Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F236 I1 R1
|
155 |
93.2 |
2393300 |
97.8% |
2340647 |
180.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,752,058 |
A→C |
I23L (ATC→CTC) |
yiaU → |
putative DNA‑binding transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,752,058 | 0 | A | C | 100.0%
| 266.6
/ NA
| 70 | I23L (ATC→CTC) | yiaU | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (38/32); total (38/32) |
AAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATATCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATGAGAAACGTGGTCGGGTCA > NC_000913/3751836‑3752286
|
aaaTAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGa < 1:142314/238‑1 (MQ=255)
ccACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTAATTg > 2:382893/1‑239 (MQ=255)
ttGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGATAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGca < 1:386504/239‑1 (MQ=255)
cGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAg > 1:705897/1‑239 (MQ=255)
aattaaCATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCa > 2:649461/1‑238 (MQ=255)
aattaaCATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTT‑‑AAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACg > 1:998007/1‑239 (MQ=255)
tCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGc < 1:649461/239‑1 (MQ=255)
ttttAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGAt > 2:875859/1‑239 (MQ=255)
tAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGAtttt > 2:582271/1‑239 (MQ=255)
tAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTT‑‑AAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGt < 2:998007/238‑1 (MQ=255)
ataataATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTc < 2:705897/238‑1 (MQ=255)
tGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCg > 1:522337/1‑239 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACt < 1:526513/162‑1 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACt > 2:526513/1‑162 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAatat < 1:1028763/193‑1 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAatat > 2:1028763/1‑193 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGa > 2:851260/1‑238 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGa > 1:8358/1‑238 (MQ=255)
cTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGa > 2:482301/1‑238 (MQ=255)
aCAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCa > 1:395066/1‑144 (MQ=255)
aCAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCa < 2:395066/144‑1 (MQ=255)
ttCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCgg < 1:582271/239‑1 (MQ=255)
gTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGa > 2:626739/1‑239 (MQ=255)
gCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGAt < 2:8358/238‑1 (MQ=255)
tatataGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTg > 1:634748/1‑238 (MQ=255)
gTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACcgc > 2:737312/1‑239 (MQ=255)
aaTATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACcgcg < 1:482301/238‑1 (MQ=255)
atatatAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCAACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCt > 2:1089539/1‑212 (MQ=255)
atatatAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCAACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCt < 1:1089539/212‑1 (MQ=255)
aaTTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGt > 1:736398/1‑239 (MQ=255)
aaTTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGt < 1:737312/239‑1 (MQ=255)
atatataATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACAt < 1:981495/239‑1 (MQ=255)
tatataATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATc > 1:56344/1‑239 (MQ=255)
aaTTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACt > 2:680661/1‑99 (MQ=255)
aaTTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACt < 1:680661/99‑1 (MQ=255)
aaTTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGca > 1:382137/1‑114 (MQ=255)
aaTTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGca < 2:382137/114‑1 (MQ=255)
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ttGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGcc > 1:998740/1‑118 (MQ=255)
ttGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGt < 2:76127/156‑1 (MQ=255)
ttGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGt > 1:76127/1‑156 (MQ=255)
ttGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTca < 2:427929/200‑1 (MQ=255)
ttGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTca > 1:427929/1‑200 (MQ=255)
gggCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATg < 1:626739/239‑1 (MQ=255)
gggCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATg < 1:851260/239‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACAt < 1:976997/228‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACAt > 2:976997/1‑228 (MQ=255)
ttGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGt < 2:141235/148‑1 (MQ=255)
ttGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGt > 1:141235/1‑148 (MQ=255)
ttGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGAc > 2:1008271/1‑239 (MQ=255)
gCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTAc < 2:751056/214‑1 (MQ=255)
gCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTAc > 1:751056/1‑214 (MQ=255)
cTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTtaataa < 2:56344/239‑1 (MQ=255)
gggAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCa < 2:634748/239‑1 (MQ=255)
ggAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTCCATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTACTAATTTTATTGCAg > 2:568484/1‑239 (MQ=255)
ggAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCa > 1:357867/1‑238 (MQ=255)
ggAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCa < 2:357867/238‑1 (MQ=255)
ggAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAg > 1:1155551/1‑239 (MQ=255)
gAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTg < 2:522337/235‑1 (MQ=255)
aaaaaTTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCACCTTAATAATTTTATTGCAGATtata > 1:1048896/1‑239 (MQ=255)
ttATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCAt > 1:551010/1‑239 (MQ=255)
tATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGCCATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATg > 2:877196/1‑239 (MQ=255)
aTCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATga > 2:607903/1‑239 (MQ=255)
gTAATCGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATGAGAAACg > 2:876043/1‑239 (MQ=255)
cGCTGCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATGAGAAACGTGGTc < 2:551010/239‑1 (MQ=255)
gCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCgcgc > 2:457084/1‑151 (MQ=255)
gCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCgcgc < 1:457084/151‑1 (MQ=255)
gCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTtaat < 1:573207/198‑1 (MQ=255)
gCCAGTGAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTtaat > 2:573207/1‑198 (MQ=255)
gAAAATCTCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATGAGAAACGTGGTCGGGTCa < 1:201944/235‑1 (MQ=255)
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AAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATATAGTAATATATAAAATTATATATAATTGGGCTGTTGCGATGACAAAATTACAACTTAAGTACCGGGAGTTAAAAATTATCTCGGTAATCGCTGCCAGTGAAAATATCAGCCATGCCGCGACTGTACTTGGCATCGCACAGGCCAACGTCAGCAAATATCTTGCTGATTTTGAATCAAAAGTGGGTTTAAAAGTCTTTGACCGAACCACCCGGCAGCTGATGCTCACACCTTTTGGCACCGCGCTGTTACCGTACATCAACGACATGCTGGACAGAAACGAGCAACTTAATAATTTTATTGCAGATTATAAGCATGAGAAACGTGGTCGGGTCA > NC_000913/3751836‑3752286
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
