Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
248,486 |
C→A |
100% |
intergenic (+46/‑6) |
dinB → / → yafN |
DNA polymerase IV/antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 248,486 | 0 | C | A | 100.0%
| 709.2
/ NA
| 215 | intergenic (+46/‑6) | dinB/yafN | DNA polymerase IV/antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (94/121); total (94/121) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCG > CP009273/248341‑248630
|
tGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACt < 1:2523965/148‑1 (MQ=255)
ggATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGt < 1:3032519/148‑1 (MQ=255)
gATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTa < 2:2739782/148‑1 (MQ=255)
gATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTa < 2:1570365/148‑1 (MQ=255)
gATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTa < 2:847012/148‑1 (MQ=255)
gAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGc < 1:3493811/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCAt < 2:1452203/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCAt < 2:1333678/148‑1 (MQ=255)
cgccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATc < 2:433783/148‑1 (MQ=255)
gccgcGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCAGTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCg > 2:1364954/1‑148 (MQ=255)
gcgggcgCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATtct > 1:3092002/1‑148 (MQ=255)
cgggcgCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATCTTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATtctc > 2:114845/1‑148 (MQ=255)
gcgcGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCt < 2:574751/148‑1 (MQ=255)
gcgGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGa > 2:2204816/1‑148 (MQ=255)
gtgtGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGaaaa < 2:770940/148‑1 (MQ=255)
gCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCg > 2:2624873/1‑148 (MQ=255)
gCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCg > 2:2624759/1‑148 (MQ=255)
gCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCg > 2:2174456/1‑148 (MQ=255)
tggtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCaa < 1:2408270/148‑1 (MQ=255)
gtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAata < 1:1737284/148‑1 (MQ=255)
gtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAata < 1:3150924/148‑1 (MQ=255)
gtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCGGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAata < 2:1547071/148‑1 (MQ=255)
ggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCAc < 1:1900350/148‑1 (MQ=255)
ggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCAc < 1:1154472/148‑1 (MQ=255)
gCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACt < 1:3223869/148‑1 (MQ=255)
cTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTg < 1:2294908/148‑1 (MQ=255)
tGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGa > 2:2951421/1‑148 (MQ=255)
cATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGt > 1:14013/1‑148 (MQ=255)
cATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGt < 1:1468316/148‑1 (MQ=255)
tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTa > 1:1167674/1‑148 (MQ=255)
gtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTAc > 2:2714146/1‑148 (MQ=255)
tgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACg > 2:3319412/1‑148 (MQ=255)
tGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCa > 1:989557/1‑148 (MQ=255)
gACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAg < 2:2025976/148‑1 (MQ=255)
gACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAg < 1:186806/148‑1 (MQ=255)
gACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAg < 1:100232/148‑1 (MQ=255)
tGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACtt > 2:91890/1‑148 (MQ=255)
ggAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACttt < 1:111682/148‑1 (MQ=255)
aaaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAt > 2:1131428/1‑148 (MQ=255)
aaaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAt > 1:3123413/1‑148 (MQ=255)
aaGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAtt > 1:2934249/1‑148 (MQ=255)
aCAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAt < 2:3017653/148‑1 (MQ=255)
aCAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATCATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAt > 1:2248424/1‑148 (MQ=255)
cAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATc > 1:934637/1‑148 (MQ=255)
ggTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCg > 2:1027057/1‑148 (MQ=255)
gTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCgg < 1:464374/148‑1 (MQ=255)
tGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGt < 1:3101746/148‑1 (MQ=255)
cTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTg < 2:3171027/148‑1 (MQ=255)
cTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTAGGCATCGAAGTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTg < 2:3171070/148‑1 (MQ=255)
ggATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCgg < 1:2113809/148‑1 (MQ=255)
aTTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGtt < 2:2914672/148‑1 (MQ=255)
aTTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGtt > 2:2730984/1‑148 (MQ=255)
tATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttct < 2:726749/148‑1 (MQ=255)
tATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAAACCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttct > 2:1661347/1‑148 (MQ=255)
tATGATGTATATGATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttct < 2:1842581/148‑1 (MQ=255)
gatgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttctttc > 1:2199562/1‑148 (MQ=255)
tgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCta < 2:1663368/148‑1 (MQ=255)
tgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCta > 2:3056147/1‑148 (MQ=255)
tgTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCta < 1:2608096/148‑1 (MQ=255)
tattattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCtaataa < 2:2551122/145‑1 (MQ=255)
attattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGATGCGGTTCTTTCTaataat > 2:3492138/3‑148 (MQ=255)
tattatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCg > 1:1645700/1‑148 (MQ=255)
ttatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGcc < 2:335142/148‑1 (MQ=255)
ttatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTGTCTAATACTCGcc > 2:2878117/1‑148 (MQ=255)
tatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGccc > 2:1939515/1‑148 (MQ=255)
tatGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGccc < 1:861590/148‑1 (MQ=255)
gTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGc > 1:3079608/1‑148 (MQ=255)
gTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGc > 1:3080026/1‑148 (MQ=255)
tattTTCTGGTGTGAATTTTTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCTGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCa < 2:3392227/148‑1 (MQ=255)
atatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAg > 2:2589122/1‑148 (MQ=255)
atatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAg > 1:1448399/1‑148 (MQ=255)
tatTCTGGTGTTCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTATATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAgg < 2:1960257/148‑1 (MQ=255)
tatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAgg < 2:3250671/148‑1 (MQ=255)
tatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAgg > 1:1063985/1‑148 (MQ=255)
tatTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAgg < 1:3492138/148‑1 (MQ=255)
atTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGa > 1:1267300/1‑148 (MQ=255)
atTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGa > 1:2582061/1‑148 (MQ=255)
ttCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGat < 1:1892934/148‑1 (MQ=255)
ttCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGat < 1:1892930/148‑1 (MQ=255)
tCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGata > 1:1348316/1‑148 (MQ=255)
ggTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAtct > 1:2517509/1‑148 (MQ=255)
ggTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAtct > 2:2131956/1‑148 (MQ=255)
tgCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTa > 1:2579046/1‑148 (MQ=255)
cATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAg < 1:2653607/148‑1 (MQ=255)
tattatGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTATATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGTATATCTCTTAATTGc > 1:2661298/1‑148 (MQ=255)
gattatGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGc > 1:290863/2‑148 (MQ=255)
ttatGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCa > 1:2351143/1‑148 (MQ=255)
tGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAgcg > 1:1686253/1‑148 (MQ=255)
aGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCa < 2:1824462/148‑1 (MQ=255)
aGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCa < 1:114610/148‑1 (MQ=255)
aGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCa < 1:2065062/148‑1 (MQ=255)
gggTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCAt < 1:978142/148‑1 (MQ=255)
gggTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCAt < 1:3318488/148‑1 (MQ=255)
gggTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCAt < 2:1983071/148‑1 (MQ=255)
ggTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCAtt < 1:267463/148‑1 (MQ=255)
gTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGttct > 1:2714344/1‑102 (MQ=255)
gTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTc < 1:629342/148‑1 (MQ=255)
gTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTc > 2:3181356/1‑148 (MQ=255)
tataACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCg > 2:650957/1‑148 (MQ=255)
tataACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCg > 2:2413957/1‑148 (MQ=255)
|
CTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCG > CP009273/248341‑248630
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAG > CP009273/248337‑248633
|
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATA > SRR19973065.226788/1‑150 (MQ=60)
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATA > SRR19973065.2011418/1‑150 (MQ=60)
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATA > SRR19973065.1256866/1‑150 (MQ=60)
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATA > SRR19973065.1256020/1‑150 (MQ=60)
AACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAA > SRR19973065.908167/1‑150 (MQ=60)
AACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAA > SRR19973065.908009/1‑150 (MQ=60)
ACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAAC < SRR19973065.2095843/150‑1 (MQ=60)
ACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAAC < SRR19973065.2095616/150‑1 (MQ=60)
ACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAAC < SRR19973065.1491511/150‑1 (MQ=60)
CCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACT < SRR19973065.2244115/150‑1 (MQ=60)
TGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGT < SRR19973065.2539808/150‑1 (MQ=60)
GGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTAT < SRR19973065.3051093/150‑1 (MQ=60)
GAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCAT < SRR19973065.1397324/150‑1 (MQ=60)
GAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCAT < SRR19973065.3515043/150‑1 (MQ=60)
GAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCAT < SRR19973065.3515048/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCT > SRR19973065.3110883/1‑150 (MQ=60)
CGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCT > SRR19973065.3110672/1‑150 (MQ=60)
CGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCT > SRR19973065.2567091/1‑150 (MQ=60)
GCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCG < SRR19973065.2058766/150‑1 (MQ=60)
GCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCG < SRR19973065.1885339/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCT < SRR19973065.2312664/150‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAA > SRR19973065.1416690/1‑150 (MQ=60)
CGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAA > SRR19973065.3172264/1‑150 (MQ=60)
TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATC < SRR19973065.2285770/150‑1 (MQ=60)
TGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTACTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATC > SRR19973065.463005/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAAT < SRR19973065.3088450/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATA < SRR19973065.2423429/150‑1 (MQ=60)
GTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATC < SRR19973065.1748770/150‑1 (MQ=60)
GTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATC < SRR19973065.3170038/150‑1 (MQ=60)
GTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATC < SRR19973065.3170047/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACT < SRR19973065.2382682/150‑1 (MQ=60)
GGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTG < SRR19973065.1161892/150‑1 (MQ=60)
GGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTG < SRR19973065.1912836/150‑1 (MQ=60)
GGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTG < SRR19973065.1912141/150‑1 (MQ=60)
GCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGA < SRR19973065.3243231/150‑1 (MQ=60)
CTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAG < SRR19973065.2309364/150‑1 (MQ=60)
TGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGT > SRR19973065.14222/1‑150 (MQ=60)
TGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGT < SRR19973065.592046/150‑1 (MQ=60)
CATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTA < SRR19973065.1477734/150‑1 (MQ=60)
CATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTA > SRR19973065.1175124/1‑150 (MQ=60)
CATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTA > SRR19973065.1175120/1‑150 (MQ=60)
TGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACG < SRR19973065.932602/150‑1 (MQ=60)
CTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCA > SRR19973065.996128/1‑150 (MQ=60)
GACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCT > SRR19973065.2152462/1‑150 (MQ=60)
GACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCT < SRR19973065.101151/150‑1 (MQ=60)
GACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCT < SRR19973065.101650/150‑1 (MQ=60)
GACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCT < SRR19973065.188273/150‑1 (MQ=60)
AATTGAAAGACTACTGGTGCTGTTATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTATATACTT < SRR19973065.1468205/150‑1 (MQ=60)
ATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTT > SRR19973065.3152731/1‑150 (MQ=60)
TGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTA > SRR19973065.3037754/1‑150 (MQ=60)
GGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAT < SRR19973065.657869/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAT < SRR19973065.999094/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAT < SRR19973065.998917/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAT > SRR19973065.3142433/1‑150 (MQ=60)
GGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTAT < SRR19973065.112686/150‑1 (MQ=60)
GAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATT > SRR19973065.2952045/1‑150 (MQ=60)
AGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATCATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAT > SRR19973065.2262684/1‑150 (MQ=60)
AGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATCATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGAT > SRR19973065.3123898/1‑150 (MQ=60)
GACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATC > SRR19973065.940807/1‑150 (MQ=60)
CAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAA > SRR19973065.1674509/1‑150 (MQ=60)
CAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAA > SRR19973065.1674508/1‑150 (MQ=60)
AACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAAC > SRR19973065.3270316/1‑150 (MQ=60)
AACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAAC < SRR19973065.1286550/150‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTT < SRR19973065.109657/150‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTT < SRR19973065.467578/150‑1 (MQ=60)
TGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTG < SRR19973065.3120676/150‑1 (MQ=60)
TGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTG < SRR19973065.3120666/150‑1 (MQ=60)
GGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTT < SRR19973065.2127414/150‑1 (MQ=60)
GGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTT < SRR19973065.2127376/150‑1 (MQ=60)
TATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTT < SRR19973065.2702992/150‑1 (MQ=60)
ATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTC > SRR19973065.2213644/1‑150 (MQ=60)
TGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCT < SRR19973065.2525699/150‑1 (MQ=60)
TGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAAT < SRR19973065.2624277/150‑1 (MQ=60)
TATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAA > SRR19973065.992558/1‑150 (MQ=60)
ATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAAT > SRR19973065.533428/1‑150 (MQ=60)
ATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCG > SRR19973065.1656748/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGTATATTCTGGTGTACATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGC > SRR19973065.2998820/1‑150 (MQ=60)
TATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCC > SRR19973065.1733351/1‑150 (MQ=60)
TATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCG < SRR19973065.2636803/150‑1 (MQ=60)
TATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCG < SRR19973065.867137/150‑1 (MQ=60)
ATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGC > SRR19973065.3098837/1‑150 (MQ=60)
ATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGC > SRR19973065.3098417/1‑150 (MQ=60)
ATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGATGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGC > SRR19973065.3098462/1‑150 (MQ=60)
TGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCA > SRR19973065.2838303/1‑150 (MQ=60)
TGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCA > SRR19973065.2386202/1‑150 (MQ=60)
GTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAG > SRR19973065.1457756/1‑150 (MQ=60)
TATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGG > SRR19973065.1071037/1‑150 (MQ=60)
TATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGG > SRR19973065.1128330/1‑150 (MQ=60)
TATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGG < SRR19973065.2601966/150‑1 (MQ=60)
ATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGA > SRR19973065.1275578/1‑150 (MQ=60)
ATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGA > SRR19973065.1275634/1‑150 (MQ=60)
ATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGA > SRR19973065.2598158/1‑150 (MQ=60)
ATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGA > SRR19973065.1275659/1‑150 (MQ=60)
TATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGAT < SRR19973065.1766799/150‑1 (MQ=60)
TATTATGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGAT < SRR19973065.3513370/150‑1 (MQ=60)
ATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATA > SRR19973065.1357234/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAT < SRR19973065.1905374/150‑1 (MQ=60)
TTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAT < SRR19973065.94649/150‑1 (MQ=60)
TTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAT < SRR19973065.1905373/150‑1 (MQ=60)
TTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATAT < SRR19973065.1905377/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT > SRR19973065.2533322/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT > SRR19973065.1543666/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCT > SRR19973065.2533328/1‑150 (MQ=60)
TGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTA > SRR19973065.2595128/1‑150 (MQ=60)
TGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTA > SRR19973065.2596325/1‑150 (MQ=60)
CATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTG < SRR19973065.2670116/150‑1 (MQ=60)
CATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTG < SRR19973065.2669996/150‑1 (MQ=60)
ATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTATATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGTATATCTCTTAATTGC > SRR19973065.2677759/1‑150 (MQ=60)
ATGATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGC > SRR19973065.292755/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCC < SRR19973065.2653231/150‑1 (MQ=60)
TATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCA > SRR19973065.2365782/1‑150 (MQ=60)
TATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCG > SRR19973065.1697521/1‑150 (MQ=60)
AGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATT < SRR19973065.294745/150‑1 (MQ=60)
AGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATT < SRR19973065.115862/150‑1 (MQ=60)
AGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATT < SRR19973065.115625/150‑1 (MQ=60)
AGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATT < SRR19973065.2078223/150‑1 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcactgatgccaga > SRR19973065.2731228/1‑106 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTC < SRR19973065.3338732/150‑1 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTC < SRR19973065.2218923/150‑1 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTC < SRR19973065.984634/150‑1 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTC < SRR19973065.2060923/150‑1 (MQ=60)
GGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTC < SRR19973065.3339662/150‑1 (MQ=60)
GGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCG < SRR19973065.269285/150‑1 (MQ=60)
GGTATAACTGTATGCATCGAAGTCTCGCAGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCG < SRR19973065.269033/150‑1 (MQ=60)
GTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGA < SRR19973065.633439/150‑1 (MQ=60)
TATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAA > SRR19973065.3472281/1‑150 (MQ=60)
ATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAG < SRR19973065.3379713/150‑1 (MQ=60)
|
AAACCTGGGATGAACGCCGCGGCGGGCGCGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAG > CP009273/248337‑248633
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |