Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F84 I1 R1
|
23 |
34.8 |
1446234 |
89.3% |
1291486 |
142.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,287,424 |
+T |
intergenic (‑53/‑340) |
acs ← / → nrfA |
acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming)/cytochrome c552 nitrite reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,287,423 | 1 | . | T | 98.8%
| 231.4
/ ‑6.0
| 81 | intergenic (‑52/‑341) | acs/nrfA | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming)/cytochrome c552 nitrite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base T (51/29); minor base A (1/0); total (52/29) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.84e-01 |
ATTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATG‑TAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGC > NC_000913/4287281‑4287559
|
aTTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATg > 1:436783/1‑143 (MQ=255)
tgATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATG‑ttagg > 1:323254/1‑139 (MQ=255)
aTCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGCTGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCGTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAACGTTAGGGGTAtt > 2:578098/1‑143 (MQ=255)
tCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGCTGTTGGCAGGAATGGTGTGGTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAAGAATATGTGGTTTATGTGTGAATTGTTGGGGGTATTg > 2:602045/1‑143 (MQ=255)
tCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGACTTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCGTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGGAtgg > 2:138191/1‑141 (MQ=255)
tCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTCGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGGATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATGAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTg > 2:669182/1‑143 (MQ=255)
cGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTgg > 1:721296/1‑143 (MQ=255)
cggTAGTGCTGAGGGTGTTTCGGGCATCGGTCTGGCTTGTGGGGAGGTATGGTGTGTTTGTGAATCTGGCTCATGCTTTGGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGAGGCATATGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGt < 2:290869/141‑1 (MQ=255)
gtgctgctgAGGGTTTATCAGGCGACGGTCTGCGATGGTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGttt < 1:462480/140‑1 (MQ=255)
tatgcgtgAGGGTTCATCAGGCATCGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGtttt < 1:230810/137‑1 (MQ=255)
tACTGCTGGGGGTTTTTCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGtttt < 2:569374/143‑1 (MQ=255)
tACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGtttt > 2:106682/1‑143 (MQ=255)
ctgctgAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGt < 1:653402/143‑1 (MQ=255)
tgctgAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGtt < 1:74996/143‑1 (MQ=255)
ctgAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCATGAATTGTGTGTTTTTTTATTTGTCTCATGCTTTTGGTCGCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTa < 1:238119/143‑1 (MQ=255)
ctgAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTa < 1:576838/143‑1 (MQ=255)
tgAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCAGAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAg > 2:427967/1‑143 (MQ=255)
aGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGAAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTa < 1:501593/143‑1 (MQ=255)
gggttATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTACATGTTAGGGGTATTGGCAGCTTTGTTTAGTGtt > 2:239181/4‑143 (MQ=255)
gTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTAttt < 1:607041/143‑1 (MQ=255)
gTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGGATTGGCAGTTTTGTTTAGTaaat > 1:20447/1‑140 (MQ=255)
aGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGATTAGTATTAgggtaaa > 2:50399/1‑139 (MQ=255)
aGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGATAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTGAGGATTTGTGCGAc > 2:572796/1‑143 (MQ=255)
aGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGCGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGATATTGGCAGTTTTGTATACCATTTggagaac > 2:191002/1‑138 (MQ=255)
ggCACCGGTCTGCAATGACAGCTGGAATGGGGTGTTTGTGAATGTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGGAGGATGTTAATAATATGTGTCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACa < 1:20557/143‑1 (MQ=255)
ggCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACa > 2:164464/1‑143 (MQ=255)
ggCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACa > 1:109482/1‑143 (MQ=255)
ggCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCATGTATGAGGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTCTGTTTAGTATTTGGGCGACa > 2:473541/1‑143 (MQ=255)
gCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGCATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAACTGTTAGGGGTCTTGGCAGTTTTGTTTAGTATTGGGGCGACAg > 2:192402/1‑143 (MQ=255)
gCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGGTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTGTAGTATTTGGGCGACAg > 2:419164/1‑143 (MQ=255)
ggTCTGCGATGTTGACAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCAc < 2:363908/143‑1 (MQ=255)
gTCTGCGAGGTGGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAGTGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACg < 2:368706/143‑1 (MQ=255)
gCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTATCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGAAGATTTGATGAGGATTTGGGCGACAGATCACGCaac > 2:314134/1‑142 (MQ=255)
gATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGAGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATAGGCAGTTTTGTGTAGTATTTGGGCGAGAGATCACGCAagag > 2:49914/1‑143 (MQ=255)
aTGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGt > 1:468324/1‑143 (MQ=255)
ttGGCAGGAGTGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTGAATAGTATGTGTCATAAGCGCTAAATGTTGGGGGTNTGGGCAGTTTTGTTTAGTAGTTGGGCGACAGAGCACGGAAAGGTAGa > 2:109387/1‑143 (MQ=255)
ggCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCCTAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAAt > 2:482847/1‑143 (MQ=255)
gtaaTGCTGTTTTTTTGATTTTGGCTCTTGCTTTTGTTCTCCTTGTATGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATtgtg < 2:509900/141‑1 (MQ=255)
ggAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATtgtg < 1:427967/143‑1 (MQ=255)
aaTGGTGTGTTTGTAGATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATGATATGTGGTGTAATCGTTATTTGTTTGGCGCAGGATCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCa < 2:511980/143‑1 (MQ=255)
aaTGGTGTGTTTGTAATGTTGGCTCATGCTTTTGTTTGCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCa < 2:154087/143‑1 (MQ=255)
gtgtgtTTGTGAATTTGGCGCATGCTGTTGTTCTCCCTGGAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAAGGTTAGGGGTATTGGCAGCTTTGTTCAGTATTTAGGCGACAGATCACGCAGAAGTAGAATTGTGcgactc > 2:155938/1‑138 (MQ=255)
gtTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGATAATAAACTGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTAGGCGACAGATCACGCAAAAGGAGAATTGTGCaaaatctcg > 2:379437/1‑137 (MQ=255)
tttGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTATATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTACTATTTGTGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACgg > 2:63369/1‑143 (MQ=255)
gtgAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAg > 1:120634/1‑143 (MQ=255)
gAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAggg > 1:375829/1‑143 (MQ=255)
aaTTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATACACGGCAGGGt > 2:393203/1‑143 (MQ=255)
tttGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTaa > 1:406468/1‑143 (MQ=255)
ttGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATCAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTGTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAGCGTAGAATTGTGCAAAGAAGCGGAAGGGTAAt > 2:666936/1‑143 (MQ=255)
ttGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTGTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAAt < 1:614897/143‑1 (MQ=255)
tGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAAtt > 1:434909/1‑143 (MQ=255)
ggCTCATGCTTTTGTTCTCCTTTTAGGATGTTAATATTATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAAttt < 1:553944/143‑1 (MQ=255)
cTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTGTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCCGGGTAAtttgt > 2:30992/1‑141 (MQ=255)
tCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTCGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTg > 2:25075/1‑143 (MQ=255)
tCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTg > 1:708224/1‑143 (MQ=255)
tCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTg > 1:198576/1‑143 (MQ=255)
tCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAAATTTTg > 2:136686/1‑143 (MQ=255)
aTGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGaa > 1:280893/1‑143 (MQ=255)
aTGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGaa < 1:106682/143‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGaa > 1:708613/1‑143 (MQ=255)
gCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAgg > 1:406112/1‑143 (MQ=255)
cTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGt > 1:55106/1‑143 (MQ=255)
cTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGt < 2:138602/143‑1 (MQ=255)
tttGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAGTTTTTGAAGGT‑Ca > 2:459536/1‑143 (MQ=255)
tttGTGCTCCTTGTATGATGTTTATGATCTGTTGTATTGGCGTTAGGTGTTAGGCGTACTGGCAGTTTTGTTTGGTATTTGGTCGACAGATTACGTTAGAGTAGGGTTGTTCTAGTAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑Ca < 2:670546/143‑1 (MQ=255)
ttGTGCGCCTTGTTGGATGTTACTAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTGTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCTGAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAg < 2:219119/143‑1 (MQ=255)
ctcCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGcaaca > 1:442556/1‑143 (MQ=255)
cTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAGTTTTTGAAGGT‑CAGCAACaaaa > 1:10112/1‑143 (MQ=255)
cTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACaaaa < 2:137251/143‑1 (MQ=255)
ttGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAg > 1:640498/1‑143 (MQ=255)
tGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATGTTTGAAGGT‑CAGCAACACAAGTTGATTaa > 2:185675/1‑143 (MQ=255)
taataTGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCttt > 1:628183/1‑143 (MQ=255)
aataTGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTg < 1:431578/143‑1 (MQ=255)
atatGTGGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGa > 1:422114/1‑143 (MQ=255)
tgtgGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGa < 1:273044/143‑1 (MQ=255)
tgGTATAAGCGGTAAGTGTTAGGGGGATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAAc < 2:165856/143‑1 (MQ=255)
tgGCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAAc > 1:10157/1‑143 (MQ=255)
gCATAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTCTTTGGGCGAGAGATCAAGCACGAGTAGAATTGTGCAAAGAACCGGCAGGGCAATTGTTCAAGGT‑CAGCAACAAAAGTGGATTAATGCTTTGAGGagcct > 2:273822/1‑139 (MQ=255)
tAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGCATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTCATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAAGATGcg > 1:295365/1‑142 (MQ=255)
tAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAGGGTAGAGCGGGAAAA‑ATGATTAATTTTTTGAGGAACATGCa < 2:323254/143‑1 (MQ=255)
tAAGCGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCa < 2:134624/143‑1 (MQ=255)
cGTTAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTAGAGGAACATGCAGTTa > 2:381975/1‑143 (MQ=255)
ttaatgg‑TAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTATTATTTGGGCGACAGATCACGCAATAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAGTTCTTTTAGGAACATGCAGTTatgc < 2:632133/137‑1 (MQ=255)
ttAAATGTTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTAGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTatg > 1:228555/1‑143 (MQ=255)
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ATTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATG‑TAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGT‑CAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGC > NC_000913/4287281‑4287559
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
