Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I0 R1
|
235 |
6960.4 |
9135780 |
98.4% |
8989607 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,706,025 |
C→A |
22.1% |
intergenic (‑635/‑20) |
yqgB ← / → metK |
acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,706,025 | 0 | C | A | 22.1%
| 352.2
/ 15.0
| 182 | intergenic (‑635/‑20) | yqgB/metK | acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (64/61); new base A (46/3); total (118/64) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-08 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
TGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACG > NZ_CP022686/1705889‑1706160
|
tGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATtct < 3:35939/138‑1 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCATACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCttt < 6:407545/140‑1 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTAACACACAAAATCCCCACCACAGTTTGAGCTAACCAAAATatctat > 6:520218/1‑138 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCATACCAAATTATCttt > 5:1038880/1‑140 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATCAACCCAACAGTTTGAGCATACCAAATTATCttt > 6:520220/1‑140 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 3:484088/138‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 3:1102263/138‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 5:992673/140‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGACAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 2:1108009/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTAGCCATCCATATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 4:639860/137‑1 (MQ=255)
aaaaaTAGCCATCCACATGTTAATCCAACCATACCGAATAACACTCAGACAGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 3:19143/137‑1 (MQ=255)
aaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATGCGCTTCCACACAAAATCCCCAAAACACTTTGAGCGAAACCAATTCTCTTTAGGTg > 5:95133/1‑140 (MQ=255)
aaTAGCCATCCAGATGGTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCAACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGa < 1:766584/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTACTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTCACCAAATTCTCTTTAGGTGa < 4:266760/138‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGa < 4:793830/138‑1 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGATACGCTAACAACCAAAATCAAACCAACAGGTTGAGGTAAGCAAATTATATTTTGGTGATAtt > 1:1018607/1‑140 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTACCCGACCACAGAAAATCCACACAACACTTTGAGCGAACAAAAATCGCTTTATGTGATAtt > 5:442484/1‑140 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGCTCCGCTACCACAAAAAATACAAACAACAGTTTGAGCAAACCCAATTGTATTTAGGTGAAAtt > 6:899097/1‑140 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGTTTCCGCTACCACATCAAATCAACACAACATTTTGAGCTAACCATATTCTCTTTATGTGATAtt > 7:968595/1‑140 (MQ=255)
ccATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTGGCTGCGCGACCCCAGAAAATCCACACAACAGTTTTAGCTAACCAAATTATCATTAGGTGATTTTa > 1:1053593/1‑140 (MQ=255)
cATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAAACAAATTATAATTAGGTGAtaataa > 7:104606/1‑140 (MQ=255)
cATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTGGATACGCGACCACCGAAAAACCCCACAACAGTTTGAGCTAACCCAATTAACTTTAGGGGTTAtt > 3:429894/1‑138 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTTGATGCGCTACCACCGAAAAAACACACAACAGGTTTAGCTGACCAAATTCTATTTATGTGTTATTAAataagtg > 6:987504/1‑136 (MQ=255)
aaTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTAACCCAGCAAATCCACACAACAATTTGAGCTAACCAAATAGTCTTTTGGGGTAATTAAATATGGa‑aaacc > 2:837179/1‑138 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGGTCCGCTACCACAGAAAATCCACACCACAGTTTTAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑aaaaa > 3:680890/1‑137 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTACCAAAGAAAATCCACACACCAGTTTTAGCGAACCAAATTAACATTAGGTGATATTAAATTTGGC‑aaaaa > 4:1072747/1‑137 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCTACCACAAAAAATCCACACAACACTTTGAGCAACCCAAAATATAGTTAGGTGATATTTAATAAGGC‑AAAACACCttt > 8:883174/1‑140 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGATACGCTACCCCAGAAAATACACACAAAAGTTTGAGCTAACCAAATTATATTTAGGTGTTATTTAATATGGG‑AAAAAACCttt > 1:87067/1‑140 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTATGTGATATTAAATATTGC‑AAAACACCttt > 8:533424/1‑140 (MQ=255)
ccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTTCAGAGTCGTGGTAGGATCCCCATCCACAGAAAAACCACACAACAGTTTTAGAGAAAACAAATAACTTTATCTGATTTTAAATATGGG‑AATCCACAtttt > 6:660164/1‑140 (MQ=255)
ccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGATCCGCTACCACAGAAAAAACACACAACAGATTTAGCTAACCAAAATATGTTTTTGTGATAATAAATATTGC‑AAAaaacaattt > 1:415426/1‑135 (MQ=255)
catACCGATTAACACTCAGTCTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCttt < 4:358020/138‑1 (MQ=255)
catACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCttttt < 7:749889/140‑1 (MQ=255)
catACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATACACACAACAGTTTGAGCTAAACAAATTATCTTTATGTGATATTTAATATTGC‑AAAACAACttt > 4:840793/1‑138 (MQ=255)
catACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCttttt < 5:531730/140‑1 (MQ=255)
tACCGATTAACACTCATACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGACGTGGGTAGATACCCGACCAAAAAAAAACCCCAAAACAAATTGAGAGAAACAAATTATGTATAGGTTATTTAAAAAATTTC‑AAAACACCtattaaa > 6:207211/1‑137 (MQ=255)
aCCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAAAACCCACAACAGTTTGAGCTAACCAAAATATCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑AAAACACCTTTTTaag > 5:1036266/1‑138 (MQ=255)
gATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACCCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTTAATAAGGC‑AAAACACCTTTTTACgg > 4:220763/1‑137 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTACCCTGCAGAGTCGTGGTGTGCTGAGGTACCACAGTAAATACACACCACACATTTAGCGAACCAAAATATATTTATGTGATATTAAAAAAGGCAAAAACACATTTTAActgcg > 5:340392/1‑136 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCGACCCCCGAAAAAACACACAACAGGTTGAGCTAACCAAATTGTCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑AAAACAACTTTTTACGGCCg > 2:588553/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAATACACACAACACTTTGAGCAAACCAAAATAGATTTAGGTGATTTTAAATATTGC‑AAAACACCTTTTtacgtacg > 8:238339/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTACCACAGAAAAAACACACAACAGTTTTAGCTAAACAAAATTTCTTTAGGTGATATTAAATATTGG‑AAAACACCTTTTTACGTCCg > 2:804531/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATACCCGACCACAAAAAAACCACACAACAGTTTGAGCTAACCCAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAAAACCATTTTAAGTCCg > 6:343239/1‑140 (MQ=255)
ttAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGTATACGCAACCACAGAAAAAACACACAACAGTTTTAGCTAAACAAAATATCTTTATGTGATATTAAATATTGC‑AAAAAACCATTTTTAGTCCGa > 2:976754/1‑140 (MQ=255)
tAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGAACCGCTACCACAGAAAATACACCCCACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTATGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCATTTTAAGTccc > 4:950059/1‑137 (MQ=255)
tAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGGTGCGCTACCACAGAAAAAACCCACCACACTTTTAGCTAACCAAAATATGTTTAGGTGGTATTATATATTGC‑AAAAAACCGTTTTAAGTCCGAg > 1:1177310/1‑140 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTc < 2:1052907/140‑1 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCGGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATACACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAg < 4:409929/138‑1 (MQ=255)
cacTCAGCCTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGGTGCGCTACCACAGAAAATACACCCAACAGTTTGGGCGAACCACATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑AAAACACCTTTTTTCGTCCGCGTcc > 6:589677/1‑140 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCTACCACAGAAAATACACACAACAGTTTGAGCGTACCAAAATCTCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑AAAAAACCTTTTTTCGTCCGAGTcc > 6:683190/1‑140 (MQ=255)
cTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTATATATGGC‑ATAACAACTTTTTACGTCCGAGTcc < 3:1065891/138‑1 (MQ=255)
tCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTTCGTACGAGTCCGtc > 8:778399/1‑140 (MQ=255)
tCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGTTCCGCGACCCCAGAAAAACCACCCAACAGGTTTAGCTAACCAAAATCTGTTTTTGTGATATTTAAAATGGG‑AAAAAACCTTTTTAAGTCCGCGTACggg > 7:955933/1‑138 (MQ=255)
aGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAATCCACACAAAAGTTTGAGCGAACCAAATTAACTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAAAACCTTTTTACGTCCGAGTCCGtcta > 8:1078866/1‑139 (MQ=255)
gACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATACACAAAACAGATTGAGCGAACCAAAATGTCTTTAGGTGTTATTAAATATGGC‑AAAAACCCTTATTTCGTCCGAGTAGGtctgt > 2:719302/1‑138 (MQ=255)
aCTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTACCACAGAAAAAACACACAACAGTTTGAGGGAACCACATTATCTTTAGGTGATATTAAATATTGC‑AAAACACCGTTTATAGGACGAGTCCGtctgtt > 7:512823/1‑137 (MQ=255)
ttttAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCCAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCt < 6:560282/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTg < 5:882467/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGTGGTAGGATCAGCTACCACAGAAAATCCACAAAACTGTTTGAGGTAACCAATTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGA‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAAt < 3:670141/138‑1 (MQ=255)
agagTCGTGGTAGGATAAGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATGGTTAGGTGATATTTAATATGGG‑CAAAAACCTTTTTAAGTCCGAGTCCGTCGCTGAAGGTCCTCCTGACAAAAtt > 4:488894/1‑138 (MQ=255)
tagTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACCACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTg < 3:82401/137‑1 (MQ=255)
tCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGAc < 2:807888/140‑1 (MQ=255)
tGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCaa < 1:873566/140‑1 (MQ=255)
gggTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTATGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCaa < 2:160434/139‑1 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACCCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGTC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 1:234180/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 2:560139/1‑140 (MQ=255)
ccGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTACCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 4:178681/1‑138 (MQ=255)
ccGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCGTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGAGAAAATTTCTGACCAAATCTCTg > 4:853801/1‑138 (MQ=255)
ccGCTACCACAGAAAAGCCACACCACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTATTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 4:111738/1‑138 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 7:365730/1‑140 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 2:297363/1‑140 (MQ=255)
cTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGcc > 7:622469/1‑140 (MQ=255)
cacaGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGt < 3:566216/138‑1 (MQ=255)
caGAAAATCCACACCACAGTTTGAGCTAAACTAATTCTCTTTAGGGTATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTa < 2:353738/140‑1 (MQ=255)
aGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAg > 2:442699/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc > 1:143391/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc > 7:549703/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAc < 4:729010/138‑1 (MQ=255)
aaTCCAAACAACAGTTTGAGCTAACCATATTCTGTTTAGGTTATATTAAATATTGC‑ACAACACCTTTTTAAGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCATATCTCTGATGCCTGTTTAGAcgc < 2:33086/140‑1 (MQ=255)
tCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGAc < 3:263965/100‑1 (MQ=255)
tCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGAc > 4:263965/1‑100 (MQ=255)
ccACACAACAGTGTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATAAAATATGGC‑AAAACACCGTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCAGATGCCGTTTTAGACGCGAt < 7:820257/140‑1 (MQ=255)
cacaACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCt > 5:61765/1‑140 (MQ=255)
cacaACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGA‑AAAACACCTTTTTACGTACTAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATc < 4:73436/138‑1 (MQ=255)
caacaGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATAATAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCAGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGATGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCg < 2:894684/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 1:982790/140‑1 (MQ=255)
cgTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 4:696864/137‑1 (MQ=255)
aGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGTC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTATCTGAAGGGCATAATGACAAAATTTCTGACAAAATCTATGATTCCGTTTTAGACGCGATCCTCgccca > 2:40377/1‑136 (MQ=255)
aGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACa < 6:771076/140‑1 (MQ=255)
tttGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAgg > 2:823446/1‑140 (MQ=255)
tttGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAgg > 5:780783/1‑140 (MQ=255)
tttGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAAACTCTGATGAAGTTTTAGACGCGATCCACGAACAgg > 5:796049/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACCCCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 8:550685/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 2:678940/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 6:149347/1‑140 (MQ=255)
tAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCATCGAACAGGATCCg > 3:892572/1‑138 (MQ=255)
aaCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGaaa > 2:1019325/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 6:468085/1‑140 (MQ=255)
ccAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTGTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGc > 5:93104/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCAcg < 3:1091044/138‑1 (MQ=255)
|
TGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGC‑AAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACG > NZ_CP022686/1705889‑1706160
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
