Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
248,486 |
C→A |
intergenic (+46/‑6) |
dinB → / → yafN |
DNA polymerase IV/antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 248,486 | 0 | C | A | 100.0%
| 696.0
/ NA
| 211 | intergenic (+46/‑6) | dinB/yafN | DNA polymerase IV/antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (82/129); total (82/129) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAA > CP009273/248340‑248632
|
gggATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTa < 2:170548/150‑1 (MQ=255)
aCGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCg > 2:451076/1‑150 (MQ=255)
aCGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCg < 2:3246335/150‑1 (MQ=255)
cgccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGa > 1:1873596/1‑150 (MQ=255)
gccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGaa < 1:2545810/150‑1 (MQ=255)
ccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAAt < 1:574775/150‑1 (MQ=255)
ccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAAt < 1:1621808/150‑1 (MQ=255)
gggcgCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCt < 1:1717306/150‑1 (MQ=255)
gggcgCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCt < 1:1718265/150‑1 (MQ=255)
tgtgCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATc > 1:2153744/1‑150 (MQ=255)
gtgCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCg > 2:1823342/1‑150 (MQ=255)
gtgCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCg < 2:2235694/150‑1 (MQ=255)
gCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGt < 1:64600/150‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTc > 1:3076076/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAat < 1:3790422/150‑1 (MQ=255)
ggtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAatat > 2:3352082/1‑150 (MQ=255)
gggggggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTAGAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAatat < 2:1531141/147‑1 (MQ=255)
gtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATc < 1:2420532/150‑1 (MQ=255)
tggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCa > 1:2739670/1‑150 (MQ=255)
tggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCa < 1:130191/150‑1 (MQ=255)
gggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCatt < 1:3607640/150‑3 (MQ=255)
gggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCatt < 1:2252087/150‑3 (MQ=255)
cTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAg < 2:252656/150‑1 (MQ=255)
gCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGtt < 2:974631/150‑1 (MQ=255)
cATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTa < 1:3433018/150‑1 (MQ=255)
aTGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTAc < 2:1187743/150‑1 (MQ=255)
aTGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTAc < 1:1531603/150‑1 (MQ=255)
tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACg < 2:2146146/150‑1 (MQ=255)
tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACg > 2:3177388/1‑150 (MQ=255)
tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACg < 1:797605/150‑1 (MQ=255)
tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACg > 2:494131/1‑150 (MQ=255)
gACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTaa > 1:406834/1‑150 (MQ=255)
gCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAAccc > 1:2611501/1‑150 (MQ=255)
cTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCa > 2:3498772/1‑150 (MQ=255)
cTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCa < 1:675423/150‑1 (MQ=255)
cTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCa < 1:1230609/150‑1 (MQ=255)
cTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCa < 1:1383481/150‑1 (MQ=255)
ttGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAg < 2:2263880/150‑1 (MQ=255)
ttGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAg < 1:853272/150‑1 (MQ=255)
gACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCt > 1:2361662/1‑150 (MQ=255)
cccGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTaa > 2:3446661/1‑150 (MQ=255)
ccGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTaaa < 1:2026264/150‑1 (MQ=255)
ccGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTaaa > 2:1295407/1‑150 (MQ=255)
aaaTGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACt > 2:410860/1‑150 (MQ=255)
aTGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACttt < 2:3672353/150‑1 (MQ=255)
aTGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACttt < 2:1166112/150‑1 (MQ=255)
tGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGTTGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGTATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTa < 1:2552509/150‑1 (MQ=255)
ggAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAt < 2:1869875/150‑1 (MQ=255)
aaaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTg < 2:2611501/150‑1 (MQ=255)
aaaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTg < 1:2672279/150‑1 (MQ=255)
aaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGa < 1:1087584/150‑1 (MQ=255)
gACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATc < 2:1091365/150‑1 (MQ=255)
aCTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAAcc < 2:2467248/150‑1 (MQ=255)
cTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCg < 2:1385284/150‑1 (MQ=255)
cTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCg < 2:1421338/150‑1 (MQ=255)
cTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCg > 2:2031912/1‑150 (MQ=255)
tGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCgg > 2:2633747/1‑150 (MQ=255)
gggATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGt > 1:883535/1‑150 (MQ=255)
ggATTATGATGTATGTTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGtt < 2:783718/150‑1 (MQ=255)
ggATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGtt > 1:3411324/1‑150 (MQ=255)
ggATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGtt > 1:3668817/1‑150 (MQ=255)
ttATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctt > 1:3587373/1‑150 (MQ=255)
tATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttcttt > 1:68264/1‑150 (MQ=255)
atgatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttc < 1:2846216/150‑1 (MQ=255)
atgatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttc < 1:3462726/150‑1 (MQ=255)
tgatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttct < 2:3581661/150‑1 (MQ=255)
tgatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttct < 1:2951191/150‑1 (MQ=255)
tgatgTATATTAGTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttct < 2:1785912/150‑1 (MQ=255)
gatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCta < 2:1644055/150‑1 (MQ=255)
tgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCtaat > 2:292702/1‑150 (MQ=255)
tataTTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCtaataa > 1:3023182/1‑150 (MQ=255)
atatTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTaataat < 2:3143404/150‑1 (MQ=255)
tattattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATc < 1:494131/147‑1 (MQ=255)
tattattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATc < 2:3802016/147‑1 (MQ=255)
attattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCg < 1:3367769/148‑1 (MQ=255)
tattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGcc < 1:3493725/150‑1 (MQ=255)
tattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGcc > 2:649049/1‑150 (MQ=255)
tattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATAGGTCAATATCATTGAGTTACGTTAAAACCCAGCTAAATTCTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGcc < 1:423157/150‑1 (MQ=255)
attatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGccc < 2:2086164/150‑1 (MQ=255)
ttatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGcccc < 2:1882254/150‑1 (MQ=255)
tatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCg > 1:905744/1‑150 (MQ=255)
tatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCg < 2:2739670/150‑1 (MQ=255)
atGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGc > 2:1326630/1‑150 (MQ=255)
tGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCa < 1:2157306/150‑1 (MQ=255)
tGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCa > 1:1848871/1‑150 (MQ=255)
atatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGa > 2:1435426/1‑150 (MQ=255)
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AAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGA < SRR19973061.1090373/150‑1 (MQ=60)
AGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAT > SRR19973061.2640444/1‑150 (MQ=60)
AGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAT > SRR19973061.306679/1‑150 (MQ=60)
TGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGG < SRR19973061.2953573/150‑1 (MQ=60)
TGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTG > SRR19973061.2191819/1‑150 (MQ=60)
GGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGT > SRR19973061.1989355/1‑150 (MQ=60)
GGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGT > SRR19973061.885824/1‑150 (MQ=60)
GGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGT > SRR19973061.3509292/1‑150 (MQ=60)
GGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATAGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGT > SRR19973061.885990/1‑150 (MQ=60)
GGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTT > SRR19973061.3420084/1‑150 (MQ=60)
GGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTT > SRR19973061.3678198/1‑150 (MQ=60)
GGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTT > SRR19973061.1518572/1‑150 (MQ=60)
TTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTT > SRR19973061.3596569/1‑150 (MQ=60)
TATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTT > SRR19973061.68520/1‑150 (MQ=60)
ATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTC < SRR19973061.3471600/150‑1 (MQ=60)
ATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTC < SRR19973061.2853506/150‑1 (MQ=60)
TGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCT < SRR19973061.2958798/150‑1 (MQ=60)
ATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAA > SRR19973061.1887419/1‑150 (MQ=60)
GTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATA > SRR19973061.2926328/1‑150 (MQ=60)
TATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAA > SRR19973061.3030989/1‑150 (MQ=60)
ATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAAT > SRR19973061.3493916/1‑150 (MQ=60)
TATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATC < SRR19973061.495440/150‑1 (MQ=60)
ATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCG < SRR19973061.3376427/150‑1 (MQ=60)
TATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCC < SRR19973061.3502651/150‑1 (MQ=60)
TATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATAGGTCAATATCATTGAGTTACGTTAAAACCCAGCTAAATTCTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCC < SRR19973061.424307/150‑1 (MQ=60)
TTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCC < SRR19973061.3444316/150‑1 (MQ=60)
TATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCG > SRR19973061.908068/1‑150 (MQ=60)
TGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCA < SRR19973061.2162725/150‑1 (MQ=60)
TGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCA > SRR19973061.1853500/1‑150 (MQ=60)
TGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCA < SRR19973061.2161992/150‑1 (MQ=60)
ATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATA > SRR19973061.1572220/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAT < SRR19973061.982572/150‑1 (MQ=60)
TCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATC < SRR19973061.1737851/150‑1 (MQ=60)
TCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATC < SRR19973061.1737848/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT < SRR19973061.794150/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT < SRR19973061.3539620/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT < SRR19973061.794213/150‑1 (MQ=60)
GGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCT > SRR19973061.2105758/1‑150 (MQ=60)
GTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTT > SRR19973061.2411770/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCC > SRR19973061.1888227/1‑150 (MQ=60)
TTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGC < SRR19973061.3430202/150‑1 (MQ=60)
GGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCG < SRR19973061.2993661/150‑1 (MQ=60)
TAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGC < SRR19973061.152128/150‑1 (MQ=60)
TAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGC < SRR19973061.152104/150‑1 (MQ=60)
AACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCG > SRR19973061.3702840/1‑150 (MQ=60)
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AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCG > CP009273/248337‑248635
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |