Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F244 I0 R1
|
270 |
114.4 |
5840133 |
93.3% |
5448844 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,214,649 |
A→T |
81.5% |
I124F (ATC→TTC) |
metA → |
homoserine O‑transsuccinylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,214,649 | 0 | A | T | 81.5%
| 264.7
/ 47.1
| 112 | I124F (ATC→TTC) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/9); new base T (48/43); total (60/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATT > NC_000913/4214550‑4214744
|
aaCTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGa > 1:1972192/1‑100 (MQ=255)
cTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc < 2:878312/100‑1 (MQ=255)
cTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc > 1:1967168/1‑100 (MQ=255)
ttGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc > 1:141278/1‑98 (MQ=255)
tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCCGTTCaaa < 2:1524638/100‑1 (MQ=255)
tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaa > 2:1131818/1‑100 (MQ=255)
tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaa > 1:2870624/1‑100 (MQ=255)
gAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaan < 1:388333/100‑2 (MQ=255)
aaGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACa < 2:1462015/100‑1 (MQ=255)
aGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAAc < 2:1071332/98‑1 (MQ=255)
aGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAg > 2:2328142/1‑100 (MQ=255)
gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAgg < 1:230409/100‑1 (MQ=255)
gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAgg < 2:649383/100‑1 (MQ=255)
gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAgg < 1:1699852/100‑1 (MQ=255)
atTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGc > 1:1670326/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCt > 2:2593860/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCt > 1:2014915/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGATCAGAACTTTGACGGGTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGCGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGc > 1:2791741/1‑99 (MQ=255)
tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTg > 1:272391/1‑100 (MQ=255)
tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTg > 1:1461528/1‑100 (MQ=255)
tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCATGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTCCTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTg > 1:121767/1‑100 (MQ=255)
cAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTgg > 2:2276350/1‑100 (MQ=255)
ngtCAGAACTTTGCCGGTTTGATTGTAACTGATGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGt > 2:1968911/3‑100 (MQ=255)
gATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGt > 1:559535/1‑100 (MQ=255)
gATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGACCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAg > 2:2629221/1‑99 (MQ=255)
aTCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTg > 2:1054757/1‑100 (MQ=255)
tCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTgg < 1:985086/100‑1 (MQ=255)
cAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTTGCCGCAGTTCAAACAGGTTCTGGAGTGGt > 1:638475/1‑100 (MQ=255)
aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc > 2:1407369/1‑100 (MQ=255)
aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc > 2:2523958/1‑100 (MQ=255)
aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc < 2:2041349/100‑1 (MQ=255)
cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa > 2:398838/1‑100 (MQ=255)
cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa > 2:2702512/1‑100 (MQ=255)
cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCACTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa < 1:2402037/100‑1 (MQ=255)
tttGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAg < 2:1748730/100‑1 (MQ=255)
gACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATc < 1:772044/100‑1 (MQ=255)
gACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATc < 2:263080/100‑1 (MQ=255)
aCGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCa < 2:553020/100‑1 (MQ=255)
ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCa < 1:2837604/98‑1 (MQ=255)
ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 1:2276335/100‑1 (MQ=255)
tttGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTc < 1:1730408/100‑1 (MQ=255)
gtaTTGGAACTGGGGCGCCGCTGGGCCTGGTGGGGTTTAATCATGTCGCTTACTGTCCGCAGTTCAGACAGGTGCTCGAGGGGTCGCAAGATCCCGTCa > 1:2769439/3‑99 (MQ=255)
gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCagc < 2:1967179/100‑3 (MQ=255)
gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAcc < 2:1902670/100‑1 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAcccc < 2:1958175/100‑3 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:565396/1‑100 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:712317/1‑100 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 1:2537200/1‑100 (MQ=255)
ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc < 2:2404045/100‑1 (MQ=255)
tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCCGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc > 1:200768/1‑100 (MQ=255)
tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc > 1:2867654/1‑100 (MQ=255)
tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc < 2:434096/100‑1 (MQ=255)
aaCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACg > 1:985740/1‑100 (MQ=255)
aaCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTAGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACg > 1:1297635/1‑100 (MQ=255)
aCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGc < 2:1705903/100‑1 (MQ=255)
gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTGGCTTACTGGCCGCAGTTGAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGCAAGATCACGTCACCTCGACGCTGt > 1:1319574/1‑99 (MQ=255)
gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGtt < 2:2816140/100‑1 (MQ=255)
tGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACCGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGCCACCTCGACGCTGttt > 1:622952/1‑100 (MQ=255)
gcgcCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTg < 1:2499458/100‑1 (MQ=255)
gcgcCGCTGGGCCTGGTGGAGATTAATGATGTCGCTTGCTGGCCGCAGTTCACACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGCCGCTGTTTg > 1:1855750/1‑100 (MQ=255)
ccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTct > 1:1632105/1‑100 (MQ=255)
tGGGCCTGATGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgctg < 1:121614/100‑1 (MQ=255)
gggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgctgn < 1:1669833/100‑2 (MQ=255)
gggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTgg < 2:2881478/100‑1 (MQ=255)
ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCATGTCACCTCGACGCCGTCTGTCTGCTgg > 1:2198008/1‑99 (MQ=255)
ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTggg < 1:315982/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGc < 2:1567843/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGc < 1:2883401/100‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 2:1172730/100‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 1:1216993/100‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 1:155674/100‑1 (MQ=255)
cTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCgg < 2:404483/100‑1 (MQ=255)
cTGGGGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCGCTTCAAACAGGTGCTGGAGAGGTCGTAAGATCACGTCTCGTCGACGCTGTTTGTctgctg > 1:411952/1‑95 (MQ=255)
tggtggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGt > 1:2123110/1‑100 (MQ=255)
tccgatcttAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTAc < 1:1316034/93‑1 (MQ=255)
gtggAGTTTAATGATGCCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGCTGCTGGAGTGGACCAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGCGCCGTAc > 1:1295095/1‑100 (MQ=255)
gaggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTAc > 2:1967835/3‑100 (MQ=255)
tggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACa < 1:2421496/100‑1 (MQ=255)
ggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAg > 2:537651/1‑100 (MQ=255)
gAGTTTAATGATGTCGTTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgg < 1:1700515/100‑1 (MQ=255)
aGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGATTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgg < 1:402336/99‑1 (MQ=255)
gTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGcc > 1:2541631/1‑100 (MQ=255)
ttAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCcgc > 2:1207128/1‑100 (MQ=255)
tAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgatcgga > 2:1316039/1‑94 (MQ=255)
tAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCcgcg > 1:509301/1‑100 (MQ=255)
aaTGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAGCAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCgcgc < 1:803666/100‑1 (MQ=255)
atgatgTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCt < 1:2333555/100‑1 (MQ=255)
tgTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAat > 1:53220/1‑100 (MQ=255)
gTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAata > 2:1709636/1‑100 (MQ=255)
tCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACCGGCCGCGCTCAatat > 1:391086/1‑100 (MQ=255)
cGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAatat > 1:234760/1‑99 (MQ=255)
gCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATcc < 1:18361/100‑1 (MQ=255)
cTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCct > 1:148348/1‑100 (MQ=255)
cTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTAc > 2:1933609/1‑100 (MQ=255)
cTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCCGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTAc > 1:1870030/1‑100 (MQ=255)
tGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACg > 2:1993537/1‑100 (MQ=255)
ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACgg > 2:1421059/1‑100 (MQ=255)
ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCGCAATATCCTCTACgg > 2:2874398/1‑100 (MQ=255)
gCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGc < 2:2818058/100‑1 (MQ=255)
gCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAtt < 2:509304/100‑1 (MQ=255)
|
AACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATT > NC_000913/4214550‑4214744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
