Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F56 I0 R1
|
312 |
170.3 |
8276235 |
93.7% |
7754832 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,686,929 |
G→T |
50.3% |
Q749K (CAG→AAG) |
bcsC ← |
cellulose synthase subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,686,929 | 0 | G | T | 50.3%
| 3.4
/ inf
| 223 | Q749K (CAG→AAG) | bcsC | cellulose synthase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/56); new base T (57/55); total (112/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CTGGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAT > NC_000913/3686831‑3687027
|
ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc < 1:2248005/100‑1 (MQ=255)
ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc > 2:2609644/1‑100 (MQ=255)
ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc < 1:954810/100‑1 (MQ=255)
tgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCg < 1:3552213/100‑1 (MQ=255)
tgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCg > 2:3178106/1‑100 (MQ=255)
ggCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCgg < 2:2015418/100‑1 (MQ=255)
ggCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCgg < 1:2133937/100‑1 (MQ=255)
gCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGa < 1:3955218/100‑1 (MQ=255)
gCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGa < 2:3319983/100‑1 (MQ=255)
tAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGAcgcg < 1:921890/100‑1 (MQ=255)
tAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGACCTCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGAAc > 1:1499160/1‑97 (MQ=255)
gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc > 1:4124471/1‑100 (MQ=255)
gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc < 1:1206290/100‑1 (MQ=255)
gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc > 1:502968/1‑100 (MQ=255)
ntCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 2:3220189/2‑100 (MQ=255)
gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 1:809727/1‑100 (MQ=255)
gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 1:730590/1‑100 (MQ=255)
gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGCCGCGTCGTa > 1:1000356/1‑100 (MQ=255)
tCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAg < 2:3487052/100‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAg < 1:3349162/100‑1 (MQ=255)
ccgccgCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGt > 1:1138062/1‑100 (MQ=255)
ccgccgCATCGCTGCGCACGCCACGTTTAAGCCAGTCCTCTCTCTCGTCGTTACGGGTCAGGCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGAGTCGTAGt > 2:1812865/1‑100 (MQ=255)
gccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTca > 2:51212/1‑100 (MQ=255)
ccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTcac < 2:2026140/100‑1 (MQ=255)
ccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTcac < 1:3756272/100‑1 (MQ=255)
cgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTcaca < 2:3941274/100‑1 (MQ=255)
gcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCAGACGCGTCGTAGTCacac > 2:1784953/1‑100 (MQ=255)
cATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACAcc < 1:2664928/100‑1 (MQ=255)
tCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCgg < 2:3117853/100‑1 (MQ=255)
cTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATg < 1:1370316/100‑1 (MQ=255)
gcgcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCg < 2:3713575/100‑1 (MQ=255)
cgcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGa < 1:2817092/100‑1 (MQ=255)
gcACGCCACGTTTCGGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACGCCGGATGCGAc < 2:2161807/100‑1 (MQ=255)
gcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGAc > 2:732014/1‑100 (MQ=255)
gcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGAc > 1:2182146/1‑100 (MQ=255)
ccACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATgg > 1:3410455/1‑100 (MQ=255)
cACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGATGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATgg < 2:2709570/99‑1 (MQ=255)
cACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGc > 1:2305098/1‑100 (MQ=255)
aCGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCg < 1:3881513/100‑1 (MQ=255)
cGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGt < 1:1272579/100‑1 (MQ=255)
gTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTc < 1:2466356/100‑1 (MQ=255)
gTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTc > 1:61221/1‑100 (MQ=255)
tttCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCt > 2:725291/1‑100 (MQ=255)
tttCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCt > 1:4042449/1‑100 (MQ=255)
tCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCttt < 2:3039946/100‑1 (MQ=255)
cAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATGCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTg > 2:3243962/1‑100 (MQ=255)
cAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTg > 1:1015215/1‑100 (MQ=255)
ccAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAg < 1:3189057/100‑1 (MQ=255)
ccAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAg > 1:373747/1‑100 (MQ=255)
aGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGt > 1:172880/1‑100 (MQ=255)
cATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTc > 2:231342/1‑100 (MQ=255)
cATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTAGGGTAATGGTGTCGTTTTCCTTCGGACGCGTCGTAGTTATACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTc > 2:1287627/1‑100 (MQ=255)
aTCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTcc < 2:2986780/100‑1 (MQ=255)
tctcGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAgcgc > 2:2446548/1‑100 (MQ=255)
ctcGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGcc > 1:2383067/1‑100 (MQ=255)
tcgtcgTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCGTGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCt > 2:3089277/1‑100 (MQ=255)
cgtcgtTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTg > 1:657931/1‑100 (MQ=255)
cgtcgtTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTg > 1:2731955/1‑100 (MQ=255)
ttACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTg < 2:2911675/100‑1 (MQ=255)
tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg > 2:2932360/1‑100 (MQ=255)
tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg < 2:128310/100‑1 (MQ=255)
tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg < 2:3538722/100‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGAt < 1:1752858/100‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGCTTCCAGCGCCTGCGTTGGAt > 2:4031563/1‑100 (MQ=255)
gggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATc > 1:157415/1‑100 (MQ=255)
ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg > 2:863858/1‑100 (MQ=255)
ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg < 2:2971707/100‑1 (MQ=255)
ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg < 1:899851/100‑1 (MQ=255)
ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg > 1:459461/1‑100 (MQ=255)
cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc > 2:3508477/1‑100 (MQ=255)
cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc < 1:3025392/100‑1 (MQ=255)
cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTCATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc > 2:2519330/1‑100 (MQ=255)
aGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccg > 1:1835067/1‑100 (MQ=255)
aGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccg > 2:1906142/1‑100 (MQ=255)
gTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccgc < 2:2997069/100‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGTGCCTGCGTTGGATcgcccgcc < 2:2639686/100‑1 (MQ=255)
cGGGTAAAGGTGTCTTTCACATGCGGACGCGTCGTAGTCACACCCGATGCGACCATGGCCTCTTTGTAGGTTTCCAACGCAGGCGCTGGaaccctaaa < 2:2679398/98‑9 (MQ=255)
cGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCt > 1:1378142/1‑100 (MQ=255)
gggTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTg > 2:3032657/1‑100 (MQ=255)
gggTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTg < 1:3987315/100‑1 (MQ=255)
tAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTgcgc > 2:663381/1‑100 (MQ=255)
aaGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCtt > 1:279193/1‑100 (MQ=255)
aGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCACCCGCCTGCGCTTc > 2:1672333/1‑100 (MQ=255)
ggTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCa > 1:1333844/1‑100 (MQ=255)
tgtCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCaa > 2:411069/1‑99 (MQ=255)
gtCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:301476/100‑1 (MQ=255)
gtCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:1062876/100‑1 (MQ=255)
gtCGTTATCCTTCGGACGCGTAGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:2631693/100‑1 (MQ=255)
gtCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 2:1625921/100‑1 (MQ=255)
tCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACt < 2:2397069/100‑1 (MQ=255)
ttATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:2326159/100‑1 (MQ=255)
ttATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:557322/100‑1 (MQ=255)
ttATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:2076036/100‑1 (MQ=255)
tATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCATCCCCTGCTTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 2:1024963/99‑1 (MQ=255)
tCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGc < 2:1156122/98‑1 (MQ=255)
tCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCAc > 2:2758970/1‑100 (MQ=255)
cTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCa < 2:3590381/100‑1 (MQ=255)
cTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCa < 2:1455178/100‑1 (MQ=255)
tGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAt < 1:3157362/100‑1 (MQ=255)
tGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAt < 1:3504780/100‑1 (MQ=255)
|
CTGGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAT > NC_000913/3686831‑3687027
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
