Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I0 R1
|
247 |
174.3 |
8556966 |
94.2% |
8060661 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,244,987 |
C→T |
52.2% |
intergenic (‑246/‑237) |
uxaC ← / → exuT |
uronate isomerase/hexuronate transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,244,987 | 0 | C | T | 52.2%
| 15.0
/ 245.6
| 179 | intergenic (‑246/‑237) | uxaC/exuT | uronate isomerase/hexuronate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/43); new base T (56/37); total (99/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GCTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGCCGA > NC_000913/3244889‑3245086
|
cTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATaa > 1:1457629/1‑100 (MQ=255)
cTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCACTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACaa > 1:2411903/1‑100 (MQ=255)
tGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAg > 2:941334/1‑100 (MQ=255)
tGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAg < 1:782468/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAg > 1:2083631/1‑100 (MQ=255)
gCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGt < 2:3075914/100‑1 (MQ=255)
gCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATc < 1:4011818/100‑1 (MQ=255)
ccGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCt < 2:1099022/100‑1 (MQ=255)
ccGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCt < 2:506798/100‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCtt > 2:312311/1‑100 (MQ=255)
cgcgCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCtt > 2:2515510/1‑100 (MQ=255)
cgttagcaCTGGCCTTGCTGGCGGCAGTTAATGGCCCTACAAATATGCCCACATTGGTGATGGCTGTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAATTTa < 1:4080483/87‑1 (MQ=255)
gcCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCt < 2:410132/100‑1 (MQ=255)
cAGTACTGGCCTTGCTGTCTTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTg < 1:549076/99‑1 (MQ=255)
tACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGt > 1:569103/1‑100 (MQ=255)
aCTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTc > 1:481548/1‑100 (MQ=255)
aCTGGCCGTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCg < 1:2976113/98‑1 (MQ=255)
cTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCg < 1:930887/100‑1 (MQ=255)
ggCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCa > 1:3475725/1‑100 (MQ=255)
ggCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCa > 2:2030103/1‑100 (MQ=255)
ggCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCa > 2:4086718/1‑100 (MQ=255)
gCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCaa > 1:1814669/1‑100 (MQ=255)
ttGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAAt < 2:2927358/99‑1 (MQ=255)
ttGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAAt < 1:3013923/99‑1 (MQ=255)
ttGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATc > 1:4096328/1‑100 (MQ=255)
ttGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATc < 2:3112900/100‑1 (MQ=255)
ttGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATc > 2:2621549/1‑100 (MQ=255)
tGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCa < 2:2100964/100‑1 (MQ=255)
tGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCa > 2:2856946/1‑100 (MQ=255)
tGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCa > 2:1201389/1‑100 (MQ=255)
tGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCa < 2:1437113/100‑1 (MQ=255)
gCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCAt > 2:3653261/1‑100 (MQ=255)
gCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCAt > 2:2072855/1‑100 (MQ=255)
cTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATa < 1:2854733/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAATTATTCCCACATGTGTGATGGCTCTCACATTTTAAAGTCGTATGATAAGTTATCTTTCTATCGTCGCAAATCATaa > 1:3891149/1‑100 (MQ=255)
gtcgtcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAg > 2:625301/1‑100 (MQ=255)
tcgtcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGt < 1:1232769/100‑1 (MQ=255)
cgtcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTc < 2:1028046/100‑1 (MQ=255)
gtcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCg > 2:2368741/1‑100 (MQ=255)
gtcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCg > 2:1224393/1‑100 (MQ=255)
tcAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGa > 2:3446671/1‑100 (MQ=255)
cAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGAc < 1:1087634/100‑1 (MQ=255)
ggTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACgg > 2:3267866/1‑100 (MQ=255)
aaTGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAAt < 1:3291915/100‑1 (MQ=255)
aaTGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAAt < 2:3049736/100‑1 (MQ=255)
gTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCa > 2:3963500/1‑100 (MQ=255)
cccTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCaaa < 2:3029646/100‑1 (MQ=255)
cccTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCaaa < 2:3323056/100‑1 (MQ=255)
cTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAAtt > 2:1056622/1‑100 (MQ=255)
cTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAAtt > 1:3512164/1‑100 (MQ=255)
tACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTg > 1:1877146/1‑100 (MQ=255)
tACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTg < 2:844979/100‑1 (MQ=255)
tACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTg > 2:599376/1‑100 (MQ=255)
cAAATATTCCTACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAGATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGcc < 2:2062739/100‑1 (MQ=255)
cAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAATTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGc > 1:1609984/1‑99 (MQ=255)
cAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGcc < 1:1528723/100‑1 (MQ=255)
naaTATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCCTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCg > 1:2726488/2‑100 (MQ=255)
atatTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGat < 2:1637758/100‑1 (MQ=255)
tatTCGTACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCTACGGAATGCAAATTGCCg < 1:2521542/97‑1 (MQ=255)
tatTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGatt < 2:3900600/100‑1 (MQ=255)
tatTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGatt < 2:1908071/100‑1 (MQ=255)
tatTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGatt < 1:2248460/100‑1 (MQ=255)
atTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattc > 2:1568925/1‑100 (MQ=255)
ttCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattca < 1:887106/100‑1 (MQ=255)
cgcacaTTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattcatt > 2:2898081/3‑100 (MQ=255)
cccACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCGAATTGCCGattcatt < 1:669007/100‑1 (MQ=255)
cccACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGGTGTATAATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATAATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattcatt > 2:573/1‑100 (MQ=255)
ccACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattcattc > 1:3710247/1‑100 (MQ=255)
ccACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGattcattc > 2:3869947/1‑100 (MQ=255)
cacaTTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGAttcattca > 1:3169588/1‑100 (MQ=255)
tttGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTg < 1:3922050/100‑1 (MQ=255)
gtgATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTa < 2:1473478/100‑1 (MQ=255)
tgATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAg < 2:2042445/100‑1 (MQ=255)
gATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGa > 1:4220395/1‑100 (MQ=255)
tGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATg > 1:3019861/1‑100 (MQ=255)
ggCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTGTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGa > 1:2625563/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGaa > 2:748916/1‑100 (MQ=255)
ctctCACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAAt > 2:1854444/1‑100 (MQ=255)
ctctCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGCCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAAt > 2:422668/1‑100 (MQ=255)
cACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCggg < 2:2311076/100‑1 (MQ=255)
cACCTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCggg > 2:1266705/1‑100 (MQ=255)
cACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGCCGCAAATCATAAGTCGACGCAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCggg < 1:2321719/100‑1 (MQ=255)
ccTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGtt > 2:1772631/1‑100 (MQ=255)
cTTTTAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTa > 1:3104796/1‑100 (MQ=255)
tttAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAAc < 2:380958/100‑1 (MQ=255)
tttAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAAc < 1:103193/100‑1 (MQ=255)
ttAAAGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAAcc > 1:3266947/1‑100 (MQ=255)
aaGTTGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGt < 2:711017/100‑1 (MQ=255)
aaGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGt < 2:3169600/100‑1 (MQ=255)
aaGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGt > 1:200154/1‑100 (MQ=255)
aGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCTGTa > 1:513447/1‑100 (MQ=255)
aGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTa < 1:3637633/100‑1 (MQ=255)
ttGTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACg < 2:3435835/100‑1 (MQ=255)
tGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACgg < 2:250877/100‑1 (MQ=255)
gTATGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGa > 1:218836/1‑100 (MQ=255)
tATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTTGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGaa > 1:2633283/1‑100 (MQ=255)
aTGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAg > 2:732952/1‑100 (MQ=255)
tGATAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGc > 2:3548914/1‑100 (MQ=255)
gACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGcc < 2:1722875/100‑1 (MQ=255)
aCAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGCCg > 2:2929665/1‑100 (MQ=255)
|
GCTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTATGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATGCAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGCCGA > NC_000913/3244889‑3245086
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
