Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F52 I0 R1
|
779 |
320.1 |
10410758 |
96.6% |
10056792 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,010 |
G→T |
26.8% |
L72I (CTT→ATT) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,010 | 0 | G | T | 26.8%
| 244.6
/ 26.8
| 165 | L72I (CTT→ATT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/52); new base T (4/46); total (67/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.25e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234862‑235158
|
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAgtaag > 1:4161319/1‑149 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaag < 2:191408/149‑1 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaag < 2:2794294/149‑1 (MQ=255)
tATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt < 2:1510130/149‑1 (MQ=255)
tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACAt < 2:2193799/149‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATg < 1:1662640/149‑1 (MQ=255)
cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGa < 1:2460588/149‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGAGAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAata < 2:3424145/149‑1 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATAttt < 1:3422716/149‑1 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATAttt < 1:3422950/149‑1 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATATTAAGT‑AAAATTAAAATAATATTTa > 1:474898/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTa > 1:1866006/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTa < 2:3333529/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTaa > 2:2529484/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3984633/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAATGaaa > 2:3499437/1‑149 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:4886651/149‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAc > 2:1973465/1‑149 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa > 2:1606312/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt > 2:2378091/1‑149 (MQ=255)
ggTGATATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATATGAGTTTGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:1142086/149‑1 (MQ=255)
ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGaaaacc > 1:550700/1‑146 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAATTAAAAAGACATTAAAACGa > 1:5014466/1‑149 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAAATAAATTAATATTTAAAAATGAAAAATACATGAAAcaca > 1:5014769/1‑146 (MQ=255)
aCGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTCCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGaa < 2:2601079/149‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTTGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTCCCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1538751/149‑1 (MQ=255)
tAGCTTTTTTTAAAAATATAATAGTTTGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACGTTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCTTATGT‑AAAATTACTTTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 2:4401623/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAACcaca > 1:2609731/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAATTAAAACTAAATGAAACCGAATcaaa > 1:1499043/1‑147 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAATGAAAACGACCTTAAAACGAAGcaca > 1:2345358/1‑149 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAg > 1:2577380/1‑149 (MQ=255)
ttttattaAAATTATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACATTATTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTTTTATCTTAAGT‑AAATTTAATTGATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 1:3720080/147‑1 (MQ=255)
ttaaaaaaTATATGTTTTCGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGTCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATCGTAATA‑AAATTTAAATTAATATTTAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:2234169/146‑1 (MQ=255)
attAAAAATATATGTTTTTGCTGTATTGTTTTGTGTGGGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTTTTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:2052852/147‑1 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:5131872/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 1:296517/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATAAAc > 1:296556/1‑149 (MQ=255)
tAAAATTATATTTGTTTGGTGTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACTTTGTTTTTTTTTTTTAAGATTTTTTTTTTTTTGTTATTT‑AAATTTACATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:4464268/149‑1 (MQ=255)
tAAAATTATAAGTGTTTGGTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTAAATTTACTACGTTCGTTTTTTTGTTTAAGATTTTTTTTTTTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:4465282/149‑1 (MQ=255)
tAAAAATATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTATGTCGGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:1292238/149‑1 (MQ=255)
aaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACAGAATCAACAttat > 2:4441323/1‑147 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTTTTATCTTAATT‑AAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTcc < 1:3859730/149‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACAATAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACACAAACAACAATCAcc > 2:4848552/1‑149 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATAAAAGTAAAA‑AAAATTAAAATAATATTTAAAAAATAAAAAGAAATGAAAACGAATCACACAAacaacaatatca > 2:4848379/1‑143 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAATAAAAATTAAAT‑AAAATTTAAAAAGGAAAACGAAAATAAAAAGAAGCACAGAAACAACAAtctcaa > 1:1131804/1‑147 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa > 2:5121293/1‑149 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa > 2:4997278/1‑149 (MQ=255)
aagttttAGCTTTTTTTTTTTTTGTGTGGCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCGTATTT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3310205/144‑1 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt > 2:4742499/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAATCa > 2:4186038/1‑149 (MQ=255)
agTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCAt < 1:295423/149‑1 (MQ=255)
gTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa > 2:2851573/1‑149 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 2:2449235/149‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAAGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATAAACAAACATAAAata > 1:1555486/1‑149 (MQ=255)
gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAATCAAAAATCACCAATAATAAAAAAtt > 1:2553016/1‑149 (MQ=255)
ttATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTGATTAATATTGTTTTTATTATCGTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 1:5086122/149‑1 (MQ=255)
ttttCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAATTTAATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 2:104021/146‑1 (MQ=255)
agttCTGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:1208497/146‑1 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 2:104012/149‑1 (MQ=255)
tGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCTTAAGT‑AAATTTACATTAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg < 1:696555/149‑1 (MQ=255)
gtatgtgGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:4199041/146‑1 (MQ=255)
tCTGTGGAGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTATGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 2:3300335/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:233552/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:2835835/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGACTACTTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATA‑AAATTTAAATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:3069302/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATGATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:3909783/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATTATTTTTTTATAGTAAGT‑AAAAATAAAATAATAATTAAAAAATAAAAACACAATAAAACCAATCACACAAAAAAAAATATACAAAAAAAAAAAATTTAAGTGGAGCAtt > 1:956341/1‑149 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt > 1:5170536/1‑149 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCTTAATT‑AAAATTAAATTAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:2494092/149‑1 (MQ=255)
tgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:3526235/149‑1 (MQ=255)
tgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAATAAGAAATAATTTATTATACTAAGT‑AAAAATAAAATAATATATAAAAATGAAAACGAAAATAAACAGAAGCAAACAAACAAAATTCTCCAAAAATAAAATATTTACGAGGAGCAtttt > 2:22784/1‑149 (MQ=255)
gggCTAATTTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:929112/148‑1 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:1343652/149‑1 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGA‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:255200/149‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:765895/149‑1 (MQ=255)
tGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:2379684/149‑1 (MQ=255)
tACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACAAGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAATCATAAAAAATTTAAGTGGAGCATTTTATTATTTAAtata > 2:2351853/1‑149 (MQ=255)
ttatttttttttATTAACAATCATTTTATTATCGTAATA‑AAAATTACATTAATATTTAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGAATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:4314816/145‑1 (MQ=255)
tttttttttATTAACAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1494623/148‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:810072/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 2:2668991/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:4656318/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:3994494/1‑149 (MQ=255)
ttttttATTAATATTTATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 1:1105953/149‑1 (MQ=255)
ttttATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3479516/149‑1 (MQ=255)
gAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa > 2:3960567/1‑149 (MQ=255)
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taatt‑aaAATTACTTGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAATCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt < 2:581379/149‑1 (MQ=255)
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GTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234862‑235158
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
