Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,330,955 |
G→T |
100% |
D290Y (GAT→TAT) |
acnA → |
aconitate hydratase 1 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,330,955 | 0 | G | T | 96.8%
| 870.4
/ 14.5
| 280 | D290Y (GAT→TAT) | acnA | aconitate hydratase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/4); new base T (143/128); total (148/132) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
GCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAG > CP009273/1330807‑1331101
|
gCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGa < 1:2938798/150‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTAt < 2:2451264/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATg > 2:2909913/1‑150 (MQ=255)
tttCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTc > 1:2641000/1‑150 (MQ=255)
ttCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCt < 2:3366596/150‑1 (MQ=255)
ttCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTAAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGACTTTTATGGTGATGGTCt > 2:3413624/1‑150 (MQ=255)
ttCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTAAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATATTATGGTGATGGTCt > 2:4833855/1‑150 (MQ=255)
aTGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGACATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGAt > 2:3868325/1‑150 (MQ=255)
gCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTc < 1:669056/150‑1 (MQ=255)
ctgaTCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCa > 2:4622164/4‑150 (MQ=255)
ttATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCAc < 1:4689699/150‑1 (MQ=255)
cccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTAcc > 2:4066767/1‑150 (MQ=255)
cGGATGTAGTGGGCTTAAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGt < 1:1320840/150‑1 (MQ=255)
ggATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGtt > 2:3516668/1‑150 (MQ=255)
gATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTg < 1:1891258/150‑1 (MQ=255)
aTGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTgg < 2:1242450/150‑1 (MQ=255)
tAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCgg > 1:2558849/1‑150 (MQ=255)
aGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGa > 1:651722/1‑150 (MQ=255)
aGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGa > 2:2518270/1‑150 (MQ=255)
gTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGAt < 2:1692095/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATc < 1:1850159/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATc > 2:3817962/1‑150 (MQ=255)
gggCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATcg < 2:2268806/150‑1 (MQ=255)
gCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATcgcg < 1:4859089/150‑1 (MQ=255)
ttCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGcc < 2:4540354/150‑1 (MQ=255)
ttCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGcc < 2:736425/150‑1 (MQ=255)
tCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAACTGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGcca < 2:897882/150‑1 (MQ=255)
aaCTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGccacca > 2:3102712/1‑150 (MQ=255)
aaCTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGccacca > 1:4578929/1‑150 (MQ=255)
aCTTACCGGATAATTACGTGAATGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGTGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCTCCACCAt < 2:1470292/150‑1 (MQ=255)
tACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGc > 2:1876726/1‑150 (MQ=255)
tACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGc > 2:1789088/1‑150 (MQ=255)
aCCGTAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGcc < 2:1334906/150‑1 (MQ=255)
cGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCaa > 2:1939030/1‑150 (MQ=255)
cGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCaa > 1:2230193/1‑150 (MQ=255)
ggAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAat < 2:2022513/150‑1 (MQ=255)
ggAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAat < 2:3273216/150‑1 (MQ=255)
gAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAata > 2:1743444/1‑150 (MQ=255)
aTTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTc < 2:4250404/150‑1 (MQ=255)
aTTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTc < 2:4415158/150‑1 (MQ=255)
cGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCa < 2:2757651/150‑1 (MQ=255)
cGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCa > 1:3646024/1‑150 (MQ=255)
tGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGa > 2:2827434/1‑150 (MQ=255)
aGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAata > 2:812060/1‑150 (MQ=255)
aGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAata < 1:638698/150‑1 (MQ=255)
gTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATg > 1:3418434/1‑150 (MQ=255)
tgcaacaGACCTGGTTCTCACTGTTACACAAATGCTGAGCAAACATGGAGTGGTGGGGAAATAAGACTAATATTATGTTTATGGTCTGGATTCACAACCTTTTGCGGATCGCGCCACCATACCCAATATGTCTCAAGAATATTGTGacac > 2:1427607/5‑150 (MQ=255)
cGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCAc > 2:1099984/1‑150 (MQ=255)
cacaGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAAGATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtg > 1:3054905/1‑150 (MQ=255)
caGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtgtg > 2:2634456/1‑150 (MQ=255)
gACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGc > 2:1576078/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGct < 1:3940984/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGctt < 1:1399627/150‑1 (MQ=255)
cTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttc > 1:3670744/1‑150 (MQ=255)
cTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttc > 1:1084269/1‑150 (MQ=255)
ggTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttctt < 2:1960077/150‑1 (MQ=255)
ggTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttctt < 2:5001005/150‑1 (MQ=255)
ctcACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGATATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCa < 1:900452/150‑1 (MQ=255)
cACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAAt > 2:2581218/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGACTATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATc > 2:111478/1‑150 (MQ=255)
cTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCg < 2:4950222/150‑1 (MQ=255)
gTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGAt > 1:2102764/1‑150 (MQ=255)
tACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGc > 2:3448630/1‑150 (MQ=255)
aCCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCt > 1:1629365/1‑150 (MQ=255)
aCCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCt > 2:4501695/1‑150 (MQ=255)
cccAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTg < 1:770284/150‑1 (MQ=255)
cccAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTg > 1:2154784/1‑150 (MQ=255)
tgcGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCg > 1:4875962/1‑150 (MQ=255)
tgcGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCg > 1:2821410/1‑150 (MQ=255)
gcgcAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGa > 2:1439995/1‑150 (MQ=255)
cgcAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGAt > 2:3221286/1‑150 (MQ=255)
aTGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGc > 2:2330773/1‑150 (MQ=255)
ggCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGt < 2:4716982/150‑1 (MQ=255)
gCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGtt > 1:1741622/1‑150 (MQ=255)
gCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGtt > 1:2866891/1‑150 (MQ=255)
gtggGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGc < 1:257287/150‑1 (MQ=255)
gtggGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGc < 2:608423/150‑1 (MQ=255)
tggGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCg > 1:4217620/1‑150 (MQ=255)
gggAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCggg > 2:4243230/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGTTTACCTGCGTTTAAGCGGgcgc > 2:163524/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGgcgc > 1:4183370/1‑150 (MQ=255)
aaTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCa < 1:4443062/150‑1 (MQ=255)
aaTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCa > 1:683075/1‑150 (MQ=255)
aTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAg < 1:3260224/150‑1 (MQ=255)
aTTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAg < 1:279046/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCg < 1:1743463/150‑1 (MQ=255)
cgtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa < 2:657637/150‑1 (MQ=255)
cgtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa < 2:651693/150‑1 (MQ=255)
cgtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa > 1:5039524/1‑150 (MQ=255)
cgtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa < 1:2419183/150‑1 (MQ=255)
gtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGaa > 1:2304493/1‑150 (MQ=255)
gtcgAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGaa < 1:1954519/150‑1 (MQ=255)
tttATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAgg > 2:3061991/1‑150 (MQ=255)
ttatggttatggTATGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCATCTTCCCAATCCATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGATTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGt > 1:4299229/1‑150 (MQ=255)
tatggttatggtCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTc < 1:5149001/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTATGGTCTGGATTCACTATCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCg < 2:5026932/150‑1 (MQ=255)
tGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGa > 1:4824577/1‑150 (MQ=255)
tGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGa > 2:2663095/1‑150 (MQ=255)
ggTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAg < 2:411138/150‑1 (MQ=255)
ggTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAg < 1:1195025/150‑1 (MQ=255)
|
GCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAG > CP009273/1330807‑1331101
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTG > CP009273/1330807‑1331104
|
GCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGA < SRR19973063.2948181/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGG < SRR19973063.424155/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGG < SRR19973063.4651499/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGG > SRR19973063.1528566/1‑150 (MQ=60)
GGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGG > SRR19973063.1528569/1‑150 (MQ=60)
GGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTCCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGG > SRR19973063.4865942/1‑150 (MQ=60)
GTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGT < SRR19973063.2801600/150‑1 (MQ=60)
TTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTC > SRR19973063.2649435/1‑150 (MQ=60)
CCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGG < SRR19973063.2860762/150‑1 (MQ=60)
TGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATT < SRR19973063.4214350/150‑1 (MQ=60)
TGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATT < SRR19973063.2170144/150‑1 (MQ=60)
GCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTC < SRR19973063.671011/150‑1 (MQ=60)
GCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTC < SRR19973063.671695/150‑1 (MQ=60)
CTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCA < SRR19973063.3062263/150‑1 (MQ=60)
CTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCA < SRR19973063.3062321/150‑1 (MQ=60)
TTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCAC < SRR19973063.4704647/150‑1 (MQ=60)
CCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACC < SRR19973063.2365720/150‑1 (MQ=60)
CGGATGTAGTGGGCTTAAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGT < SRR19973063.1324787/150‑1 (MQ=60)
GATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTG > SRR19973063.772002/1‑150 (MQ=60)
GATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTG < SRR19973063.1897172/150‑1 (MQ=60)
GTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCG > SRR19973063.681455/1‑150 (MQ=60)
TAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGG > SRR19973063.2566998/1‑150 (MQ=60)
AGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGA > SRR19973063.653604/1‑150 (MQ=60)
AGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGA > SRR19973063.653633/1‑150 (MQ=60)
GTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGAT > SRR19973063.4136439/1‑150 (MQ=60)
TGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATC < SRR19973063.1855932/150‑1 (MQ=60)
GCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCG < SRR19973063.4874744/150‑1 (MQ=60)
AACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCA > SRR19973063.4593576/1‑150 (MQ=60)
ACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCAT < SRR19973063.2150885/150‑1 (MQ=60)
ACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACAGTTGGCGGATCGCGCCACCAT > SRR19973063.2446725/1‑150 (MQ=60)
CTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATT > SRR19973063.5008172/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAA > SRR19973063.2237261/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAA > SRR19973063.360919/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAA > SRR19973063.1397859/1‑150 (MQ=60)
AAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATG > SRR19973063.3332615/1‑150 (MQ=60)
AATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGT < SRR19973063.1247983/150‑1 (MQ=60)
AATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGT < SRR19973063.1655761/150‑1 (MQ=60)
ATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTC < SRR19973063.4728712/150‑1 (MQ=60)
TTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCG > SRR19973063.2220636/1‑150 (MQ=60)
CGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCA < SRR19973063.4868987/150‑1 (MQ=60)
CGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCA > SRR19973063.3657717/1‑150 (MQ=60)
CGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCA > SRR19973063.771719/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAG < SRR19973063.1674917/150‑1 (MQ=60)
AAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAAT < SRR19973063.669801/150‑1 (MQ=60)
AGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATA < SRR19973063.640577/150‑1 (MQ=60)
AGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATA > SRR19973063.2545491/1‑150 (MQ=60)
GTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATG > SRR19973063.3429315/1‑150 (MQ=60)
TTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTG > SRR19973063.3670831/1‑150 (MQ=60)
TTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTG > SRR19973063.3670828/1‑150 (MQ=60)
TACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGC > SRR19973063.2908032/1‑150 (MQ=60)
CACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTG > SRR19973063.3827912/1‑150 (MQ=60)
CACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTG > SRR19973063.3064712/1‑150 (MQ=60)
CACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAAGATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTG > SRR19973063.3064693/1‑150 (MQ=60)
AGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGG > SRR19973063.3442177/1‑150 (MQ=60)
GACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGC > SRR19973063.5168566/1‑150 (MQ=60)
ACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCT < SRR19973063.3953582/150‑1 (MQ=60)
CCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTT < SRR19973063.1403860/150‑1 (MQ=60)
CCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTT > SRR19973063.1764408/1‑150 (MQ=60)
CTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTC > SRR19973063.4409902/1‑150 (MQ=60)
CTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTC > SRR19973063.1087566/1‑150 (MQ=60)
CTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTC > SRR19973063.3682502/1‑150 (MQ=60)
TCTCACTGTTACCCAACTGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGAGTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATANGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCC < SRR19973063.2683013/150‑1 (MQ=60)
TCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCC < SRR19973063.5160867/150‑1 (MQ=60)
CTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGATATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCA < SRR19973063.903083/150‑1 (MQ=60)
CTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCA < SRR19973063.902971/150‑1 (MQ=60)
CTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCA > SRR19973063.1959237/1‑150 (MQ=60)
TCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAA > SRR19973063.4318899/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATC > SRR19973063.544281/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATC < SRR19973063.3427018/150‑1 (MQ=60)
GTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGAT > SRR19973063.2109339/1‑150 (MQ=60)
TTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATG < SRR19973063.4875693/150‑1 (MQ=60)
TTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATG < SRR19973063.2307407/150‑1 (MQ=60)
ACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCT > SRR19973063.1634340/1‑150 (MQ=60)
CCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTG > SRR19973063.2161537/1‑150 (MQ=60)
CCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTG < SRR19973063.772529/150‑1 (MQ=60)
CCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGT > SRR19973063.669677/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAA < SRR19973063.1867435/150‑1 (MQ=60)
GCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCT < SRR19973063.1977573/150‑1 (MQ=60)
GCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCT < SRR19973063.4482193/150‑1 (MQ=60)
CTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTC > SRR19973063.4617230/1‑150 (MQ=60)
TGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCG > SRR19973063.2830478/1‑150 (MQ=60)
TGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCG > SRR19973063.4891652/1‑150 (MQ=60)
TGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCG > SRR19973063.4891682/1‑150 (MQ=60)
TGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCG > SRR19973063.2830379/1‑150 (MQ=60)
CAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTA > SRR19973063.1876444/1‑150 (MQ=60)
AAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTAC > SRR19973063.4902635/1‑150 (MQ=60)
AACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACA > SRR19973063.196938/1‑150 (MQ=60)
CATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATG > SRR19973063.119589/1‑150 (MQ=60)
CATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATG > SRR19973063.2613441/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACTTGCG < SRR19973063.2157142/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCG > SRR19973063.4548299/1‑150 (MQ=60)
GCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTT > SRR19973063.1746918/1‑150 (MQ=60)
GCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTT > SRR19973063.1746980/1‑150 (MQ=60)
GCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTT > SRR19973063.2876075/1‑150 (MQ=60)
GTGGTGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCTGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGC < SRR19973063.257897/150‑1 (MQ=60)
GTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGC < SRR19973063.258057/150‑1 (MQ=60)
GTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGC < SRR19973063.258035/150‑1 (MQ=60)
TGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCG > SRR19973063.4231069/1‑150 (MQ=60)
TGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCG > SRR19973063.4231041/1‑150 (MQ=60)
GGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGG < SRR19973063.2697106/150‑1 (MQ=60)
GGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCATTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGG > SRR19973063.1947398/1‑150 (MQ=60)
GAAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGACACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCG < SRR19973063.827743/150‑1 (MQ=60)
AAATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGC > SRR19973063.4196729/1‑150 (MQ=60)
AATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACTGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCA < SRR19973063.1799080/150‑1 (MQ=60)
AATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCA > SRR19973063.685077/1‑150 (MQ=60)
AATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCA < SRR19973063.4457315/150‑1 (MQ=60)
AATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCA < SRR19973063.644478/150‑1 (MQ=60)
ATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAG < SRR19973063.279874/150‑1 (MQ=60)
ATTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAG < SRR19973063.3270691/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGC < SRR19973063.3211165/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGC < SRR19973063.4139321/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCG < SRR19973063.1748743/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCG < SRR19973063.1748762/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCG < SRR19973063.2903311/150‑1 (MQ=60)
CGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGA > SRR19973063.5055765/1‑150 (MQ=60)
CGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGA < SRR19973063.2426917/150‑1 (MQ=60)
CGTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGA > SRR19973063.5055981/1‑150 (MQ=60)
GTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAA > SRR19973063.2311856/1‑150 (MQ=60)
GTCGAATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAA < SRR19973063.1960637/150‑1 (MQ=60)
AATTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATC < SRR19973063.2243080/150‑1 (MQ=60)
TTTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAG < SRR19973063.2373839/150‑1 (MQ=60)
TTTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGG > SRR19973063.2865140/1‑150 (MQ=60)
TTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGT > SRR19973063.4312706/1‑150 (MQ=60)
TTATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGT < SRR19973063.1342524/150‑1 (MQ=60)
TTATGGTTATGGTATGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCATCTTCCCAATCCATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGATTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGT > SRR19973063.4312892/1‑150 (MQ=60)
TATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTC < SRR19973063.5165572/150‑1 (MQ=60)
TATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTC > SRR19973063.128325/1‑150 (MQ=60)
ATGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCG < SRR19973063.3861195/150‑1 (MQ=60)
TGGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGA > SRR19973063.4840029/1‑150 (MQ=60)
GGTTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAG < SRR19973063.1198611/150‑1 (MQ=60)
TTATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTT < SRR19973063.973647/150‑1 (MQ=60)
TATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTG > SRR19973063.4262838/1‑150 (MQ=60)
|
GCCGGTTTCCATGCTTATCCCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTG > CP009273/1330807‑1331104
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
