Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I1 R1
|
186 |
136.5 |
6958264 |
92.1% |
6408561 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,360,814 |
T→G |
Y374S (TAC→TCC) |
cadC ← |
cadBA operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,360,814 | 0 | T | G | 98.5%
| 447.8
/ NA
| 133 | Y374S (TAC→TCC) | cadC | cadBA operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base G (60/70); total (63/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTG > NC_000913/4360717‑4360907
|
gTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAg < 2:1491441/100‑1 (MQ=255)
tATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGt > 1:879733/1‑100 (MQ=255)
tCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGt > 1:784436/1‑98 (MQ=255)
cTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTaaa < 2:2111969/100‑1 (MQ=255)
cTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTaaa > 2:1173785/1‑100 (MQ=255)
aTTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAtt > 2:2973046/1‑100 (MQ=255)
aTTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAtt > 2:1502839/1‑100 (MQ=255)
tCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTg < 1:1024348/100‑1 (MQ=255)
cTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgg < 2:869791/100‑1 (MQ=255)
cTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgg < 2:2395147/100‑1 (MQ=255)
cTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgg < 1:837095/100‑1 (MQ=255)
cTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgg < 1:2986213/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 2:879745/100‑1 (MQ=255)
gtgtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgggg < 1:2421072/100‑1 (MQ=255)
tCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAGTGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGgatga > 1:2952635/1‑100 (MQ=255)
cAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGgatgat > 1:1050049/1‑100 (MQ=255)
gTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTg < 1:2384730/100‑1 (MQ=255)
gTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTCTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTg < 1:1856752/100‑1 (MQ=255)
ctgctAATTGTTTTTCATCTCAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGaa > 1:2122254/1‑99 (MQ=255)
ctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAAc < 1:3177395/100‑1 (MQ=255)
tgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACa < 1:310123/100‑1 (MQ=255)
tgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACa > 2:1814981/1‑100 (MQ=255)
tgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACa > 2:2742445/1‑100 (MQ=255)
tgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACa > 2:2742600/1‑100 (MQ=255)
tgctAACTGTTTTTCATCTAAAGTATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACa < 1:3287276/100‑1 (MQ=255)
gctAATTGTTTTTCATCTAACGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACaa > 1:616740/1‑100 (MQ=255)
tAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtc < 1:130856/100‑1 (MQ=255)
aaTTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTTTTTTTTTTTGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtct > 1:2652695/1‑100 (MQ=255)
aaTTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtct > 2:2539245/1‑100 (MQ=255)
aaTTGTTCTTCATCTAAAGGACGTTGCGAATGGCGCACGATATCACCTAATGCTTTTTCTCCTCTCGCGCAGGAAAATTCTGGGGATGATCGAACaa > 1:2858421/1‑97 (MQ=255)
ttGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCa < 2:450536/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGTTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCAc < 1:1705989/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCAc > 2:3239264/1‑100 (MQ=255)
gTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTTCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCAcc < 2:3447985/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCAcc < 2:1153698/100‑1 (MQ=255)
tttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTAGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGGTTGAACAATCTCACCtaa > 2:2623157/1‑100 (MQ=255)
tCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaata < 1:2498699/100‑1 (MQ=255)
tCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaata > 2:2077798/1‑100 (MQ=255)
aTCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTaataat < 2:2735071/100‑1 (MQ=255)
tCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAAtt > 2:643654/1‑100 (MQ=255)
cTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc < 2:1440724/100‑1 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAAtt > 1:1880539/1‑98 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCa > 1:1765600/1‑100 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGAAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCa > 1:2059913/1‑100 (MQ=255)
aaaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCAc < 2:1687153/100‑1 (MQ=255)
aaaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCAc > 1:2919059/1‑100 (MQ=255)
aGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAAGGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTg < 2:3264297/100‑1 (MQ=255)
ggATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 2:1462232/100‑1 (MQ=255)
cgatcttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTgg < 1:2358100/95‑1 (MQ=255)
aTGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCa > 1:1760577/1‑100 (MQ=255)
tGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAc > 2:1133364/1‑100 (MQ=255)
tGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAc > 1:234420/1‑100 (MQ=255)
gTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACg > 2:847159/1‑100 (MQ=255)
ttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACgg < 2:2692767/100‑1 (MQ=255)
ttGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACgg > 2:2086884/1‑100 (MQ=255)
tcagaATGGCGCAAGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTggagatcg > 2:2358132/3‑94 (MQ=255)
tGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGt < 2:2947831/100‑1 (MQ=255)
tGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGt > 1:3298015/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTAACCTAATAATTCACTGGCACGGtt > 1:3420802/1‑100 (MQ=255)
agaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTc < 2:3152272/100‑1 (MQ=255)
aaaggCGCAGGATATCAACTAATGCTAGTTCTACAATAGCCGAGGCAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTCGCACGGtt < 1:1895599/94‑1 (MQ=255)
aaTGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCaa < 1:2587845/100‑1 (MQ=255)
tGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATg < 2:3253080/100‑1 (MQ=255)
tGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATg < 1:23259/100‑1 (MQ=255)
cgcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAtt < 1:1606098/100‑1 (MQ=255)
gcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt > 2:3237246/1‑100 (MQ=255)
gcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt < 1:206972/100‑1 (MQ=255)
cACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGTGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt > 1:1389696/1‑99 (MQ=255)
cACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTa < 1:1404816/100‑1 (MQ=255)
cACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTa > 1:1674704/1‑100 (MQ=255)
atgATAGCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCTCCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTat < 2:1543017/98‑1 (MQ=255)
aCGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTat < 1:1617777/100‑1 (MQ=255)
aCGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTat > 2:1454086/1‑100 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCa < 1:37207/100‑1 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 1:53621/100‑1 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 2:866264/100‑1 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 1:3390185/100‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCa > 1:1622016/1‑100 (MQ=255)
aTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAg < 1:2934555/100‑1 (MQ=255)
gCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCGTGCAGTa > 2:2988745/1‑100 (MQ=255)
gCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTa > 2:703001/1‑100 (MQ=255)
gCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTa < 1:1122976/100‑1 (MQ=255)
gCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATACAGTa > 1:490795/1‑100 (MQ=255)
cTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaa > 1:396593/1‑100 (MQ=255)
tttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGaaaa > 2:450047/1‑100 (MQ=255)
gatctCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaaa < 2:2311157/96‑1 (MQ=255)
ttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaat < 2:1878989/100‑1 (MQ=255)
tCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaataat < 1:2989708/100‑1 (MQ=255)
tCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaataat < 2:38557/100‑1 (MQ=255)
cTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaaaagatc > 1:2311125/1‑95 (MQ=255)
cTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATc < 2:2652733/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCa > 1:2689756/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt > 1:2299276/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt < 2:2703457/100‑1 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt < 1:368658/100‑1 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtg > 1:1684405/1‑100 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtg > 1:1815059/1‑100 (MQ=255)
tctcGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTATTAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtgt > 2:2497596/1‑100 (MQ=255)
ctcGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtgtg > 1:3376653/1‑100 (MQ=255)
tcGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtgtg < 1:1122194/99‑1 (MQ=255)
|
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTG > NC_000913/4360717‑4360907
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
