Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F181 I1 R1
|
66 |
119.2 |
5981814 |
94.9% |
5676741 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,800,268 |
(T)8→7 |
coding (698/699 nt) |
waaY ← |
lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,800,261 | 0 | T | . | 98.2%
| 487.4
/ 2.1
| 108 | intergenic (‑65/+6) | waaZ/waaY | lipopolysaccharide KdoIII transferase; lipopolysaccharide core biosynthesis protein/lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base . (54/52); total (55/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTC > NC_000913/3800162‑3800356
|
ncATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAt > 1:937218/2‑100 (MQ=255)
aCATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAt > 1:2686488/1‑100 (MQ=255)
cATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtt < 2:487197/100‑1 (MQ=255)
cATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtt > 1:1498200/1‑100 (MQ=255)
aTCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttt > 1:2448843/1‑100 (MQ=255)
tCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtttt > 1:1424176/1‑100 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 1:1353408/100‑1 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 1:1986958/100‑1 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 1:384993/1‑100 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 1:125158/1‑100 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 2:2265777/100‑1 (MQ=255)
tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 2:2446945/1‑100 (MQ=255)
tGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtttttttagcg < 1:2743134/100‑5 (MQ=255)
tCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAgcgcg < 1:602101/100‑1 (MQ=255)
cAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAgcgcgc > 1:2734072/1‑100 (MQ=255)
aaTGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCt < 1:1127154/100‑1 (MQ=255)
aaTGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCt > 2:851949/1‑100 (MQ=255)
tATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGtt > 2:113669/1‑100 (MQ=255)
aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt > 1:1946441/1‑100 (MQ=255)
aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt < 1:1147586/100‑1 (MQ=255)
aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt > 1:1131406/1‑100 (MQ=255)
aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCACGCTGGttt < 2:345110/100‑1 (MQ=255)
tCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTACGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTc > 2:2087917/1‑100 (MQ=255)
cTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAAATGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTcc > 1:589519/1‑100 (MQ=255)
cTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTGAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTcc < 2:2531006/100‑1 (MQ=255)
tAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTccc > 2:176496/1‑100 (MQ=255)
tAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTccc > 1:2921905/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:2336472/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt < 2:1675848/100‑1 (MQ=255)
aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:1203514/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:628319/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 1:337873/1‑100 (MQ=255)
atatTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCtt > 1:565235/1‑100 (MQ=255)
tatTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 1:2882418/1‑98 (MQ=255)
tatTCTTCAGGATAAACCTTGGAAATAAAGAACTCCGCTTAAATCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGTGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCttt < 2:575630/100‑1 (MQ=255)
atTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTc > 2:334114/1‑100 (MQ=255)
atTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTc < 1:1102137/100‑1 (MQ=255)
ttcATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAc < 1:184522/100‑1 (MQ=255)
aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc < 1:1956447/100‑1 (MQ=255)
aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc > 1:2972965/1‑100 (MQ=255)
aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc < 1:1152011/100‑1 (MQ=255)
aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTGTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCATAcgc > 1:1183711/1‑99 (MQ=255)
gATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgccgc > 1:1773971/1‑100 (MQ=255)
aTAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCa < 1:2409101/100‑1 (MQ=255)
aaCCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATaa < 2:1183705/100‑1 (MQ=255)
cTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAAt > 1:1755081/1‑100 (MQ=255)
cTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAAt < 1:232913/100‑1 (MQ=255)
gtgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTg < 2:245677/100‑1 (MQ=255)
tgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgc < 1:2955766/100‑1 (MQ=255)
tgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgc > 2:300494/1‑100 (MQ=255)
gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgtg > 2:1068328/1‑98 (MQ=255)
gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgcg < 1:2199218/100‑1 (MQ=255)
gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgcg < 1:234603/100‑1 (MQ=255)
aataaataACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCa < 1:2867274/100‑1 (MQ=255)
ataaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAt > 1:1930253/1‑100 (MQ=255)
taaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGTATAAAATTGCGCAtt > 1:2934319/1‑100 (MQ=255)
aaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAttt > 2:2796569/1‑100 (MQ=255)
aataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttt < 1:1168071/100‑1 (MQ=255)
aataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttt > 1:2629057/1‑100 (MQ=255)
aCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTa < 1:2073018/100‑1 (MQ=255)
cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttttttn < 2:589516/99‑2 (MQ=255)
cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc > 1:20494/1‑100 (MQ=255)
cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc < 1:376793/100‑1 (MQ=255)
tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc < 1:836116/100‑1 (MQ=255)
tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACg > 2:1697708/1‑100 (MQ=255)
tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACg < 2:1083779/100‑1 (MQ=255)
ccGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGa > 2:2596679/1‑100 (MQ=255)
gCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGata < 2:766576/100‑1 (MQ=255)
gCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGata < 2:2972949/100‑1 (MQ=255)
tAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATAc < 2:2180626/100‑1 (MQ=255)
tAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATAc < 1:628322/100‑1 (MQ=255)
aaaaCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACt < 1:2724490/100‑1 (MQ=255)
aaCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTaa < 2:709626/100‑1 (MQ=255)
aCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTT‑TTGTGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACAatatcttgaa > 2:1934487/1‑94 (MQ=255)
gTCCTGGTGAAGAAATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGa > 2:1848430/1‑100 (MQ=255)
tCCTTGTGAAGACATGTAATTGTGTGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGTTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGat < 2:1989126/100‑1 (MQ=255)
tCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGat < 1:300496/100‑1 (MQ=255)
ccTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGata < 1:176498/100‑1 (MQ=255)
cTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataa > 1:1476612/1‑100 (MQ=255)
cTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCATTCAAACGACGCATAAAACTGAGCATTTTTTTACGATataataca > 2:2367031/1‑92 (MQ=255)
ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:2569448/1‑100 (MQ=255)
ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 1:2984127/1‑100 (MQ=255)
ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:1425295/1‑100 (MQ=255)
gagAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataat > 1:2014736/3‑98 (MQ=255)
gTGAAGACATGTAATTGTTGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGTCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAg < 2:1440143/100‑1 (MQ=255)
gTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAg < 1:2087929/100‑1 (MQ=255)
gAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCTTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:302513/1‑97 (MQ=255)
gACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAg > 2:673067/1‑100 (MQ=255)
aCATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGa < 2:235759/100‑1 (MQ=255)
aTGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtc > 2:2104981/1‑100 (MQ=255)
tGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtct > 2:364375/1‑100 (MQ=255)
gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc > 1:2722136/1‑100 (MQ=255)
gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc < 2:2984583/100‑1 (MQ=255)
gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc < 1:663888/100‑1 (MQ=255)
tAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATctct < 1:2446960/100‑1 (MQ=255)
aaTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTa > 1:1600649/1‑100 (MQ=255)
aaTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTa < 1:505403/100‑1 (MQ=255)
aTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTaa < 1:2358821/100‑1 (MQ=255)
tgtgGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAAtc > 2:1196910/1‑100 (MQ=255)
tgGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAAtctc > 2:33253/1‑100 (MQ=255)
|
ACATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTC > NC_000913/3800162‑3800356
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
