Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
524,496 |
T→G |
91.2% |
pseudogene (401/491 nt) |
ybbD → |
pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 524,496 | 0 | T | G | 91.2%
| 716.0
/ 28.9
| 204 | pseudogene (401/491 nt) | ybbD | pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/9); new base G (81/105); total (90/114) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG > CP009273/524350‑524639
|
tCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGgtg < 1:3305739/148‑1 (MQ=255)
ccTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTa > 2:1188538/1‑148 (MQ=255)
cTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTaa < 1:3225575/148‑1 (MQ=255)
cTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTaa < 2:2957835/148‑1 (MQ=255)
tAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTaaa < 2:1771499/148‑1 (MQ=255)
aaCAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAc > 2:2343979/1‑148 (MQ=255)
aCAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAcc > 2:346093/1‑148 (MQ=255)
aCAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAcc > 1:720064/1‑148 (MQ=255)
aaTGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCttt < 2:711277/148‑1 (MQ=255)
aaTGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCttt < 1:1596110/148‑1 (MQ=255)
atgatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttt < 2:481885/148‑1 (MQ=255)
atgatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttt < 1:1264956/148‑1 (MQ=255)
gatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttttt < 2:1108603/148‑1 (MQ=255)
gatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttttt < 1:2822138/148‑1 (MQ=255)
gatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttttt < 1:1125409/148‑1 (MQ=255)
tgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCtttttttt < 2:380854/148‑1 (MQ=255)
gatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTttg > 1:1047239/1‑148 (MQ=255)
atgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTttgt < 1:2759955/148‑1 (MQ=255)
atgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTttgt < 1:2109548/148‑1 (MQ=255)
atgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTttgt < 2:2242183/148‑1 (MQ=255)
ggggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTgg < 1:107533/148‑1 (MQ=255)
ggggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTgg < 1:2269098/148‑1 (MQ=255)
gggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGt > 1:2556552/1‑148 (MQ=255)
tAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGaa < 1:503775/148‑1 (MQ=255)
tAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGaa < 1:503756/148‑1 (MQ=255)
aGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGaaa < 1:1912354/148‑1 (MQ=255)
aaGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATg < 2:595092/148‑1 (MQ=255)
aaGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATg < 2:1704305/148‑1 (MQ=255)
aGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGTGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGt < 1:651386/148‑1 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCGAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCGGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGtt > 2:1454139/1‑148 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGtt < 1:1716238/148‑1 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGtt < 1:1310829/148‑1 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGtt > 1:2394388/1‑148 (MQ=255)
aaaaCATTTACCGTGAGGCCAAGGTAACAAGTGGCGAAAATCTAAACAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAATTTACCTGGGAACGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTa < 2:2769025/148‑1 (MQ=255)
aaCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACg > 1:331205/1‑148 (MQ=255)
aCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGc < 2:2443015/148‑1 (MQ=255)
ttGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCatt > 1:2871075/1‑148 (MQ=255)
ttGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCatt < 2:1977749/148‑1 (MQ=255)
gACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCattat > 1:2491143/1‑148 (MQ=255)
cAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTAttt > 2:2761030/1‑148 (MQ=255)
tGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTtat < 2:2333663/148‑1 (MQ=255)
gAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTtata > 2:88189/1‑148 (MQ=255)
cAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGCAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAat < 1:928426/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATAtt < 2:798830/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATAtt > 1:977121/1‑148 (MQ=255)
gAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTg < 2:3250167/148‑1 (MQ=255)
aaCAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTgg < 1:1087831/148‑1 (MQ=255)
gTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTg < 1:697513/148‑1 (MQ=255)
cGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGAtt > 2:2649223/1‑148 (MQ=255)
aTCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAACAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGCGATGGTGTAAACCTTTATTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGAtagactc > 2:3126239/1‑142 (MQ=255)
aTCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTg > 2:2411039/1‑148 (MQ=255)
tCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGa < 1:2950935/148‑1 (MQ=255)
cGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGAt < 2:409421/148‑1 (MQ=255)
gTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTT‑TTGGTGAAATTAATTTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTTCCTGATGc > 2:2718890/1‑148 (MQ=255)
gTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGc > 2:160840/1‑148 (MQ=255)
tATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGc < 1:1148164/148‑1 (MQ=255)
cAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCCCCGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTtg < 2:1945872/148‑1 (MQ=255)
aaGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTtgtg > 2:671546/1‑148 (MQ=255)
aaGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTtgtg > 2:2917030/1‑148 (MQ=255)
aGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGc < 1:1303566/148‑1 (MQ=255)
aGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGc > 1:894908/1‑148 (MQ=255)
aGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGc > 2:2034920/1‑148 (MQ=255)
aaTGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCag > 1:846790/1‑148 (MQ=255)
gATCCAGATACAAAAAAAGTGTTGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGt > 2:1352030/1‑148 (MQ=255)
aTCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTa < 1:2263927/148‑1 (MQ=255)
tCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTaa < 1:2590164/148‑1 (MQ=255)
ccAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAt < 2:162205/148‑1 (MQ=255)
ccAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAt < 1:2741528/148‑1 (MQ=255)
aGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTg < 1:1538795/148‑1 (MQ=255)
gATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGc > 1:1330543/1‑148 (MQ=255)
tACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCtt < 1:1364480/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGaa < 1:2048015/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGaa > 1:3182846/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTTTTTGTTGAATTAAAGTTAAGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGTTTGCCTGATGCTTGTTCAGAGTAATTGCGTGAAt > 1:879094/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAAt > 2:540565/1‑148 (MQ=255)
aaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAAtt > 1:2002934/1‑148 (MQ=255)
aaaaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAAtt > 2:721921/1‑148 (MQ=255)
aaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTaa > 1:1365810/1‑148 (MQ=255)
aaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTaa > 2:719393/1‑148 (MQ=255)
aaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAag < 2:2547063/148‑1 (MQ=255)
aaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAag < 2:3076305/148‑1 (MQ=255)
gtgtGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAagag < 1:2343979/148‑1 (MQ=255)
tgtgGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGt > 2:1736590/1‑148 (MQ=255)
tgtgGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGGTGGTTAAAATAAATTTAAGCCATATTTTATAAAAAAAAATGGAGGTTGATTTGCGTATTCTTTTTCCGTTTAATTTCGTGAATTAagatt > 2:63012/1‑146 (MQ=255)
tggtgTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCt > 2:3094557/1‑148 (MQ=255)
gtAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATcc > 1:606083/1‑148 (MQ=255)
tAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATccc < 1:2602192/148‑1 (MQ=255)
atatGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCata > 2:564718/1‑148 (MQ=255)
tGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCg > 2:2572800/1‑148 (MQ=255)
aaGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAgt > 1:1299796/1‑148 (MQ=255)
aGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAgtc > 1:366243/1‑148 (MQ=255)
aGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAgtc > 1:3098304/1‑148 (MQ=255)
aGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAgtc < 2:2071804/148‑1 (MQ=255)
cAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAAc > 2:1566265/1‑148 (MQ=255)
gCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCg < 1:758699/148‑1 (MQ=255)
cAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGt > 2:1617084/1‑148 (MQ=255)
gggATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTg < 1:1496681/148‑1 (MQ=255)
ggATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGa < 1:993434/148‑1 (MQ=255)
ggATGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGa < 1:2392928/148‑1 (MQ=255)
aTGGGGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAgg < 2:1365810/148‑1 (MQ=255)
|
TCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG > CP009273/524350‑524639
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > CP009273/524348‑524643
|
TTTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGG < SRR19973070.1230573/150‑1 (MQ=60)
TTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAATAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGT < SRR19973070.2117313/150‑1 (MQ=60)
TTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGT < SRR19973070.3133469/150‑1 (MQ=60)
TCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTA < SRR19973070.3326901/150‑1 (MQ=60)
CTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAAC < SRR19973070.3246417/150‑1 (MQ=60)
CTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAC > SRR19973070.27092/1‑150 (MQ=60)
TAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC > SRR19973070.725192/1‑150 (MQ=60)
CAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTT > SRR19973070.663734/1‑150 (MQ=60)
AATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTT < SRR19973070.1607262/150‑1 (MQ=60)
ATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTT < SRR19973070.1273814/150‑1 (MQ=60)
GATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTT < SRR19973070.1133148/150‑1 (MQ=60)
GATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTT < SRR19973070.1133172/150‑1 (MQ=60)
GATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTT < SRR19973070.2840386/150‑1 (MQ=60)
ATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTG > SRR19973070.1054615/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTG < SRR19973070.2777656/150‑1 (MQ=60)
ATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTG < SRR19973070.2777643/150‑1 (MQ=60)
ATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTG < SRR19973070.2123700/150‑1 (MQ=60)
GGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGT > SRR19973070.2573257/1‑150 (MQ=60)
GGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGT < SRR19973070.3186445/150‑1 (MQ=60)
GGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGT < SRR19973070.723848/150‑1 (MQ=60)
GGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTG < SRR19973070.2284162/150‑1 (MQ=60)
GGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTG < SRR19973070.108538/150‑1 (MQ=60)
GGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGA < SRR19973070.3318823/150‑1 (MQ=60)
TAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAAT < SRR19973070.507248/150‑1 (MQ=60)
TAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAAT < SRR19973070.507249/150‑1 (MQ=60)
TAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAAT < SRR19973070.507268/150‑1 (MQ=60)
TAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAAT > SRR19973070.2085757/1‑150 (MQ=60)
AGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATT < SRR19973070.1925275/150‑1 (MQ=60)
TAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGT < SRR19973070.2869157/150‑1 (MQ=60)
AAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTT < SRR19973070.149287/150‑1 (MQ=60)
AAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTT > SRR19973070.2410175/1‑150 (MQ=60)
AAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTT > SRR19973070.2410192/1‑150 (MQ=60)
AGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGTGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTA < SRR19973070.656033/150‑1 (MQ=60)
GAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTAC < SRR19973070.1728104/150‑1 (MQ=60)
GAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTAC < SRR19973070.2370441/150‑1 (MQ=60)
GAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTAC < SRR19973070.1319924/150‑1 (MQ=60)
AAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACG > SRR19973070.333616/1‑150 (MQ=60)
AACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCA < SRR19973070.1974271/150‑1 (MQ=60)
CATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATT < SRR19973070.2193578/150‑1 (MQ=60)
CATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATT > SRR19973070.2889672/1‑150 (MQ=60)
TTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTAT > SRR19973070.2507311/1‑150 (MQ=60)
GAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAAC < SRR19973070.737479/150‑1 (MQ=60)
GCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAAT < SRR19973070.1196892/150‑1 (MQ=60)
CAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGCAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATAT < SRR19973070.935050/150‑1 (MQ=60)
AGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATT > SRR19973070.984098/1‑150 (MQ=60)
AGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATT > SRR19973070.984733/1‑150 (MQ=60)
GGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTG > SRR19973070.441003/1‑150 (MQ=60)
AACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAG < SRR19973070.1095363/150‑1 (MQ=60)
AACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAG < SRR19973070.1096241/150‑1 (MQ=60)
AGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGG > SRR19973070.932886/1‑150 (MQ=60)
GTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGA < SRR19973070.702485/150‑1 (MQ=60)
AAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAATTATTGGAGCTGGATTGCCTG > SRR19973070.108487/1‑150 (MQ=60)
ATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGAT < SRR19973070.1315476/150‑1 (MQ=60)
TCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATG < SRR19973070.2969927/150‑1 (MQ=60)
TATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTT < SRR19973070.1156156/150‑1 (MQ=60)
AAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGC > SRR19973070.901238/1‑150 (MQ=60)
AAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCA > SRR19973070.365471/1‑150 (MQ=60)
AGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAG < SRR19973070.1312627/150‑1 (MQ=60)
AGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAG > SRR19973070.852573/1‑150 (MQ=60)
GAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGA > SRR19973070.2541115/1‑150 (MQ=60)
AATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAG < SRR19973070.2592782/150‑1 (MQ=60)
ATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAT < SRR19973070.2278950/150‑1 (MQ=60)
ATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAT < SRR19973070.2618503/150‑1 (MQ=60)
TCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAATATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCATTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAT < SRR19973070.954868/150‑1 (MQ=60)
TCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATT < SRR19973070.626292/150‑1 (MQ=60)
TCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATT < SRR19973070.2607089/150‑1 (MQ=60)
CCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTG < SRR19973070.2759163/150‑1 (MQ=60)
CCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTG < SRR19973070.3072396/150‑1 (MQ=60)
CAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGC > SRR19973070.1339696/1‑150 (MQ=60)
CAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGC > SRR19973070.1536751/1‑150 (MQ=60)
CAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGC > SRR19973070.1339720/1‑150 (MQ=60)
AGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGTTGCTTGTGCAGAGTAATTGCT > SRR19973070.2025848/1‑150 (MQ=60)
AGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCT < SRR19973070.1549613/150‑1 (MQ=60)
ATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTG > SRR19973070.1343675/1‑150 (MQ=60)
TACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGA < SRR19973070.1374812/150‑1 (MQ=60)
TACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGA < SRR19973070.1373778/150‑1 (MQ=60)
ACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAA > SRR19973070.3203442/1‑150 (MQ=60)
CAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTTTTTGTTGAATTAAAGTTAAGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGTTTGCCTGATGCTTGTTCAGAGTAATTGCGTGAAT > SRR19973070.885282/1‑150 (MQ=60)
CAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAAT > SRR19973070.885311/1‑150 (MQ=60)
CAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAAT > SRR19973070.885280/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATT < SRR19973070.2061869/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATT > SRR19973070.1576477/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATT > SRR19973070.2465105/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATT > SRR19973070.2016494/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTA < SRR19973070.3332556/150‑1 (MQ=60)
AAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAA > SRR19973070.1375110/1‑150 (MQ=60)
AAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAG < SRR19973070.2839833/150‑1 (MQ=60)
AGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGT > SRR19973070.2303778/1‑150 (MQ=60)
GTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTC < SRR19973070.2359525/150‑1 (MQ=60)
GTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCC > SRR19973070.610316/1‑150 (MQ=60)
GTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCC > SRR19973070.2283204/1‑150 (MQ=60)
GTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCA < SRR19973070.558049/150‑1 (MQ=60)
TAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCAT < SRR19973070.2619182/150‑1 (MQ=60)
GTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGT > SRR19973070.1308836/1‑150 (MQ=60)
GTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGT > SRR19973070.1308866/1‑150 (MQ=60)
TAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTC > SRR19973070.3118272/1‑150 (MQ=60)
TAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTC > SRR19973070.368931/1‑150 (MQ=60)
TAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTC > SRR19973070.368934/1‑150 (MQ=60)
AAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCG < SRR19973070.1664991/150‑1 (MQ=60)
GATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTC < SRR19973070.1810224/150‑1 (MQ=60)
ATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCA < SRR19973070.3217653/150‑1 (MQ=60)
ACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAAC > SRR19973070.11019/1‑150 (MQ=60)
ACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAAC < SRR19973070.2205571/150‑1 (MQ=60)
GCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTA < SRR19973070.764039/150‑1 (MQ=60)
GGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGA < SRR19973070.2918121/150‑1 (MQ=60)
GGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAG < SRR19973070.1507156/150‑1 (MQ=60)
GGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG < SRR19973070.1000521/150‑1 (MQ=60)
GGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG < SRR19973070.2408726/150‑1 (MQ=60)
GGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG < SRR19973070.1304649/150‑1 (MQ=60)
ATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAA < SRR19973070.770745/150‑1 (MQ=60)
GGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > SRR19973070.835227/1‑150 (MQ=60)
|
TTTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > CP009273/524348‑524643
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |