Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,765,971 |
IS2 (+) +5 bp |
coding (3789‑3793/4134 nt) |
rhsA → |
Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
3186096 = | NA (NA) | 158 (1.010) |
97/198 |
0.2 |
96.2% |
noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3765975 |
6 (0.040) | coding (3793/4134 nt) |
rhsA |
Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3187426 | NA (NA) | 158 (1.010) |
84/198 |
0.8 |
96.2% |
noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
3765971 = |
6 (0.040) | coding (3789/4134 nt) |
rhsA |
Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186194‑3186096
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTGAT < NC_000913/3765975‑3765877
TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAC > 1:1558445/1‑100
TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAC > 1:636058/1‑100
CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACA > 1:3093963/1‑100
CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACA < 2:1371085/100‑1
AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAG < 2:580787/100‑1
ATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGG < 1:3445608/100‑1
TCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGG < 1:2970108/100‑1
CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGC > 1:1089035/1‑100
CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTT < 1:1341603/100‑1
TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTT > 1:1572781/1‑100
TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGG < 1:1707817/100‑1
TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGG < 1:2211304/100‑1
TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGG > 1:202856/1‑100
CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGC > 2:3535466/1‑100
TCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCC < 1:2015175/100‑1
CAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCAT > 2:2248407/1‑100
AATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATG < 2:1237433/100‑1
ATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGG < 2:845334/100‑1
GACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAA > 2:1707523/1‑100
GACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAA > 2:1707595/1‑100
ACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAAT < 1:2598847/100‑1
ACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAAT > 1:2861610/1‑100
CTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATT < 2:3049713/100‑1
AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGG < 1:136716/100‑1
GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGC > 1:889443/1‑100
TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCA < 1:1793/100‑1
TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCA > 1:426530/1‑100
CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAA > 2:110455/1‑100
CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAA < 1:2901410/100‑1
AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGG < 1:1898874/100‑1
AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGA < 2:1414645/100‑1
ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAA < 2:2840644/100‑1
CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAAT < 1:1058808/100‑1
CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAAT > 1:3671389/1‑100
AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGG > 1:1000888/1‑100
AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGG < 1:1695013/100‑1
GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGT > 1:443446/1‑100
TATTAAGGCTATCACTGAGTTAGGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTC < 2:440096/100‑1
TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAG < 2:1207944/100‑1
TAAGACTATCACTTATTTAAGGGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGTCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGATTGGTCTAG < 2:3840671/100‑1
accaaTATCACTTAAATAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGG > 2:2340622/6‑100
AAGACTATGACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATCGTCTAGG < 2:3005433/100‑1
caaTATCACTTAAATAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAA > 1:1920997/4‑100
GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAA > 2:1231085/1‑100
aaTATCACTTAAATAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCAAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAA > 2:3934918/3‑100
CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAA > 1:2775625/1‑100
ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGGCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAAC < 1:1312675/100‑1
ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAAC < 2:3260211/100‑1
ATCACTTATTTAAGTGAGATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCGACAGGTCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAAC < 2:2400514/100‑1
TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACT < 2:2770850/100‑1
CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTT > 2:555027/1‑100
ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTC > 1:334176/1‑100
ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTC < 2:3205521/100‑1
TTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTA > 1:1771657/1‑100
TATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCGGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAA > 1:949604/1‑100
TATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAA > 1:527407/1‑100
TATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAA > 1:3032073/1‑100
TATTTAAGCGATATCGGTTGTATGGAGATGCAGGGGGCCGGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGCGACTGGCCTAGGAAAAACATCTAA > 2:3291991/1‑100
ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAAC < 1:507746/100‑1
ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAAC < 2:2630687/100‑1
nTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACC > 1:3247755/2‑100
TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAGACTTCTAACC < 1:3572900/100‑1
TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACC < 1:2153817/100‑1
TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACC < 1:963213/100‑1
TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACC < 1:3613143/100‑1
TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACC > 1:3005588/1‑100
AGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAG > 1:1153265/1‑100
GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGA < 1:2335645/100‑1
GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGA > 2:3324562/1‑100
TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAG < 2:2555862/100‑1
GATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGACCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGG < 1:3553524/100‑1
ATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATC < 2:478128/100‑1
TTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGTCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCT > 2:3616076/1‑100
TTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCT > 1:3962232/1‑100
nGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGT > 1:3245513/2‑100
GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGT > 1:3306877/1‑100
GGTTCTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGT > 2:3380234/1‑100
GTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCGATGATAAACTTCTAACCCCAGAGTATCTGTA > 1:188200/1‑100
TTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTAT < 2:2310404/100‑1
TGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATT > 2:2292313/1‑100
TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAATTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCG < 2:1220566/100‑1
TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCG < 2:1995460/100‑1
TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCG < 1:3063027/100‑1
TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTA > 1:77688/1‑100
GATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTG > 2:2242422/1‑100
ATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGG > 1:2003155/1‑100
TCAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGAT < 1:2280082/100‑1
CAGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATT > 1:2455360/1‑100
AGGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTC < 1:736736/100‑1
GGGGGCCAGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCA > 1:2807801/1‑100
AGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATA > 1:375513/1‑100
AGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATA > 1:595909/1‑100
AGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATA < 2:3583858/100‑1
AGTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATA > 2:3565198/1‑100
GTCTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATAC > 2:3484565/1‑100
cgACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCCGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATCCTG < 1:463278/98‑1
CTACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTG > 1:2399679/1‑100
TACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTGA < 2:3744196/100‑1
ACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTGAT < 1:415759/100‑1
ACAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTGAT > 2:267179/1‑100
TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186194‑3186096
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTGGCAAGGGGAATGGTCTAGGAAAAACTTCTAACCCCAGAGGATCTGTATTCGTAACTGGATTCAACGGATACTGAT < NC_000913/3765975‑3765877
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
