Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F5 I97 R1
|
275 |
44.0 |
1733530 |
96.5% |
1672856 |
122.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
675,373 |
A→G |
E137G (GAA→GGA) |
ybeU → |
DUF1266 domain‑containing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 675,373 | 0 | A | G | 100.0%
| 180.4
/ NA
| 50 | E137G (GAA→GGA) | ybeU | DUF1266 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (27/23); total (27/23) |
GGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAA > NZ_CP009273/675247‑675502
|
ggTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGtt > 2:300093/1‑138 (MQ=255)
aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 1:781586/139‑1 (MQ=255)
aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg > 2:403751/1‑139 (MQ=255)
gCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTCCGAGCCCACCCTTa > 2:39618/1‑139 (MQ=255)
cTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTa < 2:345872/138‑1 (MQ=255)
tgtgGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg < 1:283772/127‑1 (MQ=255)
tgtgGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg > 2:283772/1‑127 (MQ=255)
tgGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTAt > 1:767023/1‑139 (MQ=255)
tgGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTAt > 1:761572/1‑139 (MQ=255)
ggggAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTAt > 1:49617/1‑138 (MQ=255)
aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 1:186138/106‑1 (MQ=255)
aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg > 2:186138/1‑106 (MQ=255)
aaGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAg > 1:698303/1‑139 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaa < 2:122452/98‑1 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaa > 1:122452/1‑98 (MQ=255)
ggAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGa > 1:683159/1‑139 (MQ=255)
ggAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGa < 1:39618/139‑1 (MQ=255)
aaccAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg > 2:524454/4‑139 (MQ=255)
aaccAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg < 2:468195/136‑1 (MQ=255)
ccAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCa < 2:767023/138‑1 (MQ=255)
aGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGttt > 2:460691/1‑78 (MQ=255)
aGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGttt < 1:460691/78‑1 (MQ=255)
gggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt < 1:463722/91‑1 (MQ=255)
gggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt > 2:463722/1‑91 (MQ=255)
ggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTcc > 2:386723/1‑139 (MQ=255)
ggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTcc < 2:606143/139‑1 (MQ=255)
tGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTa < 2:683159/138‑1 (MQ=255)
tGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTa < 1:754966/138‑1 (MQ=255)
aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGTATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 1:524454/139‑1 (MQ=255)
aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg > 1:754594/1‑139 (MQ=255)
aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 1:687687/139‑1 (MQ=255)
aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 1:118771/139‑1 (MQ=255)
tCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAc < 2:648648/138‑1 (MQ=255)
tCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAc < 1:138486/138‑1 (MQ=255)
aCGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTg < 2:49617/138‑1 (MQ=255)
cGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTgg > 1:100124/1‑138 (MQ=255)
gTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAt > 1:705815/1‑139 (MQ=255)
tCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAtc > 1:728299/1‑139 (MQ=255)
tCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAtc > 2:596445/1‑139 (MQ=255)
gtgtGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg > 1:792232/1‑92 (MQ=255)
gtgtGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg < 2:792232/92‑1 (MQ=255)
gTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGa > 2:679371/1‑138 (MQ=255)
gTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGa > 1:347001/1‑138 (MQ=255)
gCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGacaa > 2:795267/1‑138 (MQ=255)
tGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt > 2:101315/1‑37 (MQ=255)
tGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt < 1:101315/37‑1 (MQ=255)
tGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc < 2:6166/128‑1 (MQ=255)
tGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc > 1:6166/1‑128 (MQ=255)
aCGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTCCTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTg < 2:461635/110‑1 (MQ=255)
aCGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTg > 1:461635/1‑110 (MQ=255)
|
GGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAA > NZ_CP009273/675247‑675502
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTC > NZ_CP009273/675227‑675508
|
TGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGA < SRR3722120.140112/150‑1 (MQ=60)
atacgagattcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAT < SRR3722120.467396/100‑1 (MQ=60)
CAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTAC < SRR3722120.792123/151‑1 (MQ=60)
cggagatgtgtataagagacagGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTAC < SRR3722120.188728/128‑1 (MQ=60)
atggatatatttgtgtttttttttttcaagcagaagacggcatacgagattcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAG < SRR3722120.102668/59‑1 (MQ=60)
tagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagaacCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAG < SRR3722120.470458/110‑1 (MQ=60)
AGCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTAC < SRR3722120.287843/151‑1 (MQ=60)
GCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATC > SRR3722120.777356/1‑151 (MQ=60)
GCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATC > SRR3722120.771841/1‑151 (MQ=60)
CTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATC > SRR3722120.50217/1‑150 (MQ=60)
GTGCTGTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGC > SRR3722120.707837/1‑151 (MQ=60)
CTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTActgtctcttatacacatctccgagcccacg > SRR3722120.124071/1‑120 (MQ=60)
GTGGGGAAGGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGAT > SRR3722120.692518/1‑151 (MQ=60)
GGGGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtcttctg > SRR3722120.419603/1‑89 (MQ=60)
GGGAACCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTT < SRR3722120.40101/151‑1 (MQ=60)
ATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGG > SRR3722120.764791/1‑151 (MQ=60)
ATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGAC < SRR3722120.765169/150‑1 (MQ=60)
AATGGGGTTTCTGTCACTGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGTATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAC < SRR3722120.531927/151‑1 (MQ=60)
AATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAC < SRR3722120.697104/151‑1 (MQ=60)
AATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAC < SRR3722120.120341/151‑1 (MQ=60)
GGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGC > SRR3722120.101463/1‑150 (MQ=60)
TTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATC > SRR3722120.715433/1‑151 (MQ=60)
TCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCT > SRR3722120.738168/1‑151 (MQ=60)
GTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacta > SRR3722120.802885/1‑115 (MQ=60)
GTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTC < SRR3722120.140357/150‑1 (MQ=60)
GTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGAC > SRR3722120.352025/1‑150 (MQ=60)
CAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACC > SRR3722120.6233/1‑151 (MQ=60)
ACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCctgtctcttatacacatct > SRR3722120.468346/1‑132 (MQ=60)
|
TGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTC > NZ_CP009273/675227‑675508
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
