Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F124 I1 R1
|
18 |
121.9 |
6003667 |
95.0% |
5703483 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,186,293 |
C→T |
A315V (GCG→GTG) |
rpoC → |
RNA polymerase, beta prime subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,186,293 | 0 | C | T | 100.0%
| 339.3
/ NA
| 95 | A315V (GCG→GTG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (47/48); total (47/48) |
GGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGT > NC_000913/4186198‑4186389
|
ggATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATc < 1:1964105/100‑1 (MQ=255)
ggATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATc < 2:268647/100‑1 (MQ=255)
aTCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGTGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCa > 1:2761638/1‑99 (MQ=255)
aTCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCAc > 2:179835/1‑100 (MQ=255)
tCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCAcc > 1:1062579/1‑100 (MQ=255)
ngCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGt > 1:354258/2‑100 (MQ=255)
ggCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGGCGTGTGATCACCgg > 1:1934341/1‑99 (MQ=255)
gCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGtt < 1:2606021/100‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTc < 1:1402557/100‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACCAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTc < 1:595880/100‑1 (MQ=255)
gcgcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTa < 2:1412688/100‑1 (MQ=255)
gcgcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTa < 1:2134311/100‑1 (MQ=255)
cgcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTaa < 2:95344/100‑1 (MQ=255)
gcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAAc < 1:1118620/100‑1 (MQ=255)
gcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAAc > 2:808569/1‑100 (MQ=255)
gcCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGATCTaa > 1:111859/1‑99 (MQ=255)
ccGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACa < 1:2565261/100‑1 (MQ=255)
ccGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACa > 2:1498219/1‑100 (MQ=255)
ggACATCATCGTACGTAACGAAAATCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGTCGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCCTGTGATCACCGGTTCTAACAAg < 1:2796419/100‑1 (MQ=255)
ggACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAg > 1:2111493/1‑100 (MQ=255)
atcGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCctc > 1:1631095/1‑100 (MQ=255)
tcGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCctct < 2:2788407/100‑1 (MQ=255)
cgtacgtaACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTg < 2:1016080/100‑1 (MQ=255)
ntacgtaACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGa > 1:1555516/2‑100 (MQ=255)
tacgtaACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGaa > 2:2001608/1‑100 (MQ=255)
cgtaACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAAt < 2:1687029/100‑1 (MQ=255)
cgtaACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAAt < 2:1687131/100‑1 (MQ=255)
taACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCt > 2:230845/1‑100 (MQ=255)
aaCGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCtt > 1:624592/1‑100 (MQ=255)
aaCGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCtt < 1:155114/100‑1 (MQ=255)
aCGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCttt > 1:2285705/1‑100 (MQ=255)
cGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTg < 1:1090237/100‑1 (MQ=255)
cGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTg > 2:1792245/1‑100 (MQ=255)
gAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTgg > 2:936844/1‑100 (MQ=255)
gAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTgg > 1:438315/1‑100 (MQ=255)
gAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTgg < 1:1440730/100‑1 (MQ=255)
gAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTg < 1:883987/99‑1 (MQ=255)
aaaaaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGc < 1:167528/100‑1 (MQ=255)
aaaaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGcc > 1:462211/1‑100 (MQ=255)
aaaaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGcc > 1:2622610/1‑100 (MQ=255)
aaaaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGcc > 2:2685359/1‑100 (MQ=255)
aaaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCg < 2:2676739/100‑1 (MQ=255)
aaCGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCg > 1:1062201/1‑99 (MQ=255)
gctgcAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATc > 1:2857982/1‑100 (MQ=255)
gctgcAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATc > 2:664597/1‑100 (MQ=255)
ctgcAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCa < 1:2342508/100‑1 (MQ=255)
gcAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCaaa > 2:1559629/1‑100 (MQ=255)
cAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAg < 1:100800/100‑1 (MQ=255)
cAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAg > 1:1169846/1‑100 (MQ=255)
cAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAg < 2:319771/100‑1 (MQ=255)
cAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAg < 1:2443240/100‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTGACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAgg < 2:1520978/100‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAgg < 1:2329909/100‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAgg < 2:2437331/100‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAgg < 2:1521063/100‑1 (MQ=255)
aagtggTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTaa < 2:2761653/96‑1 (MQ=255)
ggTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAg > 1:2895694/1‑100 (MQ=255)
ggTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAg < 2:316264/100‑1 (MQ=255)
tAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAggg > 2:1094354/1‑100 (MQ=255)
aGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGt < 2:329314/100‑1 (MQ=255)
aGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGt > 2:1544491/1‑100 (MQ=255)
aCGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCg > 2:2690883/1‑100 (MQ=255)
cGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGt > 1:1924427/1‑100 (MQ=255)
cccTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGttt > 1:2634571/1‑100 (MQ=255)
cccTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGttt > 1:2634495/1‑100 (MQ=255)
ctgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTcc > 1:2824859/1‑100 (MQ=255)
tgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCg > 2:1949585/1‑100 (MQ=255)
gctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGt < 2:149462/100‑1 (MQ=255)
gctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGt < 1:2001600/100‑1 (MQ=255)
ctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTc < 1:21510/100‑1 (MQ=255)
tgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCa < 1:179834/100‑1 (MQ=255)
tgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCa > 2:2035852/1‑100 (MQ=255)
ggATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAg > 1:570975/1‑100 (MQ=255)
ggATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAg > 2:1653043/1‑100 (MQ=255)
ggATAACGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAg > 1:2949503/1‑100 (MQ=255)
gATAACGGTTGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGATATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAg < 1:1963280/99‑1 (MQ=255)
aaCGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAAcc < 1:1498211/100‑1 (MQ=255)
aCGGTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCt > 1:374769/1‑100 (MQ=255)
aCGGTCGTCGCGGTCCTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCt < 2:2949520/100‑1 (MQ=255)
ggTCGTCGCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGc < 2:589639/100‑1 (MQ=255)
tcgtcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTc < 1:1277491/100‑1 (MQ=255)
cgtcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCg > 2:777498/1‑100 (MQ=255)
gtcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCgg > 2:2437403/1‑100 (MQ=255)
gtcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCgg < 2:474615/100‑1 (MQ=255)
gtcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCgg > 1:887978/1‑100 (MQ=255)
tcgCGGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGt < 2:1078637/100‑1 (MQ=255)
cgcgGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTa > 1:203173/1‑100 (MQ=255)
cgcgGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTa > 2:909146/1‑100 (MQ=255)
cgcgGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTa > 1:62687/1‑100 (MQ=255)
cgGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAg < 2:2994340/100‑1 (MQ=255)
cgGTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAg < 2:2737269/100‑1 (MQ=255)
ggTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGc > 1:1094042/1‑100 (MQ=255)
ggTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGc < 2:1436676/100‑1 (MQ=255)
ggTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGc < 2:688175/100‑1 (MQ=255)
gTCGTGTGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGcn < 1:2449792/100‑2 (MQ=255)
gtgtGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCgtgt > 2:440376/1‑100 (MQ=255)
|
GGATCTGGCTGCGCCGGACATCATCGTACGTAACGAAAAACGTATGCTGCAGGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGT > NC_000913/4186198‑4186389
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
