Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F56 I0 R1
|
312 |
170.3 |
8276235 |
93.7% |
7754832 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,281,967 |
T→C |
53.7% |
Q370R (CAG→CGG) |
yjcF ← |
pentapeptide repeats protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,281,967 | 0 | T | C | 53.7%
| 37.3
/ 281.1
| 222 | Q370R (CAG→CGG) | yjcF | pentapeptide repeats protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/49); new base C (65/53); total (119/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.69e-02 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGG > NC_000913/4281868‑4282066
|
ggCACAATCTTGTTAAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTACTTAGCACGTAGAATGGTAATAACGATTCCCt > 2:3465728/1‑98 (MQ=255)
ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTgg < 1:1335723/100‑1 (MQ=255)
acaATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACg > 2:1490274/1‑100 (MQ=255)
aaTCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCt > 1:2586220/1‑100 (MQ=255)
tcttctTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAg < 1:750645/100‑1 (MQ=255)
tcttctTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAg > 1:926502/1‑100 (MQ=255)
cttcttCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGc > 1:1205831/1‑100 (MQ=255)
cttcttCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGc < 1:1436009/100‑1 (MQ=255)
ttcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATCTTTTCCTCACAACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGcc < 2:2208892/100‑1 (MQ=255)
tcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGCTATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCt > 2:766145/1‑100 (MQ=255)
ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTcc < 2:2680228/100‑2 (MQ=255)
ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCa > 1:3414449/1‑100 (MQ=255)
ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCa > 2:3071130/1‑100 (MQ=255)
tcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCAt > 1:2348593/1‑100 (MQ=255)
cAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATc < 1:4133733/100‑1 (MQ=255)
aaaGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCg > 1:1132559/1‑100 (MQ=255)
aaaGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCg > 1:525087/1‑100 (MQ=255)
gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATTGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGaaa < 2:1697767/100‑1 (MQ=255)
gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGTAGAATGGTAATACCCATTCTCCGGACGCTAGCCTCATCGaa > 2:1393788/1‑99 (MQ=255)
aTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt < 1:1590339/100‑1 (MQ=255)
aTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt < 1:4101638/100‑1 (MQ=255)
cTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAaca < 1:79406/100‑1 (MQ=255)
tGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac < 1:1039787/100‑1 (MQ=255)
ngTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac > 2:1335804/2‑100 (MQ=255)
gTAGTGTTACCAGGCTATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGTTAATACCCATTCCCTGTACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac > 2:3586012/1‑99 (MQ=255)
gTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACg > 2:3824705/1‑100 (MQ=255)
aGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGAt < 2:1748962/100‑1 (MQ=255)
gtgtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATa < 1:2260974/100‑1 (MQ=255)
tgtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag < 2:1942349/100‑1 (MQ=255)
tcttccccggACATCATTACTAATGGAGATACTTTCCTCACCACGCCGACTAGTAATACCCATCCCCCGTACCCTACCCTCATAGAAATTAACACGAt > 2:1829528/9‑98 (MQ=255)
tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 1:661705/1‑100 (MQ=255)
tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 1:2294992/1‑100 (MQ=255)
tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 2:2851825/1‑100 (MQ=255)
aCCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGAACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGAc > 2:2179626/1‑100 (MQ=255)
ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATATCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:642260/100‑1 (MQ=255)
ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCTCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:3408438/100‑1 (MQ=255)
ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg > 1:573372/1‑100 (MQ=255)
ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:97455/100‑1 (MQ=255)
ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg > 1:1834532/1‑100 (MQ=255)
cAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCACCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACgg > 2:3641809/1‑100 (MQ=255)
gATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGa < 2:493623/98‑1 (MQ=255)
atatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGatat > 1:3870223/1‑100 (MQ=255)
cACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTaaa > 1:3786859/1‑100 (MQ=255)
cTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACa > 1:3503666/1‑100 (MQ=255)
aTTAATGTAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATCGTAATACCCATTCCCCTGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATc < 2:4052542/100‑1 (MQ=255)
aTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAgg > 1:3719099/1‑100 (MQ=255)
aTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAgg < 1:3071149/100‑1 (MQ=255)
tGGAGATATTTGCCTCACCACGGAGAATGGTAATAACCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGc < 2:3645415/100‑1 (MQ=255)
ggAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCt > 1:3216138/1‑100 (MQ=255)
tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGt < 1:2461200/100‑1 (MQ=255)
tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGt > 1:3470712/1‑100 (MQ=255)
tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCAAGGCTTTTGt > 2:37295/1‑100 (MQ=255)
atTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGtt < 2:2694978/100‑1 (MQ=255)
cTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaaca < 1:1468213/100‑1 (MQ=255)
tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:148896/1‑100 (MQ=255)
tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:2762004/1‑100 (MQ=255)
tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag < 1:2120067/100‑1 (MQ=255)
tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:1957282/1‑100 (MQ=255)
caccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacaga < 2:1677301/100‑1 (MQ=255)
accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 1:390418/100‑1 (MQ=255)
accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 2:1451673/100‑1 (MQ=255)
accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 1:3429477/100‑1 (MQ=255)
ccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaac < 2:3702741/100‑1 (MQ=255)
ccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 2:885558/99‑1 (MQ=255)
acttagaATGGTAATACCCAATCCCCAGAAGATAGCCTCATCGAAGTTAATACGATAGAGACGGAGATTAAACAGCCAGGCTTTTGTTAAaacagaacag < 2:2154753/96‑1 (MQ=255)
gtgggctGGGAATAGCCATACTCCGGACGCGTTCCTCATCGTAAGTACCACGATAGCGACTAATATTAGACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaac < 2:3930641/90‑1 (MQ=255)
ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACCGtt > 2:1150090/1‑100 (MQ=255)
ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGtt > 2:1873988/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGTAATACCCATTGCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:2102015/100‑1 (MQ=255)
gagaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg > 1:819122/1‑100 (MQ=255)
gagaATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATGGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:2294979/100‑1 (MQ=255)
gagaATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:776570/100‑1 (MQ=255)
gaATGGTAATACCGATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCAAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa > 1:2807134/1‑100 (MQ=255)
gaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa < 1:3364444/100‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa < 2:4096819/100‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa > 2:3119613/1‑100 (MQ=255)
aaTGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa < 1:1865208/100‑1 (MQ=255)
tGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATg > 1:3439833/1‑100 (MQ=255)
tGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATg < 1:2510733/100‑1 (MQ=255)
gTAATACCCATTCCCTGTACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGATACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 2:344714/1‑100 (MQ=255)
gTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 1:2211400/1‑100 (MQ=255)
gTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 2:614435/1‑100 (MQ=255)
gTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATggn < 2:910274/100‑2 (MQ=255)
tAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCa < 2:3503644/100‑1 (MQ=255)
tAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 1:3586591/1‑99 (MQ=255)
aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:862578/1‑100 (MQ=255)
aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:3389408/1‑100 (MQ=255)
aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:472499/1‑100 (MQ=255)
cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 2:3424799/1‑100 (MQ=255)
cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc < 2:1971672/100‑1 (MQ=255)
cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 1:1825571/1‑100 (MQ=255)
cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATGAACACGATAGATACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 2:1636341/1‑100 (MQ=255)
cccATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACATGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc < 1:2905725/100‑1 (MQ=255)
ccATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCt > 2:2603692/1‑100 (MQ=255)
cATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCtt > 1:3171321/1‑100 (MQ=255)
aTTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTCTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTa < 2:2474048/100‑1 (MQ=255)
ttCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 2:3206460/100‑1 (MQ=255)
tCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaaa < 2:2348580/100‑1 (MQ=255)
ccccGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAt > 2:1088694/1‑100 (MQ=255)
cTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTg < 1:3223597/100‑1 (MQ=255)
|
GTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGG > NC_000913/4281868‑4282066
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
