Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F2 I0 R1
|
233 |
6461.8 |
9239822 |
98.3% |
9082745 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,706,025 |
C→A |
16.5% |
intergenic (‑635/‑20) |
yqgB ← / → metK |
acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,706,025 | 0 | C | A | 16.5%
| 406.7
/ 6.9
| 188 | intergenic (‑635/‑20) | yqgB/metK | acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (64/78); new base A (40/2); total (108/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-10 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGC > NZ_CP022686/1705889‑1706161
|
tGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTctct < 2:1067944/140‑1 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTCCCCTACCACACAAAATCCACACAACACTTTGTGCGAACCAAAATctct > 6:738007/1‑138 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTACGCTACCACAGAAAATACACACAAAAGTTTGAGCTAAACAAATTATCttt > 1:1167919/1‑140 (MQ=255)
aCCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATGCGCGACCACAGAAAATCCACCCCACATTTTTTGCTAACCAAAGTCTCgtt > 1:79039/1‑140 (MQ=255)
tAACATAGCCATCCAGATGTTAATGCAGCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGGGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 2:765702/140‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATTTTAATCCATCCATACCGATTAACAATCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 7:371887/140‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 3:998549/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 3:1094436/139‑1 (MQ=255)
aaaaaTAGCCAACCAGCAGGTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTACCCTGCAGAGGCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 5:401406/137‑1 (MQ=255)
aaaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGt < 8:466916/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCTTCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGGGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 4:28953/140‑1 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAAGATCCCCGACCACACAAAATCCACACAACACTTAGAGCAAAACAAATTATCTTTATGGGGTAtt > 7:957596/1‑140 (MQ=255)
cATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATACACACAACAGTTTGAGCTAACCAAAATCTCTTTATGTGATATTaa > 2:290397/1‑140 (MQ=255)
tCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAat < 8:424885/140‑1 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTACCACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGGTCCGCGAACACAGACACTACCCCCAACAATTTTTGCGAACCAAATTCTCTTTTGGGGATATTAAatattgg > 1:845779/1‑137 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTAACACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTAACTTTAGGTGAGATTAAATATGGc > 8:648699/1‑140 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAAACCACCCAACAGGTTTAGCGAAACAAATTAGGTTTTGGTGTTTTTAAATATTGc > 1:530766/1‑140 (MQ=255)
gTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTTACCTGCAGAGGCGTGGTAGGATCCTCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaa < 4:983590/140‑1 (MQ=255)
tAATCCATCCTTACCGATTAACACTCAGACTGACAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaaaa < 3:705958/140‑1 (MQ=255)
tAATCCATCCATACCGATTAAGACTCAGTCTGCCTGTGTTTTTTACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaaaa < 3:168003/140‑1 (MQ=255)
tAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaa < 5:150499/138‑1 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAAAAGTTTTATCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATTGCAAAac > 5:611575/1‑138 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAAACCACCCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTATGTGATTTTAAATATGGGaaaaa > 5:1106362/1‑137 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTAACACAGAAAATCCACACAACAGATTGAGCTAACCAAATTCTCATTAGGTGTTATTAAATATTGCaaaaa > 5:367133/1‑137 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAacac < 3:1111389/140‑1 (MQ=255)
accatgcatACCGATTATCACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTACCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAac < 6:932663/137‑1 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCttt < 7:283902/140‑1 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTACGATCCCCTAACACACAAAAACCACACAACACTTTGAGCTAACCAAATTAACTTTATGTGATATTTAATATTTCaaaaaaacatt > 7:918539/1‑133 (MQ=255)
catACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTCCGCGACCACAGAAAATCCCCACAACAGTTTGAGAGAACAAAATTATCTTTAGGTTATTTTAAATATTGGAAAACACCttt > 5:654891/1‑138 (MQ=255)
actACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCttt < 6:867660/136‑1 (MQ=255)
gATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACCCAGCCACAGAAAATAAACACAAAACTTTTAGCTATCCAAAATATAATTTGGTGATATTAAATATTGCAAAAAAACttttttcttac > 2:228810/1‑134 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGGTCCGCTACCACACAAAATCCACACCACAAGTTTAGCTAACCAAAATCTCGTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCATTTTAAGTCCg > 7:189834/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATACGCGACCACAGAAAATCCACACAACACGTTTAGCTAAACAAATTCTCTTTAGGTGATATTTAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCg > 7:696602/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGCTACGCGACCCCAGAAAATACACACAACACTTTGTGCGAACCAAATTTTCTTTAGGTGATATTAAAATTTGGAAAACACCTTTTTAAGTCCg > 3:749689/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGGTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGGTAACCAAATTGTCTTTAGGTGATATTAAAAATTGCAAAACACCTTTTTAAGTCCg > 3:468635/1‑140 (MQ=255)
tAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCGACCACAGAAAAACCACACAACACTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTTTGTTATATTAAATATTGCAAAACACCTTTTTTAGTccc > 5:607287/1‑137 (MQ=255)
tAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCCCGACCACAGAAAATACACACCAAAGTTTGAGCTAACCAAAGTATCGGTAGGGGATATTAAATATGGCAAAACACCGTTTTACggcgg > 6:429216/1‑134 (MQ=255)
aaCACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCGAACACAGAAAATACCCACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCGTTAGGGGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTAAGTCCgc > 6:444811/1‑137 (MQ=255)
caacTCAGACTGCCAGTGTTTATAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACCCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTc < 1:195998/138‑1 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAg < 5:925797/138‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTcc < 2:844450/140‑1 (MQ=255)
cTCAGACTGCCTGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGGGGTAGGATCCGCTTCCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGt < 4:1149172/140‑1 (MQ=255)
cTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTcc < 5:111733/138‑1 (MQ=255)
aGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTTGCTCCGCGACCAAAGAAAATACACACAACAGTTTGATCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCATTTTACGTCCGCGTCCGtggc > 8:342287/1‑137 (MQ=255)
aGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGGTGCGCTACCACAGAAAATCCACACCACAGGTTGAGCTAACCAAATTATCTTTATGGGATATTAAAAATTGCAAAACACCATTTTAAGTACGCGTACggatc > 2:1156636/1‑136 (MQ=255)
aGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCGAACCAAATTATCTTTATGGGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTAAgtccgtgtccgtatg > 4:580780/1‑137 (MQ=255)
gACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGtct < 6:332546/138‑1 (MQ=255)
gCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGCTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGGTTGAGCTTACCAAATTCTCTTTATGTGATATTTAATATTGCAAAACACCTTTTTACGTACGAGTCCCTCTCTGAAg > 8:831279/1‑140 (MQ=255)
gCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACCACAGTTTTAGCAAACCAAATTCTCTTTTTGTTATATTAAATATTGGAAAAAAACATTTTACGGCCGCGTCCGGCTCTGacg > 2:1028443/1‑138 (MQ=255)
ccAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGATCCGCTACCACAGAAAATACCCACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATATTTATGTGATATTAAATATTGGAAAACACCATTTTACGTACCAGTCCGGATCTGAAgg > 3:900288/1‑140 (MQ=255)
ccAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATACGCTACCCCAGAAAATCCACACAACAGGTTGAGCTAACCAAATTATCTTTATGTGATATTAAATATGGGAAAACAACGTGTTACGTCCGAGTACTTCTCTGAAgg > 8:102082/1‑140 (MQ=255)
cAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTATGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAg < 6:592855/138‑1 (MQ=255)
tttttAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGTTACGCATCCACCGAAAAACAACCCAACCGTTTGAGCGAACCAAATTATATTTTGGTGTTATTAAAAATTGCCAAACACCATTTTAAGTCCCCGTCCCGCGCTGAAGGGccaaa > 4:29539/1‑136 (MQ=255)
gagTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCt < 8:1061739/140‑1 (MQ=255)
gTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCa < 1:987248/140‑1 (MQ=255)
tGGTAGTATCCGCTACCACAGAAACTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCaa < 4:895975/140‑1 (MQ=255)
gATCCGCTACCACAGAAAATCCACACCACACTTTGAGCTAACCAAATAATCTTTTTGTGATATTAAATATGGCAAAACACATTTTTACGTCCGAGTCCGACTCTGAAGGGCATCCAGACAAAATTGATGACCAAAactca > 3:891477/1‑139 (MQ=255)
gtCCGCTACAACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAATTATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 2:479033/2‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGCCCAAATCTCTg > 4:1060436/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 4:223538/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 3:660634/1‑140 (MQ=255)
gccGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAACTCTCTGa < 7:122384/139‑1 (MQ=255)
ccGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 5:50168/1‑138 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg < 7:428097/140‑1 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg < 4:382934/140‑1 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 8:179155/1‑140 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 1:448300/1‑140 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAAACAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg < 1:533561/140‑1 (MQ=255)
gCTAACACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATGCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAAAACCTTTTTACGTCCGAGTCCGGCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGAt < 6:1095960/138‑1 (MQ=255)
cTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 6:394338/1‑138 (MQ=255)
cTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACAAAATCTCTGATg > 6:775599/1‑138 (MQ=255)
atACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGATAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATCGCAAAAAACCTATTTACGTCCGAGTCCGACTCTCAAGGGAATCCTTACAAAATTGCTGACCAAAAATCTCATGcc > 8:922100/2‑140 (MQ=255)
tACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGCCCAAATCTCTGATGcag > 8:395220/1‑138 (MQ=255)
cacaGAAAATCCCCACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTGAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGCCAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGttt > 8:950078/1‑140 (MQ=255)
caGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTa < 1:496336/140‑1 (MQ=255)
aGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGtttt > 5:103586/1‑138 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc < 4:203334/140‑1 (MQ=255)
tCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGa > 8:375526/1‑140 (MQ=255)
cacaACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCt > 2:1192629/1‑140 (MQ=255)
ccaGTTTGTGCTATCCAAATTCTCTGTAGGTGATATTAAATATTTCAAAACACATTTTTAATTTCGAGTCAGTCACTGAATGGCATCCTGACAAATTTGCTGACCAAATCTCTGATGCAGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 8:1090733/139‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 1:1091/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATACTATTTAGGTGATATTAAAAATGGCAAAACTCATTTTTACGTCCTAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 7:748441/140‑1 (MQ=255)
aGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGGCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACa < 8:570816/140‑1 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 8:731115/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 8:166384/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAAAATGTCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCAGTCTCTGCAGGTCATCCTGCCAAAATTGATGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 7:205846/1‑140 (MQ=255)
tAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 5:844296/1‑138 (MQ=255)
aaCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGGCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGaaa < 1:150691/140‑1 (MQ=255)
aaCCAAATTCTCTTTAGGCGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGaaa > 3:919640/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGCCAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 1:280823/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 1:303433/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 1:1089803/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 2:60397/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 3:399948/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAAATGCTGACCAAATCTCTGATGCCGGTTTAGACGCGATCCGCGAACAGCATCCGAAAg > 2:660892/1‑140 (MQ=255)
cAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGaaac > 5:76838/1‑137 (MQ=255)
cAAATTCTCTTTAGGAGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGAATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 6:995908/1‑138 (MQ=255)
aaaTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGc > 6:799026/1‑138 (MQ=255)
aTTATCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAACCACCTTTTTACGTCCGCCTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGAAAAAATTGCTGCCCAAATCTCTGATGCCGTGTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCAcgc < 4:1091772/140‑1 (MQ=255)
tctcTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCAcgc > 6:827345/1‑138 (MQ=255)
|
TGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGC > NZ_CP022686/1705889‑1706161
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
