Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F5 I175 R1
|
328 |
64.7 |
2582366 |
96.2% |
2484236 |
120.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
547,284 |
A→G |
I256T (ATC→ACC) |
purK ← |
5‑(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 547,284 | 0 | A | G | 100.0%
| 249.7
/ NA
| 67 | I256T (ATC→ACC) | purK | 5‑(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (26/41); total (26/41) |
CCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAA > NZ_CP009273/547153‑547413
|
ccAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGc < 2:962533/139‑1 (MQ=255)
cAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCa < 1:1068058/139‑1 (MQ=255)
aGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGtttt < 1:25003/139‑1 (MQ=255)
cAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTtg < 1:48738/135‑1 (MQ=255)
cAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTtg > 2:48738/1‑135 (MQ=255)
tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 1:820722/139‑1 (MQ=255)
tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:599237/139‑1 (MQ=255)
tCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 1:286751/139‑1 (MQ=255)
aTAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:1234328/139‑1 (MQ=255)
ttCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGttt < 2:914360/120‑1 (MQ=255)
ttCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGttt > 1:914360/1‑120 (MQ=255)
caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATg > 2:906076/1‑139 (MQ=255)
caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATg > 2:156292/1‑139 (MQ=255)
tCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca < 2:494838/139‑1 (MQ=255)
tACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg > 2:851477/1‑139 (MQ=255)
ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcgc < 1:156292/138‑1 (MQ=255)
ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 2:783475/137‑1 (MQ=255)
ccAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 2:287326/137‑1 (MQ=255)
aGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCa < 2:401720/139‑1 (MQ=255)
aTTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGt > 1:700417/1‑139 (MQ=255)
aTTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGt > 2:936539/1‑139 (MQ=255)
atcatcACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCg < 2:700417/138‑1 (MQ=255)
tcatcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGtt < 1:1252791/139‑1 (MQ=255)
atcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 1:1180111/138‑1 (MQ=255)
atcaCCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 2:900607/138‑1 (MQ=255)
aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCaa > 2:950847/1‑136 (MQ=255)
aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCaa > 2:897513/1‑136 (MQ=255)
aCGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAg < 1:936539/139‑1 (MQ=255)
ttattCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCtt > 1:860372/1‑139 (MQ=255)
caccacTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCgg < 2:558401/138‑1 (MQ=255)
caccacTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCgg < 1:950847/138‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg < 1:597646/99‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACAcg > 2:597646/1‑99 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:243793/81‑1 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc > 1:243793/1‑81 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:845732/83‑1 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg > 1:845732/1‑83 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg < 2:716352/113‑1 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTg > 1:716352/1‑113 (MQ=255)
gTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACaa < 2:1063694/138‑1 (MQ=255)
ttGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACaaaa < 2:1258645/139‑1 (MQ=255)
ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTg < 2:4606/122‑1 (MQ=255)
ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTg > 1:4606/1‑122 (MQ=255)
ggTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACt < 1:897513/139‑1 (MQ=255)
cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca < 1:1148971/83‑1 (MQ=255)
cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGca > 2:1148971/1‑83 (MQ=255)
cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATc > 2:954604/1‑139 (MQ=255)
cGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATc < 1:851477/139‑1 (MQ=255)
cAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGc > 1:182186/1‑138 (MQ=255)
gATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGccct < 1:455470/139‑3 (MQ=255)
gATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCAt < 1:906076/139‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCAt > 2:440640/1‑138 (MQ=255)
ggTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACg < 2:25835/139‑1 (MQ=255)
gTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGc < 2:1032329/139‑1 (MQ=255)
gTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGc < 2:229753/139‑1 (MQ=255)
tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg > 1:548481/1‑62 (MQ=255)
tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCg < 2:548481/62‑1 (MQ=255)
tAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGcc > 1:15865/1‑139 (MQ=255)
gCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCcaca > 1:742585/1‑138 (MQ=255)
cGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGc > 1:631740/1‑139 (MQ=255)
gCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGcc < 1:440640/139‑1 (MQ=255)
cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc > 1:439345/1‑41 (MQ=255)
cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAc < 2:439345/41‑1 (MQ=255)
cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGc > 1:247028/1‑63 (MQ=255)
cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGc < 2:247028/63‑1 (MQ=255)
cTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTg > 1:2941/1‑138 (MQ=255)
aaCTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATaa < 2:860372/139‑1 (MQ=255)
|
CCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAA > NZ_CP009273/547153‑547413
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCA > NZ_CP009273/547144‑547410
|
GCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCAC < SRR3722129.1036752/150‑1 (MQ=60)
CCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGT < SRR3722129.1083044/151‑1 (MQ=60)
CAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGA < SRR3722129.25323/151‑1 (MQ=60)
AGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGAC < SRR3722129.49394/151‑1 (MQ=60)
GCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGctgtctctt > SRR3722129.927370/1‑142 (MQ=60)
GTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGC < SRR3722129.832538/151‑1 (MQ=60)
GTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGC < SRR3722129.290863/151‑1 (MQ=60)
agattcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCC < SRR3722129.1164937/105‑1 (MQ=60)
cgtgggctcggagatgtgtataagagacagTTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTT < SRR3722129.606566/121‑1 (MQ=60)
CTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTT > SRR3722129.710744/1‑151 (MQ=60)
ACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTC < SRR3722129.158471/150‑1 (MQ=60)
ATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGAC < SRR3722129.1270224/151‑1 (MQ=60)
CATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACC < SRR3722129.1196536/150‑1 (MQ=60)
TCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTG > SRR3722129.872636/1‑151 (MQ=60)
GACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGG < SRR3722129.949820/151‑1 (MQ=60)
TTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaa > SRR3722129.1300028/1‑77 (MQ=60)
ATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcg > SRR3722129.247253/1‑103 (MQ=60)
ATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatct > SRR3722129.857840/1‑105 (MQ=60)
ATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCctgtctcttatacac > SRR3722129.726861/1‑135 (MQ=60)
ATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaa > SRR3722129.955472/1‑75 (MQ=60)
TCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAAC < SRR3722129.964285/150‑1 (MQ=60)
CCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAActgtctc > SRR3722129.4668/1‑144 (MQ=60)
TGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCC > SRR3722129.184680/1‑150 (MQ=60)
CGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATC < SRR3722129.910254/151‑1 (MQ=60)
ACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCC < SRR3722129.863644/151‑1 (MQ=60)
CGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtctgctgcttg > SRR3722129.556558/1‑84 (MQ=60)
CGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCC > SRR3722129.16050/1‑151 (MQ=60)
AGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCCTCACGCCCACAT < SRR3722129.462043/151‑1 (MQ=60)
AGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACAT < SRR3722129.918911/151‑1 (MQ=60)
GATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACAT > SRR3722129.753449/1‑150 (MQ=60)
CGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCC > SRR3722129.641136/1‑151 (MQ=60)
GTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGTCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGCTATGCACACGCCGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGGGACAAAACACTCCATCGCCtgtctcttatacacatctc > SRR3722129.998222/1‑132 (MQ=60)
CGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaaacaaccac > SRR3722129.445720/1‑63 (MQ=60)
CGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGActgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtatgccgtcttctgcttg > SRR3722129.250525/1‑85 (MQ=60)
CGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCA < SRR3722129.447033/151‑1 (MQ=60)
CGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGGTGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGC > SRR3722129.2980/1‑150 (MQ=60)
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GCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACCGTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCA > NZ_CP009273/547144‑547410
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
