Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I0 R1
|
247 |
174.3 |
8556966 |
94.2% |
8060661 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,603,361 |
A→G |
58.0% |
intergenic (‑503/‑116) |
yjjP ← / → yjjQ |
DUF1212 family inner membrane protein/putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,603,361 | 0 | A | G | 58.0%
| 89.9
/ 175.4
| 156 | intergenic (‑503/‑116) | yjjP/yjjQ | DUF1212 family inner membrane protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/29); new base G (48/42); total (85/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGACAG > NC_000913/4603263‑4603460
|
ttttAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCACTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGaa < 2:3005257/100‑1 (MQ=255)
tttAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGaaa > 1:131628/1‑100 (MQ=255)
aaTGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGa < 2:3485813/100‑1 (MQ=255)
tGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGTAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAAt < 2:1038775/100‑1 (MQ=255)
tGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAAt > 1:924659/1‑100 (MQ=255)
tGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAAt > 2:1842268/1‑100 (MQ=255)
tGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAAt > 2:1487127/1‑100 (MQ=255)
tGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAAt > 1:924681/1‑100 (MQ=255)
gTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATg < 2:3102230/100‑1 (MQ=255)
ctcCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCt > 2:4252016/1‑100 (MQ=255)
ctcCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACATTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCt > 1:2632107/1‑100 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAg > 1:2098074/1‑100 (MQ=255)
cAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAg < 2:3854283/100‑1 (MQ=255)
ggCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCCGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGa > 1:2963493/1‑100 (MQ=255)
ggCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGCTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGa > 2:2766276/1‑100 (MQ=255)
cTATTTCACCAGGTTATCATTTGACGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATa > 2:396733/1‑100 (MQ=255)
tATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATaa > 2:3075685/1‑100 (MQ=255)
aTTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAAt > 1:3692561/1‑100 (MQ=255)
cACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCCGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTAt > 1:44221/1‑100 (MQ=255)
cACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTTCAGCAGGAGCCTGCTCATATGCAAGTGAATGCTAAGGAAAAtt > 1:1717533/1‑97 (MQ=255)
cACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCATGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTAt < 1:2383217/100‑1 (MQ=255)
ccAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGCTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTc > 1:3566709/1‑100 (MQ=255)
aGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGc > 2:4168544/1‑100 (MQ=255)
aGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGc < 1:1409608/100‑1 (MQ=255)
ggTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGc < 1:1793846/99‑1 (MQ=255)
gTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCtt < 2:2002161/100‑1 (MQ=255)
ttATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTa < 2:1904655/100‑1 (MQ=255)
tCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATc > 1:309857/1‑100 (MQ=255)
tCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATc < 2:1331553/100‑1 (MQ=255)
cATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCt > 1:1668189/1‑100 (MQ=255)
aTTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTa > 2:377989/1‑100 (MQ=255)
aTTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTa < 1:3462536/100‑1 (MQ=255)
aTTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTa > 2:3536745/1‑100 (MQ=255)
aTTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTa > 2:3881081/1‑100 (MQ=255)
tttGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTAt > 2:1959613/1‑100 (MQ=255)
tGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAAtt > 2:2632812/1‑100 (MQ=255)
tGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAAtt < 2:4010847/100‑1 (MQ=255)
tGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAAtt < 2:394673/100‑1 (MQ=255)
cTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTg > 1:2462935/1‑100 (MQ=255)
tAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGc > 2:2575711/1‑100 (MQ=255)
ccTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTgg < 1:2143582/100‑1 (MQ=255)
tCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGaaa < 1:1016040/100‑1 (MQ=255)
cTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAAc > 1:740397/1‑100 (MQ=255)
tGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAAc < 1:964134/99‑1 (MQ=255)
gACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACa > 2:1460290/1‑99 (MQ=255)
gACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAt > 1:4259942/1‑100 (MQ=255)
gACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACAt > 1:3376514/1‑100 (MQ=255)
caTGCAGAGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTaa > 2:2233931/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg > 2:4074848/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAg < 1:1959609/100‑1 (MQ=255)
tGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTTGAAACATTTAAgg < 1:2637239/100‑1 (MQ=255)
tGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAgg > 2:217305/1‑100 (MQ=255)
tGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAgg < 1:1411228/100‑1 (MQ=255)
cAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATATATTAATTTGCTGGAAACATATAAGgaa > 1:1460691/1‑100 (MQ=255)
aGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaat < 2:1109903/100‑1 (MQ=255)
aGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaat > 2:3140061/1‑100 (MQ=255)
gTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatg > 1:4028727/1‑100 (MQ=255)
gTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatg < 2:1421442/100‑1 (MQ=255)
ccgatcttgttgTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatg < 2:3585915/94‑1 (MQ=255)
ggAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaa < 2:1450425/100‑1 (MQ=255)
ggAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaa > 2:2563457/1‑100 (MQ=255)
gAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGgaatgaat > 1:1739675/1‑100 (MQ=255)
aGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAata > 2:730651/1‑100 (MQ=255)
gttgttGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAatat > 1:3275150/1‑100 (MQ=255)
tgttgtGCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATcc < 1:3516511/100‑1 (MQ=255)
tgtgCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGa < 2:2932906/100‑1 (MQ=255)
tgtgCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGa > 2:3914779/1‑100 (MQ=255)
tgtgCAGCAGGAGTACGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGa > 1:1222396/1‑100 (MQ=255)
gtgCAGCAGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGaa < 2:2393041/100‑1 (MQ=255)
gtgCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGaa > 1:947194/1‑100 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATa < 1:2261693/100‑1 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATa > 1:3807324/1‑100 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATa > 1:605628/1‑100 (MQ=255)
gcagcaGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAAAATTTAAGGAATGAATATCCTGAAt > 1:956830/1‑99 (MQ=255)
cagcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaa > 2:845976/1‑100 (MQ=255)
cagcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaa > 1:1119015/1‑100 (MQ=255)
agcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaaa < 2:489734/100‑1 (MQ=255)
agcagGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATaaa < 2:683058/100‑1 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGTTATGAAAGTGAATGCTAAGGAAAATTTATACGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc < 1:843143/100‑1 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTCAGGATTATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc < 1:2889346/100‑1 (MQ=255)
gcagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAc > 1:3883380/1‑100 (MQ=255)
cagGAGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAAcc < 1:4159099/100‑1 (MQ=255)
agGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACca < 1:1617870/100‑1 (MQ=255)
aGTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACcatca < 2:2113873/100‑1 (MQ=255)
gTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACcatcat > 1:3174088/1‑100 (MQ=255)
gTATGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCACTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACcatcat > 1:2518364/1‑100 (MQ=255)
aTGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATaa > 2:2721768/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAt > 2:632294/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATTAATATCCTGAATAAACTATCATAAt > 2:630522/1‑100 (MQ=255)
cTGATATGGAAGTGAATGCTCAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATCTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGCATAAACCATCATAAtt > 1:101870/1‑99 (MQ=255)
cTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttt > 1:2382071/1‑100 (MQ=255)
tGATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAtttt < 1:2515640/100‑1 (MQ=255)
gATATGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAAttttt < 1:3634369/100‑1 (MQ=255)
atatGGAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTa < 2:1370529/100‑1 (MQ=255)
atatGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATGTCCTGAATAAACCATCATAATTTTTa < 2:474520/100‑1 (MQ=255)
atatGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTa < 2:924961/100‑1 (MQ=255)
tatGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAg < 2:3806859/100‑1 (MQ=255)
tatGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAg > 1:1957663/1‑100 (MQ=255)
ttaaaGTGTATGCTAAGTATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAATGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGAc < 1:3617136/98‑1 (MQ=255)
tGAAAGTGAATGCTCAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGAc > 1:4060406/1‑100 (MQ=255)
|
TTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAGTATGCTGATATGAAAGTGAATGCTAAGGATAATTTATTCGCTTAATCTATTAATTTGCTGGAAACATTTAAGGAATGAATATCCTGAATAAACCATCATAATTTTTAGACAG > NC_000913/4603263‑4603460
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
