Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I2 R1
|
780 |
68.3 |
3343050 |
93.5% |
3125751 |
102.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,759,680 |
(C)5→6 |
coding (844/1221 nt) |
sufS ← |
cysteine desulfurase, stimulated by SufE, selenocysteine lyase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,759,675 | 1 | . | C | 98.5%
| 225.0
/ ‑3.7
| 66 | coding (849/1221 nt) | sufS | cysteine desulfurase, stimulated by SufE, selenocysteine lyase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (33/32); total (34/32) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
GGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCT > NC_000913/1759541‑1759807
|
gggCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc < 2:1220226/139‑1 (MQ=255)
ggCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑ccc > 1:659550/1‑139 (MQ=255)
agTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTggg > 2:358877/1‑139 (MQ=255)
gaTCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACGAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTAc > 1:960857/1‑139 (MQ=255)
ccGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCgg > 2:1503200/1‑139 (MQ=255)
cGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGc > 2:184261/1‑139 (MQ=255)
ggTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCt > 2:779880/1‑139 (MQ=255)
aTTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAcc > 2:1445999/1‑139 (MQ=255)
aTTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAcc > 2:1222116/1‑139 (MQ=255)
tCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCg < 2:1137350/138‑1 (MQ=255)
tCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCACCCGGGATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCg > 1:1137350/1‑138 (MQ=255)
cAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCa < 1:358877/139‑1 (MQ=255)
aGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCAt > 1:412981/1‑139 (MQ=255)
aGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc > 1:882720/1‑106 (MQ=255)
aGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc < 2:882720/106‑1 (MQ=255)
aTAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCtt > 1:251373/1‑139 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGt > 1:601866/1‑139 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGt < 2:659550/139‑1 (MQ=255)
gcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTc < 1:1445999/139‑1 (MQ=255)
cATAATGCATCAGATTTTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc < 2:1136115/139‑1 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTc > 1:713562/1‑136 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTc < 2:713562/136‑1 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc < 1:1637332/91‑1 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc > 2:1637332/1‑91 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt < 2:412981/139‑1 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt > 2:13078/1‑139 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt < 1:1222116/139‑1 (MQ=255)
cAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCa > 2:784558/1‑115 (MQ=255)
cAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCa < 1:784558/115‑1 (MQ=255)
cAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcc < 1:184261/139‑1 (MQ=255)
cTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACt < 1:1503200/139‑1 (MQ=255)
cTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACt < 2:960857/139‑1 (MQ=255)
tGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTc > 1:244933/1‑139 (MQ=255)
ttCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc < 2:1607051/72‑1 (MQ=255)
ttCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc > 1:1607051/1‑72 (MQ=255)
tCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAgg > 2:686897/1‑139 (MQ=255)
ggCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGt < 2:244933/139‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:1276467/116‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg > 2:1276467/1‑116 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑ccccggt < 1:1025471/69‑5 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc > 1:841595/1‑64 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑cc < 2:841595/64‑1 (MQ=255)
acTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑cc‑ccccggt > 2:1025471/2‑65 (MQ=255)
tATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 1:686897/139‑1 (MQ=255)
tATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:926058/139‑1 (MQ=255)
tGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATgg < 1:385734/95‑1 (MQ=255)
tGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATgg > 2:385734/1‑95 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 2:854435/92‑1 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 1:854435/1‑92 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTc > 2:609271/1‑98 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTc < 1:609271/98‑1 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 1:15006/1‑130 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:15006/130‑1 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGa > 1:1384623/1‑139 (MQ=255)
ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 1:156966/127‑1 (MQ=255)
ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 2:156966/1‑127 (MQ=255)
ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAcc > 2:1177651/1‑139 (MQ=255)
cccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACt > 2:309540/1‑111 (MQ=255)
cccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGGATTGTGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACt < 1:309540/111‑1 (MQ=255)
gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 2:1435470/1‑84 (MQ=255)
gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:1435470/84‑1 (MQ=255)
gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGc < 2:1517922/136‑1 (MQ=255)
gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGc > 1:1517922/1‑136 (MQ=255)
gAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGt > 2:968390/1‑84 (MQ=255)
gAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTAGt < 1:968390/84‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAcggcg < 2:251373/139‑1 (MQ=255)
gcgccgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:1507214/66‑1 (MQ=255)
gcgccgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 2:1507214/1‑66 (MQ=255)
cgccgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg > 2:429273/1‑78 (MQ=255)
cgccgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:429273/78‑1 (MQ=255)
cgccgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAtctc > 1:600342/1‑139 (MQ=255)
cgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:1382321/62‑1 (MQ=255)
cgcgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 2:1382321/1‑62 (MQ=255)
cgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 2:307920/60‑1 (MQ=255)
cgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 1:307920/1‑60 (MQ=255)
cgccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGca > 1:391307/1‑139 (MQ=255)
ccAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGcaac < 2:601866/139‑1 (MQ=255)
cAAGACCAATGATGCCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGcaaca < 1:779880/139‑1 (MQ=255)
atgatgcCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAt > 2:398707/1‑120 (MQ=255)
atgatgcCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAt < 1:398707/120‑1 (MQ=255)
atgatgcCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGcttct < 2:1384623/139‑1 (MQ=255)
atgatgcCC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGcttct > 2:174823/1‑139 (MQ=255)
|
GGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CC‑CCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCT > NC_000913/1759541‑1759807
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
