Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,118,591 |
C→A |
66.2% |
G47C (GGT→TGT) |
yceB ← |
lipoprotein, DUF1439 family |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,118,591 | 0 | C | A | 66.2%
| 188.2
/ 287.1
| 275 | G47C (GGT→TGT) | yceB | lipoprotein, DUF1439 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/54); new base A (82/99); total (121/154) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.35e-01 |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTC > CP009273/1118442‑1118739
|
tttCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACTGGGAGTTCTTGTCCAGATTGGCGTCTCCGTTTTGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCTGAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGat < 1:1770314/150‑1 (MQ=255)
tttCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGat < 1:3068978/150‑1 (MQ=255)
tttCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGat < 2:2871118/150‑1 (MQ=255)
tttCAGGGTCGCTTTCTGACTACCTAACAGGGAGTTCATGACCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTGGGCTGTTCTGGTTTGTCAGAAAAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGat < 2:2317533/150‑1 (MQ=255)
ttCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACATTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGata < 1:2191047/150‑1 (MQ=255)
aTGGTCGCTTTCTGACTCCCTAACCGGTTGTTCATGTCCCGTTGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGTTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCt < 2:4899165/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGCTTTCTGACTACCGAACTGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCtt < 2:1547636/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCtt < 2:1022451/150‑1 (MQ=255)
ggTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCttt < 2:3478665/150‑1 (MQ=255)
gTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCTTGTCCAGTTGGGCGTCGCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGGTGGTCTGGTTTGTCATAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCtttt < 1:3851727/150‑1 (MQ=255)
gTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCtttt > 2:3643079/1‑150 (MQ=255)
cGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTga > 2:3752603/1‑150 (MQ=255)
cTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTgaga < 2:567405/150‑1 (MQ=255)
gACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattat > 1:1989082/1‑150 (MQ=255)
aCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattatt > 1:2746642/1‑150 (MQ=255)
cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAAttatta < 1:440473/150‑1 (MQ=255)
cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAAttatta < 2:2822490/150‑1 (MQ=255)
cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCTACCATTTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAAttatta < 2:4099091/150‑1 (MQ=255)
tACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATtattat < 1:3447781/150‑1 (MQ=255)
tACAGAACTGGGTGTTCATGTCCAGTTTGGAGTATCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCATTTTGGCTGGTCAGGTTTTTCATAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATtattat < 2:1000695/150‑1 (MQ=255)
aCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTGGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATg < 1:3343429/150‑1 (MQ=255)
aCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTACACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATg > 2:4744311/1‑150 (MQ=255)
aCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATg < 2:3559272/150‑1 (MQ=255)
aCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATg > 2:4265870/1‑150 (MQ=255)
gAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGttt > 1:462031/1‑150 (MQ=255)
aaCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc > 1:4687937/1‑150 (MQ=255)
aaCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc > 2:5199283/1‑150 (MQ=255)
gAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCTACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGc < 1:3965182/150‑1 (MQ=255)
cATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTg < 1:362658/150‑1 (MQ=255)
gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGtt > 2:926212/1‑150 (MQ=255)
tgATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTTTGCGGCTCTTCGCGACCATTTGGGCTGGTCTGGTTTGTCATAACAATTTGGGCGACAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt < 1:1337610/149‑1 (MQ=255)
agtttGGCGTCTCCGTTTAGGTTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGACAGGTTTTTCAGAACAATTTGGGGGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt < 2:1161677/147‑1 (MQ=255)
aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAACCAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt < 2:2130204/150‑1 (MQ=255)
aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt > 2:2746372/1‑150 (MQ=255)
aGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt > 1:3143029/1‑150 (MQ=255)
gTCTCCGTTTTGGGTACCCTTATTCGGCTCTCCGCCACCATTTGGGCTGGTCTGTTTTTTCAGAAAAATAGGGGCTTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc < 1:270479/150‑1 (MQ=255)
gTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 1:1880878/1‑150 (MQ=255)
gTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTGGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc < 2:726232/150‑1 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg > 2:3573896/1‑150 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg > 1:4793213/1‑150 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTGGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCg < 2:2616648/150‑1 (MQ=255)
ggTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 1:4291998/1‑150 (MQ=255)
gTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg > 2:3617382/1‑150 (MQ=255)
aGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtg > 1:5235169/1‑150 (MQ=255)
tAACCTTTTGCGGCACTCCGCCCCCATTTTGGCTGGTCTGTTTTGTCATAACATTTTGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 1:1592373/150‑1 (MQ=255)
tAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATCTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 2:2945278/150‑1 (MQ=255)
tAACATTATGCGGCTCTACGCGCCCATTTGGGCGGGACAGTTTTGACCCAACAATCGGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 2:4484300/150‑1 (MQ=255)
aaCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTg > 1:602940/1‑150 (MQ=255)
aaCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTg > 1:3590210/1‑150 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 1:4007819/1‑150 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 1:855382/1‑150 (MQ=255)
ttATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTg < 2:524374/150‑1 (MQ=255)
ttATGCGGATCTTCGCCCCAATTTTGGCTGTTCTGTTTTTTATTAAAAATAGGGGCGTCCCCCACGCCGGTTAAAAATATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTg < 1:1466208/150‑1 (MQ=255)
tATTGGGCCATTCGCGACCATTTTGGCTGGTCTGGTTTGCAAGACCAATTGGGGCGCCACCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa < 1:1166337/150‑1 (MQ=255)
tgggCTCTTCGCCACATTTGTGGGTGGTCTGTTTTGTAATAAAATTTGGGGCTACCCCCACGCCGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGtt < 1:1908714/148‑1 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGAtt > 2:3173351/1‑150 (MQ=255)
tctTCGCGACCAATTTGGCTGGACAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTa < 2:4003584/150‑1 (MQ=255)
ttCGCGACAAATTTGGCTGTTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACa < 1:814249/150‑1 (MQ=255)
tCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAg < 2:2244049/150‑1 (MQ=255)
aCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAAc > 2:2455662/1‑150 (MQ=255)
ggTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACt > 1:1085173/1‑150 (MQ=255)
cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGAc > 1:1296653/1‑150 (MQ=255)
cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGAc > 2:2404690/1‑150 (MQ=255)
tggTTTGTCAGAACAATCTGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACg < 1:3243457/149‑1 (MQ=255)
tggTTTGTCAGAACAATCGGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACg < 1:5165026/149‑1 (MQ=255)
ttttGTCATAACAATATGGGCTACAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt < 1:2466903/149‑1 (MQ=255)
ttttGTCACAACAATATGGGCGACACCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt < 1:4258175/149‑1 (MQ=255)
gTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt > 1:2776131/1‑150 (MQ=255)
tGTCATAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGTTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCaa < 1:3755123/150‑1 (MQ=255)
cAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGc < 2:3286603/150‑1 (MQ=255)
ataaCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCa < 2:5137083/148‑1 (MQ=255)
aGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCa > 2:4780450/1‑150 (MQ=255)
attatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc < 2:1919047/148‑1 (MQ=255)
atatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCa > 1:444594/1‑150 (MQ=255)
atagGGGCGACAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCa < 1:654051/150‑1 (MQ=255)
tttGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa < 2:4675182/148‑1 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt > 2:4223243/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt < 2:567570/150‑1 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt > 1:262988/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt < 2:1062722/150‑1 (MQ=255)
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ggggCGTCCGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTAGGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAAt < 1:1712327/149‑1 (MQ=255)
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GTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAA > SRR19973062.4731552/1‑150 (MQ=60)
GCCACGCCGGGTAAACCTATATCTTTTTAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTG < SRR19973062.3521807/150‑1 (MQ=60)
CCACGACGGGTAAACTGATATATTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGT < SRR19973062.3592962/150‑1 (MQ=60)
CCACGACGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGT < SRR19973062.3589575/150‑1 (MQ=60)
CACGCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAAATTGTT < SRR19973062.2220173/150‑1 (MQ=60)
GCCGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCAT < SRR19973062.4468166/150‑1 (MQ=60)
CCGGTTAAACCGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATG < SRR19973062.3591954/150‑1 (MQ=60)
CCGGGTAAACCTATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATG < SRR19973062.3591920/150‑1 (MQ=60)
CCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATG > SRR19973062.859263/1‑150 (MQ=60)
CCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATATTTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATG < SRR19973062.3591932/150‑1 (MQ=60)
CGGGTAAACCGATATATTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGG < SRR19973062.2977653/150‑1 (MQ=60)
GGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGT > SRR19973062.3399159/1‑150 (MQ=60)
GGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGT > SRR19973062.230258/1‑150 (MQ=60)
GGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTA > SRR19973062.4357797/1‑150 (MQ=60)
GTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAG < SRR19973062.2790265/150‑1 (MQ=60)
GTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAG < SRR19973062.2790279/150‑1 (MQ=60)
TAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGT > SRR19973062.2275342/1‑150 (MQ=60)
TAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGT > SRR19973062.2272181/1‑150 (MQ=60)
TAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAACAATGCAGCGGCAAAAAAAAACATGTTCATGGTAGT > SRR19973062.3416624/1‑150 (MQ=60)
AAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTC > SRR19973062.1033245/1‑150 (MQ=60)
AACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCC < SRR19973062.5239904/150‑1 (MQ=60)
AGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTCG > SRR19973062.1795313/1‑150 (MQ=60)
AGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTCG < SRR19973062.4875369/150‑1 (MQ=60)
AGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTATTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATTTTAGTCCTCG > SRR19973062.1201743/1‑150 (MQ=60)
AGATATCATTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTTTTCGTTTATAGTGAATTGTGTGAGTTTAAAACATCCAACGAGCAGGCCACAGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTTTTAATGGTAGACCTCG > SRR19973062.524917/1‑150 (MQ=60)
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CAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAAATAAAAACTTGTTCATGGTAGTCCTCG > CP009273/1118442‑1118740
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |