Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,118,591 |
C→A |
79.5% |
G47C (GGT→TGT) |
yceB ← |
lipoprotein, DUF1439 family |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,118,591 | 0 | C | A | 79.5%
| 438.8
/ 144.1
| 254 | G47C (GGT→TGT) | yceB | lipoprotein, DUF1439 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/26); new base A (98/104); total (124/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
AGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC > CP009273/1118443‑1118739
|
aGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCg > 2:2230555/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACTGGGTGTTCATGTCCTGATTGGCGTCTCGGGTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGa < 1:2443619/150‑1 (MQ=255)
gTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCTGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTAGTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGa < 2:1893416/150‑1 (MQ=255)
gTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGa < 2:4942163/150‑1 (MQ=255)
cATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATc < 2:579527/150‑1 (MQ=255)
cATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTAGTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATc < 2:2436255/150‑1 (MQ=255)
aTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCt < 2:803421/150‑1 (MQ=255)
cTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTgaga > 2:3442105/1‑150 (MQ=255)
tttCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGaa > 1:4924317/1‑150 (MQ=255)
ttCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGaaa > 2:682312/1‑150 (MQ=255)
ttCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGaaa < 2:4786074/150‑1 (MQ=255)
tCTTACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCATATTGGCGTCTCCGTTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAat < 1:1061190/150‑1 (MQ=255)
cTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAatt > 2:4862381/1‑150 (MQ=255)
gACTACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGATCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattat < 1:1735952/150‑1 (MQ=255)
cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAAttatta < 2:1621315/150‑1 (MQ=255)
aCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATg < 1:5031522/150‑1 (MQ=255)
cGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt > 1:437512/1‑150 (MQ=255)
cGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt > 1:3797744/1‑150 (MQ=255)
aaCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc < 2:1797098/150‑1 (MQ=255)
aaCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc < 2:3149442/150‑1 (MQ=255)
cAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGc > 1:26805/1‑150 (MQ=255)
gggAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCaa < 2:1214478/150‑1 (MQ=255)
gAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGc > 2:3634243/1‑150 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCg > 2:2271613/1‑150 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCg > 1:1583888/1‑150 (MQ=255)
gTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGa < 2:3884320/150‑1 (MQ=255)
gTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGa < 2:3159349/150‑1 (MQ=255)
tCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACt > 2:1924350/1‑150 (MQ=255)
gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGtt > 2:3344521/1‑150 (MQ=255)
gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGtt < 2:4668929/150‑1 (MQ=255)
aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt < 1:1173255/150‑1 (MQ=255)
aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt > 1:2419123/1‑150 (MQ=255)
ttGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCt > 2:19313/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTg > 2:4005411/1‑150 (MQ=255)
gggTCTCGGTTTTGGTTAACGTTTTTGGGCTCTTCGCGACAATTTGGGGTGGTCTGGTTTGAACTAAAAATATGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGACAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGt < 1:2230555/148‑1 (MQ=255)
gTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 2:3018525/1‑150 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg < 2:4338183/150‑1 (MQ=255)
ctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCgg > 1:4812930/1‑150 (MQ=255)
tcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGt > 1:1405767/1‑150 (MQ=255)
gggTTAGGGTAACCTTAGTCGGCTCTTCGCGACCAATTGGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGa < 2:3036935/149‑1 (MQ=255)
ggTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt < 2:1705496/150‑1 (MQ=255)
ggTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 1:1350509/1‑150 (MQ=255)
gTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg > 1:3332407/1‑150 (MQ=255)
ttAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg > 1:2981878/1‑150 (MQ=255)
ttAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACGGGTAAATTGCTTGTTCGGTgtggg > 1:3070970/1‑146 (MQ=255)
gggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgt < 2:2319592/150‑1 (MQ=255)
ggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTGGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa < 2:968225/150‑1 (MQ=255)
gTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt > 2:3328963/1‑150 (MQ=255)
gTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt < 1:757654/150‑1 (MQ=255)
tAACCTTTTTGGGCTATTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCATAACAATATGGGCTTCAGCCACGCCGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 1:2561856/150‑1 (MQ=255)
tAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 2:2140132/150‑1 (MQ=255)
aaCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTg > 2:522364/1‑150 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg < 2:3475679/150‑1 (MQ=255)
cTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt > 1:443992/1‑150 (MQ=255)
tATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa > 2:4779201/1‑150 (MQ=255)
aTTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAg < 2:3666812/150‑1 (MQ=255)
cGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTg > 1:3425593/1‑150 (MQ=255)
ggCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGa > 1:2815800/1‑150 (MQ=255)
tctTCGCGACAATTTTGGGTGGTTTGGTTTTTCATAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTa < 1:894710/150‑1 (MQ=255)
ttCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACa < 2:1346898/150‑1 (MQ=255)
taCCAATTTGGCTGGTCTGTTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCaa < 1:452072/149‑1 (MQ=255)
gACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCaa < 2:4704585/150‑1 (MQ=255)
aCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAAc > 1:114761/1‑150 (MQ=255)
aaTTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 1:41042/1‑150 (MQ=255)
tttGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCa > 2:1388727/1‑150 (MQ=255)
tttGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCa > 2:5103819/1‑150 (MQ=255)
ttGGCTGTTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAg < 1:1897877/150‑1 (MQ=255)
ttGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAg < 1:517583/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTCAACAGATATCGTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAGGGTGTATGGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGcc > 1:366259/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGcc < 2:3786918/150‑1 (MQ=255)
aGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACg > 1:4885395/1‑150 (MQ=255)
aGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACg > 2:2046525/1‑150 (MQ=255)
gttttGTCATAACATTCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGa < 1:2779371/148‑1 (MQ=255)
ggTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGa < 1:3868814/150‑1 (MQ=255)
ggTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGa > 1:2093537/1‑150 (MQ=255)
gTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 2:4529242/1‑150 (MQ=255)
gTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt < 2:1977769/150‑1 (MQ=255)
aGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCa > 1:119950/1‑150 (MQ=255)
gAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAg < 2:5082257/150‑1 (MQ=255)
aaCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc < 2:2887368/150‑1 (MQ=255)
aaCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACGGACGATCAATGCAGc < 2:2924318/150‑1 (MQ=255)
aCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCg < 2:1264805/150‑1 (MQ=255)
ctatatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCgg > 1:434628/3‑150 (MQ=255)
atatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCa > 2:817818/1‑150 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa < 1:199181/150‑1 (MQ=255)
atGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaaa > 2:4216784/1‑150 (MQ=255)
atGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaaa < 1:3945476/150‑1 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt > 2:2641985/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt < 2:1120904/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATaaaa < 2:437512/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATaaaa > 1:3324435/1‑150 (MQ=255)
ccACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGt < 1:1952989/150‑1 (MQ=255)
ccACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGt > 1:4274839/1‑150 (MQ=255)
cACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGtt > 2:1557305/1‑150 (MQ=255)
aCGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTc < 1:809677/150‑1 (MQ=255)
gCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCAt < 2:4493314/150‑1 (MQ=255)
ggTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTa < 1:997511/150‑1 (MQ=255)
ggTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTGGTTCATGGTa > 2:4117924/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTc > 2:2583385/1‑150 (MQ=255)
ccGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTc < 2:3261351/150‑1 (MQ=255)
|
AGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC > CP009273/1118443‑1118739
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC > CP009273/1118443‑1118739
|
TGTTTCTTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACTGGGTGTTCAGGTCCAGTTTGGCGTCTCGGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAG < SRR19973063.1869974/150‑1 (MQ=60)
TGTTTCATGGTCGCTTTCTTACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCTGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGAAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCAATTTGGCTGGTAAGGTTTGTCATAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAG < SRR19973063.4975094/150‑1 (MQ=60)
AGTTTCTTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAG < SRR19973063.1869978/150‑1 (MQ=60)
AGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAG > SRR19973063.664650/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACTGGGTGTTCATGTCCTGATTGGCGTCTCGGGTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGA < SRR19973063.2451423/150‑1 (MQ=60)
TTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCGTATTAGGCTCTTCGCGACCAAATTGGCTGGTCAGGTTTTTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACCCCGGGTAAACAGATA > SRR19973063.590118/1‑150 (MQ=60)
CATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTTTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATC > SRR19973063.1124310/1‑150 (MQ=60)
TGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTT < SRR19973063.4303835/150‑1 (MQ=60)
GGTCGATTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTT < SRR19973063.1826436/150‑1 (MQ=60)
TTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAA > SRR19973063.4940216/1‑150 (MQ=60)
TTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAA > SRR19973063.4939536/1‑150 (MQ=60)
TCTTACTACCGATCAGGGAGTTCATGTCCAGTTTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGGTCTTCGCGACCATTTTGGCTGGTAAGTTTTTTCATAACAATATGGGGGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAAT < SRR19973063.2675189/150‑1 (MQ=60)
TCTTACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCATATTGGCGTCTCCGTTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAAT < SRR19973063.1064413/150‑1 (MQ=60)
CTGACTACCGAAAAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGAGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTAAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTTAGAAATT > SRR19973063.4526516/1‑150 (MQ=60)
GACTACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGATCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTAT < SRR19973063.1741234/150‑1 (MQ=60)
GACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTAT > SRR19973063.3876181/1‑150 (MQ=60)
GACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTAT > SRR19973063.3875983/1‑150 (MQ=60)
TACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTAT > SRR19973063.776704/1‑150 (MQ=60)
ACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATG < SRR19973063.5047743/150‑1 (MQ=60)
CCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGT > SRR19973063.41015/1‑150 (MQ=60)
CGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTT > SRR19973063.3809846/1‑150 (MQ=60)
CGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTT > SRR19973063.438728/1‑150 (MQ=60)
GAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTT > SRR19973063.2427570/1‑150 (MQ=60)
AACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTC < SRR19973063.1190879/150‑1 (MQ=60)
CAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGC > SRR19973063.26913/1‑150 (MQ=60)
CAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGC > SRR19973063.1384800/1‑150 (MQ=60)
GGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAA > SRR19973063.1965308/1‑150 (MQ=60)
AGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCG > SRR19973063.1588740/1‑150 (MQ=60)
AGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCG > SRR19973063.1588716/1‑150 (MQ=60)
GTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTT > SRR19973063.4379602/1‑150 (MQ=60)
TCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTA > SRR19973063.3714746/1‑150 (MQ=60)
attTTGGCGTCTCCGGTTTGGTTAACATTTTTGGGCTATTCGCGACAATTTTGGCGGGTCTGGTTTGACAGAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATT < SRR19973063.1456511/147‑1 (MQ=60)
AGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATT < SRR19973063.1176792/150‑1 (MQ=60)
AGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATT > SRR19973063.4994666/1‑150 (MQ=60)
AGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATT > SRR19973063.2426857/1‑150 (MQ=60)
TTGGCGTCTCCGTTTAGGGTAACCTTTTTCGGCACTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTGGTCAGAACAATATGGGCGTCCGCCACGCCGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCT < SRR19973063.4896097/150‑1 (MQ=60)
GGCGTCTCGGGTTTGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAATTTTGGCTGTTCTGTTTTGTCACAAAAATATGGGCTTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTG < SRR19973063.4982314/150‑1 (MQ=60)
gggtctcggttttggttaacgtttttgggctcttcgcgacaatttggggtggtctggtttgaactaaaAATATGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGACAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGT < SRR19973063.2237624/82‑1 (MQ=60)
CGTCTCCGGTAAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAAATTGGCTGGTCAGGTTAGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTACACAGATATCTaaagagaaataattaggtatcccaagctactggttaaaatctgggt > SRR19973063.4849180/1‑104 (MQ=60)
TCTCGGGTTAGGTTAACCTTAGTCGGCTCTTCGCCACAATTTGGGGTGTTCAGGTTGGAACGAACAATCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATAACTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCG < SRR19973063.3978582/150‑1 (MQ=60)
TCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCG > SRR19973063.1268570/1‑150 (MQ=60)
TCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCG > SRR19973063.1268434/1‑150 (MQ=60)
ctccgttttgtttaacatttttcggatctccgctacaattttgggtggtctgttttttaatAACAATATGGGCTTCAGCCACGCGGGTTAAACATATATATTTTGTTAAATTATTATGTTTCTCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGG < SRR19973063.4376048/89‑1 (MQ=44)
CTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGG > SRR19973063.2150746/1‑150 (MQ=60)
CTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGG > SRR19973063.4828328/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTTCGGGGAACCTTATTCGGCTCTTCGCGCCCAATTGGGCGGGTCCGGTTTGTCAGAACAATTGGGGCGGCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGT < SRR19973063.729199/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGT > SRR19973063.1410022/1‑150 (MQ=60)
CGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGA > SRR19973063.2571741/1‑150 (MQ=60)
GGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAT > SRR19973063.1354561/1‑150 (MQ=60)
GGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAT > SRR19973063.803876/1‑150 (MQ=60)
GGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAT > SRR19973063.2956540/1‑150 (MQ=60)
GTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATG > SRR19973063.3343037/1‑150 (MQ=60)
TTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGG > SRR19973063.3080774/1‑150 (MQ=60)
TTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGG > SRR19973063.2991490/1‑150 (MQ=60)
TTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGG > SRR19973063.2991402/1‑150 (MQ=60)
TTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACGGGTAAATTGCTTGTTCGGTGtggg > SRR19973063.3080834/1‑146 (MQ=60)
GGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTA > SRR19973063.898530/1‑150 (MQ=60)
ttaccctttttctgcatttggctccaaatttgggtgtcctggttttacataaaattctggcagaccGCCACGCCGGGTAAACATATAACTTTTGATAAATTATTTTGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAT < SRR19973063.2810889/84‑1 (MQ=60)
GTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAT < SRR19973063.759860/150‑1 (MQ=60)
TAACCTTTTTGGGCTATTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCATAACAATATGGGCTTCAGCCACGCCGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATT < SRR19973063.2570017/150‑1 (MQ=60)
CTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGT > SRR19973063.445237/1‑150 (MQ=60)
gggctttgcgggacaattttgtgttttcttttttgtcacaccattttggtgggctgcatcgcgGGGTAAACGGATTTCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTG < SRR19973063.2210686/87‑1 (MQ=60)
cggatcttcgagacaattttggttgttactgtttgacttaaatattggggctcaagcctCGCCGGGAAAACCTATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCTAAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTG < SRR19973063.2210591/91‑1 (MQ=60)
CGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTG > SRR19973063.3436488/1‑150 (MQ=60)
CGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTG > SRR19973063.3436482/1‑150 (MQ=60)
GGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGA > SRR19973063.2824850/1‑150 (MQ=60)
GGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGA > SRR19973063.420606/1‑150 (MQ=60)
TCTTCGCGACAATTTTGGGTGGTTTGGTTTTTCATAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTA < SRR19973063.897312/150‑1 (MQ=60)
TCTGCGCGACCATTTGGGGTGGTCTGGTTGGTCAGAACAATTTGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTN < SRR19973063.897304/150‑1 (MQ=60)
TTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACA > SRR19973063.2768945/1‑150 (MQ=60)
CGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCA > SRR19973063.4406076/1‑150 (MQ=60)
CGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCA < SRR19973063.2373796/150‑1 (MQ=60)
CGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCA < SRR19973063.293619/150‑1 (MQ=60)
TACCAATTTGGCTGGTCTGTTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAA < SRR19973063.453342/150‑1 (MQ=60)
ACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAAC > SRR19973063.115164/1‑150 (MQ=60)
ACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAAC > SRR19973063.115145/1‑150 (MQ=60)
AATTTGGCTGGTCAGTTTTGTCAGAACAATATGGGCTTCAGCAACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAATTTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAG < SRR19973063.5168998/150‑1 (MQ=60)
AATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAG > SRR19973063.41200/1‑150 (MQ=60)
ATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGC > SRR19973063.3622406/1‑150 (MQ=60)
TTGGCTGTTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAG < SRR19973063.1903815/150‑1 (MQ=60)
TTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAG < SRR19973063.519093/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGG < SRR19973063.3339555/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGG > SRR19973063.255941/1‑150 (MQ=60)
TGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGG < SRR19973063.3339586/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTCAACAGATATCGTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAGGGTGTATGGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCC > SRR19973063.367309/1‑150 (MQ=60)
GTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTG < SRR19973063.1736395/150‑1 (MQ=60)
GTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTG > SRR19973063.4521334/1‑150 (MQ=60)
atttttgaCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACG < SRR19973063.4384695/142‑1 (MQ=60)
AGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACG > SRR19973063.4901149/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGTCATAACATTCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGA < SRR19973063.2788323/150‑1 (MQ=60)
GGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGA < SRR19973063.3881114/150‑1 (MQ=60)
GGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGA < SRR19973063.2725888/150‑1 (MQ=60)
GGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGA > SRR19973063.2100078/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGA > SRR19973063.4678503/1‑150 (MQ=60)
TTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCA < SRR19973063.116671/150‑1 (MQ=60)
TGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAA < SRR19973063.3947587/150‑1 (MQ=60)
GTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAT < SRR19973063.4339847/150‑1 (MQ=60)
AGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCA > SRR19973063.120348/1‑150 (MQ=60)
AGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCA > SRR19973063.1809116/1‑150 (MQ=60)
CTATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGG > SRR19973063.435836/1‑150 (MQ=60)
CAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGG < SRR19973063.191341/150‑1 (MQ=60)
TATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA < SRR19973063.199784/150‑1 (MQ=60)
TATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA < SRR19973063.2802608/150‑1 (MQ=60)
cgGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAA < SRR19973063.4878048/148‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAA < SRR19973063.3958096/150‑1 (MQ=60)
AGGGGCGTCAGCCACGCCTGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGAAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAA < SRR19973063.226661/150‑1 (MQ=60)
CGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAA > SRR19973063.3334950/1‑150 (MQ=60)
CGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAA < SRR19973063.4535218/150‑1 (MQ=60)
CGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAA > SRR19973063.3552812/1‑150 (MQ=60)
CGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAA > SRR19973063.3335047/1‑150 (MQ=60)
CCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGT > SRR19973063.4288430/1‑150 (MQ=60)
CCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGT < SRR19973063.1959106/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTC < SRR19973063.812007/150‑1 (MQ=60)
CCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATG < SRR19973063.1966880/150‑1 (MQ=60)
CGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGG < SRR19973063.2045451/150‑1 (MQ=60)
GGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGT < SRR19973063.2563550/150‑1 (MQ=60)
GGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGT > SRR19973063.908588/1‑150 (MQ=60)
GGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTA < SRR19973063.1000521/150‑1 (MQ=60)
TAAACAGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGT < SRR19973063.2015250/150‑1 (MQ=60)
ACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCT > SRR19973063.4576206/1‑150 (MQ=60)
ACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCT > SRR19973063.4100412/1‑150 (MQ=60)
CAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC < SRR19973063.2995944/150‑1 (MQ=60)
CAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC < SRR19973063.1639306/150‑1 (MQ=60)
|
AGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC > CP009273/1118443‑1118739
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |