Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
868,500 |
A→T |
93.3% |
S22S (TCA→TCT) |
yliE → |
putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 868,500 | 0 | A | T | 93.3%
| 663.0
/ 28.8
| 218 | S22S (TCA→TCT) | yliE | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/2); new base T (100/103); total (113/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.09e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
ATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTGAACGTTCGGCCCTGACATTAAAGGACTCA > CP009273/868355‑868647
|
aTTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCttt < 1:2989678/148‑1 (MQ=255)
ttAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTgg > 1:673416/1‑148 (MQ=255)
aaaaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTc < 2:3105349/148‑1 (MQ=255)
aaaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCt < 1:831137/148‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtt < 2:2246071/148‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtt < 1:2679275/148‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtt > 1:232909/1‑148 (MQ=255)
aaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtt < 1:1037600/148‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtt > 1:1138731/1‑148 (MQ=255)
aaGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCttt < 2:1356121/148‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAGGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtttt < 2:1553635/148‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtttt < 2:3191952/148‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtttt < 1:594099/148‑1 (MQ=255)
gCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCttttt < 2:2570708/148‑1 (MQ=255)
ccGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCtttttt > 1:1305087/1‑148 (MQ=255)
caAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTtcatca < 2:1305087/148‑1 (MQ=255)
gggACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATTTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAATATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTa < 2:1458251/148‑1 (MQ=255)
gggACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTa < 2:1458349/148‑1 (MQ=255)
gggACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTa < 1:2261001/148‑1 (MQ=255)
gggACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTa > 2:955229/1‑148 (MQ=255)
ggACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTaa < 1:2811515/148‑1 (MQ=255)
aCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACt > 2:2258382/1‑148 (MQ=255)
aTTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATc > 2:2351636/1‑148 (MQ=255)
tttGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAAc < 2:2005938/148‑1 (MQ=255)
gCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTgg < 2:3038571/148‑1 (MQ=255)
gCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTgg > 2:681192/1‑148 (MQ=255)
cacaGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGa < 1:1257740/148‑1 (MQ=255)
caGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAgc < 2:701752/148‑1 (MQ=255)
aGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAgcg < 2:1321299/148‑1 (MQ=255)
aGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAgcg < 2:2969613/148‑1 (MQ=255)
aGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAgcg > 1:1833118/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCgg > 1:2082120/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCgg > 2:1037669/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCgg > 2:2954814/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCgg > 2:2462529/1‑148 (MQ=255)
gATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTaa > 2:1894806/1‑148 (MQ=255)
tAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTaaaa > 2:446391/1‑148 (MQ=255)
aGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAAc > 1:1000443/1‑148 (MQ=255)
aGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAAc > 1:2663876/1‑148 (MQ=255)
tATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTg < 1:2849673/148‑1 (MQ=255)
aTTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGc > 2:2583797/1‑148 (MQ=255)
tttGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCg > 2:2776017/1‑148 (MQ=255)
ttGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGa < 1:3303863/148‑1 (MQ=255)
tttAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATa < 2:61970/147‑1 (MQ=255)
gTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATa < 1:1321032/148‑1 (MQ=255)
ttAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAg > 2:1507219/1‑148 (MQ=255)
ttAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAg > 1:221554/1‑148 (MQ=255)
tAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGc < 2:2597646/148‑1 (MQ=255)
aaTGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCg < 1:2251836/148‑1 (MQ=255)
aTGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGc > 1:1286031/1‑148 (MQ=255)
gTATTAACATGCTGAGTATAAACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTATATTTTTATTGGCAGCACTGTATTTTATTGGTCTTTTTTTCATCAATAACTATCAACTGGTAGCGGAGCGCGCGGTAAAAAGTGCCGATAGCCGCtt > 2:2723255/1‑148 (MQ=255)
tATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCttt < 1:1605768/148‑1 (MQ=255)
tATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCttt > 1:3152224/1‑148 (MQ=255)
ttAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGa > 1:2770921/1‑148 (MQ=255)
tAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGaa > 2:2226174/1‑148 (MQ=255)
tAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATAAACTGGTATCGTAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGaa > 1:2163432/1‑148 (MQ=255)
aaCATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATAATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAAc > 1:1419261/1‑148 (MQ=255)
aCATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACt > 2:248528/1‑148 (MQ=255)
cATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACtt > 1:1461499/1‑148 (MQ=255)
tGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTAt > 2:143449/1‑148 (MQ=255)
cTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTc > 1:567915/1‑148 (MQ=255)
aGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGa > 2:2082347/1‑148 (MQ=255)
ttATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGaaaa < 2:530357/148‑1 (MQ=255)
taCGAAAATATAAAGATAAGTCTGATAATTTTATTTTTATTTGCAGCTCTGTCTTTTATTTGTCTTTTTTTCATAATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCTCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTTTTCAGAAAAACg < 1:1748185/148‑1 (MQ=255)
taCGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACg < 2:3087875/148‑1 (MQ=255)
aaaaGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTgg > 1:1979022/1‑148 (MQ=255)
aaagataaagatAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGc > 1:899578/1‑148 (MQ=255)
aagataaagataAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCt > 1:1184530/1‑148 (MQ=255)
gataaagataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTAt > 2:770894/1‑148 (MQ=255)
ataaagataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTAtt > 2:1934141/1‑148 (MQ=255)
ataaagataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTAtt > 2:98747/1‑148 (MQ=255)
aaagataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTc < 2:1714129/148‑1 (MQ=255)
ataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTa > 1:1516957/1‑148 (MQ=255)
ataaGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTa < 2:879659/148‑1 (MQ=255)
ataaGGATGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTa < 2:878866/148‑1 (MQ=255)
aGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAg < 1:2803006/148‑1 (MQ=255)
aGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAg < 1:2503275/148‑1 (MQ=255)
aGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAg > 2:406045/1‑148 (MQ=255)
ggCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGa < 2:673416/148‑1 (MQ=255)
gCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGat > 1:1644425/1‑148 (MQ=255)
cTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGata < 2:1765969/148‑1 (MQ=255)
tGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGatat < 1:1425889/148‑1 (MQ=255)
tGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGatat < 2:1566990/148‑1 (MQ=255)
aTAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTg > 2:1637332/1‑148 (MQ=255)
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TACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATAATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTT < SRR19973070.2192725/150‑1 (MQ=60)
CGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGG > SRR19973070.1992403/1‑150 (MQ=60)
CGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGG > SRR19973070.2258069/1‑150 (MQ=60)
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GAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGC > SRR19973070.905953/1‑150 (MQ=60)
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CTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTGAACGTTCGGCCCTGACATTAAAGGACTCAC < SRR19973070.3249393/150‑1 (MQ=60)
CTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTGAACGTTCGGCCCTGACATTAAAGGACTCAC < SRR19973070.728918/150‑1 (MQ=60)
CTTTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTGAACGTTCGGCCCTGACATTAAAGGACTCAC > SRR19973070.2988336/1‑150 (MQ=60)
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GTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTTTCATCATTAACTATCAACTGGTATCGGAGCGCGCGGTAAAACGTGCCGATAGCCGCTTTGAACTTATTCAGAAAAACGTTGGCTATTTCTTTAAAGATATTGAACGTTCGGCCCTGACATTAAAGGACTCAC > CP009273/868352‑868648
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
