Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,066,300 |
T→C |
intergenic (‑957/‑330) |
trs56 ← / → b1995 |
IS5 transposase/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,066,300 | 0 | T | C | 100.0%
| 824.6
/ NA
| 256 | intergenic (‑957/‑330) | trs56/b1995 | IS5 transposase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (115/141); total (115/141) |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGAC > NC_000913/2066210‑2066389
|
tctGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCt < 2:87564/93‑1 (MQ=255)
tctGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCt < 1:3993809/93‑1 (MQ=255)
tGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTGAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTa < 1:1628154/93‑1 (MQ=255)
tGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTa > 2:4637637/1‑93 (MQ=255)
gCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAcc > 1:2553705/1‑93 (MQ=255)
cATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGc > 1:2741734/1‑93 (MQ=255)
aTTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCa > 1:2157626/1‑93 (MQ=255)
ttAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCat > 1:5025497/1‑93 (MQ=255)
ttAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCat < 2:6588394/93‑1 (MQ=255)
tAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCata < 2:4422860/93‑1 (MQ=255)
tAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCata < 2:2699773/93‑1 (MQ=255)
gagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtata > 1:6625416/1‑93 (MQ=255)
gagTAACATTCTGCATTCATCCTTTTGAAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtcta < 2:7019249/93‑1 (MQ=255)
agTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATAc < 2:4475302/93‑1 (MQ=255)
gTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACg < 2:669685/93‑1 (MQ=255)
tAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACgg > 1:7124383/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGt > 2:3636148/1‑93 (MQ=255)
ccTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCa < 1:1105053/93‑1 (MQ=255)
cTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCaa > 1:1513783/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAt > 1:2757521/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAt > 1:5440966/1‑93 (MQ=255)
tCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAtt < 2:5300866/93‑1 (MQ=255)
tCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAtt > 2:1034652/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAttt < 2:2122498/93‑1 (MQ=255)
tGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTc < 2:5116528/93‑1 (MQ=255)
tGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTc < 2:2904437/93‑1 (MQ=255)
gCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCa < 1:195576/93‑1 (MQ=255)
cATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAg > 2:2595450/1‑93 (MQ=255)
aTTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGc > 2:6701881/1‑93 (MQ=255)
ttCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCa > 1:4105821/1‑93 (MQ=255)
ttCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCa > 1:801188/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaatt > 2:3431221/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaatt < 2:6370281/93‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaatta > 1:5354117/1‑93 (MQ=255)
cTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaat < 2:1064359/93‑1 (MQ=255)
ttttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaatt > 2:1305908/1‑93 (MQ=255)
ttttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaatt < 1:899634/93‑1 (MQ=255)
ttttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaatt > 2:7219583/1‑93 (MQ=255)
tttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAattaatta > 2:7140555/1‑93 (MQ=255)
tttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAattaatta < 2:1396098/93‑1 (MQ=255)
tttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAattaatta < 1:5819792/93‑1 (MQ=255)
gTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACAt > 2:4555550/1‑93 (MQ=255)
tAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACAtt < 2:1640217/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTa < 1:1410419/93‑1 (MQ=255)
aaaaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTAt > 1:4405161/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATc > 1:627050/1‑93 (MQ=255)
aaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATcc < 1:1326089/93‑1 (MQ=255)
aGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCa < 2:5039595/93‑1 (MQ=255)
atatTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCa > 2:5811530/1‑93 (MQ=255)
atTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaaa < 1:4231809/93‑1 (MQ=255)
atTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaaa > 2:2230438/1‑93 (MQ=255)
atTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaaa < 1:7128769/93‑1 (MQ=255)
tAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGt > 1:3412853/1‑93 (MQ=255)
tAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGt < 1:7336695/93‑1 (MQ=255)
tAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGt > 1:2266653/1‑93 (MQ=255)
tAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGt > 1:4747352/1‑93 (MQ=255)
aGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTa < 1:3266614/93‑1 (MQ=255)
gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTTATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt > 1:2611927/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt < 1:2515470/93‑1 (MQ=255)
gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt > 2:5442560/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt > 2:2791372/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 1:7794556/93‑1 (MQ=255)
tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTCACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 1:6899255/93‑1 (MQ=255)
tCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTg < 1:1670932/93‑1 (MQ=255)
tCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTg < 1:7657770/93‑1 (MQ=255)
tCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTg > 2:7724363/1‑93 (MQ=255)
cAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGt > 1:85151/1‑93 (MQ=255)
aGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtc < 1:6147484/93‑1 (MQ=255)
aGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtc < 1:582988/93‑1 (MQ=255)
gCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtca < 1:7764732/93‑1 (MQ=255)
aaTTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtcatc < 1:4705474/93‑1 (MQ=255)
aTTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtcatca > 1:3889352/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATcac > 2:5995666/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATcac < 2:566961/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATcac < 2:5921992/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACaa < 2:6937691/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACaa < 2:198424/93‑1 (MQ=255)
aCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAat < 2:7091437/93‑1 (MQ=255)
aCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATACACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAat < 1:2482009/93‑1 (MQ=255)
ccGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatg > 2:326854/1‑93 (MQ=255)
cGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatga > 2:5589150/1‑93 (MQ=255)
ggACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgat < 1:1860706/93‑1 (MQ=255)
ggACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgat < 1:5716737/93‑1 (MQ=255)
ggACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgat < 1:5779025/93‑1 (MQ=255)
ggACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgat < 2:4183516/93‑1 (MQ=255)
gACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgatg < 2:3820432/93‑1 (MQ=255)
aCCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATgg < 2:731575/93‑1 (MQ=255)
ccTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGt > 2:7493265/1‑93 (MQ=255)
tgatactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAc < 2:4689121/93‑1 (MQ=255)
gatactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAct > 1:6487586/1‑92 (MQ=255)
atactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACct > 2:5962669/1‑93 (MQ=255)
tctgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttc < 2:6247967/92‑1 (MQ=255)
actgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttc > 1:7786188/1‑93 (MQ=255)
actgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttc < 2:4913960/93‑1 (MQ=255)
ctgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttct > 1:5043800/1‑93 (MQ=255)
atatGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTc < 1:776711/93‑1 (MQ=255)
tatGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCa < 2:4166990/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGa < 1:7507427/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGa > 2:7864122/1‑93 (MQ=255)
gAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGac < 1:523338/93‑1 (MQ=255)
|
TCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGAC > NC_000913/2066210‑2066389
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACTCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCA > NC_000913/2066208‑2066393
|
ACTCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCC > SRR4302543.3439025/1‑94 (MQ=60)
ACTCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCC > SRR4302543.3505830/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCATTATAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTT < SRR4302543.4029364/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTT < SRR4302543.4029365/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTA < SRR4302543.2628440/94‑1 (MQ=60)
TGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTGAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAC < SRR4302543.1642655/94‑1 (MQ=60)
GGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACC > SRR4302543.2577044/1‑94 (MQ=60)
GGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACC < SRR4302543.7308029/94‑1 (MQ=60)
GGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACC < SRR4302543.5076909/94‑1 (MQ=60)
CCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGC > SRR4302543.2766667/1‑94 (MQ=60)
CCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGC > SRR4302543.2766668/1‑94 (MQ=60)
CATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCA > SRR4302543.7648039/1‑94 (MQ=60)
CATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCA > SRR4302543.2176945/1‑94 (MQ=60)
CATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCA > SRR4302543.407925/1‑94 (MQ=60)
ATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAT > SRR4302543.7791195/1‑94 (MQ=60)
ATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAT > SRR4302543.5071234/1‑94 (MQ=60)
TAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATAT < SRR4302543.1967870/94‑1 (MQ=60)
AGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATA > SRR4302543.6687896/1‑94 (MQ=60)
GAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATAC < SRR4302543.3540374/94‑1 (MQ=60)
AGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACG < SRR4302543.2527923/94‑1 (MQ=60)
AGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACG < SRR4302543.2527922/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGG < SRR4302543.2098287/94‑1 (MQ=60)
GTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGG > SRR4302543.7193600/1‑94 (MQ=60)
GTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGG > SRR4302543.7193601/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAA > SRR4302543.6662715/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAA < SRR4302543.1115016/94‑1 (MQ=60)
CCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAA > SRR4302543.1527377/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAT > SRR4302543.7629461/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAT > SRR4302543.5490358/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAT > SRR4302543.2782603/1‑94 (MQ=60)
TGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCA > SRR4302543.5117500/1‑94 (MQ=60)
GCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAG < SRR4302543.197226/94‑1 (MQ=60)
ATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCA > SRR4302543.4142749/1‑94 (MQ=60)
ATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCA > SRR4302543.808238/1‑94 (MQ=60)
ATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCA < SRR4302543.1670034/94‑1 (MQ=60)
ATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATATCAGCA > SRR4302543.808237/1‑94 (MQ=60)
CATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATT < SRR4302543.3342594/94‑1 (MQ=60)
CATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATT < SRR4302543.3125974/94‑1 (MQ=60)
ATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTA > SRR4302543.5733039/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTA > SRR4302543.5402573/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAAT < SRR4302543.6283997/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATT > SRR4302543.1451334/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATT > SRR4302543.6484853/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATT > SRR4302543.6484854/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATT < SRR4302543.548307/94‑1 (MQ=60)
CTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATT < SRR4302543.267018/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATATGGTCAATTTCAGCAATTAATTA < SRR4302543.4398626/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTA < SRR4302543.907577/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTA < SRR4302543.48799/94‑1 (MQ=60)
TTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTAC < SRR4302543.5872710/94‑1 (MQ=60)
TTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTAC < SRR4302543.5872709/94‑1 (MQ=60)
TGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACAT < SRR4302543.2582240/94‑1 (MQ=60)
TTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTCCCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATT < SRR4302543.7747912/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTA < SRR4302543.4143331/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTAT > SRR4302543.4445100/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTAT < SRR4302543.1423165/94‑1 (MQ=60)
AAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATC > SRR4302543.632787/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCC < SRR4302543.7343955/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCC < SRR4302543.2564665/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCC > SRR4302543.1005573/1‑94 (MQ=60)
AAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCA < SRR4302543.1337865/94‑1 (MQ=60)
AGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCAC < SRR4302543.6163937/94‑1 (MQ=60)
AGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCAC > SRR4302543.4769083/1‑94 (MQ=60)
GTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACG < SRR4302543.2330962/94‑1 (MQ=60)
GTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACG < SRR4302543.7864623/94‑1 (MQ=60)
GTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACG > SRR4302543.7856283/1‑94 (MQ=60)
GTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACG > SRR4302543.4508996/1‑94 (MQ=60)
TTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGC < SRR4302543.4534770/94‑1 (MQ=60)
TTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCC < SRR4302543.7950775/94‑1 (MQ=60)
ATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAA > SRR4302543.5375396/1‑94 (MQ=60)
ATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAG < SRR4302543.7198044/94‑1 (MQ=60)
ATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAG < SRR4302543.5548123/94‑1 (MQ=60)
ATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAG < SRR4302543.4270198/94‑1 (MQ=60)
ATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAG > SRR4302543.7445366/1‑94 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT < SRR4302543.5045466/94‑1 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT > SRR4302543.4790741/1‑94 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT > SRR4302543.2287346/1‑94 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT < SRR4302543.7088201/94‑1 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT > SRR4302543.3443409/1‑94 (MQ=60)
TTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGT > SRR4302543.3443410/1‑94 (MQ=60)
TAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTA < SRR4302543.7407273/94‑1 (MQ=60)
AGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTTATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAT > SRR4302543.2635627/1‑94 (MQ=60)
AGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAT < SRR4302543.3296132/94‑1 (MQ=60)
GTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATT < SRR4302543.2538316/94‑1 (MQ=60)
GTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATT > SRR4302543.4380998/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTT < SRR4302543.7868011/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTCACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTT < SRR4302543.6964089/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTG < SRR4302543.2213704/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAATTAACCGGACCTGGTACTGATATTAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGT < SRR4302543.2187333/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGT < SRR4302543.1685911/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGT < SRR4302543.7730363/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGT > SRR4302543.85937/1‑94 (MQ=60)
AGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCA < SRR4302543.588313/94‑1 (MQ=60)
AGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCA < SRR4302543.6205697/94‑1 (MQ=60)
GCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCAT < SRR4302543.7838003/94‑1 (MQ=60)
GCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCAT > SRR4302543.890244/1‑94 (MQ=60)
CAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATC > SRR4302543.831484/1‑94 (MQ=60)
CAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATAACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATC > SRR4302543.664919/1‑94 (MQ=60)
AATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCA > SRR4302543.1342372/1‑94 (MQ=60)
AATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCA > SRR4302543.1633609/1‑94 (MQ=60)
AATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCA < SRR4302543.4748466/94‑1 (MQ=60)
AATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCA > SRR4302543.3923689/1‑94 (MQ=60)
AATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCA < SRR4302543.5876984/94‑1 (MQ=60)
ATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCAC > SRR4302543.7180066/1‑94 (MQ=60)
ACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATG < SRR4302543.2117608/94‑1 (MQ=60)
ACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATACACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATG < SRR4302543.2504478/94‑1 (MQ=60)
CCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGA > SRR4302543.5436611/1‑94 (MQ=60)
CGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGAT < SRR4302543.3001205/94‑1 (MQ=60)
CGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGAT < SRR4302543.6146608/94‑1 (MQ=60)
CGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGAT > SRR4302543.182190/1‑94 (MQ=60)
CGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGAT > SRR4302543.2776655/1‑94 (MQ=60)
GGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATG < SRR4302543.410668/94‑1 (MQ=60)
GGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATG < SRR4302543.5831622/94‑1 (MQ=60)
GGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATG < SRR4302543.5768902/94‑1 (MQ=60)
GGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATG < SRR4302543.1877425/94‑1 (MQ=60)
GACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGG < SRR4302543.7846593/94‑1 (MQ=60)
GACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGG < SRR4302543.917795/94‑1 (MQ=60)
GACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGG < SRR4302543.578236/94‑1 (MQ=60)
ACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGT > SRR4302543.6727134/1‑94 (MQ=60)
CTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAC > SRR4302543.1633670/1‑94 (MQ=60)
TGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACT > SRR4302543.6548705/1‑94 (MQ=60)
TGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACC > SRR4302543.1213732/1‑94 (MQ=60)
ATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTT > SRR4302543.89697/1‑94 (MQ=60)
TACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTC > SRR4302543.7859592/1‑94 (MQ=60)
ACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCT > SRR4302543.1852907/1‑94 (MQ=60)
ACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCT > SRR4302543.5089664/1‑94 (MQ=60)
TGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTT > SRR4302543.5843620/1‑94 (MQ=60)
ATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCA < SRR4302543.783538/94‑1 (MQ=60)
ATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCA < SRR4302543.783536/94‑1 (MQ=60)
TATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAG > SRR4302543.1377280/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGAC < SRR4302543.7579174/94‑1 (MQ=60)
GAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACA < SRR4302543.528187/94‑1 (MQ=60)
AGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACAC > SRR4302543.7246961/1‑94 (MQ=60)
CCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCA < SRR4302543.6708332/94‑1 (MQ=60)
|
ACTCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCA > NC_000913/2066208‑2066393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
