Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I0 R1
|
247 |
174.3 |
8556966 |
94.2% |
8060661 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,410,649 |
A→G |
52.8% |
I124V (ATC→GTC) |
dusB → |
tRNA‑dihydrouridine synthase B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,410,649 | 0 | A | G | 52.8%
| 50.6
/ 212.7
| 173 | I124V (ATC→GTC) | dusB | tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/41); new base G (45/46); total (86/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CCAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCCAA > NC_000913/3410552‑3410747
|
ccAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATc > 2:193361/1‑100 (MQ=255)
cAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATcc < 1:3590412/100‑1 (MQ=255)
aGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCt < 1:690784/100‑1 (MQ=255)
tattGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTAcc > 2:1473538/1‑100 (MQ=255)
attGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCg < 2:2769795/100‑1 (MQ=255)
ttGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGa > 2:677083/1‑100 (MQ=255)
ttGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGa > 1:522109/1‑100 (MQ=255)
gATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAgg > 1:3133436/1‑100 (MQ=255)
tatCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGgtc > 2:1663329/1‑100 (MQ=255)
tatCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGgtc > 1:1109354/1‑100 (MQ=255)
atCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGgtcg < 1:4264391/100‑1 (MQ=255)
atCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGgtcg < 2:3979688/100‑1 (MQ=255)
atCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGgtc > 1:3270584/1‑99 (MQ=255)
cAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGgtcgtc < 2:3825349/100‑1 (MQ=255)
aaTATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCa > 2:366510/1‑100 (MQ=255)
aaTATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCa > 1:3422984/1‑100 (MQ=255)
aaTATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCa > 2:2316330/1‑100 (MQ=255)
tatGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAAt < 1:3345592/100‑1 (MQ=255)
atGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATg < 2:1889152/100‑1 (MQ=255)
tGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGc < 2:759129/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAg > 2:1465218/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAg > 2:2814950/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAg < 1:1836502/100‑1 (MQ=255)
gTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGt < 1:3183353/100‑1 (MQ=255)
gTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGt < 2:2385071/100‑1 (MQ=255)
gTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGt > 2:3275537/1‑100 (MQ=255)
gCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGa > 2:2317698/1‑100 (MQ=255)
cccGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGAc < 2:2152458/100‑1 (MQ=255)
cccGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGAc < 2:2159241/100‑1 (MQ=255)
cccGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGAc > 1:667975/1‑100 (MQ=255)
cccGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGAc > 1:1338/1‑100 (MQ=255)
ccGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACg < 1:193361/100‑1 (MQ=255)
cTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTcc < 2:1382059/100‑1 (MQ=255)
cTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTcc < 1:1007817/100‑1 (MQ=255)
cTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTcc < 1:216196/100‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTg < 1:2563556/100‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTg < 2:127216/100‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTg > 2:1062813/1‑100 (MQ=255)
aaGTGAATCGCAAGCTCGCAGTTTCAGCCCTCTGGCAGTACCCGGATGTCGTGAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAc < 1:1288872/100‑1 (MQ=255)
aaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAc < 2:3380428/100‑1 (MQ=255)
gTGAATCGCAAGCCCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAccc > 1:1267682/1‑100 (MQ=255)
aaTCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTCCCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTg > 1:3965707/1‑99 (MQ=255)
aaTCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGa > 2:3781426/1‑100 (MQ=255)
aaTCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTg > 2:2038091/1‑99 (MQ=255)
aTCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGaa < 2:485120/100‑1 (MQ=255)
aTCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGaa < 1:271786/100‑1 (MQ=255)
gCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGATCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGAt > 2:299839/1‑100 (MQ=255)
cAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGAtt > 1:2895030/1‑100 (MQ=255)
aaGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTc < 2:3497166/100‑1 (MQ=255)
aGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCg < 1:2137839/100‑1 (MQ=255)
aGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCg < 1:626370/100‑1 (MQ=255)
aGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCg < 1:1552820/100‑1 (MQ=255)
cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa > 2:1314217/1‑100 (MQ=255)
cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa > 2:1345991/1‑100 (MQ=255)
cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa < 1:2857821/100‑1 (MQ=255)
cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa < 2:2730129/100‑1 (MQ=255)
cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa > 1:3538827/1‑100 (MQ=255)
tCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGCTGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAc > 1:3393818/1‑100 (MQ=255)
tCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAc > 2:636318/1‑100 (MQ=255)
tCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGc > 1:992257/1‑98 (MQ=255)
tCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAc < 2:2993168/100‑1 (MQ=255)
tCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAc < 1:2268543/100‑1 (MQ=255)
cGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAcc < 2:3569703/100‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCg < 2:3545404/100‑1 (MQ=255)
ggTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCt < 1:1638277/100‑1 (MQ=255)
ttCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTgg > 1:4195287/1‑100 (MQ=255)
tCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTggg < 2:610115/100‑1 (MQ=255)
tCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTggg < 2:4055657/100‑1 (MQ=255)
tCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTggg < 1:3465146/100‑1 (MQ=255)
cAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCTGTCCTTACCGAGGTCGTCAAGGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGc < 1:845252/100‑1 (MQ=255)
aGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCa > 2:2453413/1‑100 (MQ=255)
aGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCCGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTgg > 2:2640771/1‑97 (MQ=255)
gCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCAc > 2:1214225/1‑100 (MQ=255)
cccTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCAcc < 1:559238/100‑1 (MQ=255)
cccTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCAcc < 1:2816909/100‑1 (MQ=255)
ccTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCg < 2:3210492/100‑1 (MQ=255)
ctctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCgg < 1:946089/100‑1 (MQ=255)
ctctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCgg < 1:2133033/100‑1 (MQ=255)
ctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCAATTCTTACTGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCgg < 1:66416/98‑1 (MQ=255)
tGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACTTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAac > 1:4017449/1‑99 (MQ=255)
tGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAaca > 2:1207202/1‑100 (MQ=255)
tGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAaca < 2:3251711/100‑1 (MQ=255)
gCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAacac > 2:4113535/1‑100 (MQ=255)
aGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCg > 2:61841/1‑100 (MQ=255)
gTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGt > 2:595513/1‑100 (MQ=255)
gTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGt < 1:2406124/100‑1 (MQ=255)
aCCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTaa > 2:2405498/1‑100 (MQ=255)
cccGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAAc > 1:1515235/1‑100 (MQ=255)
ggATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGc < 1:3087231/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGaa < 1:3851203/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGaa < 2:310049/100‑1 (MQ=255)
tCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAaga > 2:1186967/1‑100 (MQ=255)
cGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAagag < 2:1866035/100‑1 (MQ=255)
cGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAagag > 1:1453375/1‑100 (MQ=255)
gTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAgaga < 1:2077367/100‑1 (MQ=255)
gTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAgaga < 1:3302190/100‑1 (MQ=255)
aTCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAAAGATTGc > 1:3450566/1‑99 (MQ=255)
cGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCCa < 1:1703352/100‑1 (MQ=255)
cGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCCa < 1:1002648/100‑1 (MQ=255)
gATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCCaa > 2:1329203/1‑100 (MQ=255)
|
CCAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCCAA > NC_000913/3410552‑3410747
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
