Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I0 R1
|
328 |
102.7 |
5123138 |
93.4% |
4785010 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,360,814 |
T→G |
100% |
Y374S (TAC→TCC) |
cadC ← |
cadBA operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,360,814 | 0 | T | G | 97.6%
| 344.4
/ ‑3.6
| 107 | Y374S (TAC→TCC) | cadC | cadBA operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base G (57/45); total (60/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.31e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGCC > NC_000913/4360717‑4360909
|
gTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAg > 1:1610732/1‑100 (MQ=255)
gTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAg > 1:1623294/1‑100 (MQ=255)
aTCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTa > 1:765536/1‑100 (MQ=255)
aTCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTa > 1:1779665/1‑100 (MQ=255)
cTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTaaa > 2:2064666/1‑100 (MQ=255)
tATTTCTGTGTTAAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAt < 2:1930049/100‑1 (MQ=255)
aTTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAtt < 2:44945/100‑1 (MQ=255)
aTTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAtt > 1:767805/1‑100 (MQ=255)
aTTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAAtt > 2:2148975/1‑100 (MQ=255)
tttCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTc > 1:658796/1‑100 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:365901/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:495090/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg > 2:154559/1‑100 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 1:2098954/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTAGCGGAGGTAAATTCTggg > 1:273856/1‑100 (MQ=255)
tgtgTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATAACAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 2:1401266/100‑1 (MQ=255)
gtgtagaGTGCTTCTAATTGGTTTTTATCTAAATGTTTTTGAGAATGGCTTACGATACCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTggg < 2:1400325/93‑1 (MQ=255)
gtgtTCAGTGCTGCTAATTTGTTTTCATCTAAAGAATGTTGAGAATGGCGCACGATATAAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTg < 2:1275265/97‑1 (MQ=255)
gtgtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgggg < 2:2512070/100‑1 (MQ=255)
tgtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTgggg < 2:581786/99‑1 (MQ=255)
gtTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGAAAATTCTGGGgat > 2:1179278/1‑100 (MQ=255)
aGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGAtt > 2:1883991/1‑100 (MQ=255)
tgctgcTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATCCTTTTTCTGCTCTCGCCTAGGTCTATTCTtgggctcgct > 2:2354811/1‑92 (MQ=255)
gctgctAATTGTTTTTCCTCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCAGAGGTAAATTCTGGGGATGAtt > 2:946290/1‑97 (MQ=255)
gctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGaa < 2:2236619/100‑1 (MQ=255)
gctgctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGAATATTCTGGGGATGATTGaa > 2:865086/1‑100 (MQ=255)
agctAATTGTATTTCACCTAAAGGATGTAAAGGATGTCGCACTAGTTATACTCATGCTTTTTCTGCTTGAGCCCAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAAc < 2:2406883/98‑1 (MQ=255)
gctAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACaa > 1:1508390/1‑100 (MQ=255)
tAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtc > 2:997326/1‑100 (MQ=255)
tAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAAtc < 1:1075134/100‑1 (MQ=255)
ttGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGGTTGAACAATCTCa < 1:1721119/100‑1 (MQ=255)
ttGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCa > 1:2508168/1‑100 (MQ=255)
gTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATTAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTCGGGATGATTGAACAATCTCAc > 1:1457438/1‑99 (MQ=255)
tttttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATTTCACCt > 1:2418911/1‑100 (MQ=255)
tttttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCt < 1:714759/100‑1 (MQ=255)
ttttCATCTAGAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCt < 2:1522881/99‑1 (MQ=255)
tttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaa > 1:2399426/1‑100 (MQ=255)
tttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaa > 2:1538562/1‑100 (MQ=255)
ttCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaat < 2:31924/100‑1 (MQ=255)
tCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaata < 1:573565/100‑1 (MQ=255)
cATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCtaataa > 1:2268619/1‑100 (MQ=255)
tCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAAtt < 2:1412643/100‑1 (MQ=255)
cTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTc > 1:2241852/1‑100 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCa > 2:787323/1‑100 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCa > 1:470267/1‑100 (MQ=255)
tAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCa > 2:1248153/1‑100 (MQ=255)
aaaGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCAc < 1:2193732/100‑1 (MQ=255)
aGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTg < 2:2197963/100‑1 (MQ=255)
gATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGc > 2:1598364/1‑100 (MQ=255)
tGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAc < 1:2318832/100‑1 (MQ=255)
tGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAc < 2:2026735/100‑1 (MQ=255)
cttccgatctGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAc < 1:1378074/91‑1 (MQ=255)
gTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACg < 1:735/100‑1 (MQ=255)
gTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACg > 1:2397701/1‑100 (MQ=255)
tGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGt > 1:1477495/1‑100 (MQ=255)
tGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGt > 1:2209254/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGtt > 1:1073793/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGtt > 2:692675/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGtt > 2:935708/1‑100 (MQ=255)
agaATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTc < 1:2042969/100‑1 (MQ=255)
ggCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCAcagatcggaag > 2:1378065/1‑90 (MQ=255)
gcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt < 1:536405/100‑1 (MQ=255)
gcACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt < 1:2258808/100‑1 (MQ=255)
cACGATATCAACTAATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTCAATTCTGGGGATGTTTTTATATTCTCACATAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGAttt > 2:1689547/1‑99 (MQ=255)
aagATATCAACTAATGATTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTAAATGAttt < 2:695922/96‑1 (MQ=255)
gATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTatca < 2:1823907/100‑1 (MQ=255)
atCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCg < 1:687649/100‑1 (MQ=255)
tCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCg < 2:1224891/99‑1 (MQ=255)
tCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTAAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGc > 1:920771/1‑100 (MQ=255)
cAACTAATGCTTTATCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGcc < 2:2053773/100‑1 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCa > 1:1864051/1‑100 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCa < 2:470263/100‑1 (MQ=255)
aaCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCa > 2:1784228/1‑100 (MQ=255)
aCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCAt < 2:2236558/100‑1 (MQ=255)
aCTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCAt > 1:108931/1‑100 (MQ=255)
cTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTCAATTCTAGGGATGATTGAACAATCTCACCTACTAATTCACTAGAACGGGTCAATGATTTATCATCGCCAt > 2:995390/1‑99 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 1:1925130/100‑1 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc < 1:1604821/100‑1 (MQ=255)
tAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTACCATCGCCATGc < 1:630108/100‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGc > 2:1988796/1‑99 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCa > 1:702923/1‑100 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCa < 1:1838874/100‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTAAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCa > 2:471958/1‑100 (MQ=255)
attcTTTTTCTGCTCTCGGGGATGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGTACGGTTTAATGATTTATCATCGCCATGCa < 2:406678/96‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTTCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAg > 2:2253823/1‑100 (MQ=255)
tttttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTaaa < 2:1422571/100‑1 (MQ=255)
tttCTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCACTAaata > 2:639326/1‑100 (MQ=255)
ttCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAaataa > 2:1426451/1‑100 (MQ=255)
cTGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATc > 2:1621367/1‑100 (MQ=255)
tGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCa > 2:1067877/1‑100 (MQ=255)
tGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCa < 2:658789/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCa < 2:1779652/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATAGCCATGCAGTAAATAATCa > 2:1756181/1‑100 (MQ=255)
gCTCTCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAt > 2:325491/1‑100 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtg < 2:731745/100‑1 (MQ=255)
ctctCGCGGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCAtg > 1:364368/1‑100 (MQ=255)
cgcgGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGcc > 1:2283128/1‑100 (MQ=255)
cgcgGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGcc < 2:733081/100‑1 (MQ=255)
cgcgGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGcc > 2:1998286/1‑100 (MQ=255)
gcgGAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGcc < 2:925681/99‑1 (MQ=255)
|
GTTATCTATTTCTGTGTTCAGTGCTGCTAATTGTTTTTCATCTAAAGGATGTTGAGAATGGCGCACGATATCAACTAATGCTTTTTCTGCTCTCGCGTAGGTAAATTCTGGGGATGATTGAACAATCTCACCTAATAATTCACTGGCACGGTTCAATGATTTATCATCGCCATGCAGTAAATAATCATGTGCC > NC_000913/4360717‑4360909
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
