Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F14 I0 R1
|
127 |
310.1 |
10402230 |
94.2% |
9798900 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,010 |
G→T |
17.6% |
L72I (CTT→ATT) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,010 | 0 | G | T | 17.6%
| 419.7
/ 10.6
| 223 | L72I (CTT→ATT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (104/66); new base T (13/35); total (122/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234862‑235158
|
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCgtaag > 1:2535847/1‑149 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgtaag > 1:5162730/1‑149 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAATTATTTTATTATATTAATTAAAAt > 1:3069982/1‑149 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 2:230231/149‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 2:896912/149‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAATAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAAt > 1:907741/1‑149 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 2:1975741/149‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 1:4229617/149‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGaa < 2:3898833/149‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAatat > 2:3756361/1‑149 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAATAAAATTACATGAatat > 1:2006104/1‑149 (MQ=255)
cAAAACGAGCTATTAAAGGTTCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAttt < 2:4106665/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa > 2:1400479/1‑149 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATGATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAAAGAATATTTaaa > 1:3521039/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATGAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTaaaa > 2:5041831/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAATATTTTATTATAGTAATTAAAAATAAAATAATAATTaaaa > 1:940857/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa > 2:1096/1‑149 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTATAATGATTTTATTATCGTAAATAAAAATACATGAATATTTaaaaa > 1:1018707/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTaaaaatg > 2:628883/1‑147 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3183075/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3182597/149‑1 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑a > 2:1275758/1‑149 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑a < 2:4916458/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aa > 2:3673364/1‑149 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aa < 1:716356/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTATTTTAGTTAGTAAAATTAAATGAATATTTaaaaattaaa > 1:3343516/1‑144 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aaa > 2:1971776/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aaaa < 1:642303/149‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGG‑AAAAc > 1:2971837/1‑149 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTATATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAc < 2:3020079/149‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAc < 2:4535421/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTTCTATTACGATAGCAATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGATGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:4673842/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:1787158/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:718976/149‑1 (MQ=255)
aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGAc > 2:2799201/1‑149 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑TAAACGACa > 2:4194695/1‑149 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATTATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAAGAATATTTAAAAATG‑AAAACGACATGaa > 1:1559336/1‑149 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGTATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGaa > 2:313701/1‑149 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGACATGaa > 2:313230/1‑149 (MQ=255)
cTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACATGAATATTTAAAAATG‑AAAACGACATGaaa > 1:2423974/1‑149 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTTAGTAAAAATACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAAACGa > 1:4601850/1‑149 (MQ=255)
ttAGATATTTTTAAAAATATAATATTTTGTTTTATTTTTTTTTCTGTGGCGAATTTGACTACTTTCGTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTTTTATCTTAATTAAATTTACTTTATTATTTAAAAAGT‑AACACGACATGAAACCGAAGca < 2:600627/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTATTAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATG‑AAAAAGACATTAAAACGAAGca > 1:525270/1‑149 (MQ=255)
cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGa > 1:4305160/1‑149 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGTATATTTAAAAATG‑AAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATc > 1:2509232/1‑149 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATc > 2:2573776/1‑149 (MQ=255)
ttAAAAATATATGTGTTTGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:1545525/148‑1 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGG‑AAAAAGACATGAAACCGAATCACAAAATaaaaaa > 1:4666807/1‑146 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATAAACaa > 1:2361604/1‑148 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTcc > 2:1244014/1‑149 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATTAATAATTAAAAAGGAAAAACAACA‑GAAAAACAATCACAGAATAAACATTCTcc > 2:1339178/1‑149 (MQ=255)
atattagTTAGATGTATTGTTATTTTGGTGGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAACAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 2:1817611/144‑1 (MQ=255)
taAGTGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACGACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:1500318/149‑1 (MQ=255)
attatttAGTTGTTTTGTTATGTCTTTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTTTTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3894943/144‑1 (MQ=255)
aaGTGTTTGCTTTATTTTTTTGTCTTTGGCTAAATTGACTACATTGGTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCTTAAGAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:771711/149‑1 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt > 2:1220846/1‑149 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAATATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAAAATTTAAAAAGG‑AAAACGACAATAAACCCAAGCACAGAAACAACAATATCCaaa > 1:1239552/1‑148 (MQ=255)
agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTTTTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAATAAACATTCTACAAta > 1:1155978/1‑148 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGAAAAGAAACCGAAGCACACAATCAACATTCTCCAATCa > 2:3648294/1‑149 (MQ=255)
agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTTTTATAGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGG‑AAAAATAAATGAAAACGAAGCACAGAATAAACATTCTACAAtaaa > 2:4770587/1‑146 (MQ=255)
gTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa < 2:722225/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATTAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAtaataa > 2:4842192/1‑149 (MQ=255)
tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAatat > 2:2474427/1‑149 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAAAATAAAATATTTc > 1:2126754/1‑149 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAAAATTTACGt > 2:3507067/1‑149 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTATCCAATCATAAAATATTTACGt > 2:4023733/1‑149 (MQ=255)
tttgtgtgtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:370187/147‑1 (MQ=255)
ttGTCTGTGGATAATTTTAATACATTCTTTTTTTTTATTATTATTTATTTTTTTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAATT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:3190437/148‑1 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGACAAGAAACCGAATCACAAAAACAACAATATACAAACATAAAAAATTTAAGTTGAGCa > 2:4792585/1‑149 (MQ=255)
gctaaaTTCACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 1:4211307/146‑1 (MQ=255)
aaaTTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:1859276/149‑1 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTTAAATTACATGAATATTTAAAAAAG‑AAAACGACATTAAAACGAACCACATAAAAAACATTAACAAAACAAAAAATAATTACGTTGAGAATTTTATTATTGAat > 2:199879/1‑149 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAAAGAAAAATTAAAAAAG‑AAAAACACAAGAAACCCAAGCACACAATAAACAATATACACTAATAAAAAATTTACCGGGAGCATTTTATTATTGAat > 2:3091849/1‑149 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAAAAATTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCACCAATCAAAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat > 2:835526/1‑149 (MQ=255)
ttCTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTTTTTATCGTAAGAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGC‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:5041706/149‑1 (MQ=255)
ttCTTTTTTTTGATTAATATTGTTTTTATTATCTTAATAAAAATTACATTAATTTTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:2877831/149‑1 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATATAgg > 1:1518398/1‑149 (MQ=255)
tctttttttttATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:940098/146‑1 (MQ=255)
ttttTATTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt < 2:4095195/149‑1 (MQ=255)
ttttTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt < 2:2970682/149‑1 (MQ=255)
ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt > 1:4644926/1‑149 (MQ=255)
taTTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg < 2:5187123/148‑1 (MQ=255)
aTTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 2:4495369/149‑1 (MQ=255)
aTTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 2:4495384/149‑1 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:4851322/1‑149 (MQ=255)
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tAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaa > 2:3448830/1‑149 (MQ=255)
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ttattaTCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTACAAAACAaagaa > 2:2913483/1‑149 (MQ=255)
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ttaattaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:3070587/148‑1 (MQ=255)
gtaattaaAATTACATTAATTTTTAAAAATG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:691052/149‑1 (MQ=255)
agtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc > 1:3352204/1‑149 (MQ=255)
|
GTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234862‑235158
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
