Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I1 R1
|
117 |
93.2 |
4682243 |
93.4% |
4373214 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,603,361 |
A→G |
intergenic (‑503/‑116) |
yjjP ← / → yjjQ |
DUF1212 family inner membrane protein/putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,603,361 | 0 | A | G | 98.4%
| 442.7
/ ‑4.5
| 124 | intergenic (‑503/‑116) | yjjP/yjjQ | DUF1212 family inner membrane protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (63/58); total (64/60) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGA > NC_000913/4603265‑4603457
|
ttAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAg < 2:815947/100‑1 (MQ=255)
ttAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAg < 1:144601/100‑1 (MQ=255)
aaaTGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTg < 2:851399/100‑1 (MQ=255)
gTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATg < 1:1369792/100‑1 (MQ=255)
gTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATg > 2:177135/1‑100 (MQ=255)
tctcCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGc < 2:1701714/100‑1 (MQ=255)
tcCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTa < 2:345215/100‑1 (MQ=255)
ccAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGATACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTaa < 2:1172232/100‑1 (MQ=255)
ccAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTaa > 2:187258/1‑100 (MQ=255)
ccAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTaa > 2:88598/1‑100 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGTGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGAGAATGCTAAg > 1:124850/1‑100 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAg < 1:2011600/100‑1 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAg > 1:479438/1‑100 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAg < 1:1016797/100‑1 (MQ=255)
aGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAgg < 1:804525/100‑1 (MQ=255)
tATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATaa > 1:1910195/1‑100 (MQ=255)
ttCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAAttt < 2:1794136/100‑1 (MQ=255)
ccAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTAttn < 2:362130/100‑2 (MQ=255)
ccAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTc > 2:489625/1‑100 (MQ=255)
ccAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTc < 2:2265556/100‑1 (MQ=255)
ggTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCt < 1:2176283/100‑1 (MQ=255)
ggTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCt < 1:623337/100‑1 (MQ=255)
ggTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCt > 2:884552/1‑100 (MQ=255)
tATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTaa < 1:884554/100‑1 (MQ=255)
aTCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGGGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAAt < 1:291628/100‑1 (MQ=255)
cATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCt > 1:698729/1‑100 (MQ=255)
cATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCt < 1:114117/100‑1 (MQ=255)
tttGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGCTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTAt < 1:1642749/100‑1 (MQ=255)
ttGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTAtt < 2:1128948/100‑1 (MQ=255)
tGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAAtt > 2:2313889/1‑100 (MQ=255)
tGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAAtt > 2:124209/1‑100 (MQ=255)
cTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTg > 2:157821/1‑100 (MQ=255)
cTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTg < 2:73095/100‑1 (MQ=255)
cTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATATCTTAATTTg > 1:427982/1‑100 (MQ=255)
tAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGc > 2:1754838/1‑100 (MQ=255)
aaCCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCt < 2:479436/100‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTg > 2:802063/1‑100 (MQ=255)
aCCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTg < 1:177137/100‑1 (MQ=255)
ttCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGaa < 1:1918463/100‑1 (MQ=255)
tCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATAGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTg < 2:588475/96‑1 (MQ=255)
gACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAt > 1:1901048/1‑100 (MQ=255)
gACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAt < 2:439271/100‑1 (MQ=255)
cacaTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAttt > 1:953394/1‑100 (MQ=255)
cacaTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAttt > 2:1991/1‑100 (MQ=255)
cacaTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAttt < 1:489627/100‑1 (MQ=255)
acaTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTa < 2:1248863/100‑1 (MQ=255)
caTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTaa > 2:291524/1‑100 (MQ=255)
caTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTaa > 2:291921/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 1:753991/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 2:578800/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 2:956628/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 1:1438538/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 1:1807868/1‑100 (MQ=255)
ccgatctaGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGCAACATTTAAGga < 1:1531138/93‑1 (MQ=255)
cAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaa < 2:753990/100‑1 (MQ=255)
aGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaat < 2:544953/100‑1 (MQ=255)
aGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTGAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaat < 2:1540826/100‑1 (MQ=255)
gTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatg > 2:1309980/1‑100 (MQ=255)
ggAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaa < 2:698728/100‑1 (MQ=255)
gAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaat < 2:1720364/100‑1 (MQ=255)
gAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaat > 2:630634/1‑100 (MQ=255)
aGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaagatcgg > 2:355076/1‑94 (MQ=255)
aGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATAGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAGGgaagatcgg > 2:1531134/1‑94 (MQ=255)
ttgttgTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATc > 1:1839049/1‑100 (MQ=255)
tgttgtGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATcc > 1:2233116/1‑100 (MQ=255)
gttgtGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCt > 1:904562/1‑100 (MQ=255)
ttgtGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTg > 2:1698325/1‑100 (MQ=255)
ttgtGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTg < 1:1769846/100‑1 (MQ=255)
tgtgCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGa > 2:1591830/1‑100 (MQ=255)
tgCAGCAGGAGTATGCTGATATGATAGTTAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAAt < 2:22990/100‑1 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGagat > 1:1938626/1‑97 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATa > 1:1079780/1‑100 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATAAGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATa > 2:1428774/1‑100 (MQ=255)
cagcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaa > 1:262795/1‑100 (MQ=255)
agcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaaa > 2:993131/1‑100 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc > 1:1612421/1‑100 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc > 1:2112269/1‑100 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc > 1:393188/1‑100 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc > 1:792779/1‑100 (MQ=255)
gAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACcatc < 2:2004136/100‑1 (MQ=255)
gTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACcatcat < 1:574324/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATaa > 2:1184714/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAt > 2:241689/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAt > 2:848518/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAt > 1:273951/1‑100 (MQ=255)
gCTGATATGTAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtt > 2:336062/1‑100 (MQ=255)
gCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtt < 2:1877347/100‑1 (MQ=255)
gCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtt < 1:578801/100‑1 (MQ=255)
gCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtt < 1:291923/100‑1 (MQ=255)
gCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtt < 1:291526/100‑1 (MQ=255)
cTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttt > 2:2184276/1‑100 (MQ=255)
tGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGACTATCCTGAATAAACCATCATAAtttt < 1:1428778/100‑1 (MQ=255)
tGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtttt > 1:781292/1‑100 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt < 2:719464/100‑1 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt < 1:612115/100‑1 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt > 2:1987366/1‑100 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt < 2:137008/100‑1 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt < 1:1309983/100‑1 (MQ=255)
atatGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTa < 1:157823/100‑1 (MQ=255)
tatGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAg < 1:88600/100‑1 (MQ=255)
|
TTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGA > NC_000913/4603265‑4603457
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
