Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F201 I0 R1
|
306 |
176.9 |
8831342 |
93.4% |
8248473 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,214,649 |
A→T |
31.2% |
I124F (ATC→TTC) |
metA → |
homoserine O‑transsuccinylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,214,649 | 0 | A | T | 31.2%
| 206.4
/ 139.2
| 154 | I124F (ATC→TTC) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/57); new base T (25/23); total (74/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.76e-01 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
ACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTCCTA > NC_000913/4214551‑4214748
|
cTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATc < 2:1056344/100‑1 (MQ=255)
tttGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCa < 1:1043637/100‑1 (MQ=255)
ttGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaa < 1:3557111/100‑1 (MQ=255)
ttGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCaa < 2:79172/100‑1 (MQ=255)
tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCaaa > 2:380941/1‑100 (MQ=255)
gAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAAc < 1:642481/100‑1 (MQ=255)
gAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAAc < 1:748950/100‑1 (MQ=255)
gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAgg > 2:2732843/1‑100 (MQ=255)
gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCGGGTTGATTTTAATGATGTCTCTTACTGGCCGCAGATCAAACggg < 1:2456238/100‑1 (MQ=255)
tatTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTg > 2:1009293/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCt > 1:1942776/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCt > 2:3189190/1‑100 (MQ=255)
tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTg > 2:4257975/1‑100 (MQ=255)
cAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTgg < 1:1249956/100‑1 (MQ=255)
cAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTgg < 1:2153042/100‑1 (MQ=255)
cAGGATCAGAACTTTGAAGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTg > 1:584873/1‑99 (MQ=255)
ggATCAGAACTTTGACGGTTTTATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAg < 1:4028821/100‑1 (MQ=255)
ggATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAg < 1:4378554/100‑1 (MQ=255)
ggATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAg > 2:776198/1‑100 (MQ=255)
aTCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTg > 2:4071218/1‑100 (MQ=255)
cAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGt < 1:2393565/100‑1 (MQ=255)
aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc > 2:1510416/1‑100 (MQ=255)
gAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCg > 2:905790/1‑100 (MQ=255)
aCTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaa < 2:3286074/100‑1 (MQ=255)
tttGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAg > 2:123050/1‑100 (MQ=255)
ttGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTGAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAg > 1:2483634/1‑99 (MQ=255)
ttGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGa < 1:2590727/100‑1 (MQ=255)
gACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATc < 2:2195554/100‑1 (MQ=255)
aCGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCGGCAGATCAAACAGGTGCTGGTGTGGTCGAAAGATCa > 2:4351781/1‑100 (MQ=255)
aCGGTTTGATGGTAACTTGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAATGATGGCTCTTACTTGCCTCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCa < 1:4169268/100‑1 (MQ=255)
cGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCAc > 2:1936816/1‑100 (MQ=255)
cGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCAc > 2:562479/1‑100 (MQ=255)
ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 2:1759893/100‑1 (MQ=255)
ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 2:4241661/100‑1 (MQ=255)
ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCCGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 1:104861/100‑1 (MQ=255)
tttGATTGTAACTGGTGCGGCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCTCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 1:991015/98‑1 (MQ=255)
tttGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTc > 1:209482/1‑100 (MQ=255)
tGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGATTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAATGATTACGTCAc < 1:2314203/100‑1 (MQ=255)
tGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAc > 1:4104101/1‑100 (MQ=255)
gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAcc > 1:4267233/1‑100 (MQ=255)
gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCATGGTGCAGATTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCCAAACGGTGCCGGAGTCGTCGAAAGATCAAGTCAcc > 1:3654020/1‑100 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:163737/1‑100 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:2387716/1‑100 (MQ=255)
tGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCg > 1:3375463/1‑100 (MQ=255)
tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc > 2:2263198/1‑100 (MQ=255)
cTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCt > 2:3728567/1‑100 (MQ=255)
tGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTg < 1:562030/100‑1 (MQ=255)
tGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc < 1:56246/96‑1 (MQ=255)
gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTGATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGtt > 2:2687467/1‑100 (MQ=255)
gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGtt > 1:2803768/1‑100 (MQ=255)
gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGCCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGtt < 1:1923497/100‑1 (MQ=255)
tGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGttt < 2:3332854/100‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGt > 2:44967/1‑100 (MQ=255)
gccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTc < 1:3923953/100‑1 (MQ=255)
gccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGGCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGTTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTc < 1:2645228/100‑1 (MQ=255)
ccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTct > 2:3487667/1‑100 (MQ=255)
cgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctg > 2:2586147/1‑100 (MQ=255)
cgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTAGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctg > 1:1510117/1‑100 (MQ=255)
cTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgct < 2:4063170/100‑1 (MQ=255)
cTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgct < 2:293307/100‑1 (MQ=255)
ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGCGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTgg > 1:3095876/1‑99 (MQ=255)
ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTggg < 1:2094956/100‑1 (MQ=255)
tggtggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGt < 2:308322/100‑1 (MQ=255)
tcgAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACa > 2:2982039/3‑100 (MQ=255)
ggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGTTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACa > 1:1343847/1‑99 (MQ=255)
gAGTTTAATAATGTCGCATACTGGCAGAAGAACCAACTGGTAATGAAGTGTTCGAAGCATGAAGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTTGGCGGTActg > 1:1462152/1‑97 (MQ=255)
ngTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGc > 1:3352938/2‑100 (MQ=255)
aGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAg > 1:4138047/1‑98 (MQ=255)
aGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGc < 2:3194843/100‑1 (MQ=255)
aGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGc > 2:3113258/1‑100 (MQ=255)
aGTTTAATGATGTCGCGTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGc < 1:3245643/100‑1 (MQ=255)
tAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCcgcg > 2:3576737/1‑100 (MQ=255)
aaTGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCgcgc > 1:1336547/1‑100 (MQ=255)
aaTGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCgcgc < 1:1820546/100‑1 (MQ=255)
atgatgTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCt < 2:921517/100‑1 (MQ=255)
tgatgTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTc > 1:2061280/1‑100 (MQ=255)
gatgTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCa > 2:3120338/1‑100 (MQ=255)
tgTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAat < 2:148109/100‑1 (MQ=255)
ggcGCTTACTGGCGGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAata < 1:3844158/98‑1 (MQ=255)
gCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATcc < 2:2347172/100‑1 (MQ=255)
gCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATcc < 2:734412/100‑1 (MQ=255)
gCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATcc < 2:1122865/100‑1 (MQ=255)
tGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACg > 1:2819934/1‑100 (MQ=255)
ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACgg < 2:2650686/100‑1 (MQ=255)
ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACgg > 1:68560/1‑100 (MQ=255)
gCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGc < 1:1229052/100‑1 (MQ=255)
gCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGc > 1:4306860/1‑100 (MQ=255)
ccGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCa < 2:2747382/100‑1 (MQ=255)
cGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAt > 2:3914335/1‑100 (MQ=255)
cGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAt > 1:32736/1‑100 (MQ=255)
cGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAt > 2:1424842/1‑100 (MQ=255)
cGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAt > 2:2057044/1‑100 (MQ=255)
gCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTAGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAtt < 1:1968431/100‑1 (MQ=255)
gCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAtt < 1:3695354/100‑1 (MQ=255)
cAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTc < 2:1394984/100‑1 (MQ=255)
aGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTcc < 2:3862875/100‑1 (MQ=255)
aGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTcc < 2:3377460/100‑1 (MQ=255)
aGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTcc < 1:4071188/100‑1 (MQ=255)
aTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTCCTa > 2:143800/1‑100 (MQ=255)
aTCAAACAGGTGCTGGAGCGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTATGCTGACCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTATACAGCATTcaaa > 1:3734116/1‑97 (MQ=255)
|
ACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATTCCTA > NC_000913/4214551‑4214748
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
