Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
3,354,405 |
C→T |
100% |
intergenic (+430/‑130) |
gltD → / → gltF |
glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit/periplasmic protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 3,354,405 | 0 | C | T | 100.0%
| 877.2
/ NA
| 263 | intergenic (+430/‑130) | gltD/gltF | glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit/periplasmic protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (121/142); total (121/142) |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAA > CP009273/3354260‑3354547
|
atGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATttatta < 2:2891341/148‑1 (MQ=255)
gAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaa < 2:3006782/148‑1 (MQ=255)
gAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaa < 2:444730/148‑1 (MQ=255)
atatAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaata < 2:2875321/148‑1 (MQ=255)
tataAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaataa > 2:3085484/1‑148 (MQ=255)
ataAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaataaa > 2:3086663/1‑148 (MQ=255)
ataAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATtaaataaa > 1:3491641/1‑148 (MQ=255)
taAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTaaataaat < 2:1742182/148‑1 (MQ=255)
taAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTaaataaat > 1:2294180/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAaataaata > 1:314617/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATAc < 2:3141275/148‑1 (MQ=255)
aaaaCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACa > 2:1918482/1‑148 (MQ=255)
aaaaCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACa < 1:406532/148‑1 (MQ=255)
aaaCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACAt < 2:1301589/148‑1 (MQ=255)
aCCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATcc < 1:3014178/148‑1 (MQ=255)
atatTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCaa > 1:2912086/1‑148 (MQ=255)
tattatCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAg < 1:686786/148‑1 (MQ=255)
ccTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGTCt > 2:2128844/1‑148 (MQ=255)
ccTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCt < 2:1053565/148‑1 (MQ=255)
ccTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCt < 2:1053600/148‑1 (MQ=255)
ttAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTAt > 2:2926576/1‑148 (MQ=255)
tAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTAtt > 1:2413365/1‑148 (MQ=255)
ttATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCt > 1:2066052/1‑148 (MQ=255)
aTCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGa < 2:500192/148‑1 (MQ=255)
tCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGaa > 1:135358/1‑148 (MQ=255)
tCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGaa < 2:1844973/148‑1 (MQ=255)
tatataTTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACg < 1:515792/148‑1 (MQ=255)
atatatTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAActa > 2:1825858/1‑146 (MQ=255)
atatatTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGa < 1:2617481/148‑1 (MQ=255)
atTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGtta > 2:3055219/1‑148 (MQ=255)
ttttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttat < 1:2528961/148‑1 (MQ=255)
ttttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttat < 1:1157554/148‑1 (MQ=255)
tttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatt > 1:570173/1‑148 (MQ=255)
tttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatt > 1:1044507/1‑148 (MQ=255)
tttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatt > 1:1922084/1‑148 (MQ=255)
tttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatt > 1:3134054/1‑148 (MQ=255)
tttCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatt < 2:3455805/148‑1 (MQ=255)
ccTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGttatttat > 2:3392694/1‑148 (MQ=255)
cTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTtatttatt > 2:3148985/1‑148 (MQ=255)
tATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTatttattt > 2:2530430/1‑148 (MQ=255)
tttttCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTAc > 1:2888372/1‑148 (MQ=255)
tttttCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTAc < 1:3190524/148‑1 (MQ=255)
ttttCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCAAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACTAGTTATTTATTTACa > 1:3304389/1‑148 (MQ=255)
ttCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACAtt < 1:1642197/148‑1 (MQ=255)
ttCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACAtt > 2:1668314/1‑148 (MQ=255)
cAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTca < 1:2720446/148‑1 (MQ=255)
cAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTca > 1:1991844/1‑148 (MQ=255)
cgcAAACATTCATGTAATGAATAATTATAACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACaa < 1:2273070/148‑1 (MQ=255)
gcAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACaaa < 2:3357592/148‑1 (MQ=255)
aCATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGa > 2:200944/1‑148 (MQ=255)
aCATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGa > 2:802262/1‑148 (MQ=255)
tCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGatata > 2:2810534/1‑148 (MQ=255)
tCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGatata > 2:3013896/1‑148 (MQ=255)
aTGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTg > 2:2629365/1‑148 (MQ=255)
aTGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTg > 1:1729109/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGc < 1:3086663/148‑1 (MQ=255)
tGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGc > 1:2369846/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGc > 2:2431025/1‑148 (MQ=255)
gAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCt > 1:3407110/1‑148 (MQ=255)
ataatTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTc > 1:472534/1‑148 (MQ=255)
taatTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCa > 2:928350/1‑148 (MQ=255)
aatTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAg < 2:1010301/148‑1 (MQ=255)
aatTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAg > 1:2155617/1‑148 (MQ=255)
ttATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCt > 2:2043889/1‑148 (MQ=255)
ttATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCt > 1:2449535/1‑148 (MQ=255)
ttATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCt < 2:376552/148‑1 (MQ=255)
tATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCtt < 2:1445096/148‑1 (MQ=255)
tATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCtt < 2:1090347/148‑1 (MQ=255)
tATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCtt < 2:216757/148‑1 (MQ=255)
tCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCtttt < 2:3165679/148‑1 (MQ=255)
accacAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTtttta < 2:2237481/148‑1 (MQ=255)
aaCCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGATCGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTaa < 1:3392694/148‑1 (MQ=255)
accaccTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTaaa > 1:3343968/1‑148 (MQ=255)
accaccTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTaaa > 1:1274817/1‑148 (MQ=255)
accTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTaaaaaa < 2:2236685/148‑1 (MQ=255)
tCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAaaataa < 1:994868/148‑1 (MQ=255)
tCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAaaataa > 1:1307856/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAaaataaat < 2:314619/148‑1 (MQ=255)
gCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGt < 2:701588/148‑1 (MQ=255)
cACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGtt < 1:3533005/148‑1 (MQ=255)
aCCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGtta < 2:1648860/148‑1 (MQ=255)
aCCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGtta > 2:1525807/1‑148 (MQ=255)
ccTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGttat < 1:1085295/148‑1 (MQ=255)
ccTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGttat > 1:1912041/1‑148 (MQ=255)
cTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGttatt > 1:2824668/1‑148 (MQ=255)
ttattCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAgg < 1:1176447/148‑1 (MQ=255)
ttattCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAgg > 2:464719/1‑148 (MQ=255)
tattCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGa < 1:2239605/148‑1 (MQ=255)
acaTGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGt < 1:1500007/148‑1 (MQ=255)
acaTGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGt < 2:3493856/148‑1 (MQ=255)
tGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCa < 1:607962/148‑1 (MQ=255)
gATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCat < 2:1946177/148‑1 (MQ=255)
gATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCat < 1:3148984/148‑1 (MQ=255)
gATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCat < 2:3134676/148‑1 (MQ=255)
aTCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCata < 1:928518/148‑1 (MQ=255)
tCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCatat > 1:2486736/1‑148 (MQ=255)
cGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATg < 1:2114494/148‑1 (MQ=255)
aaCTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACACACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGttt > 1:366144/1‑148 (MQ=255)
aCTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGtttt > 2:2276159/1‑148 (MQ=255)
tataAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTc < 1:1770915/148‑1 (MQ=255)
|
ATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAA > CP009273/3354260‑3354547
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACC > CP009273/3354256‑3354553
|
CAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTT < SRR19973067.2180094/150‑1 (MQ=60)
CAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTT < SRR19973067.1136323/150‑1 (MQ=60)
CAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTT > SRR19973067.3267924/1‑150 (MQ=60)
AAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTAT > SRR19973067.585705/1‑150 (MQ=60)
AATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATT > SRR19973067.456439/1‑150 (MQ=60)
AATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATT > SRR19973067.3528456/1‑150 (MQ=60)
ATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTA > SRR19973067.3185727/1‑150 (MQ=60)
ATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTA < SRR19973067.2621677/150‑1 (MQ=60)
TATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAA > SRR19973067.600611/1‑150 (MQ=60)
TATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAA < SRR19973067.127066/150‑1 (MQ=60)
TATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGAAACTATAAAATTTATTAA > SRR19973067.2540385/1‑150 (MQ=60)
ATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAA > SRR19973067.3513801/1‑150 (MQ=60)
ATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTAGCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAGACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAA > SRR19973067.3212794/1‑150 (MQ=60)
TATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAAT < SRR19973067.1986463/150‑1 (MQ=60)
TATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAAT > SRR19973067.2309324/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATA > SRR19973067.316721/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATA > SRR19973067.316723/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATA > SRR19973067.316727/1‑150 (MQ=60)
AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACAT < SRR19973067.1785627/150‑1 (MQ=60)
AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACAT < SRR19973067.1713306/150‑1 (MQ=60)
AAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATC < SRR19973067.409363/150‑1 (MQ=60)
AACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACAagat > SRR19973067.1777344/1‑146 (MQ=60)
ACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCA < SRR19973067.3033357/150‑1 (MQ=60)
ACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCA > SRR19973067.150086/1‑150 (MQ=60)
ATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAA > SRR19973067.2930636/1‑150 (MQ=60)
ATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAA > SRR19973067.484860/1‑150 (MQ=60)
TATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTT < SRR19973067.691509/150‑1 (MQ=60)
ATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTG < SRR19973067.1412186/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCT < SRR19973067.1637188/150‑1 (MQ=60)
CTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATT > SRR19973067.2429162/1‑150 (MQ=60)
CTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATT < SRR19973067.3342723/150‑1 (MQ=60)
CTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATT > SRR19973067.2429175/1‑150 (MQ=60)
CTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATT > SRR19973067.1296828/1‑150 (MQ=60)
TTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTT < SRR19973067.3048614/150‑1 (MQ=60)
TAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTC < SRR19973067.2496698/150‑1 (MQ=60)
AATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCT > SRR19973067.3516023/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCT > SRR19973067.2079792/1‑150 (MQ=60)
ATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTG < SRR19973067.2429900/150‑1 (MQ=60)
TATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAA > SRR19973067.136565/1‑150 (MQ=60)
ATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAAC > SRR19973067.342947/1‑150 (MQ=60)
TATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAG < SRR19973067.519291/150‑1 (MQ=60)
TATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAG < SRR19973067.519301/150‑1 (MQ=60)
ATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGT < SRR19973067.2634458/150‑1 (MQ=60)
TATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTAT > SRR19973067.2159002/1‑150 (MQ=60)
TATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTAT > SRR19973067.2159037/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.3153964/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.3154588/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.573870/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.1051688/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.1935197/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.1959446/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATT > SRR19973067.2068810/1‑150 (MQ=60)
TTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTT < SRR19973067.3372657/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTT < SRR19973067.183902/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTT < SRR19973067.1165271/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTT < SRR19973067.2545532/150‑1 (MQ=60)
TTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTAT < SRR19973067.2699539/150‑1 (MQ=60)
CCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATCATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTCTTTCTGAACGAGTTATTTATTT > SRR19973067.382172/1‑150 (MQ=60)
CTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTA > SRR19973067.863779/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTAC > SRR19973067.2906833/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACA > SRR19973067.2907074/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCAAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACTAGTTATTTATTTACA > SRR19973067.3325231/1‑150 (MQ=60)
TTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACAT < SRR19973067.3210678/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATT < SRR19973067.1099163/150‑1 (MQ=60)
TTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCA > SRR19973067.2005301/1‑150 (MQ=60)
TTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCA < SRR19973067.1653506/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACA < SRR19973067.2737989/150‑1 (MQ=60)
AGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAA > SRR19973067.418079/1‑150 (MQ=60)
CGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATAACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAAC < SRR19973067.2288257/150‑1 (MQ=60)
CGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATAACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAAC < SRR19973067.2288118/150‑1 (MQ=60)
CGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATAACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAAC < SRR19973067.2288116/150‑1 (MQ=60)
AACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGAT < SRR19973067.1084682/150‑1 (MQ=60)
ACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATA < SRR19973067.529832/150‑1 (MQ=60)
ATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATA < SRR19973067.1312103/150‑1 (MQ=60)
GTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACT < SRR19973067.36195/150‑1 (MQ=60)
TAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTG > SRR19973067.1740949/1‑150 (MQ=60)
TAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTG > SRR19973067.2329968/1‑150 (MQ=60)
AATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGC > SRR19973067.3133391/1‑150 (MQ=60)
AATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGC > SRR19973067.2385268/1‑150 (MQ=60)
ATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCT > SRR19973067.3428802/1‑150 (MQ=60)
ATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCT > SRR19973067.3428797/1‑150 (MQ=60)
TGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTT < SRR19973067.3106299/150‑1 (MQ=60)
GAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTC < SRR19973067.2337850/150‑1 (MQ=60)
GAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTC > SRR19973067.203009/1‑150 (MQ=60)
GAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTC > SRR19973067.475796/1‑150 (MQ=60)
ATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAG > SRR19973067.2170029/1‑150 (MQ=60)
AATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCT > SRR19973067.2900286/1‑150 (MQ=60)
AATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCT > SRR19973067.2465630/1‑150 (MQ=60)
ATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTT < SRR19973067.1168828/150‑1 (MQ=60)
CACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTAT > SRR19973067.2279668/1‑150 (MQ=60)
CCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTT < SRR19973067.1931572/150‑1 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA > SRR19973067.1590245/1‑150 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA > SRR19973067.3365134/1‑150 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA > SRR19973067.1283492/1‑150 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA > SRR19973067.3365156/1‑150 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA > SRR19973067.1282570/1‑150 (MQ=60)
AAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAA < SRR19973067.2173746/150‑1 (MQ=60)
AACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAA < SRR19973067.3414250/150‑1 (MQ=60)
AACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATAGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGATCGATTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAA < SRR19973067.3414279/150‑1 (MQ=60)
ACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAA > SRR19973067.2890378/1‑150 (MQ=60)
CACCTCACCAGCACCTTATTATTCACCTGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAAT < SRR19973067.3124168/150‑1 (MQ=60)
CCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAA > SRR19973067.1316777/1‑150 (MQ=60)
CCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAA > SRR19973067.1317131/1‑150 (MQ=60)
TCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAAT < SRR19973067.1001717/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTT > SRR19973067.1776768/1‑150 (MQ=60)
ACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTT > SRR19973067.2637529/1‑150 (MQ=60)
CAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGT < SRR19973067.30117/150‑1 (MQ=60)
CACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTAT < SRR19973067.3555339/150‑1 (MQ=60)
CACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTAT < SRR19973067.2917875/150‑1 (MQ=60)
CACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTAT > SRR19973067.116730/1‑150 (MQ=60)
CACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTAT > SRR19973067.1925086/1‑150 (MQ=60)
CACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTAT < SRR19973067.2209571/150‑1 (MQ=60)
ACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATT < SRR19973067.3054932/150‑1 (MQ=60)
ACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATT > SRR19973067.2842842/1‑150 (MQ=60)
ACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATT < SRR19973067.2756517/150‑1 (MQ=60)
ACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATT < SRR19973067.944161/150‑1 (MQ=60)
CCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTA < SRR19973067.981913/150‑1 (MQ=60)
CCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTA < SRR19973067.1092720/150‑1 (MQ=60)
TTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGAT < SRR19973067.1184229/150‑1 (MQ=60)
TATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATA < SRR19973067.2254502/150‑1 (MQ=60)
ATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATAT > SRR19973067.3491901/1‑150 (MQ=60)
ATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATAT > SRR19973067.684023/1‑150 (MQ=60)
ATTCACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATAT < SRR19973067.2098628/150‑1 (MQ=60)
TCACATGATCGTAAATATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACACACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGT < SRR19973067.2569562/150‑1 (MQ=60)
ACATGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTC < SRR19973067.1509889/150‑1 (MQ=60)
TGATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATA < SRR19973067.611872/150‑1 (MQ=60)
GNTCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATAT > SRR19973067.2503069/1‑150 (MQ=60)
GATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATAT < SRR19973067.372202/150‑1 (MQ=60)
GATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATAT < SRR19973067.3168962/150‑1 (MQ=60)
GATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATAT < SRR19973067.3168961/150‑1 (MQ=60)
GATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATAT > SRR19973067.2503078/1‑150 (MQ=60)
ATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATG < SRR19973067.934794/150‑1 (MQ=60)
ATCGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATG < SRR19973067.934624/150‑1 (MQ=60)
CGTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTT < SRR19973067.2128581/150‑1 (MQ=60)
GTAACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACACACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTT > SRR19973067.368689/1‑150 (MQ=60)
ACTATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTC < SRR19973067.2387725/150‑1 (MQ=60)
TATAAAATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAA < SRR19973067.1782934/150‑1 (MQ=60)
AATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGA > SRR19973067.3427516/1‑150 (MQ=60)
AATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGA > SRR19973067.267728/1‑150 (MQ=60)
ATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATTTGTTTTTCAAAAAGAA > SRR19973067.1402107/1‑150 (MQ=60)
ATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAA > SRR19973067.3096489/1‑150 (MQ=60)
ATTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAA > SRR19973067.2327426/1‑150 (MQ=60)
TTTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAAC < SRR19973067.131098/150‑1 (MQ=60)
TTATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACC > SRR19973067.3576554/1‑150 (MQ=60)
|
CAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACC > CP009273/3354256‑3354553
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |