Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
102,502 |
A→G |
A90A (GCA→GCG) |
ddlB → |
D‑alanine‑D‑alanine ligase B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 102,502 | 0 | A | G | 99.6%
| 779.8
/ ‑5.1
| 249 | A90A (GCA→GCG) | ddlB | D‑alanine‑D‑alanine ligase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (135/113); total (136/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.71e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCATCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGC > NC_000913/102412‑102591
|
cgcgCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTc < 2:1511238/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCCACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATACTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCt < 2:4985433/93‑1 (MQ=255)
gcgcTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCt < 2:2425784/93‑1 (MQ=255)
gcTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgg > 1:1036307/1‑92 (MQ=255)
gcTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgc > 2:6067828/1‑93 (MQ=255)
cTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgcg > 1:5115447/1‑93 (MQ=255)
tACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgcgc > 1:1864172/1‑93 (MQ=255)
tACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgcgc > 1:5794753/1‑93 (MQ=255)
tACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTgcgc < 1:271931/93‑1 (MQ=255)
tACACGGTCGCGGCGGGGAAAATGGTCCGCTGCAGGGGATGTTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGCAGCGGCAGGATGGCGTCTgtcc > 2:6652933/1‑90 (MQ=255)
cacGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCtt > 2:5567218/1‑93 (MQ=255)
cacGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCtt < 1:412436/93‑1 (MQ=255)
acGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCttt > 2:7922476/1‑93 (MQ=255)
acGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCttt < 2:2185827/93‑1 (MQ=255)
cGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTc > 1:2025266/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGCTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCa > 1:5615781/1‑93 (MQ=255)
tCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAAt < 2:1474388/93‑1 (MQ=255)
cgcgGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGAGCTTTCAATg > 2:2798078/1‑93 (MQ=255)
cggcggTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTCTACCGGAGGCGGAGTGATGGGGTCTGCGCTTTCAATggt > 1:2182010/1‑92 (MQ=255)
ggcggTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGAt < 2:637455/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATaaa < 1:4526482/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATaaa > 1:6885862/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACt > 2:3251260/1‑93 (MQ=255)
tGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACt > 1:6098189/1‑93 (MQ=255)
gAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTa > 1:4062416/1‑93 (MQ=255)
aaGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTGTGCGCTTTCAATGGATAAACTAc > 2:4277798/1‑93 (MQ=255)
aaGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAc > 1:3100040/1‑93 (MQ=255)
aaGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAc > 2:2333248/1‑93 (MQ=255)
aaGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAc > 2:4545687/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACg > 1:3515228/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACg > 1:7119274/1‑93 (MQ=255)
gATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACgc > 2:1449523/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCaa > 2:7928395/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAAc < 2:469977/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCAGGGGATGCTCGAGCNGNTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAAc < 1:3824005/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGGGGGTGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACtt < 2:5403417/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACtt > 2:3037919/1‑93 (MQ=255)
cTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACtt < 1:4436802/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTc > 1:5430719/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTc < 1:1023315/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTc < 2:3539835/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTa < 2:1065323/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTa < 1:798913/93‑1 (MQ=255)
ggggATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGGGTCTGGGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTCTg > 1:5204381/1‑93 (MQ=255)
ggggATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATg > 1:6523236/1‑93 (MQ=255)
ggggATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATg > 2:3713083/1‑93 (MQ=255)
gATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCa < 1:2356459/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCaa > 1:6920798/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAg > 2:2552904/1‑93 (MQ=255)
gCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAgg > 2:5849066/1‑93 (MQ=255)
gCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAgg < 1:7856393/93‑1 (MQ=255)
gCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAgg < 2:7898827/93‑1 (MQ=255)
gCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAgg > 2:1925083/1‑93 (MQ=255)
cTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAggg > 2:7500328/1‑92 (MQ=255)
cTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGt > 1:5286846/1‑93 (MQ=255)
cTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATAGCAAGGt > 2:5070768/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTg < 2:6750251/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGcc > 2:1379697/1‑93 (MQ=255)
gAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGcc < 1:3650076/93‑1 (MQ=255)
aGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGTATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGTCg > 2:7025477/1‑93 (MQ=255)
aGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCg > 2:1192670/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGt < 1:1843048/93‑1 (MQ=255)
cTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGt < 1:5989990/93‑1 (MQ=255)
gATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGttt > 1:4716434/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGttt > 2:1798253/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGttt > 1:6672092/1‑93 (MQ=255)
aTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTa > 1:7558590/1‑93 (MQ=255)
aTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTa > 1:7668473/1‑93 (MQ=255)
aTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTa > 1:3009990/1‑93 (MQ=255)
tGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTAc < 1:4650303/93‑1 (MQ=255)
gggCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTAcc < 2:6446187/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCg < 1:2295414/93‑1 (MQ=255)
cTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGt < 1:4257221/93‑1 (MQ=255)
cTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGt > 2:6151706/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGt > 2:6548038/1‑93 (MQ=255)
ttGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTc > 1:6590612/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTcg > 1:492079/1‑93 (MQ=255)
gCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTcgc < 1:5060056/93‑1 (MQ=255)
ccTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTcgcg > 2:5609463/1‑93 (MQ=255)
ttATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGcc > 2:4869992/1‑93 (MQ=255)
ttATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGcc < 2:3324659/93‑1 (MQ=255)
ataCCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGt > 1:2878057/1‑93 (MQ=255)
taCCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTg > 1:5760683/1‑93 (MQ=255)
aCCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTATATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTgg < 1:1407801/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTggg < 1:4889439/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTggg < 1:950233/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTggg > 2:3870910/1‑93 (MQ=255)
ccGGAAGAGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTggg < 1:2493678/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTa < 2:6977746/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAg > 1:3175800/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAg > 2:6674507/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGc < 1:6338987/93‑1 (MQ=255)
gCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGt > 2:734739/1‑93 (MQ=255)
gCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGt > 2:7778594/1‑93 (MQ=255)
gggAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGtt < 1:1535691/92‑1 (MQ=255)
gAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTac > 2:1572926/1‑92 (MQ=255)
gAGTGATGGCGTCTCCGCTTTCAATTGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCTCCGTGGGTAGCGTTaa < 2:2274576/93‑1 (MQ=255)
gAGTGACGGCATCTTATCTAGAAATGGATAAAGTACACAACAAACTGCGATGGCAAGGAACTGGTTTACCGAACCCTCCGTGGGTAGCGTTac > 2:2578267/1‑92 (MQ=255)
gTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAAcc < 1:4760993/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAAccc < 1:1335508/93‑1 (MQ=255)
|
CGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCATCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGC > NC_000913/102412‑102591
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TATCGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCATCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG > NC_000913/102409‑102595
|
TATCGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCG > SRR4302543.2778283/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCT < SRR4302543.4606965/94‑1 (MQ=60)
GCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTG > SRR4302543.2580320/1‑94 (MQ=60)
CGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGG > SRR4302543.1045519/1‑94 (MQ=60)
CGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGC > SRR4302543.1037179/1‑94 (MQ=60)
CGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGC > SRR4302543.2287708/1‑94 (MQ=60)
CGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGC < SRR4302543.1677602/94‑1 (MQ=60)
GCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCG > SRR4302543.5161724/1‑94 (MQ=60)
CTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGC > SRR4302543.5847473/1‑94 (MQ=60)
CTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGC > SRR4302543.1880917/1‑94 (MQ=60)
TACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCT < SRR4302543.274321/94‑1 (MQ=60)
TACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGGGATGGCGTCTGCGCT > SRR4302543.4575733/1‑94 (MQ=60)
CACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTT < SRR4302543.416251/94‑1 (MQ=60)
AACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTT < SRR4302543.6758462/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTC > SRR4302543.2043467/1‑94 (MQ=60)
ACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTC > SRR4302543.5279823/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGCTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCA > SRR4302543.5666956/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCA < SRR4302543.4342686/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCA > SRR4302543.6559150/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCA > SRR4302543.5666957/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAAT > SRR4302543.1001864/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAAT < SRR4302543.7635616/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGG < SRR4302543.348594/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGG < SRR4302543.3997687/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGG < SRR4302543.5788930/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTCTACCGGAGGCGGAGTGATGGGGTCTGCGCTTTCAATGGT > SRR4302543.2201571/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGAT < SRR4302543.4822277/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAA < SRR4302543.2144937/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAA > SRR4302543.6950633/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAAC > SRR4302543.5931955/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAAC < SRR4302543.4567674/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACT < SRR4302543.5026754/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACT > SRR4302543.6155967/1‑94 (MQ=60)
GTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACT < SRR4302543.1978669/94‑1 (MQ=60)
TGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTA > SRR4302543.4098792/1‑94 (MQ=60)
GAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAC < SRR4302543.955261/94‑1 (MQ=60)
GAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAC > SRR4302543.3127926/1‑94 (MQ=60)
GAAGATGGTACGCAGCAGGAGATGCTCGAGCTGATGGGCTTACCTTATACCGGAAGCGGAGTGCTGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTAC < SRR4302543.7105523/94‑1 (MQ=60)
AAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACG > SRR4302543.7188439/1‑94 (MQ=60)
AAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACG > SRR4302543.3546626/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGC > SRR4302543.6608254/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGC > SRR4302543.704698/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGC < SRR4302543.4102388/94‑1 (MQ=60)
AGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGC > SRR4302543.6913628/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGC > SRR4302543.5290028/1‑94 (MQ=60)
ATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAG < SRR4302543.7504697/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAG < SRR4302543.7849369/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCA > SRR4302543.2401889/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACT > SRR4302543.3034784/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGGGATGCTCGAGCNGNTGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACT < SRR4302543.3857733/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTC < SRR4302543.4476987/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTC > SRR4302543.6511515/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTC > SRR4302543.5480059/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTC > SRR4302543.1509/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCT < SRR4302543.1032370/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCT < SRR4302543.6968588/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTAT < SRR4302543.805938/94‑1 (MQ=60)
AGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGGGTCTGGGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTCTG > SRR4302543.5251295/1‑94 (MQ=60)
AGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATG > SRR4302543.6584660/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGG > SRR4302543.6592899/1‑94 (MQ=60)
GGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGC > SRR4302543.5454556/1‑94 (MQ=60)
GGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCA < SRR4302543.2850588/94‑1 (MQ=60)
GGATGCTCGAGCTGATGCGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCA < SRR4302543.7936517/94‑1 (MQ=60)
GATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAA > SRR4302543.4182061/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAA > SRR4302543.4310077/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAA > SRR4302543.6985869/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAA < SRR4302543.2377831/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGAGCTGATTGGCTTGCCTTATACCGGAAGCAGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAG < SRR4302543.5172326/94‑1 (MQ=60)
GCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGT < SRR4302543.7930405/94‑1 (MQ=60)
GCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGT < SRR4302543.3334453/94‑1 (MQ=60)
GCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGT > SRR4302543.5334568/1‑94 (MQ=60)
CTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTG > SRR4302543.2592321/1‑94 (MQ=60)
CTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTG > SRR4302543.4794655/1‑94 (MQ=60)
CTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTG > SRR4302543.3061684/1‑94 (MQ=60)
CGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCC > SRR4302543.198945/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCG < SRR4302543.3682152/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGG < SRR4302543.2748939/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGGGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTCGGCAGCAAACTTCTATGGCAAGTTGCCGG > SRR4302543.6158486/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTT < SRR4302543.1859622/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTT > SRR4302543.5440259/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTT < SRR4302543.6044887/94‑1 (MQ=60)
TGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTT < SRR4302543.2365578/94‑1 (MQ=60)
TGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTT > SRR4302543.4759526/1‑94 (MQ=60)
TGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTT > SRR4302543.6735087/1‑94 (MQ=60)
TGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTT > SRR4302543.5124146/1‑94 (MQ=60)
GATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTA > SRR4302543.3037250/1‑94 (MQ=60)
GATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTA > SRR4302543.7741145/1‑94 (MQ=60)
GATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTA > SRR4302543.7630551/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTAC < SRR4302543.4885645/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTAC < SRR4302543.5989381/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACC < SRR4302543.4692623/94‑1 (MQ=60)
GGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGG < SRR4302543.2316349/94‑1 (MQ=60)
GGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGG < SRR4302543.7986676/94‑1 (MQ=60)
GGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGG < SRR4302543.4132003/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGT < SRR4302543.4718214/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTC > SRR4302543.6652704/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTC < SRR4302543.4295873/94‑1 (MQ=60)
TTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCG > SRR4302543.496624/1‑94 (MQ=60)
TGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGC < SRR4302543.7229666/94‑1 (MQ=60)
GCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCG > SRR4302543.7758323/1‑94 (MQ=60)
GCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCG < SRR4302543.5106035/94‑1 (MQ=60)
CTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCC > SRR4302543.1340654/1‑94 (MQ=60)
CTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCC < SRR4302543.3600618/94‑1 (MQ=60)
CTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCC > SRR4302543.1609973/1‑94 (MQ=60)
CTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCC < SRR4302543.1876374/94‑1 (MQ=60)
TATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGT > SRR4302543.2904246/1‑94 (MQ=60)
ATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTG > SRR4302543.5548077/1‑94 (MQ=60)
ATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTG > SRR4302543.5813163/1‑94 (MQ=60)
ATACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTG > SRR4302543.4935823/1‑94 (MQ=60)
ACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGG > SRR4302543.4536159/1‑94 (MQ=60)
ACCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTATATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGG < SRR4302543.1420515/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGCTGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGGAAACTTCTAGGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGT < SRR4302543.958535/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGT < SRR4302543.958534/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGT < SRR4302543.4934013/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGAGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGT < SRR4302543.2516298/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTA < SRR4302543.5128971/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAG > SRR4302543.3204415/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAG > SRR4302543.3780414/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAG > SRR4302543.5012475/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCG < SRR4302543.6398592/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCG > SRR4302543.4064587/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCG < SRR4302543.4715627/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCG < SRR4302543.1470179/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGT < SRR4302543.3104126/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGT < SRR4302543.1369175/94‑1 (MQ=60)
GGGAGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTA < SRR4302543.1549442/94‑1 (MQ=60)
AGTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACC > SRR4302543.1296130/1‑94 (MQ=60)
GTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCC > SRR4302543.66797/1‑94 (MQ=60)
GTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCC < SRR4302543.4804499/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCC > SRR4302543.58365/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAGCTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCG < SRR4302543.367137/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCG < SRR4302543.1347419/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCG < SRR4302543.2316369/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCG < SRR4302543.610875/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTCTGCGCGCTCACTGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACGGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCG < SRR4302543.610874/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGC > SRR4302543.3201685/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGC < SRR4302543.2293663/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCA > SRR4302543.5204807/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAG < SRR4302543.23764/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAG < SRR4302543.441859/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAG < SRR4302543.4792623/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAG < SRR4302543.4792624/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAG < SRR4302543.5617869/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGA > SRR4302543.7803353/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG < SRR4302543.7447902/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG > SRR4302543.3360486/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG < SRR4302543.2034685/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG > SRR4302543.1092125/1‑94 (MQ=60)
GTCNNCGNTTTCAATGGATAANNNANNCANCAAACTTCTATGGCANGGTGCCGGTTTNCCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG < SRR4302543.3891713/94‑1 (MQ=60)
|
TATCGCGCTACACGGTCGCGGCGGTGAAGATGGTACGCTGCAGGGGATGCTCGAGCTGATGGGCTTGCCTTATACCGGAAGCGGAGTGATGGCATCTGCGCTTTCAATGGATAAACTACGCAGCAAACTTCTATGGCAAGGTGCCGGTTTACCGGTCGCGCCGTGGGTAGCGTTAACCCGCGCAGAG > NC_000913/102409‑102595
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
