1:388137/1‑239 (MQ=255)
cAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACcac < 1:316508/236‑1 (MQ=255)
gTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCgg > 2:861950/1‑235 (MQ=255)
gTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCgg > 2:782593/1‑235 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGGGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAgg < 2:268704/225‑1 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAgg > 1:268704/1‑225 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtga > 2:924384/1‑239 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtga > 1:266441/1‑239 (MQ=255)
tGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtga > 1:866111/1‑239 (MQ=255)
gAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtgat > 2:299879/1‑239 (MQ=255)
ggCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTc > 1:776188/1‑238 (MQ=255)
cgcTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGGGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGc < 1:320580/238‑1 (MQ=255)
gcTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCt < 1:299879/238‑1 (MQ=255)
gcTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACATGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCtt < 1:924384/239‑1 (MQ=255)
cTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACACAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGATCACTTTGGTTCACTGGAAAACCCGAAAGGTAAAAAAATCGCCAGAACCTGGGCCTCGTCTCCGCGCTATTGGAGACCGCTCTTTGTTCCACAAGGCATCATCGGTCTGATGCCTCGCtt < 2:824294/238‑1 (MQ=255)
cTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTAt < 1:924506/239‑1 (MQ=255)
tgaCGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATg < 1:666189/239‑1 (MQ=255)
cGGTTACAAGCTGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGAATCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATg > 1:987757/1‑232 (MQ=255)
ttACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct > 1:104524/1‑183 (MQ=255)
ttACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGct < 2:104524/183‑1 (MQ=255)
ggTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATcc > 1:221423/1‑239 (MQ=255)
gtgtACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACCCTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGc < 2:875385/232‑1 (MQ=255)
gtgtACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATcc < 1:749802/238‑1 (MQ=255)
tACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCACACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGAt > 2:339630/1‑218 (MQ=255)
tACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGcatcat > 2:301935/1‑190 (MQ=255)
tACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGcatcat < 1:301935/190‑1 (MQ=255)
tACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGAt < 1:339630/218‑1 (MQ=255)
cTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAg > 2:39512/1‑238 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCTCCCGACTTAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTCCGTGATCACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCGGGGCCTACCATCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTATCACAAGGCATCATTGGTCTGATGACCCGCTTCGGCCTGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGTAGGCTa > 2:755013/1‑238 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa > 2:454164/1‑232 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 1:454164/232‑1 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTAc > 1:275352/1‑239 (MQ=255)
cacaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTAc > 1:588782/1‑239 (MQ=255)
acaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGGTCTCTGTACCACAAGGCAGCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa < 2:334361/231‑1 (MQ=255)
acaGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGa > 1:334361/1‑231 (MQ=255)
gTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTa < 1:782593/232‑1 (MQ=255)
gTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACg < 1:861950/234‑1 (MQ=255)
cGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTAt > 2:341827/1‑199 (MQ=255)
cGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTAt < 1:341827/199‑1 (MQ=255)
ttAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACGCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCGCTGGAAAACCTGGAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCCCCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGa < 1:755013/239‑1 (MQ=255)
tAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGAt < 2:866111/239‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATcc < 1:725477/229‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATcc > 2:725477/1‑229 (MQ=255)
atTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGaaaaa < 2:221423/239‑1 (MQ=255)
tGACCCCCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTACCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCAGCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGATACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACa < 1:528400/239‑1 (MQ=255)
caccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCtt > 2:509580/1‑161 (MQ=255)
caccCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCtt < 1:509580/161‑1 (MQ=255)
ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAGTCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTaa > 1:255067/1‑239 (MQ=255)
ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTaa > 2:567702/1‑239 (MQ=255)
ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTaa > 1:469425/1‑239 (MQ=255)
cGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTaaa < 2:469425/239‑1 (MQ=255)
gACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACTCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCt > 1:729230/1‑198 (MQ=255)
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cGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAg < 2:266441/239‑1 (MQ=255)
gTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACa > 1:611789/1‑198 (MQ=255)
gTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACa < 2:611789/198‑1 (MQ=255)
acTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGgaa > 2:416071/1‑239 (MQ=255)
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tCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAg < 2:588782/239‑1 (MQ=255)
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gCCATGACCTGGGCCTACTCTCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCggtgg > 2:1013878/1‑173 (MQ=255)
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ctctCCACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAg > 1:249490/1‑239 (MQ=255)
ccACGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGAt > 1:410593/1‑239 (MQ=255)
|
GATATGTATCTGGGCGCAGGCAACGCCTATATGCGTGAAGTTGGCGCTGCACTTGATGACGGTTACAAGCAGGGTGTACTGCCACAGCGTCCGGCTTTAGTGAACCTGCAATGCGATATTGACCACCCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCAGACATCGTTTATCCGAAGTCATGGGCACCTTACAAAGTGAT > NC_000913/3006631‑3007094
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
