Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F78 I1 R1
|
17 |
139.3 |
7053113 |
93.9% |
6622873 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
932,304 |
C→T |
intergenic (‑254/‑291) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding/leucine‑responsive global transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 932,304 | 0 | C | T | 98.7%
| 537.9
/ ‑2.9
| 155 | intergenic (‑254/‑291) | trxB/lrp | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding/leucine‑responsive global transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (90/63); total (92/63) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGT > NC_000913/932207‑932396
|
tCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCACTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTg < 1:2067098/100‑1 (MQ=255)
cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg > 1:1012079/1‑100 (MQ=255)
cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg > 1:1622866/1‑100 (MQ=255)
ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgt > 1:3502296/1‑100 (MQ=255)
cGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtg < 1:3463281/100‑1 (MQ=255)
cGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCAAATAAAAAAAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg < 1:2714761/98‑1 (MQ=255)
gCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtgt < 2:1495482/100‑1 (MQ=255)
gCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtgt > 2:1941940/1‑100 (MQ=255)
cTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGtt > 1:892817/1‑100 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGttt < 1:1662637/100‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGtttt > 1:694245/1‑99 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTg < 1:804328/100‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTg < 2:1728438/100‑1 (MQ=255)
taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCg > 2:2078200/1‑100 (MQ=255)
taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCg < 2:414754/100‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGa > 2:1922707/1‑100 (MQ=255)
aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaa > 1:241386/1‑100 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaaa < 2:66271/100‑1 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaaaa > 2:2599527/1‑100 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTc > 1:2357073/1‑100 (MQ=255)
aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 2:3133771/100‑1 (MQ=255)
aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 2:2164686/100‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 1:1822662/100‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg > 1:1535055/1‑100 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 2:86245/100‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 1:2981945/100‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg > 2:2895430/1‑100 (MQ=255)
gatgaATAAACGCCCCTGATCATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATTCCTTTGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 1:3238447/96‑1 (MQ=255)
atgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa > 1:1519143/1‑100 (MQ=255)
tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 2:3398944/1‑100 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaagaa > 2:2058289/1‑100 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaagaa > 1:102034/1‑100 (MQ=255)
aTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaa > 1:390459/1‑100 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaa > 1:641891/1‑100 (MQ=255)
aaaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaaa < 2:3275452/100‑1 (MQ=255)
aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaaaca < 2:3263874/100‑3 (MQ=255)
acccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACa > 1:1743542/2‑100 (MQ=255)
cccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCTATGTTTTGCTTTGACAATCGCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAg < 1:1922692/100‑1 (MQ=255)
ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAg < 1:3297377/99‑1 (MQ=255)
ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGt > 2:1507976/1‑100 (MQ=255)
cTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTa > 2:576966/1‑100 (MQ=255)
ttAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTc > 2:495709/1‑100 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 2:2467296/100‑1 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 1:661998/1‑100 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 2:3105630/100‑1 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 2:3186992/1‑100 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 2:1692132/1‑100 (MQ=255)
ctcttccgatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 1:50323/92‑1 (MQ=255)
aaTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCtt > 1:69883/1‑100 (MQ=255)
aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta > 2:3426844/1‑100 (MQ=255)
aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta > 2:3058818/1‑100 (MQ=255)
aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta < 2:3096903/100‑1 (MQ=255)
tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAACAACAGTATTCTtat > 2:1974344/1‑100 (MQ=255)
tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTtat > 1:1802775/1‑100 (MQ=255)
tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTtat > 2:777589/1‑100 (MQ=255)
aaTATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTatat > 1:3411414/1‑100 (MQ=255)
atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg < 2:2946508/100‑1 (MQ=255)
atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg > 1:3104902/1‑100 (MQ=255)
atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg > 1:2647994/1‑100 (MQ=255)
atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATgcg > 1:2596554/1‑100 (MQ=255)
cTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGCTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCa > 2:807703/1‑100 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATa > 1:1997252/1‑100 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:584947/1‑100 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 1:2895410/100‑1 (MQ=255)
cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:1613962/1‑99 (MQ=255)
cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 2:2648011/100‑1 (MQ=255)
aTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa < 2:672473/98‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:2623626/100‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1258441/100‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGAAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:777586/100‑1 (MQ=255)
gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 2:2426411/100‑1 (MQ=255)
gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca > 1:2034438/1‑100 (MQ=255)
aCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg > 1:1362972/1‑100 (MQ=255)
cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt > 1:1754617/1‑100 (MQ=255)
tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 1:971766/1‑100 (MQ=255)
aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaaa > 1:523344/1‑100 (MQ=255)
aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaaa > 2:2805826/1‑100 (MQ=255)
aTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCTAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc > 1:1880502/1‑100 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCa > 2:2152015/1‑100 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCa > 2:1340824/1‑100 (MQ=255)
gATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 2:2411158/100‑1 (MQ=255)
gATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt > 2:10610/1‑100 (MQ=255)
ttttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGttt > 2:1410229/1‑100 (MQ=255)
ttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTan < 1:3426820/100‑2 (MQ=255)
ttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAc > 1:1833249/1‑100 (MQ=255)
tGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAcc < 1:2545031/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAcc < 2:371800/100‑1 (MQ=255)
gCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCg < 2:272827/100‑1 (MQ=255)
cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt > 2:3245952/1‑100 (MQ=255)
cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt > 1:2770226/1‑100 (MQ=255)
cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt < 1:2343822/100‑1 (MQ=255)
cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACAATGCATGAAAATACCATGATTACCGt > 1:3138061/1‑100 (MQ=255)
tttGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:1160892/100‑1 (MQ=255)
ttGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGc > 2:1206234/1‑100 (MQ=255)
tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt < 1:2078184/100‑1 (MQ=255)
tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAACATGCATGTAAATACAATGTTTACCGTGCt > 1:2446975/1‑100 (MQ=255)
tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGAAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt < 1:2058274/100‑1 (MQ=255)
gACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTa > 2:1608092/1‑100 (MQ=255)
cAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:2752602/1‑100 (MQ=255)
cAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:2904562/1‑100 (MQ=255)
|
TCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGT > NC_000913/932207‑932396
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
