Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,010 |
G→T |
25.5% |
L72I (CTT→ATT) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,010 | 0 | G | T | 25.5%
| 356.9
/ 44.4
| 216 | L72I (CTT→ATT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/68); new base T (10/50); total (96/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
ATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGC > CP009273/234864‑235157
|
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt < 1:1413754/148‑1 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt > 1:1031621/1‑148 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt > 1:2549686/1‑148 (MQ=255)
gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaa < 2:1566573/148‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:238564/148‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa > 2:3380238/1‑148 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACAt < 1:134994/148‑1 (MQ=255)
cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATg < 1:722101/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGTATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2639635/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa < 2:3139069/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa < 1:286366/148‑1 (MQ=255)
gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGaa < 1:2811970/148‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAat > 2:2559074/1‑148 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:1349986/148‑1 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑ATACATGAATAtt > 2:713516/1‑148 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAttt > 1:1968190/1‑148 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATATTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTa > 2:2665612/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:366627/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:1464211/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑ATAAATGTATATTTaa > 1:2363329/1‑148 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGGTTAAGAATGATTTTATTATAGTTATTAAAA‑TTAAAATAAAATTTaaa > 1:2230518/1‑148 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaa < 2:3101087/148‑1 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaa < 1:794985/148‑1 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTaaaaa > 2:2035267/1‑148 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:263380/1‑148 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATA‑TTAAAAAgg < 2:802997/148‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAAATATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:1616621/1‑148 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaa > 2:3481817/1‑148 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2068896/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:2763919/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1717223/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1788078/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1939226/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTTAAAATGaaa > 1:1300462/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1108274/148‑1 (MQ=255)
acggTGCTATTACGATAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa < 2:1016539/146‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAc > 2:3499782/1‑148 (MQ=255)
gTGCTATTACTATAGTTATTATTAAAAATATAAGTGTTAGTTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:2102995/148‑1 (MQ=255)
tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTATGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaaa < 2:1734352/148‑1 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTTTATTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGaaaaac > 1:632535/1‑145 (MQ=255)
aCGATTGCTATTATAAAAAATATAAGTGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGa < 2:1352705/148‑1 (MQ=255)
ctaTAGATATTATAAAAAATATAATTTTTCGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGaa < 1:1152749/146‑1 (MQ=255)
cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGaa > 2:1203491/1‑148 (MQ=255)
aTAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGc < 2:1961415/148‑1 (MQ=255)
tAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1426249/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTAGTAAAAATATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTATATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:276953/148‑1 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGATAAAGTCATGAAACCGAAGcaca > 2:3272378/1‑148 (MQ=255)
attattAAAAATATAATAGTTCGGTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:158044/148‑1 (MQ=255)
ttattaAAAATATATGTGTTAGATTTATTTTTATGTCTGTGGAGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:3366245/148‑1 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTTAGAATTATTTTTTTTTAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAATTTAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACACaaac > 1:3285728/1‑146 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCCAAGCACACAATc > 1:1849148/1‑148 (MQ=255)
attAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:1404346/146‑1 (MQ=255)
ttAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:783541/147‑1 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:749434/1‑148 (MQ=255)
aaaaaTATATTTTTTCGCTTTTTTTTTTTGTCTTGGGCTATATTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTATCATTTATTTTATTAGCTTAATAAAAT‑TTACATTAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:301310/148‑1 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTTTTATGGTAATTAAAA‑TTAAATGTATATTTAAAAATGAAAAAGACATGTAACCGCAGCACAGAATGAACa > 1:2965535/1‑148 (MQ=255)
atatAATCGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTAGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3454182/148‑1 (MQ=255)
atatAATAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:528120/148‑1 (MQ=255)
atatAAGTGTTAGCTGTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACGTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:1289978/148‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGAAATGAAAACGAAGCACAGAAACAAAATtctc > 1:3457068/1‑148 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATTAAACCCAAGCACAGAAAAAACAtaaacca > 1:3437078/1‑142 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa > 2:2298247/1‑148 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGTATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAACATa > 1:759501/1‑148 (MQ=255)
cTGTTTTGTTTTGACTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:2869640/148‑1 (MQ=255)
gttttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:2928290/145‑1 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:867200/148‑1 (MQ=255)
tttttATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTGGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCTTATGTAAAA‑TTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 2:1306505/145‑1 (MQ=255)
tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTGAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCCCAGCACCGAATAAACATTCTCCAATAATAAAAAAtttac > 1:2253714/1‑146 (MQ=255)
tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATAATAAAATAtttaa > 2:2830288/1‑146 (MQ=255)
ttATGTTTGTGGCAAAATTGAAAACTTTTTTTTTTTTTATTAACATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 1:2417713/148‑1 (MQ=255)
tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg > 2:573037/1‑148 (MQ=255)
ttttttgtgGATAATTTGAATACCTTTTTTTTTTTGATTAATATTTTTTTTATTTTCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988452/143‑1 (MQ=255)
ttgtgtgtgGCTAAATTGACTCCATTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCTTAATAAAAA‑TTAATTTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988351/147‑1 (MQ=255)
agAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:2024182/147‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAAGCACAGAATCAACAATATACAATCAAAAAAAATTTACGGGGAGCATTTtattat > 1:574978/1‑148 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2919101/1‑148 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAATAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCAAATAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2224706/1‑148 (MQ=255)
ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg > 2:1683658/1‑148 (MQ=255)
gACCACCTTAGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAAAAAAAA‑TTAAATTAAAATAAAAAAACCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 1:306443/148‑1 (MQ=255)
tcttttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:454333/145‑1 (MQ=255)
ttttttttATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGACACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1169338/148‑1 (MQ=255)
ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 1:43917/1‑148 (MQ=255)
ttttttATTAATAATTATTTTATTATC‑TAAATAAAATTTAAATTAATATTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTaa < 1:1524820/148‑1 (MQ=255)
tttaTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3347759/145‑1 (MQ=255)
tttaTTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 2:834505/145‑1 (MQ=255)
gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:754039/1‑148 (MQ=255)
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taagtaaAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:3310296/148‑1 (MQ=255)
|
ATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGC > CP009273/234864‑235157
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
