Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,131,521 |
C→A |
100% |
Q168K (CAG→AAG) |
flgH → |
flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,131,521 | 0 | C | A | 97.3%
| 910.7
/ 10.7
| 291 | Q168K (CAG→AAG) | flgH | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (139/142); total (143/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Polymorphic base substitution creates a homopolymer stretch. |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
AACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCG > CP009273/1131374‑1131667
|
aaCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAg < 1:5070413/150‑1 (MQ=255)
cGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGAt < 2:4549424/150‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGAtt > 2:1261356/1‑150 (MQ=255)
gCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCAtt < 1:476861/150‑1 (MQ=255)
gCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCAtt > 1:3532757/1‑150 (MQ=255)
gATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAAt > 1:3952619/1‑150 (MQ=255)
aTGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATc > 1:4841923/1‑150 (MQ=255)
tGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCa < 2:4106469/150‑1 (MQ=255)
gTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAg < 2:2715707/150‑1 (MQ=255)
tCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAgg < 2:645124/150‑1 (MQ=255)
cGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAggg < 1:1880040/150‑1 (MQ=255)
aaGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTa < 2:4519877/150‑1 (MQ=255)
aaGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTa > 2:3021951/1‑150 (MQ=255)
aGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTAc < 2:3661167/150‑1 (MQ=255)
aGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTAc > 1:865040/1‑150 (MQ=255)
gCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTAcc < 1:3777811/150‑1 (MQ=255)
ccTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTAcca < 1:2816246/150‑2 (MQ=255)
cTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGa > 2:610319/1‑150 (MQ=255)
tCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGaa > 2:3109801/1‑150 (MQ=255)
tCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGaa < 1:2165592/150‑1 (MQ=255)
ggtggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAAttt < 2:1540644/150‑1 (MQ=255)
gtggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTa < 1:1652362/150‑1 (MQ=255)
tggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGACTTTAt > 2:4190833/1‑150 (MQ=255)
ggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAtt > 1:1203494/1‑150 (MQ=255)
gtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTc > 2:4985925/1‑150 (MQ=255)
tAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCg > 1:4488789/1‑150 (MQ=255)
acGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtc < 1:3078497/150‑1 (MQ=255)
acGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtc < 1:298456/150‑1 (MQ=255)
cGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtct < 2:2102721/150‑1 (MQ=255)
tCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGTACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTg < 2:916355/150‑1 (MQ=255)
tCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTg > 1:4008860/1‑150 (MQ=255)
cAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTgg > 1:3053839/1‑150 (MQ=255)
cAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACGGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAGTCGCGGCTCTgg > 2:2990412/1‑150 (MQ=255)
aaCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGc < 1:2222450/150‑1 (MQ=255)
cGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGt > 1:4731102/1‑150 (MQ=255)
gAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTgg > 2:804314/1‑150 (MQ=255)
gCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATc > 1:2278331/1‑150 (MQ=255)
ggggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCa > 2:2006181/1‑150 (MQ=255)
ggggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCAGGTGGTGGGTGACAAAAAGATTGCCATTCATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTACTCCa > 2:1620993/1‑150 (MQ=255)
gggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAATGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCAc < 1:1728217/150‑1 (MQ=255)
gggCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCAc > 2:2291513/1‑150 (MQ=255)
gCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGc > 2:4363256/1‑150 (MQ=255)
gCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGc > 1:2312784/1‑150 (MQ=255)
ccAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCa < 2:296065/150‑1 (MQ=255)
ccAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCa > 2:2773370/1‑150 (MQ=255)
gCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATc > 2:43251/1‑150 (MQ=255)
gCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATc > 2:376453/1‑150 (MQ=255)
ccAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCa > 2:1670725/1‑150 (MQ=255)
cAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAg < 2:3952619/150‑1 (MQ=255)
gCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCg > 1:4122562/1‑150 (MQ=255)
cAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTCCCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCgg > 1:3870830/1‑150 (MQ=255)
aTACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGgca < 2:512975/150‑1 (MQ=255)
tACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCAGGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGgcag > 2:1204241/1‑150 (MQ=255)
aCCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGgcagc > 1:4225662/1‑150 (MQ=255)
cTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCaa > 2:1862051/1‑150 (MQ=255)
ttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAta < 2:2538176/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtac > 1:1439696/1‑150 (MQ=255)
aGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtacc > 2:2380058/1‑150 (MQ=255)
aGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtacc < 1:3350977/150‑1 (MQ=255)
aGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCGTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtacc > 1:1166973/1‑150 (MQ=255)
cGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtaccgt > 2:3262475/1‑150 (MQ=255)
tgacggtgacggTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTa < 1:1558275/150‑1 (MQ=255)
tgacggtgacggTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTa > 2:3472210/1‑150 (MQ=255)
tgacggtgaaggTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTa < 2:3511873/150‑1 (MQ=255)
tggtTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 2:1739762/2‑150 (MQ=255)
ttGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCgg < 2:2160944/150‑1 (MQ=255)
ttGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCgg > 1:2088144/1‑150 (MQ=255)
ttGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCgg < 2:3370428/150‑1 (MQ=255)
gACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt > 2:4698719/1‑150 (MQ=255)
gACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt > 2:1337938/1‑150 (MQ=255)
gACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAt > 2:1058138/1‑150 (MQ=255)
cAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcg < 1:1032533/150‑1 (MQ=255)
ggTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg > 1:4660248/1‑150 (MQ=255)
ggTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg < 2:2258101/150‑1 (MQ=255)
ggTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg > 1:3245539/1‑150 (MQ=255)
ggTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcg > 1:4660309/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCAt < 2:1131029/150‑1 (MQ=255)
tCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAAt > 2:1765531/1‑150 (MQ=255)
cAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATa > 1:1323967/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATAc < 2:3334453/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATAc > 1:4624868/1‑150 (MQ=255)
aCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACg < 2:1222024/150‑1 (MQ=255)
aCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACg < 1:905640/150‑1 (MQ=255)
aCGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACg > 1:607339/1‑150 (MQ=255)
cGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACga > 2:2820239/1‑149 (MQ=255)
cGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGt > 1:3709819/1‑150 (MQ=255)
tgCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTa > 1:1193714/2‑150 (MQ=255)
tgCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTa > 1:260036/2‑150 (MQ=255)
ggCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTa < 2:2419898/150‑1 (MQ=255)
aaCCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGc < 1:4419682/150‑1 (MQ=255)
aaCCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGc < 2:2467271/150‑1 (MQ=255)
tGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATg > 2:2925269/1‑150 (MQ=255)
aTGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCt < 1:678092/150‑1 (MQ=255)
tggtggGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACa < 2:3835109/150‑1 (MQ=255)
gtgAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACg > 1:2509373/1‑150 (MQ=255)
gtgAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACg > 1:2873267/1‑150 (MQ=255)
gAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGaa > 2:718494/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAg > 1:2581140/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTCTCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAgc > 2:1156409/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAgc > 2:2603527/1‑150 (MQ=255)
|
AACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCG > CP009273/1131374‑1131667
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAA > CP009273/1131372‑1131670
|
GTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAA > SRR19973063.1274073/1‑150 (MQ=60)
TAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAA > SRR19973063.1653565/1‑150 (MQ=60)
TAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAA > SRR19973063.4833014/1‑150 (MQ=60)
TAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAA > SRR19973063.3175799/1‑150 (MQ=60)
AACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAG < SRR19973063.5086723/150‑1 (MQ=60)
ACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGA < SRR19973063.5113598/150‑1 (MQ=60)
CGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGAT < SRR19973063.3760725/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGC < SRR19973063.1173268/150‑1 (MQ=60)
GTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCA < SRR19973063.2040628/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCACTGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATT < SRR19973063.3075144/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATT < SRR19973063.478211/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATT > SRR19973063.3544075/1‑150 (MQ=60)
CCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTA < SRR19973063.2156274/150‑1 (MQ=60)
GATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAAT > SRR19973063.3965259/1‑150 (MQ=60)
GATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAAT > SRR19973063.4054884/1‑150 (MQ=60)
ATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATC > SRR19973063.4857503/1‑150 (MQ=60)
GTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAG > SRR19973063.2828112/1‑150 (MQ=60)
GTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAG > SRR19973063.2306950/1‑150 (MQ=60)
GTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAG < SRR19973063.4282503/150‑1 (MQ=60)
CGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGG < SRR19973063.1885915/150‑1 (MQ=60)
GAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAATGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGT > SRR19973063.2546270/1‑150 (MQ=60)
GAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGT < SRR19973063.3283258/150‑1 (MQ=60)
GAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGT < SRR19973063.4818643/150‑1 (MQ=60)
AAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTA > SRR19973063.490310/1‑150 (MQ=60)
AAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTA < SRR19973063.1936903/150‑1 (MQ=60)
AGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTAC > SRR19973063.867530/1‑150 (MQ=60)
GCCTCCGGTTGTAACTCGTTCATCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCTGGTACTGGTCAACGGCTACCTGCATGTGGTGGGTTAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACC < SRR19973063.4639732/150‑1 (MQ=60)
GCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACC < SRR19973063.3789877/150‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCA < SRR19973063.2825301/150‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGA < SRR19973063.2241016/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAA < SRR19973063.2172374/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAA < SRR19973063.1118819/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAAT < SRR19973063.3170135/150‑1 (MQ=60)
GTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTA < SRR19973063.1657408/150‑1 (MQ=60)
GTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTA < SRR19973063.1657404/150‑1 (MQ=60)
GGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATT > SRR19973063.1207108/1‑150 (MQ=60)
GGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATT > SRR19973063.2591393/1‑150 (MQ=60)
GGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATT < SRR19973063.895392/150‑1 (MQ=60)
TAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCG > SRR19973063.4503183/1‑150 (MQ=60)
TAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCG > SRR19973063.4503190/1‑150 (MQ=60)
ACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTC < SRR19973063.3088296/150‑1 (MQ=60)
ACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTC < SRR19973063.299338/150‑1 (MQ=60)
ACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTC < SRR19973063.3088394/150‑1 (MQ=60)
CGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCT < SRR19973063.2333922/150‑1 (MQ=60)
CGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCT < SRR19973063.2836810/150‑1 (MQ=60)
GTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTC > SRR19973063.3882519/1‑150 (MQ=60)
GTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTC < SRR19973063.4765006/150‑1 (MQ=60)
GTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTC < SRR19973063.4764835/150‑1 (MQ=60)
TCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTG > SRR19973063.4021717/1‑150 (MQ=60)
TCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTG > SRR19973063.4021718/1‑150 (MQ=60)
CAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGG > SRR19973063.3063624/1‑150 (MQ=60)
CAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGG > SRR19973063.3063377/1‑150 (MQ=60)
AACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGC < SRR19973063.2229479/150‑1 (MQ=60)
AACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGC < SRR19973063.2219719/150‑1 (MQ=60)
CGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGT > SRR19973063.4746179/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGT > SRR19973063.172885/1‑150 (MQ=60)
GGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTG < SRR19973063.4646850/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTG < SRR19973063.3929430/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTG < SRR19973063.3929756/150‑1 (MQ=60)
GAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGG < SRR19973063.850799/150‑1 (MQ=60)
AAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGT < SRR19973063.1767058/150‑1 (MQ=60)
GCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATC > SRR19973063.2285604/1‑150 (MQ=60)
GGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAATGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCAC < SRR19973063.1733485/150‑1 (MQ=60)
GCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGC > SRR19973063.2320181/1‑150 (MQ=60)
CAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCAC < SRR19973063.2239440/150‑1 (MQ=60)
CCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCA < SRR19973063.759865/150‑1 (MQ=60)
CCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCA < SRR19973063.2547617/150‑1 (MQ=60)
CAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAG > SRR19973063.2315750/1‑150 (MQ=60)
GCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCG > SRR19973063.4135759/1‑150 (MQ=60)
GCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCG > SRR19973063.4135784/1‑150 (MQ=60)
GCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCG > SRR19973063.1334469/1‑150 (MQ=60)
CAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTCCCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGG > SRR19973063.3883137/1‑150 (MQ=60)
ATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCA < SRR19973063.1457922/150‑1 (MQ=60)
TACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAG > SRR19973063.1735115/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGC > SRR19973063.4239130/1‑150 (MQ=60)
TTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATA > SRR19973063.461873/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATAC > SRR19973063.264323/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATAC > SRR19973063.1444093/1‑150 (MQ=60)
AGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACC > SRR19973063.1174469/1‑150 (MQ=60)
AGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACC < SRR19973063.3361648/150‑1 (MQ=60)
AGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACC < SRR19973063.4223520/150‑1 (MQ=60)
AGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCGTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACC > SRR19973063.1170491/1‑150 (MQ=60)
GCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTAC > SRR19973063.617619/1‑150 (MQ=60)
GCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTAC > SRR19973063.4708319/1‑150 (MQ=60)
CACGTTGACAGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACC > SRR19973063.1205602/1‑150 (MQ=60)
CGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAAACTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGT > SRR19973063.3527194/1‑150 (MQ=60)
GTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTC > SRR19973063.2447594/1‑150 (MQ=60)
TGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTA < SRR19973063.1563056/150‑1 (MQ=60)
TGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTA < SRR19973063.1563067/150‑1 (MQ=60)
TGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTA < SRR19973063.3404890/150‑1 (MQ=60)
TGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTA < SRR19973063.1563052/150‑1 (MQ=60)
CGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTC > SRR19973063.2169885/1‑150 (MQ=60)
CGGGGTCGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAATAGATTGCCATTTGTCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCTTGGTTAATCCTAGCACTCTCAGCGGCAGCAATTCCGTACCGTCTACTC < SRR19973063.1383489/150‑1 (MQ=60)
ACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTG < SRR19973063.5156000/150‑1 (MQ=60)
GTTGACCAGTTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCG < SRR19973063.3237256/150‑1 (MQ=60)
TTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGG > SRR19973063.294774/1‑150 (MQ=60)
TTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGG > SRR19973063.2094670/1‑150 (MQ=60)
GACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAT < SRR19973063.1491086/150‑1 (MQ=60)
GACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGAT < SRR19973063.2647635/150‑1 (MQ=60)
CAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCG < SRR19973063.132214/150‑1 (MQ=60)
CAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCG < SRR19973063.1035651/150‑1 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.4675176/1‑150 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.4675151/1‑150 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.3853594/1‑150 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.4675121/1‑150 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.4675115/1‑150 (MQ=60)
GGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCG > SRR19973063.3255959/1‑150 (MQ=60)
CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATT < SRR19973063.4365361/150‑1 (MQ=60)
CAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATA > SRR19973063.1327927/1‑150 (MQ=60)
AACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATAC > SRR19973063.948/1‑150 (MQ=60)
AACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATAC > SRR19973063.4639649/1‑150 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG > SRR19973063.609119/1‑150 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG < SRR19973063.908288/150‑1 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG < SRR19973063.908283/150‑1 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG < SRR19973063.4734090/150‑1 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG < SRR19973063.3984476/150‑1 (MQ=60)
ACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACG > SRR19973063.609134/1‑150 (MQ=60)
CGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGT > SRR19973063.3721680/1‑150 (MQ=60)
CGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGT > SRR19973063.3721704/1‑150 (MQ=60)
TGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTA > SRR19973063.1197298/1‑150 (MQ=60)
TGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTA > SRR19973063.260814/1‑150 (MQ=60)
GCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAG > SRR19973063.2192070/1‑150 (MQ=60)
AACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGC < SRR19973063.4433870/150‑1 (MQ=60)
AACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGC < SRR19973063.4433906/150‑1 (MQ=60)
AACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGC > SRR19973063.3319820/1‑150 (MQ=60)
TCTGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAA > SRR19973063.30132/1‑150 (MQ=60)
CTGCGTGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAAT < SRR19973063.3692363/150‑1 (MQ=60)
TGCATGTGGTGGGTGAAAAATAGATTGCCATTTATCAGGGTACCGAATTTTTTCGAGTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCTGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATG < SRR19973063.4029379/150‑1 (MQ=60)
TGCATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATG > SRR19973063.1202161/1‑150 (MQ=60)
ATGTGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCT < SRR19973063.680077/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACA > SRR19973063.922530/1‑150 (MQ=60)
TGGGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTA < SRR19973063.4440751/150‑1 (MQ=60)
TGGGTGAAAAAAAGATGGCCCTTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCGTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTA < SRR19973063.4837934/150‑1 (MQ=60)
GGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAAC < SRR19973063.1229766/150‑1 (MQ=60)
GGTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAAC > SRR19973063.3689256/1‑150 (MQ=60)
GTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACG > SRR19973063.2882460/1‑150 (MQ=60)
GTGAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACG > SRR19973063.2517374/1‑150 (MQ=60)
GAAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACAGTAACGAA > SRR19973063.493990/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGATTGCCATTAATCAGTGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAG > SRR19973063.2589419/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAG > SRR19973063.2589347/1‑150 (MQ=60)
AAAAAGGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGC < SRR19973063.4212617/150‑1 (MQ=60)
AAAAAGAGTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCG < SRR19973063.2924220/150‑1 (MQ=60)
AAAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGC > SRR19973063.4687121/1‑150 (MQ=60)
AAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCA > SRR19973063.4066989/1‑150 (MQ=60)
AAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCA < SRR19973063.4157372/150‑1 (MQ=60)
AAAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCA < SRR19973063.2042771/150‑1 (MQ=60)
AAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAA < SRR19973063.4157574/150‑1 (MQ=60)
|
GTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTACTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGCATTGAATACGTAGGCAATGGCTACATTAACGAAGCGCAA > CP009273/1131372‑1131670
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |