Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F56 I1 R1
|
155 |
65.2 |
3164312 |
95.9% |
3034575 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,360,814 |
T→G |
Y374S (TAC→TCC) |
cadC ← |
cadBA operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,360,814 | 0 | T | G | 95.7%
| 297.0
/ 3.2
| 93 | Y374S (TAC→TCC) | cadC | cadBA operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base G (51/37); total (54/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.61e-01 |
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTG > NC_000913/4360717‑4360907
|
gTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAg < 1:1510821/100‑1 (MQ=255)
ttATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAgg < 2:324080/100‑1 (MQ=255)
tATCTATTTCTGTGTTCAGTACTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGt > 2:968659/1‑100 (MQ=255)
aTCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTa > 1:783204/1‑100 (MQ=255)
aTCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTCTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAGCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTa > 2:947470/1‑100 (MQ=255)
tCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTaa > 1:366192/1‑100 (MQ=255)
tCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTaa > 2:94662/1‑100 (MQ=255)
tCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTATCGAGGAGGTaa > 1:1254208/1‑100 (MQ=255)
tATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAt > 1:607423/1‑100 (MQ=255)
tATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAt > 2:523175/1‑100 (MQ=255)
tCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTg < 1:801604/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:1298734/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg > 2:396678/1‑100 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:609715/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:1193598/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgg > 1:889916/1‑99 (MQ=255)
gtgtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgggg < 2:690566/100‑1 (MQ=255)
gtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGgat > 2:469416/1‑100 (MQ=255)
cAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGgatgat > 1:727351/1‑100 (MQ=255)
aGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGAtt > 2:1322856/1‑100 (MQ=255)
gctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGaa > 1:1498533/1‑100 (MQ=255)
gctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCGCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTg < 2:1491955/98‑1 (MQ=255)
ctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAAc < 1:229431/100‑1 (MQ=255)
ctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAAc > 1:939199/1‑100 (MQ=255)
gctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACaa < 2:741669/100‑1 (MQ=255)
tAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGAGAAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtc > 1:538237/1‑100 (MQ=255)
aaTTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtct > 1:1088191/1‑100 (MQ=255)
aTTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtctc > 1:239539/1‑100 (MQ=255)
ttGTTTTTCATCAAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCa < 2:1230071/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCa < 2:458864/99‑1 (MQ=255)
ttttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCta > 2:1524705/1‑100 (MQ=255)
ttttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCAGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCta > 1:916219/1‑100 (MQ=255)
cATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCAGAGGTAAATTCTAGGGATGATTGAACAATCTCACCtaataa > 2:141176/1‑100 (MQ=255)
cTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc < 2:1120365/100‑1 (MQ=255)
cTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc < 1:968664/100‑1 (MQ=255)
cTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc < 1:1009868/100‑1 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTTGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc > 1:995153/1‑99 (MQ=255)
tAAAGGATGGTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc < 2:236645/99‑1 (MQ=255)
aaaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGTTTGAACAATCTCACCTAATAATTCAc > 2:727757/1‑100 (MQ=255)
aaaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCAc < 1:1181154/100‑1 (MQ=255)
aaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACt > 2:1049478/1‑100 (MQ=255)
ggATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 1:1578975/100‑1 (MQ=255)
ggATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 1:653788/100‑1 (MQ=255)
ggATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 2:1084771/100‑1 (MQ=255)
ggATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 1:396679/100‑1 (MQ=255)
gATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGc < 1:220764/100‑1 (MQ=255)
gTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACg > 1:1568343/1‑100 (MQ=255)
ttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACgg > 2:397064/1‑100 (MQ=255)
ttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACgg > 1:1275153/1‑100 (MQ=255)
ttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTATCGCGGCGGAAAATTCTGGGGATTATTGACTCATCTAACCTAATAATTCACTGTCAAgg > 2:1002078/1‑100 (MQ=255)
tGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGt > 2:336018/1‑100 (MQ=255)
agaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTc < 1:469417/100‑1 (MQ=255)
agaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTc < 2:732398/100‑1 (MQ=255)
agaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTCTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAACTCTGGGGATGATTAAACAATCTCACATAATAATTCACTggacag > 2:1279081/1‑92 (MQ=255)
agaATGGACCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAATCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTc < 1:1206297/100‑1 (MQ=255)
gaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCa > 1:1446715/1‑100 (MQ=255)
aaTGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAGCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCaa < 2:373223/100‑1 (MQ=255)
aTGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAAt < 2:241864/100‑1 (MQ=255)
tGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAAt < 2:1226825/99‑1 (MQ=255)
tGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATg < 1:94662/100‑1 (MQ=255)
tGGCGAACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGGGGAGGTAAAGTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATg < 2:1064618/100‑1 (MQ=255)
ggCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAAtn < 2:381484/99‑2 (MQ=255)
gcgcCCGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCTCGGt > 2:327163/1‑92 (MQ=255)
gcgcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAt < 2:727349/100‑1 (MQ=255)
gcgcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAt > 1:396348/1‑100 (MQ=255)
gcgcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTAACTGAt > 2:699308/1‑100 (MQ=255)
cACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTa > 1:123962/1‑100 (MQ=255)
cGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTatc > 1:764936/1‑100 (MQ=255)
atatCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTatcat < 2:396348/100‑1 (MQ=255)
tatCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTatcatc > 2:1146042/1‑100 (MQ=255)
tatCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTatcatc > 2:1145998/1‑100 (MQ=255)
atCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTCATCATCg < 1:833482/100‑1 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGcc > 2:847337/1‑99 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTATGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGAGGATGATTAAACAATCTCAAATAATAATTCAATGACACGATTCAATAATTTatcataacca > 2:15370/1‑95 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 2:995147/100‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc > 2:133846/1‑99 (MQ=255)
tGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGt > 2:883823/1‑100 (MQ=255)
gCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTa > 2:405205/1‑100 (MQ=255)
tttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaaa < 1:887202/100‑1 (MQ=255)
tttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaaa > 2:338356/1‑100 (MQ=255)
ttttCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaat < 2:235120/100‑1 (MQ=255)
ttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaat > 1:333988/1‑100 (MQ=255)
ttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCGCTGTCACGGTTCAATGATTTCTTATCGCCATGCCGTAaatga > 2:1107056/1‑98 (MQ=255)
tCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaataat < 1:62611/100‑1 (MQ=255)
ntGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATc > 1:1257322/2‑100 (MQ=255)
cTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCGCACCTAATAATTCACTGGCGCGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATc > 2:862196/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAACTAATCAt > 1:1362227/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt > 1:1378437/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt > 2:1322552/1‑100 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtg > 1:1308592/1‑100 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTATGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGTACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCa < 2:658198/98‑1 (MQ=255)
tctcGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAcgt > 2:1443679/1‑100 (MQ=255)
ctcGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtgtg > 1:655139/1‑100 (MQ=255)
|
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTG > NC_000913/4360717‑4360907
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
