Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
524,496 |
T→G |
83.0% |
pseudogene (401/491 nt) |
ybbD → |
pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 524,496 | 0 | T | G | 83.0%
| 791.9
/ 104.4
| 274 | pseudogene (401/491 nt) | ybbD | pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/30); new base G (109/118); total (126/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.51e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.51e-01 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAA > CP009273/524350‑524641
|
tCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGgggt < 2:1486779/149‑1 (MQ=255)
tAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAc > 2:3510816/1‑149 (MQ=255)
aaCAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAcc < 2:262179/149‑1 (MQ=255)
aaCAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAcc < 2:3135569/149‑1 (MQ=255)
aaaTGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTACGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑ttt > 2:4673572/1‑149 (MQ=255)
aaaTGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑ttt < 1:3504520/149‑1 (MQ=255)
aaTGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑tttt < 1:2030918/149‑1 (MQ=255)
atgatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑ttttt < 1:2777287/149‑1 (MQ=255)
atgatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑ttttt < 2:1941733/149‑1 (MQ=255)
tgatgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑tttttt < 1:120598/149‑1 (MQ=255)
atgatgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑tttttttt < 1:16100/149‑1 (MQ=255)
tgGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTttgttg < 1:2268965/149‑1 (MQ=255)
ggggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGt < 2:3339295/149‑1 (MQ=255)
ggggGAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCATATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGt < 2:2995367/149‑1 (MQ=255)
gggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTg > 1:1598331/1‑149 (MQ=255)
gggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTg > 1:1246784/1‑149 (MQ=255)
gggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTg > 1:1246805/1‑149 (MQ=255)
ggTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGa < 1:3571017/149‑1 (MQ=255)
ggTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAAtt < 2:1794903/149‑1 (MQ=255)
tttAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTaa < 1:2177585/149‑1 (MQ=255)
ttAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACCTTTTTTTTTGTTGGTGAAATTaa < 1:3345016/149‑1 (MQ=255)
aaGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCTAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGt < 1:212372/149‑1 (MQ=255)
aaGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGt < 1:399183/149‑1 (MQ=255)
aGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGtt < 2:3255679/149‑1 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTa > 2:926042/1‑149 (MQ=255)
gAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTa < 2:3880331/149‑1 (MQ=255)
aaaaCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTAc < 2:4165495/149‑1 (MQ=255)
aaaaCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTAc < 2:1257534/149‑1 (MQ=255)
aCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCa < 2:2350495/149‑1 (MQ=255)
aCATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCa < 1:759180/149‑1 (MQ=255)
cATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCat < 2:1079205/149‑1 (MQ=255)
gACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCattatt < 1:2304781/149‑1 (MQ=255)
gACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCattatt < 1:3189467/149‑1 (MQ=255)
gACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCattatt < 1:1936867/149‑1 (MQ=255)
aGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTta > 2:4366950/1‑149 (MQ=255)
gTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTtat > 1:2245328/1‑149 (MQ=255)
gAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATaa < 1:682244/149‑1 (MQ=255)
gggCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACa > 1:1075340/1‑149 (MQ=255)
ggCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACaa < 2:1158592/149‑1 (MQ=255)
aGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAatat > 2:1585488/1‑149 (MQ=255)
aGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAatat < 2:1393801/149‑1 (MQ=255)
gggAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATAtt < 2:663866/149‑1 (MQ=255)
gggAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATAtt > 2:2007923/1‑149 (MQ=255)
aCAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAg < 1:865123/149‑1 (MQ=255)
cAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGc < 1:1019980/149‑1 (MQ=255)
aaGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCt < 1:4303546/149‑1 (MQ=255)
aaGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCt < 1:1150674/149‑1 (MQ=255)
aGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTg > 2:1900701/1‑149 (MQ=255)
aGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTgg < 2:3210442/149‑1 (MQ=255)
gTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGa > 2:3046278/1‑149 (MQ=255)
tGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGa < 2:4767832/149‑1 (MQ=255)
ggCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCGGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGTAtt > 1:4233084/1‑149 (MQ=255)
ggCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGAt < 2:375070/149‑1 (MQ=255)
gCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGAtt > 2:1861375/1‑149 (MQ=255)
gAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGc < 1:3663658/149‑1 (MQ=255)
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aaTCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTg > 1:3783813/1‑149 (MQ=255)
aaTCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTg > 2:126344/1‑149 (MQ=255)
tATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCt > 1:809759/1‑149 (MQ=255)
aTCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCtt < 2:3404072/149‑1 (MQ=255)
aTCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCtt > 2:358137/1‑149 (MQ=255)
aGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCa < 2:2219184/149‑1 (MQ=255)
aGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCa > 1:448952/1‑149 (MQ=255)
aTCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTaa < 1:4142315/149‑1 (MQ=255)
aTCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTaa < 1:1731871/149‑1 (MQ=255)
tCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAtt > 2:4526474/1‑149 (MQ=255)
tCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGAGACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAAt < 1:2879126/149‑1 (MQ=255)
aGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGc < 1:3393741/149‑1 (MQ=255)
gATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATTTTACGCATTATTTTATAAAAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCt > 1:495529/1‑149 (MQ=255)
gATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCt > 1:3330665/1‑149 (MQ=255)
gATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCt > 1:3279667/1‑149 (MQ=255)
tACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTg < 2:2866211/149‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAag < 1:255097/149‑1 (MQ=255)
aGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAagag < 1:2412910/149‑1 (MQ=255)
tgtgGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTc < 1:2396848/149‑1 (MQ=255)
gtggttTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAAAC‑TTTTTTTTGTTTGTTAAATTAATTTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCt < 1:4270977/149‑1 (MQ=255)
gtggtgTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCt < 2:4644558/149‑1 (MQ=255)
tgtAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATcc > 2:441820/1‑149 (MQ=255)
tgtAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGAAGAGTAATTGATTGAATTAAGAGTCTATca > 2:2531095/1‑148 (MQ=255)
aaTATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCata > 2:2709421/1‑149 (MQ=255)
tatGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATc > 2:3081293/1‑149 (MQ=255)
tatGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATc > 1:4034358/1‑149 (MQ=255)
tGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGa > 2:4742000/1‑149 (MQ=255)
tGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGa > 1:857990/1‑149 (MQ=255)
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tAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAgt > 1:650645/1‑149 (MQ=255)
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CAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCT < SRR19973071.1023838/150‑1 (MQ=60)
CAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCT < SRR19973071.1023678/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTG < SRR19973071.4318770/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTG > SRR19973071.4307635/1‑150 (MQ=60)
AAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTG < SRR19973071.1154677/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCGGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑‑TTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGTATT > SRR19973071.4248133/1‑150 (MQ=60)
GAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCC < SRR19973071.3676578/150‑1 (MQ=60)
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AATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGA > SRR19973071.4601223/1‑150 (MQ=60)
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TCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGT > SRR19973071.1638752/1‑150 (MQ=60)
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ATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTG > SRR19973071.1484916/1‑150 (MQ=60)
ATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTG > SRR19973071.4114530/1‑150 (MQ=60)
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TACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTACTTGCTTGA > SRR19973071.1776977/1‑150 (MQ=60)
TACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGA > SRR19973071.4008773/1‑150 (MQ=60)
TACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGA > SRR19973071.4008787/1‑150 (MQ=60)
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AAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAG > SRR19973071.943883/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGA < SRR19973071.2203653/150‑1 (MQ=60)
AAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGA < SRR19973071.256058/150‑1 (MQ=60)
AGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGT < SRR19973071.2421620/150‑1 (MQ=60)
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AAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGT > SRR19973071.165196/1‑150 (MQ=60)
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GGATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGG > SRR19973071.634394/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAA < SRR19973071.3053679/150‑1 (MQ=60)
TGGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAA < SRR19973071.2623511/150‑1 (MQ=60)
GGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > SRR19973071.4574906/1‑150 (MQ=60)
GGGGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > SRR19973071.4574805/1‑150 (MQ=60)
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TTTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACC‑TTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAA > CP009273/524348‑524643
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |