Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F124 I1 R1
|
18 |
121.9 |
6003667 |
95.0% |
5703483 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
572,447 |
IS2 (+) +5 bp |
coding (80‑84/102 nt) |
ylcH → |
uncharacterized protein, DLP12 prophage |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
572447 = | 1 (0.010) | 127 (1.050) |
80/198 |
0.3 |
99.2% |
coding (80/102 nt) |
ylcH |
uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| ? | NC_000913 |
1467910 = |
NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 572451 | 1 (0.010) | 146 (1.220) |
93/196 |
0.0 |
99.3% |
coding (84/102 nt) |
ylcH |
uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| ? | NC_000913 |
= 1469240 |
NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TCCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/572545‑572447
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > NC_000913/1467910‑1468008
TCCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTT > 1:407373/1‑100
CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG > 1:1138826/1‑100
CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG < 1:2735847/100‑1
CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG > 2:318279/1‑100
CAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGG < 2:422498/100‑1
AGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGA < 2:1688410/100‑1
GATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGAT > 2:2552684/1‑100
GATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGAT < 1:2371580/100‑1
AAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTG < 1:2985502/100‑1
AAGGCTGGATATGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTG < 1:1882548/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 2:1870073/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 2:2335269/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 2:2659901/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 1:498533/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 2:581092/100‑1
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC > 1:1551409/1‑100
GGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCC < 2:1901135/100‑1
CTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCC < 2:407374/100‑1
GATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTAT > 2:2238210/1‑100
GATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTAT < 2:2790701/100‑1
ATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATA < 1:2055878/100‑1
TCTGCCGACCGAGAGCGGTGGAGTTGCCGCGATGTAATTTTATGCCGTCTTGTGAGACGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTAT < 1:2827535/98‑1
TGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCACTCCGCAGGGGTTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:2020038/1‑100
GCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTC < 2:2730214/100‑1
GCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTC > 1:2600255/1‑100
CCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 2:1119480/100‑1
GACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTTAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 2:205796/100‑1
GACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 1:2398076/100‑1
GACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 2:562540/100‑1
GACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 2:628639/100‑1
GACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 2:730119/100‑1
atCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:1457048/98‑1
CCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:2535206/1‑100
CGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 2:521732/100‑1
CGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA > 1:1702675/1‑100
GATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT > 2:1799818/1‑100
ATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:2328990/100‑1
ATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:540065/100‑1
AGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:1650716/100‑1
AGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATCTCCAGACATCTG < 2:1971218/100‑1
GCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT > 1:1151702/1‑100
GGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA > 1:1284025/1‑100
TGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 2:1378510/100‑1
GAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:397289/100‑1
GAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 2:1124302/100‑1
AAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 2:469412/100‑1
AAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 2:1467548/100‑1
AGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:1306730/100‑1
AGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:522111/100‑1
GTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCACCTCCGCAGAAGTGAGATCTGCCCCTATATCTCCAGACACCTGTTATC > 1:184461/1‑96
TTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 2:2976736/100‑1
TTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 2:1701082/100‑1
GCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 2:2285955/1‑100
CCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTACCC < 1:2664936/100‑1
CCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC > 2:51925/1‑100
CCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC > 2:2444843/1‑100
CGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 2:2725832/1‑100
TGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC > 1:401020/1‑100
TAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 2:251899/100‑1
TAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA > 1:42691/1‑100
AATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 2:2668334/100‑1
ATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 1:2725817/100‑1
ATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 2:914246/1‑100
TTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:1239524/100‑1
TTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC > 1:2319780/1‑100
GATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 2:1088867/1‑100
TGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCAATTACAAGCCCGCTG > 2:2951902/1‑100
CCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC > 2:2310440/1‑100
GTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTCTCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC > 2:978218/1‑100
TCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 1:2259311/100‑1
TCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 2:992934/100‑1
TCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 2:2342598/100‑1
TCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 2:2600267/100‑1
CTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG < 1:2413097/100‑1
CTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 2:592469/1‑100
TTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA < 2:703855/100‑1
TTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA < 1:862362/100‑1
GTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 2:1353053/1‑100
TGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 1:891603/1‑100
GAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTCACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCC < 2:2843837/100‑1
GTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGT > 1:2396205/1‑100
TTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTG > 1:957345/1‑100
TCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG > 2:2809769/1‑100
TCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG > 2:1694540/1‑100
CGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA > 2:2132470/1‑100
CGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 2:2799459/99‑1
CTTCCCCTCCGCAGCGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACACGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 1:1433177/1‑100
CTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC < 1:1984767/100‑1
CTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC < 2:1138832/100‑1
CTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 2:688954/1‑100
CTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACCTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC < 1:632530/100‑1
CCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT < 2:401732/100‑1
CCTCCGCAGAGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAA > 1:560621/1‑100
CTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGATCGATAAC < 2:1577739/100‑1
CTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < 1:1539367/100‑1
CCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCC < 2:687374/100‑1
AGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 2:1333818/1‑100
GTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 2:1552941/1‑100
TTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < 1:1382868/100‑1
TTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < 1:2298101/100‑1
TCCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/572545‑572447
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > NC_000913/1467910‑1468008
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
